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PARG 敲除 MDA-MB-231 细胞系
描述 PARG 敲除 MDA-MB-231 细胞系是一种 MDA-MB-231 细胞系，其中人类 PARG（聚 ADP-核糖糖水解酶）长同工酶（PARG111、PARG102 和 PARG99）已使用 CRISPR/Cas9 基因组编辑从基因上去除，慢病毒编码 CRISPR/Cas9 基因和针对人类 PARG 的 sgRNA（单向导 RNA）。该细胞系已通过基因组测序和蛋白质印迹分析验证。背景聚（ADP-核糖）糖水解酶 (PARG) 是一种分解代谢酶，参与 PARylated 链的降解，释放 ADP-核糖和寡（ADP-核糖）链。 PAR（聚 ADP 核糖基化）稳态由 PAR 聚合酶 (PARP) 家族和 PARG 调节，以响应细胞应激条件，例如 DNA 损伤反应 (DDR)。PARG 活性与炎症、缺血、中风和癌症中的细胞反应有关。PARG 在乳腺癌中过度表达，与肿瘤生长和存活有关。PARG 活性降低可以增强当前癌症疗法（例如化疗和放疗）的效果，使 PARG 选择性抑制剂抑制成为癌症和免疫疗法中一种有前途的方法。MDA-MB-231 是一种源自乳腺腺癌的上皮细胞系，具有突变的 p53。它是 ER（雌激素受体）、HER2 和 E-钙粘蛋白阴性，用作晚期乳腺癌的模型。应用
甘肠蛋白作为免疫检查点受体的可溶性配体吗？
抽象背景卵巢癌是最致命的妇科恶性肿瘤，在标准疗法失败后治疗方案有限。尽管聚（ADP-核糖）聚合酶抑制剂的潜力在治疗DNA损伤反应（DDR）缺乏卵巢癌中，耐药性和免疫抑制的发展限制了其疗效，因此需要替代治疗策略。聚（ADP-核糖）糖醇酶（PARG）的抑制剂代表了一类新型抑制剂，目前正在临床前和临床研究中评估用于癌症治疗的抑制剂。Methods By using a PARG small-molecule inhibitor, COH34, and a cell-penetrating antibody targeting the PARG's catalytic domain, we investigated the effects of PARG inhibition on signal transducer and activator of transcription 3 (STAT3) in OVCAR8, PEO1, and Brca1 - null ID8 ovarian cancer cell lines, as well as in immune cells.我们检查了PARG抑制诱导的对Stat3磷酸化，核定位，靶基因表达和抗肿瘤免疫反应的影响，在患者衍生的肿瘤器官中以及免疫功能的BRCA1-NULL ID8卵巢小鼠模型中，与DDR缺乏人类高度污染的染色ovarian癌症相似。我们还测试了过表达组成型激活的STAT3突变体对COH34诱导的肿瘤细胞生长抑制的影响。结果我们的发现表明，PARG抑制通过卵巢癌细胞的去磷酸化下调了STAT3活性。重要的是，肿瘤细胞中组成型激活的STAT3突变体的过表达减弱了PARG抑制剂诱导的生长抑制作用。另外，PARG抑制可减少免疫细胞中的STAT3磷酸化，从而导致抗肿瘤免疫反应的激活，这在与卵巢癌患者肿瘤衍生的类器官和免疫功能型小鼠体内的免疫细胞中显示，体现了抗肿瘤的免疫反应。结论我们已经确定了通过阻止DDR在卵巢癌中的DDR，超出其主要抗肿瘤作用的新型抗肿瘤机制。
使用新型金属结合药效团与USP1，PARP，PARG和ATR抑制剂协同的Fen1核酸酶的小分子抑制剂
皮瓣核酸内切酶1（Fen1）是一种结构特异性的金属核酸酶，在复制和修复过程中切割5'DNA瓣。fen1是开发抗癌疗法的有吸引力的靶标，因为它在许多肿瘤类型中过表达，并且具有大量的合成致死性伴侣，包括同源重组基因（HR）途径（Mengwasser等，2019; Guo等，2020）。利用基于碎片的药物发现（FBDD）方法，我们确定了一种新型的金属结合药效团，该药效团与Fen1活性位点中的两个镁离子结合。使用碎片增长策略进一步阐述导致高度有效和选择性抑制剂。在生物化学测定中（分别为7 nm和460 nm的IC50），对FEN1的当前铅（BSM-1516）对FEN1的有效性比其相关酶外核酸酶1（EXO1）高65倍，与早期努力相比，改善了量的更大范围。fen1靶标在活细胞中的靶标参与通过细胞热偏移分析验证（CETSA
IDE161 是一种潜在的首创临床候选 PARG 抑制剂，选择性靶向具有复制压力和 DNA 修复脆弱性的实体肿瘤
A) 描绘了对 TOP1 和 PARG 双重抑制的拟议 MOA 的模型。B) 对 PRISM 化合物和 PARGi 的反应的 Spearman 相关图；橙色表示 TOP1 抑制剂，黑色表示其他。（插图）按 MOA 分组的顶级相关化合物的 Swarmplot（未显示少于 2 种化合物的 MOA）。拓扑异构酶抑制剂 (TOP)、法呢基转移酶 (FT)、微管蛋白聚合 (TP)、极光激酶 (AK)、胸苷酸合酶 (TS)。C) 使用 PAR MSD 测定法评估 PAR 链积累。值绘制为相对于 DMSO 对照的平均值 ± SD。使用 Student's t 检验进行统计分析；ns（不显著）、**（<0.01）、***（<0.001）。D）（左）使用基于抗 TOP1cc 抗体的免疫荧光测定法在指示时间点测量 TOP1-DNA 裂解复合物 (TOP1cc)。根据单个细胞中的 TOP1cc 平均强度值进行群体分箱和非线性曲线拟合。使用 Kruskal-Wallis 检验进行统计分析；****(<0.0001)。（右）使用基于抗 γ -H2AX 抗体的免疫荧光测定法检测核 γ -H2AX。值（平均值 ± SD）绘制为 γ -H2AX 平均强度范围的百分比群体。E）从 CldU 标记的 DNA 纤维测量结果显示，IDE161 和 CPT 介导的复制叉减慢。框表示中位数和 IQR。使用 Mann-Whitney U 检验进行统计分析；*(<0.05)，**** (<0.0001)。
PARG 缺陷的肿瘤细胞对 EXO1/FEN1 介导的 DNA 修复的依赖性增强
目前正在研究以聚（ADP-核糖）糖基水解酶 (PARG) 为靶点治疗各种癌症，但我们对导致癌细胞易受这种定制疗法影响的特定遗传弱点了解甚少。此外，识别此类弱点对于靶向 BRCA2；p53 缺陷型肿瘤很有意义，这些肿瘤通过 PARG 表达丧失而获得对聚（ADP-核糖）聚合酶抑制剂 (PARPi) 的耐药性。在这里，通过进行全基因组 CRISPR/Cas9 缺失筛选，我们识别出参与 DNA 修复的各种基因，这些基因对于 PARG；BRCA2；p53 缺陷型细胞的存活至关重要。特别是，我们的研究结果揭示了 EXO1 和 FEN1 是 PARG 缺失的主要合成致死相互作用因子。我们提供了证据表明，在 PARG；BRCA2；p53 缺陷细胞中，复制叉进展、DNA 单链断裂修复和冈崎片段处理受损，这些改变加剧了 EXO1/FEN1 抑制的效果，并在这种情况下变得致命。由于这种敏感性取决于 BRCA2 缺陷，我们建议在失去 PARG 活性的 PARPi 抗性肿瘤中靶向 EXO1/FEN1。此外，EXO1/FEN1 靶向可能是增强 PARG 抑制剂在同源重组缺陷肿瘤中效果的有效策略。
Tali Sarah Berman ElportTali Sarah Berman Elport
al parg 12。 。 oagl？Al Tvugra Tarah，我引用了我，2013年）。 /.t/tvin？在/b //////dd中出售exmedis malists的alval uaralalalalalalalalalalalalalalalalalalalalalalalalalalalalalalalalalalalalalal。
靶向PARG通过减少卵巢癌的磷酸化STAT3诱导肿瘤细胞生长抑制和抗肿瘤免疫反应
抽象背景将免疫检查点抑制剂（ICI）与化疗相结合已成为缺乏驱动器基因突变的非小细胞肺癌（NSCLC）患者的标准治疗方法。可靠的生物标志物对于预测治疗结果至关重要。来自各种癌症的新兴证据表明，对血清代谢产物的早期评估可以作为预测结果的宝贵生物标志物。本研究旨在鉴定与经过一线或二线治疗患者的治疗结果相关的代谢产物，并使用程序性细胞死亡1（PD-1）抑制剂加化学疗法。方法200患者接受一线或二线PD-1抑制剂加化疗，50例接受一线化学疗法的患者参加了这项研究。将200例接受联合治疗的患者分为发现集（n = 50）和验证集（n = 150）。基于无进展的生存PFS标准（PFS≥12和PFS <12个月），将这些集合进一步分为响应和非回答组。血清样品，以进行未靶向的代谢组学分析，目的是鉴定和验证可以预测免疫疗法和化学疗法的功效的生物标志物。此外，经过验证的代谢产物根据其中位数分为高和低类别，并使用COX回归模型在接受联合治疗的患者中分析了与PFS的关系。值得注意的是，在预后较差的该组中观察到了这两种代谢产物的上调。在化学疗法影响后的结果是，在发现和验证集中都确定了两个显着的差异代谢产物：N-（3-吲哚基乙酰基）-L-丙氨酸和甲烷基（VIP> 1和P <0.05）。在对PFS的单变量分析中，较低水平的N-（3-吲哚基乙酰基）-L-丙氨酸与较长的PFS相关（HR = 0.59，95％CI，0.41至0.41至0.84，P = 0.003），延长的PF和延长的PF表示，甲基含量较低（HR = 0.96）0.96. HR = 0.67，95％，95％，95％，95％，95％，95％，95％，95％，95％，95％，95％，含量p = 0.029）。在PFS的多元分析中，较低水平的N-（3-吲哚基乙酰基）-L-丙氨酸与较长的PFS显着相关（HR = 0.60、95％CI，0.37至0.98，p = 0.041）。
生物物理学和分子生物学的进展
poly（ADP-核糖基）在维持基因组稳定性方面具有中心功能，包括促进DNA复制和修复。在癌细胞中，这些过程经常被破坏，因此干扰聚（ADP-核糖基）ation会加剧固有的基因组不稳定性并诱导选择性的细胞毒性。的确，基于同源重组的缺陷，聚（ADP-核糖）聚合酶（PARP）的抑制剂对治疗BRCA-突变卵巢癌的女性具有重大临床影响。然而，只有大约一半的卵巢癌在同源重组中存在缺陷，并且大多数敏感的肿瘤最终通过治疗获得了PARP抑制剂耐药性。因此，需要制定替代治疗策略，以靶向具有固有和获得抗性的PARP抑制的肿瘤。已经描述了多种新型聚（ADP-核糖）糖醇（PARG）的新型抑制剂，并在体外具有有希望的抗癌活性，与PARP抑制剂不同。在这里，我们讨论了聚（ADP-核糖基）在基因组稳定性中的作用，以及将PARG抑制剂作为PARP抑制剂治疗卵巢癌的互补策略的潜力。©2021 Elsevier Ltd.保留所有权利。
发现RNA ADP核糖基化逆转酶揭示了可能针对有毒攻击的防御模块
摘要核酸ADP-核糖基化及其在催化和水解中的杂化酶在生命的所有王国中都普遍存在。然而，目前不Xpleder Xpled ，其在哺乳动物和细菌pH y生物学中的作用包括 - 植物间冲突。 R ecently, se v eral e xamples of enzymatic sy stems f or RNA ADP-ribosylation ha v e been identified, sho wing that all major types of RNA species, including messenger RNA, ribosomal RNA, and transfer RNA, can be targeted by ADP -ribosyltransf erases (ARTs) whic h at tac h ADP-ribose modifications either to nucle- obases, the backbone核糖或磷酸盐末端。 对于属于宏观域，ARH或Nadar Superf Amilies的RNA ADP-核糖基化的可抗性知之甚少。 在这里，我们表征了ADP-核糖基y drolase对RNA物种ADP-核糖基化的drolytic活性。 我们证明了Nadar ADP-核糖基Y drolase是唯一能够在磷酸末端RNA ADP-核糖基上不活跃的同时，唯一能够对鸟氨酸RNA RNA碱基ADP-核糖基化。 此外，我们揭示了含宏域的PARG酶是唯一具有具有2'-H y DRO Xyl Xyl Xyl Xyl Xyl Xyl Xyl rNA ADP-核糖基催化催化催化sed b y pseudomonAsAsAsAsuginosa效应的特定和有效性的Drolase类型。 moreo ver，使用Rhsp2 /细菌作为e茎，我们证明了par g酶可以作为对抗Xins抗菌RNA-T的保护性免疫酶的作用。，其在哺乳动物和细菌pH y生物学中的作用包括 - 植物间冲突。R ecently, se v eral e xamples of enzymatic sy stems f or RNA ADP-ribosylation ha v e been identified, sho wing that all major types of RNA species, including messenger RNA, ribosomal RNA, and transfer RNA, can be targeted by ADP -ribosyltransf erases (ARTs) whic h at tac h ADP-ribose modifications either to nucle- obases, the backbone核糖或磷酸盐末端。对于属于宏观域，ARH或Nadar Superf Amilies的RNA ADP-核糖基化的可抗性知之甚少。在这里，我们表征了ADP-核糖基y drolase对RNA物种ADP-核糖基化的drolytic活性。我们证明了Nadar ADP-核糖基Y drolase是唯一能够在磷酸末端RNA ADP-核糖基上不活跃的同时，唯一能够对鸟氨酸RNA RNA碱基ADP-核糖基化。此外，我们揭示了含宏域的PARG酶是唯一具有具有2'-H y DRO Xyl Xyl Xyl Xyl Xyl Xyl Xyl rNA ADP-核糖基催化催化催化sed b y pseudomonAsAsAsAsuginosa效应的特定和有效性的Drolase类型。moreo ver，使用Rhsp2 /细菌作为e茎，我们证明了par g酶可以作为对抗Xins抗菌RNA-T的保护性免疫酶的作用。
靶向 Clp 蛋白酶的 BacPROTAC：一种有前途的抗分枝杆菌药物研发策略
两千年来，结核病 (TB) 夺走的生命比世界上任何其他传染病都要多。2021 年，世界卫生组织 (WHO) 估计有 1060 万人被诊断出患有结核病，导致 140 万 HIV 阴性患者死亡。耐多药结核病 (MDR-TB)（定义为至少对利福平 (RIF) 和异烟肼 (INH) 具有耐药性）和广泛耐药结核病 (XDR-TB) 的出现是未来几年要克服的主要挑战。我们最近对该领域的投资和研究工作进行了广泛的分析，总体目标是到 2030 年实现消除结核病的既定里程碑。在过去几年中，在将多种有前景的化合物推进到临床开发阶段方面取得了显着进展，每种化合物都具有不同的作用机制。但值得注意的是，已经出现了对目前某些抗结核药物产生耐药性的分枝杆菌菌株。创新的蛋白水解靶标嵌合体 (PROTACs) 蛋白质降解方法的探索已成为发现新型抗菌药物的可行途径。虽然泛素系统是真核细胞独有的，但某些细菌使用类似的降解系统，该系统依赖于 ClpC:ClpP (ClpCP) 蛋白酶对磷酸化精氨酸残基 (pArg) 的识别，从而导致蛋白质降解。在这篇评论文章中，我们描述和分析了利用细菌蛋白水解机制 (BacPROTACs) 的 PROTACs 设计新型抗结核药物的进展。范围声明。由于耐药菌株的出现，开发用于治疗结核病的新型药物被认为迫切需要。在此背景下，引进能够减轻疾病并实现世界卫生组织所概述的目标的新技术势在必行。在创新策略中，降解对杆菌生存至关重要的蛋白质有望产生新药物，特别是那些对治疗潜伏（非复制性）结核分枝杆菌有效的药物。从这个角度来看，我们介绍了结核分枝杆菌治疗领域取得的进展和遇到的障碍