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一个模块化的DNA组件作为miRNA抑制剂
图3。miRNA储物柜的miRNA抑制作用的验证。（a）示意图表示miR-214对癌细胞EMT过程的影响。两个miRNA储物柜LC-1和LC-2有望通过阻止miR-214对EMT促进蛋白的RNF8的抑制作用来促进EMT。（b）IP-PCR分析确定miRNA储物储物在A549细胞中与靶microRNA的结合能力。启动设计的示意图表示，Hago2代表了表达质粒的标志标记的人AGO2，输入表示总DNA的等分试样。用于免疫沉淀的抗体在泳道上方指示。（c）RT-QPCR结果证明了用miR-214储物柜LC-C（作为对照）/LC-1/LC-1/LC-2或miR-214 Antagomir（AN-214）/Antagomir对照（ANANTAGOMIR对照）转染的A549细胞中miR-214的丰度。（d）用miR-214储物柜LC-C/LC-1/LC-2或Antagomir AN-214/AN-C转染的A549细胞中RNF8表达水平的蛋白质印迹。 （e）用miR-214储物柜LC-C/LC-1/LC-2或Antagomir AN-214/AN-C转染的A549细胞中迁移的Transwell分析。 （F）CCK8分析表明用miR-214储物柜LC-C/LC-1/LC-2转染的A549细胞的增殖。使用2-ΔΔCT方法计算了相对基因表达，并在每组内针对U6 snRNA的基因初始归一化。对照组（LC-C或AN-C）中每个基因的表达水平
尿miRNA签名作为Hirschsprung病的潜在非侵入性诊断生物标志物
hirschsprung疾病（HSCR）的特征是胃肠道中没有神经节细胞的先天性缺失，从而导致排便，便秘和肠梗阻受损。当前的HSCR诊断是基于直肠吸力活检（RSB），这在新生儿中可能很复杂。有时会延迟诊断会增加临床并发症的风险。因此，有新的非侵入性诊断方法是客观的，更可行的，并且为潜在的手术干预提供了更早的基础。近年来，MicroRNA（miRNA）已成为相关的早期标志物的重点，该标志物可以提供对疾病的病因和进展的更多见解。因此，在寻找非侵入性HSCR生物标志物时，我们分析了HSCR患者尿液样品中的miRNA表达。使用微阵列的5例HSCR患者的结果显示，HSA-MIR-378 H，HSA-MIR-210-5P，HSA-MIR-6876-3P，HSA-MIR-634和HSA-MIR-634和HSA-MIR-6883-3P是最上升的miRNA；而HSA-MIR-4443，HSA-MIR-22-3P，HSA-MIR-4732-5P，HSA-MIR-3187-5P和HSA-MIR-371B-5P最下调的miRNA。在mirnawalk和mirdb数据库中进一步搜索表明，这些失调的miRNA肯定鉴定出靶标HSCR相关基因，例如RET，GDNF，BDNF，BDNF，EDN3，EDNRB，ERBB，ERBB，NRG1，NRG1，SOX10；以及神经元迁移和神经发生中暗示的其他基因。最后，我们还可以通过RT-QPCR验证HSCR尿中的一些miRNA变化。总的来说，我们的分析的HSCR队列表现出失调的miRNA表达表达，可以在尿液中检测到。我们的发现为将来使用特定的尿液miRNA特征作为非侵入性HSCR诊断方法开辟了可能性。
AGO2蛋白：miRNA途径中的关键酶是肾上腺皮质癌中的一种新生物标志物
肾上腺皮质癌（ACC）是一种罕见且侵略性的恶性肿瘤，其特征是诊断挑战，高复发率和预后不良。这项研究探讨了miRNA加工基因在ACC中的作用及其作为诊断和预后生物标志物的潜在作用。我们分析了使用癌症基因组图（TCGA）和基因型 - 型 - 型 - 基因组表达（GTEX）项目的mRNA-SEQ数据，分析了miRNA机械组件（Drosha，DGCR8，XPO5，RAN，DICER，DICER，TARBP2和AGO2）的mRNA表达水平。此外，在科林医学研究所的肿瘤库的组织样品中量化了蛋白质水平。我们的结果表明，与正常的肾上腺皮质和良性肾上腺腺瘤相比，AGO2在所有miRNA加工成分中均表现出明显的过表达（P <0.001）。kaplan – Meier生存分析表明，ACC患者的总体生存率明显较差（HR：7.07，p <0.001）。在TCGA的32种癌症类型中，AGO2的预后意义在ACC中最为突出。这项研究是第一个在ACC中报道AGO2作为诊断和预后生物标志物的潜力，强调了其在ACC发病机理和潜在应用中作为无创液体活检生物标志物的重要性。
参与心脏纤维化的 miRNA 评估
摘要背景和目的：心脏功能缺陷会导致心脏中细胞外基质蛋白的过度积聚。本研究旨在使用机器学习算法研究和分析与心脏纤维化有关的 miRNA。方法：从公共来源和相关临床数据库收集与健康个体和心脏纤维化患者中 miRNA 表达相关的数据集。我们选择了 50 人作为研究对象，其中包括 25 名健康对照者和 25 名心脏纤维化患者。采用不同的机器学习算法，包括支持向量机、随机森林和人工神经网络来分析、分类和预测 miRNA 表达变化在心脏纤维化中的作用。通过留一交叉验证和独立数据集对机器学习模型的验证有效地支持了结果的稳健性。报告的准确性、敏感性和特异性指标令人印象深刻。结果：两组间共发现 78 个 miRNA 存在差异表达（调整 P < 0.05），与对照组相比，心脏纤维化组有 47 个 miRNA 上调，31 个 miRNA 下调。比较每种方法选出的前 10 个 miRNA，并确定一组一致的 5 个 miRNA（miR-21-5p、miR-29a-3p、miR-29c-3p、miR-30b-5p 和 miR-133a-3p）作为区分心脏纤维化和对照样本最具参考价值的特征。结果显示，与对照组相比，心脏纤维化患者的 miR-21-5p、miR-29a-3p 和 miR-29c-3p 表达增加。相反，与患者相比，正常受试者中 miR-30b-5p 和 miR-133a-3p 的表达增加。发现具有径向基函数核的 SVM 算法是性能最佳的模型，其准确率为 92%，灵敏度为 88%，特异性为 96%，受试者工作特征曲线下面积 (AUC-ROC) 为 0.95。结论：总体而言，对患者体内 miRNA 的评估可作为监测患者和应用治疗策略的生物标志物。关键词：miRNA、心脏纤维化、机器学习、网络分析、生物标志物资金：无*本作品已根据 CC BY-NC-SA 许可发表。版权所有 © 作者引用本文为：Amin A、Rashki Ghalehnoo S、Mohajerian A、Samadi P、Torabahmadi A、Ahadi S、Hasanvand A、Nikdoust F。评估与心脏纤维化有关的 miRNA：基于机器学习的方法。伊朗红新月会医学杂志。2024,54.1-10。
以 miRNA 和其他非编码 RNA 为靶点的治疗方法：最新进展
摘要：自发现第一个微小RNA（miRNA，miR）以来，人们对miRNA生物学的理解已大大扩展。miRNA参与并被描述为癌症主要特征的主要调节器，包括细胞分化、增殖、存活、细胞周期、侵袭和转移。实验数据表明，可以通过靶向miRNA表达来改变癌症表型，并且由于miRNA充当肿瘤抑制因子或致癌基因（oncomiR），它们已成为有吸引力的工具，更重要的是，成为癌症治疗药物开发的新靶点。通过使用miRNA模拟物或靶向miRNA的分子（即小分子抑制剂，如抗miRS），这些疗法在临床前环境中显示出良好的前景。一些以miRNA为靶向的疗法已扩展到临床开发，例如用于治疗癌症的miRNA-34模拟物。在这里，我们讨论了 miRNA 和其他非编码 RNA 在肿瘤发生和抗药性中的作用，并总结了一些最近成功的系统性递送方法以及 miRNA 作为抗癌药物开发靶标的最新进展。此外，我们还全面概述了临床试验中的模拟物和抑制剂，最后列出了基于 miRNA 的临床试验。
VMIX™平台：量身定制的miRNA基因疗法...
5 Van Zundert B. Neurosci Lett 2017; 636：32-9; 6 Bravo-Hernandez M. Nat Med 2020; 26：118–30。 缩写：ALS：肌萎缩性侧硬化；方差分析：方差分析； ATXN2：ataxin-2; BP：基对； FTD：额颞痴呆； IGV：综合基因组学观众； mRNA：Messenger RNA； mirna：microRNA； PBS：磷酸盐缓冲盐水； NT：核苷酸； NS：不重要； SD：标准偏差； SOD1：超氧化物歧化酶1； WT：野生类型的致谢和披露：这项研究由Aviadobio Ltd. CA，RE，AU，AG，AG，DO，LO，LO，ZW，YB，AA，AA，PH，SC，PC，PC，CM，RJ，JI，JI，JI和CS是Aviadobio Ltd.的员工和股东Aviadobio Ltd.是Aviadobio Ltd.的雇员。 根据国际医学杂志编辑委员会（ICMJE）的建议，作者符合作者身份标准。 医学写作和社论支持由英国Costello Medical的David Morgan和Oliver Palmer，BSC（荣誉），并由Aviadobio Ltd. RJ资助。 CA已从伦敦大学学院和惠康信托基金会获得赠款/合同。5 Van Zundert B. Neurosci Lett 2017; 636：32-9; 6 Bravo-Hernandez M. Nat Med 2020; 26：118–30。缩写：ALS：肌萎缩性侧硬化；方差分析：方差分析； ATXN2：ataxin-2; BP：基对； FTD：额颞痴呆； IGV：综合基因组学观众； mRNA：Messenger RNA； mirna：microRNA； PBS：磷酸盐缓冲盐水； NT：核苷酸； NS：不重要； SD：标准偏差； SOD1：超氧化物歧化酶1； WT：野生类型的致谢和披露：这项研究由Aviadobio Ltd. CA，RE，AU，AG，AG，DO，LO，LO，ZW，YB，AA，AA，PH，SC，PC，PC，CM，RJ，JI，JI，JI和CS是Aviadobio Ltd.的员工和股东Aviadobio Ltd.是Aviadobio Ltd.的雇员。根据国际医学杂志编辑委员会（ICMJE）的建议，作者符合作者身份标准。医学写作和社论支持由英国Costello Medical的David Morgan和Oliver Palmer，BSC（荣誉），并由Aviadobio Ltd. RJ资助。CA已从伦敦大学学院和惠康信托基金会获得赠款/合同。
miRNA- ...
miRNA感应指南RNAS ANTONIO GARCIA-GUERRA 1,2,3,4 *，CHAITRA SATHYAPRAKASH 5，OLIVIER G.DE JONG 6，WOOI F. LIM 2,4 Turberfield 1,3，Matthew J.A.木材2,4，Carlo Rinaldi 2,4 *。1。牛津大学牛津大学物理系，英国。2。牛津大学儿科学系，牛津大学，英国。 3。 卡夫利纳米科学研究所，牛津大学，多萝西·克劳特·霍奇金大楼，牛津，英国。 4。 发展和再生医学研究所（IDRM），IMS-Tetsuya Nakamura大楼，旧路校园，牛津，英国。 5。 国家神经科学研究所分子治疗系，国家牛津大学儿科学系，牛津大学，英国。3。卡夫利纳米科学研究所，牛津大学，多萝西·克劳特·霍奇金大楼，牛津，英国。4。发展和再生医学研究所（IDRM），IMS-Tetsuya Nakamura大楼，旧路校园，牛津，英国。5。国家神经科学研究所分子治疗系，国家
差异miRNA和蛋白质表达揭示了mir- ...
1圣约瑟夫医院Bochum，外科诊所，鲁尔 - 大学Bochum，Gudrunstr。56，44791 Bochum，德国； britta.majchrzak-stiller@ruhr-uni-bochum.de（B.M.-S.）; marie.buchholz-a7y@rub.de（M.B. ）; vanessa.mense@studmail.w-hs.de（v.m。 ）; johanna.strotmann@ruhr-uni-bochum.de（J.S. ）; ilka.peters@rub.de（i.p. ）; lea.skrzypczyk@klinikum-bochum.de（L.S. ）; waldemar.uhl@ruhr-uni-bochum.de（W.U. ）; chris.braumann@evk-ge.de（C.B. ）; philipp.hohn@ruhr-uni-bochum.de（P.H.） 2 Kirrberger Str。 100，66424德国霍姆堡； louise.massia@hotmail.fr（L.M.M. ）; Mathias.wagner@uks.eu（M.W。） 3大学医院Essen，桥梁肿瘤疗法研究所，西德肿瘤中心Essen，Hufelandstr。 55，45147德国埃森； sven-thorsten.liffers@uk-essen.de 4 Crbip，Pasteur Institut Pasteur，ÉparisUniversit，Cite，25 Rue du Roux Roux Roux Roux，75015，法国巴黎75015； fay.betsou@pasteur.fr 5 Ibbl（卢森堡的综合生物库），1，Lue Louis Rech，L-3555，L-3555 Dudelange，卢森堡； wim.ammerlaan@ibbl.lu 6 Sciomics GmbH，Karl-Landsteiner Str。 6，69151德国海德堡； ronny.schmidt@sciomics.de（R.S. ）; Christoph.schroeder@sciomics.de（C.S.） 7，Munckelstr大学Duisburg-Essen的Evk Gelsenkirchen将军，内脏和血管外科。 27，45879 Gelsenkirchen，德国 *通信：Fernado13984@yahoo.gr.gr†联合首先作者。 •共同延迟作者。56，44791 Bochum，德国； britta.majchrzak-stiller@ruhr-uni-bochum.de（B.M.-S.）; marie.buchholz-a7y@rub.de（M.B.）; vanessa.mense@studmail.w-hs.de（v.m。）; johanna.strotmann@ruhr-uni-bochum.de（J.S.）; ilka.peters@rub.de（i.p.）; lea.skrzypczyk@klinikum-bochum.de（L.S.）; waldemar.uhl@ruhr-uni-bochum.de（W.U.）; chris.braumann@evk-ge.de（C.B.）; philipp.hohn@ruhr-uni-bochum.de（P.H.）2 Kirrberger Str。 100，66424德国霍姆堡； louise.massia@hotmail.fr（L.M.M. ）; Mathias.wagner@uks.eu（M.W。） 3大学医院Essen，桥梁肿瘤疗法研究所，西德肿瘤中心Essen，Hufelandstr。 55，45147德国埃森； sven-thorsten.liffers@uk-essen.de 4 Crbip，Pasteur Institut Pasteur，ÉparisUniversit，Cite，25 Rue du Roux Roux Roux Roux，75015，法国巴黎75015； fay.betsou@pasteur.fr 5 Ibbl（卢森堡的综合生物库），1，Lue Louis Rech，L-3555，L-3555 Dudelange，卢森堡； wim.ammerlaan@ibbl.lu 6 Sciomics GmbH，Karl-Landsteiner Str。 6，69151德国海德堡； ronny.schmidt@sciomics.de（R.S. ）; Christoph.schroeder@sciomics.de（C.S.） 7，Munckelstr大学Duisburg-Essen的Evk Gelsenkirchen将军，内脏和血管外科。 27，45879 Gelsenkirchen，德国 *通信：Fernado13984@yahoo.gr.gr†联合首先作者。 •共同延迟作者。2 Kirrberger Str。100，66424德国霍姆堡； louise.massia@hotmail.fr（L.M.M.）; Mathias.wagner@uks.eu（M.W。）3大学医院Essen，桥梁肿瘤疗法研究所，西德肿瘤中心Essen，Hufelandstr。55，45147德国埃森； sven-thorsten.liffers@uk-essen.de 4 Crbip，Pasteur Institut Pasteur，ÉparisUniversit，Cite，25 Rue du Roux Roux Roux Roux，75015，法国巴黎75015； fay.betsou@pasteur.fr 5 Ibbl（卢森堡的综合生物库），1，Lue Louis Rech，L-3555，L-3555 Dudelange，卢森堡； wim.ammerlaan@ibbl.lu 6 Sciomics GmbH，Karl-Landsteiner Str。6，69151德国海德堡； ronny.schmidt@sciomics.de（R.S.）; Christoph.schroeder@sciomics.de（C.S.）7，Munckelstr大学Duisburg-Essen的Evk Gelsenkirchen将军，内脏和血管外科。27，45879 Gelsenkirchen，德国 *通信：Fernado13984@yahoo.gr.gr†联合首先作者。 •共同延迟作者。27，45879 Gelsenkirchen，德国 *通信：Fernado13984@yahoo.gr.gr†联合首先作者。•共同延迟作者。
通过自动化机器学习进行全面的血清 miRNA 测序，早期发现胰腺癌
背景：胰腺癌通常在晚期才被诊断出来，而早期诊断胰腺癌由于症状不典型且缺乏可用的生物标志物而十分困难。方法：我们对来自 14 家医院的 212 个胰腺癌患者样本和 213 个非癌性健康对照样本进行了全面的血清 miRNA 测序。我们将胰腺癌和对照样本随机分为两组：训练组 (N = 185) 和验证组 (N = 240)。我们创建了将自动机器学习与 100 种高表达 miRNA 及其与 CA19-9 的组合相结合的集成模型，并在独立验证组验证了模型的性能。结果：100 个高表达 miRNA 和 CA19-9 组合的诊断模型可以高精度区分胰腺癌和非癌症健康对照（曲线下面积 (AUC)，0.99；灵敏度，90%；特异性，98%）。我们在独立的无症状早期（0-I 期）胰腺癌队列中验证了高诊断准确性（AUC：0.97；灵敏度，67%；特异性，98%）。结论：我们证明 100 个高表达 miRNA 及其与 CA19-9 的组合可以作为胰腺癌特异性和早期检测的生物标志物。
为突触脑机界面投射轴突。
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