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饱和基因组编辑解决了致病性 VHL 等位基因的功能谱
。CC-BY 4.0 国际许可证下可用（未经同行评审认证）是作者/资助者，他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者此版本于 2023 年 6 月 10 日发布。；https://doi.org/10.1101/2023.06.10.542698 doi：bioRxiv 预印本
医院废水作为致病微生物的热点扩散到水生环境中：评论
结合人类对人类的接触，通过气溶胶和粪便传播SARS-COV-2病毒的潜力提高了有效治疗医院废水（HWW）的紧迫性，这已被认为是传播到水生环境中的致病微生物的重要来源。但是，很少有评论讨论医院废水矩阵中病原体的存在和去除。本综述总结了医院废水中存在的细菌，真菌，病毒和寄生虫在内的致病微生物，相关疾病和治疗过程。此外，还审查了医院废水处理过程中病原体的去除，包括初步过程，次要过程和第三过程。由于人们对当前全球大流行对医院废水处理过程的影响的影响越来越大，因此需要进一步的研究来研究医院废水中病原体的实际命运并优化消毒过程。
针对单碱基编辑的致病变异的基因组规模分析
方法：使用 ClinVar 数据库 (GRCh37_clinvar_20171203) 搜索和选择可用于当前单碱基编辑系统的突变。我们仅纳入致病和可能致病的变异以供进一步分析。对于每一个可能可编辑的突变，我们检查 PAM 的存在。如果发现 PAM，我们会分析序列以找到只编辑一个核苷酸而不改变相邻核苷酸的可能性。用于搜索 Clinvar 数据库和分析序列的脚本代码是用 R 编写的，可在附录中找到。结果：我们分析了目前在 9 篇出版物中报道的 21 个编辑系统。每个系统都有不同的工作特性，例如编辑窗口和 PAM 序列。C > T 碱基编辑器可以精确定位 3196 个突变（占所有致病 T > C 变异的 46%），A > G 编辑器可以精确定位 6900 个突变（占所有致病 G > A 变异的 34%）。
针对数千种人类致病变异的 CRISPR 主编辑器的自动设计
1. 纽约基因组中心，纽约州纽约市，美国。2. 纽约大学生物学系，纽约州纽约市，美国。† 这些作者贡献相同。 * 电子邮件：neville@sanjanalab.org 关键词：Prime 编辑、CRISPR、致病变异、ClinVar、人类遗传变异
在致病性变形虫中控制泛素样蛋白下的繁殖和应力反应
1 POITIERS，国家科学研究中心UMR7267，《互动生态与生物学实验室》，TSA51106，86073 POITIERS，法国2学院2帕斯德研究所，生物图像分析单元，国家科学研究中心UMR3691，ParisCité大学，国家科学研究中心elisabeth.labruyere@pastteur.fr（E.L。）; jean-christophe.olivo-marin@pastteur.fr（J.-C.O.-M。）3 Pasteur，蛋白质组学核心设施，生物学质谱单元质谱单元，国家科学中心，2024年2024年，巴黎大学Cité大学，法国75015 Paris，法国，法国，法国75015 Paris； Mariette.matondo@pastteur.fr 4国家科学研究中心药理学与结构生物学研究所UMR 5089，图卢兹大学IIIII-PAUL SABATIER，法国31077，法国图卢兹； Marie.locard-paulet@ipbs.fr 5 Proteomique Profi的国家基础设施-FR2048，2048法国Toulouse 6 C. nguillen@pastteur.fr（n.g。）;这样的。： +33-（0）549454013（A.S.-L。）; +33-（0）145688675（N.G.）
CRISPR Prime编辑的自动设计，用于56,000人的病原变体 使用优化的CAS9在病原体中使用的简短同源指导修复，Neoformans可以实现快速的基因缺失和标记 BBB捆绑包 - 与父母交谈 b'' 小胶质细胞：神经回路的活动依赖性调节剂 微型无线神经界面：教程 认知大脑的两个观点 孕产妇虐待：与后代大脑体积和白质连接性的关联 新生儿皮质表面的功能性分割 2025年脑蜂脑科学活动知识大纲 心脏研究所的2025年年度超声心动图和... rwmpc+2025+call+for+prograted+Talks.pdf Levidian的循环技术将在世界上的一个... 中播放 spar3d：来自单个图像的3D对象的稳定点感知重建 1。来自一个月TB006治疗方案的TOPLINE数据... 遗传综合征的基因治疗 七个原始问题 探索Go Gryptography
摘要Prime Editor（PES）是定期间隔的短篇小说重复序列（CRISPR）基于基于基于）的基因组工程工具，可以引入精确的基本配置编辑。我们开发了一条自动管道，以纠正（治疗性编辑）或引入（疾病建模）人类的致病变异，该变异能够阐明主要编辑所需的几种RNA构建体的设计，并避免了人类基因组中预测的非目标。但是，使用最佳的PE设计标准，我们发现只有一小部分这些致病性变体才能得到焦油。通过使用替代CAS9酶和扩展模板，我们将可靶向的病原变体的数量从32,000增加到56,000个变体，并使这些预先设计的PE构建体可通过基于Web的门户（http://primeedit.nygenome.org）访问。鉴于具有治疗基因编辑的巨大潜力，我们还评估了开发通用PE构建体的可能性，发现常见遗传变异仅影响少数少数设计的PE。
社论：致病微生物组研究中的机器学习和深度学习应用
人工智能已经建立了深度学习（DL）的扎实基础，尤其是在引入变压器体系结构的过程中，该体系结构引起了多个学科的研究人员的广泛关注。机器学习（ML）和DL，是人工智能的分支，已经越来越多地改变了各种领域的研究。一个区域受到的影响特别是微生物学（Obermeyer和Emanuel，2016年）。特别是微生物和传染病的复杂性和多样性使它们成为新型ML和DL技术的理想候选者。在此研究主题中，标题为“致病微生物组研究中的机器学习和深度学习应用”，我们收集了11种手稿的集合，这些手稿体现了ML和DL在致病微生物组研究领域的应用。这些收集的手稿主要是原始文章，可提供了解如何使用ML和DL来进一步了解致病微生物组的研究。目前，ML广泛用于预测模型的开发（Collins and Moon，2019年）。通过将ML或DL方法与预测模型相结合，本研究主题中的手稿强调了跨学科整合在理解与致病微生物组相关的疾病中的重要性，并促进了更好的健康以及人类和生态系统的健康。在这个研究主题中，Shao等。在迷你审查中探讨了致病性微生物与各种骨科条件之间的复杂相互作用，“探索致病微生物组在骨科疾病中的影响：机器学习和深度学习方法”。通过分析微生物群的数据集以及与宿主的相互作用，它们突出了ML和DL如何增强对骨质疏松和关节炎等疾病的理解，诊断和治疗。
视网膜神经节细胞在阿尔茨海默氏病中对致病性tau的脆弱性
。cc-by-nc 4.0国际许可（未获得同行评审证明），他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人，该版本于2024年9月21日发布。 https://doi.org/10.1101/2024.09.17.613293 doi：biorxiv Preprint
