摘要 随着反向遗传操作平台的建立,柔嫩艾美耳球虫已成为研究原虫生物学和免疫学的宝贵模式生物。本文介绍了利用CRISPR(成簇的规律间隔的短回文重复序列)/Cas9(内切酶)系统对柔嫩艾美耳球虫进行高效基因编辑的应用,表明CRISPR/Cas9系统可通过一条向导RNA介导位点特异性的双链DNA断裂。利用该系统,我们成功地将红色荧光蛋白插入内源性微线体蛋白2(EtMic2)的C端,对其进行了标记。我们的研究结果将CRISPR/Cas9介导的基因改造系统的应用扩展到柔嫩艾美耳球虫,为针对性地研究顶复门寄生虫的基因功能开辟了一条新途径。
这项研究评估了饮食中的葡萄球菌酿酒酵母和酿酒酵母对疫苗接种的鸟类的免疫力,以疫苗接种了甲壳虫的鸟类和沙门氏菌。总共将105个男性柯布500个肉鸡分为四组:T1(接种疫苗,无补充,n = 30),T2(接种疫苗,S。Boulardii补充剂,n = 30),T3(接种疫苗,S。cerevisiae补充剂,补充剂,n = 30),n = 30)和T4(无疫苗接种,无补充,n = 15)。鸡接受玉米豆饮食,用1x10 7 cfu/g的s。boulardii或S. cerevisiae接受42天。通过间接ELISA和白细胞计数评估免疫反应。在21天后,两个补充组的IGY水平明显高于接种疫苗的对照(p <0.05)。S。boulardii补充增加了淋巴细胞(p = 0.003)和杂脂降低(p = 0.004),而酿酒酵母没有显着影响。在42天的酿酒酵母和boulardii组中,杂质/淋巴细胞比分别降低了23.4%和32.8%,在21天时没有变化。这些结果表明,Boulardii和S.酿酒酵母可以提高肉鸡的免疫力和整体健康状况。
fi g u r e 1脂质液滴:代谢,形态和组成。(a)主要代谢途径和中间代谢产物的简化方案参与LDS的生物发生和消耗。有关其他详细信息,请参见文本。fa,脂肪酸; FA-COA,酰基辅酶A; CPT1,肉碱棕榈转移酶I; CAC,柠檬酸周期; FASN,脂肪酸合酶; Oxphos,氧化磷酸化; ACC,乙酰辅酶A羧化酶; GPAT,甘油-3-磷酸酰基转移酶; AGPAT,1-酰基-SN-甘油-3-磷酸酰基转移酶; PAP,磷脂酸磷酸酶; DGAT,二甘油类酰基转移酶-1和-2; ACSL,酰基-COA合成酶; ATGL,脂肪甘油三酸酯脂肪酶; HSL,激素敏感脂肪酶; MAGL,单酰基甘油脂肪酶; NCEH,中性胆固醇酯水解酶。(b)内质网中发生的LD生物发生的示意图(ER)。酯化后,中性脂质积聚在ER双层中,形成透镜结构,该结构在ER双层内经过相位分离并成长为形成新生LD的细胞质。细胞质和ER蛋白被募集到LDS表面,促进其生长并萌芽到成熟的LDS中。附件蛋白在此过程中合作。在上面板(红色:TAG的化学结构)中说明了脂肪酸(FA)到三酰基甘油(TAG)中的酯化。(c)。用油酸处理肝HuH7细胞以诱导LD形成16小时(左图)。plin2(绿色)用特异性抗体定位,并用Lipidtox染色中性脂质。(n)表示细胞的核。箭头标记高放大倍数插图中的LD。THP-1细胞进行TEM分析(右图)。脂质液滴由它们的球形形态,相对较低的电子密度和通过单个磷脂单层界定。(d)代表LDS上主要蛋白质的简化方案。(e)该方案包含一些由病原体在宿主细胞中分泌的毒力因子操纵的LD蛋白(黑色)的例子(红色)(有关详细信息,请参见文本)。
线粒体是细胞内活性氧(ROS)产生的主要部位。ROS是重要的sig nalling分子,但产生过多会导致细胞损伤和功能障碍。因此,准确确定线粒体内产生ROS的何时,方式和地点至关重要。以前,ROS检测涉及各种化学探针和荧光蛋白。这些仅由于分子在线粒体基质中的积累而有局限性,或者需要为每个不同物种表达新蛋白质。我们报告动态H 2 O 2在所有线粒体子室内具有惊人空间分辨率的变化。我们将自标记蛋白的特定靶向与新型H 2 O 2-反应性探针相结合。该方法是宽范围且灵活的,具有相同的表达蛋白质可加载带有不同染料和传感器的蛋白质。它为其他化学物种(除了ROS之外的其他化学物种)提供了一个框架,其在线粒体内的DY NAMICS尚不清楚,而无需设计新蛋白质。
新墨西哥州立大学 2024 数学 401/530:量子信息数学 达尔豪斯大学 2023 CSCI 1300:计算机科学微积分 加州大学戴维斯分校 2019 MAT 16A:简易微积分 2018 MAT 21A:微积分 MAT 108:抽象数学简介 MAT 199:高级本科生特别研究 MAT 17B:生物和医学微积分 2017 MAT 21A:微积分 MAT 215A:拓扑学 MAT 21C:微积分 MAT 202:泛函分析 2016 MAT 147:拓扑学 MAT 16C:简易微积分 MAT 108:抽象数学简介 MAT 125A:实分析 2015 MAT 125A:实分析 加州大学伯克利分校 2007 MAT 53: 多元微积分
沙门氏菌感染可导致禽类肠道炎症与代谢紊乱,但花生四烯酸(ARA)代谢是否参与沙门氏菌引起的肠道炎症尚不明确。本试验利用16s rDNA测序和靶向代谢组学技术研究了感染鼠伤寒沙门氏菌的海南文昌鸡盲肠菌群和ARA代谢的变化。研究结果表明,文昌鸡感染鼠伤寒沙门氏菌后盲肠组织中ARA代谢产物含量升高,包括前列腺素E2(PGE 2 )、前列腺素F2α(PGF 2 α)、脂氧素A4(LXA4)、±8(9)-EET、±11(12)-EET和±8,9-DiHETrE。感染沙门氏菌后,鸡盲肠组织中ARA生成和代谢的关键酶(磷脂酶A2 PLA2和环氧合酶-2 COX-2)含量增加。感染后炎症因子的相对mRNA水平也增加,包括干扰素-γ(IFN-γ)、转化生长因子-β1(TGF-β1)、白细胞介素-4(IL-4)和白细胞介素-6(IL-6)。在HD11细胞中,使用环氧合酶(COX)抑制剂可降低沙门氏菌感染引起的COX-2和PGF 2α水平升高,并有效降低炎症反应。此外,文昌鸡感染鼠伤寒沙门氏菌后,盲肠中有益菌属(如双歧杆菌、乳酸杆菌、臭杆菌)的数量显著减少。本研究揭示了鼠伤寒沙门氏菌感染文昌鸡盲肠菌群的结构。此外,本研究还证实了鼠伤寒沙门氏菌激活ARA环氧合酶代谢途径,进而介导文昌鸡肠道炎症的发生。研究结果可为禽科沙门氏菌病的防控提供数据支持和理论支撑。
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细胞绘画近年来引起了人们的兴趣,因为它使研究人员能够捕捉到对各种扰动的细胞反应的全面图片。细胞绘画测定法使用六个污渍来标记DNA,细胞质RNA,核仁,肌动蛋白,高尔基体,质膜,内质网和线粒体。然而,“油漆”或染料的其他组合也是可能的,可以根据研究需求的方式可视化略有不同的细胞成分和过程。这样一个例子是fenovue™多晶体染色套件。该试剂盒允许DNA,脂质液滴,肌动蛋白,线粒体和溶酶体染色。及其溶酶体和脂质液滴标签该套件量身定制用于研究与
他的研究小组的研究成果发表在 500 多篇期刊论文上,包括《科学》、《自然》、《物理评论快报》、《应用物理快报》和《电子设备快报》。作为 APS 和 IEEE 的研究员,他曾获得 2012 年 ISCS 青年科学家奖、2014 年 MBE 青年科学家奖、2024 年 Art Gossard MBE 创新者奖以及业界研究奖,如 2012 年 IBM 教师奖和 2020 年英特尔杰出研究奖。他曾在多个国家中心担任领导职务,例如 ME Commons NITRIDER、SRC/DARPA JUMP 中心、DOE EFRC、NSF DMREF 和 NSF EFRI。他的研究工作获得了多项专利和两家衍生公司(Soctera、Gallox)。耶拿的录制讲座已被观看超过 250,000 次,他 2022 年编写的教科书《半导体材料和器件的量子物理学》已被多所大学用作本科生和研究生的课程。
微生物倾向于积聚在表面,形成诸如生物膜之类的聚集体,这使它们能够抵抗各种环境压力和抗菌剂。这种能力阻碍了对包括沙门氏菌在内的致病微生物引起的疾病的有效治疗,沙门氏菌是造成全球大量死亡的罪魁祸首。本研究旨在使用代谢组学方法比较肠炎沙门氏菌浮游细胞和固着细胞的代谢特征。用 LC/MS 方法分析从细菌细胞中提取的代谢物。使用 Thermo Xcalibur v 3.1 软件分析原始数据。对于数据处理,使用 XCMS 进行特征检测、保留时间、校正和对齐。通过 MetaboAnalyst 软件 v 6.0 中的单变量和多变量统计方法(PCA、PLS-DA、热图)分析数据矩阵。总共 121 种代谢物被推定为两种细菌状态之间的差异代谢特征,并且它们与它们相应的代谢途径相关。在浮游细胞中表现出正向调节的代谢物包括脯氨酸、苯丙氨酸,它们是必需代谢物的前体,也是应激适应机制的一部分。此外,腐胺和尸胺在生长、应激反应和细胞稳定性中起着至关重要的作用。相反,固着细胞中最具代表性的代谢物包括赖氨酸、腺苷、嘌呤、嘧啶和柠檬酸,主要与维持细胞稳态、应激反应和代谢调节有关。最后,通路富集分析确定了 11 条通路的代谢变化,主要涉及嘌呤和嘧啶代谢、精氨酸和脯氨酸代谢以及维生素 B6 代谢。这些发现有助于鉴定与肠炎沙门氏菌固着细胞生物膜形成有关的潜在代谢途径。