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适应性表型调节导致慢性粒细胞白血病细胞产生治疗耐药性
酪氨酸激酶抑制剂 (TKI) 耐药性是慢性粒细胞白血病 (CML) 的主要问题。我们在选择性伊马替尼-甲磺酸盐压力下产生了 TKI 耐药的 K562 亚群 K562-IR。K562-IR 细胞是 CD34 - /CD38 - 、BCR-Abl 非依赖性的，增殖缓慢，高度粘附并形成完整的肿瘤球体。CD45 和其他造血标志物的缺失表明这些细胞已脱离其造血起源。CD34 阴性，E-cadherin 和 CD44 高表达；CD45 和 β -catenin 水平降低与白血病干细胞 (LSC) 表型不完全一致。表达分析表明 K562-IR 细胞差异表达组织/器官发育和分化基因。我们的数据表明，观察到的表型转变是一个适应性过程，使 TKI 应激下的细胞变得不依赖致癌基因。细胞发展转录不稳定性以寻找适合新环境压力的基因表达框架，从而导致适应性表型转变，其中某些细胞部分表现出 LSC 样特性。随着白血病/癌症干细胞靶向疗法的进行，治疗实体和一系列动态细胞状态之间的差异将对结果产生决定性影响。
研究论文在2型糖尿病小鼠中的骨质疏松症的整合表型和转录组分析
1。西北大学生命科学学院，西安，Shaanxi 710069，中国。 2。 国家颌面重建和再生的国家主要实验室，国家口腔疾病临床研究中心，Shaanxi International International International口腔疾病联合研究中心，纸巾工程中心，口腔学院，第四届军事医学院，第四届军事医学院，XI'AN，Shaanxi 710032，中国。 3。 XI'AN的主要细胞和再生医学主要实验室，西北理工大学医学研究所，XI'AN，Shaanxi 710072，中国。 4。 牙齿牙科学院牙本质学院，第四届军事医科大学，西安克斯，Shaanxi 710032，中国。 5。 中国第四届军事医科大学的口腔植入学系，口腔植入学院，中国西安克西710032。 6。 中国北京100039北京中国PLA综合医院第一医疗中心的口腔学系。 7。 中国西部的资源生物学和生物技术的主要实验室，西北大学医学院，西安，西安克斯，Shaanxi 710069，中国。 8。 基础医学院，Shaanxi TCM物理宪法研究的关键研究实验室，预防与治疗，Shaanxi中医大学，Xianyang，Shaanxi 712046，中国。 9。 中医系，第四届军事医科大学第一家附属医院，中国西安克斯710032。西北大学生命科学学院，西安，Shaanxi 710069，中国。2。国家颌面重建和再生的国家主要实验室，国家口腔疾病临床研究中心，Shaanxi International International International口腔疾病联合研究中心，纸巾工程中心，口腔学院，第四届军事医学院，第四届军事医学院，XI'AN，Shaanxi 710032，中国。3。XI'AN的主要细胞和再生医学主要实验室，西北理工大学医学研究所，XI'AN，Shaanxi 710072，中国。 4。 牙齿牙科学院牙本质学院，第四届军事医科大学，西安克斯，Shaanxi 710032，中国。 5。 中国第四届军事医科大学的口腔植入学系，口腔植入学院，中国西安克西710032。 6。 中国北京100039北京中国PLA综合医院第一医疗中心的口腔学系。 7。 中国西部的资源生物学和生物技术的主要实验室，西北大学医学院，西安，西安克斯，Shaanxi 710069，中国。 8。 基础医学院，Shaanxi TCM物理宪法研究的关键研究实验室，预防与治疗，Shaanxi中医大学，Xianyang，Shaanxi 712046，中国。 9。 中医系，第四届军事医科大学第一家附属医院，中国西安克斯710032。XI'AN的主要细胞和再生医学主要实验室，西北理工大学医学研究所，XI'AN，Shaanxi 710072，中国。4。牙齿牙科学院牙本质学院，第四届军事医科大学，西安克斯，Shaanxi 710032，中国。5。中国第四届军事医科大学的口腔植入学系，口腔植入学院，中国西安克西710032。6。中国北京100039北京中国PLA综合医院第一医疗中心的口腔学系。7。中国西部的资源生物学和生物技术的主要实验室，西北大学医学院，西安，西安克斯，Shaanxi 710069，中国。8。基础医学院，Shaanxi TCM物理宪法研究的关键研究实验室，预防与治疗，Shaanxi中医大学，Xianyang，Shaanxi 712046，中国。9。中医系，第四届军事医科大学第一家附属医院，中国西安克斯710032。
蘑菇形成真菌菌株之间的高表型和基因型可塑性
schizophyllum cumine是一种蘑菇形成的真菌，以其独特的结实物体具有分裂的g。它被用作研究蘑菇发育，木质纤维素降解和交配类型基因座的模型生物。这是一种高变量物种，菌株之间具有相当大的遗传和表型多样性。在这项研究中，我们系统地表现出16种硫化菌株，用于蘑菇发育方面和木质纤维素降解的18个单被子菌株。有关这些表型的菌株之间存在相当大的异质性。大多数菌株发展出具有不同形态的蘑菇，尽管有些菌株仅在经过测试的条件下营养生长。各种碳源上的生长显示出特异性特异性曲线。对七个单因子菌株的基因组进行了测序，并与六个前发表的基因组序列进行了分析。此外，对相关的物种进行了schizophyllum fasciatum。尽管基因组组件之间存在很大的遗传变异，但与蘑菇形成和木质纤维素降解有关的基因得到了很好的保守。这些测序的基因组与高表型多样性相结合，将为S. comuncom菌株的功能基因组学分析提供扎实的基础。
联合基因型和表型结果建模改进了碱基编辑变异效应的量化
是作者/资助者，已授予 medRxiv 永久展示预印本的许可。 （未经同行评审认证）预印本此版本的版权持有者于 2023 年 9 月 10 日发布。；https://doi.org/10.1101/2023.09.08.23295253 doi：medRxiv 预印本
微流体患者的单个活循环肿瘤细胞的遗传和表型分析
免疫检查点抑制剂，例如PD -1/ PD -L1抑制剂进行免疫疗法，现在被认为是实体瘤最有前途的治疗方式之一。然而，基于肿瘤组织中PD -L1表达的临床疗效预测目前不精确，并且缺乏实现时间监测的能力。在这里，我们描述了一种独特的纳米植物，用于原位的PD -L1 RNA表达表达，与体外细胞行为分析相结合，以更好地预测患者癌症治疗的疗效。通过使用5 mL的血液样本，该系统产生分析输出，合并后，提供了一个指数，与传统活检相比，可以对患者的预测进行定量，更准确地预测患者的结局。
扩展了由CDR和NACC FTLD评估的表型光谱在遗传额颞痴呆中
注意：年龄，教育，MMSE，FRS和临床评级量表得分显示为平均值（标准偏差）。请注意，FRS可在440个突变载体（187 C9orf72，178 GRN，75 MAPT）和252个对照中使用。与对照组相比，使用线性回归，与对照组相比，BOLD项目与对照组有显着不同（斜体化项目的差异明显较小），而对照组，突变组之间的逻辑回归以及性别差异的卡方（p <0.005）。其他差异显示为：与C9ORF72相比，明显受损/年轻/更多的男性； B与GRN相比，B明显受损/年轻；或与MAPT突变载体相比，C大大受损/较少的教育年份。缩写：CDR Plus NACC FTLD；临床痴呆评级痴呆症分期仪器加上国家阿尔茨海默氏症的协调中心行为和语言领域； FRS，ftd评级量表GRN，progranulin; MAPT，微管相关蛋白Tau； MMSE，小型国家考试。
汇集表型 CRISPR 筛选能够识别用于癌症治疗的协同药物组合。
图 1：CRISPR 死亡筛选设置。在死亡细胞群中确定 sgRNA 丰度，从而可以识别在泛 PI3K 抑制剂 GDC-0941 存在下诱导细胞死亡的 sgRNA，并可以识别适合联合治疗的靶标。
使用表型、结构和功能 MRI 数据增强自闭症谱系障碍的诊断
模型 3 分类器使用深度学习方法来预测目标类别。图像的目标大小为 190 x 190。每幅图像乘以因子 1/255，因此像素值在 [0, 1] 范围内。该模型的架构由 2D-CNN 模型的所有层组成，除了密集层。在训练之前，所有来自卷积的层都不可训练。它有两个密集层，每个层有 120 个单元，后面跟着一个 S 形层。采用 Adam 优化器，损失函数为二元交叉熵。模型 3 的架构如图 3 所示。
302种绿豆种质资源的种子表型特征的遗传多样性分析
摘要：由于维生素，蛋白质，矿物质元素和活性物质丰富，因此已证明绿豆种子的高药和经济价值被证明对人有益。为了完全识别出优质种质资源的绿豆产量和质量育种的优质种质资源，通过多样性分析，相关性分析，主成分分析（PCA）和群集分析，对八个种子表型特征的遗传多样性水平进行了全面评估。结果表明，八个种子表型性状的遗传多样性具有302个绿豆种质资源，其香农多样性指数范围为0.25至2.09。对于大多数特征，它们的变异系数（CV）超过10％，最高为种子形状（41.51％）。相关分析表明，100种子的重量与种子大小，种子长度，种子宽度和种子厚度具有极为正相关的相关性。PCA表明，前三个主要成分的累积贡献率为78.551％。这些主要成分包括种子宽度，种子外套和种子颜色。通过群集分析将302个绿豆种质资源分为八组。从I组和II组中选择了共有140种具有大种子的种质资源，其中II组中的9种种质资源可能是高收益的品种。关键词：绿豆，种子表型特征，遗传多样性，聚类分析，主要成分。总体而言，这项研究不仅表明研究的种质资源之间有足够的差异，而且还为绿豆种质资源的选择，利用和杂交育种提供了理论基础。
PRESTIGIO 登记处登记的多重耐药 HIV-1 患者对多拉韦林的残留表型敏感性
请以以下方式引用本文：Francesco SALADINI、Federica Giammarino、Franco Maggiolo、Micol Ferrara、Giovanni Cenderello、Benedetto M. Celesia、Ferdinando Martellotta、Vincenzo Spagnuolo、Giulio M. Corbelli、Nicola Gianotti、Maria M. Santoro、Stefano Rusconi、Maurizio Zazzi、Antonella Castagna，来自 PRESTIGIO 登记处受试者的多药耐药 HIV-1 对多拉韦林的残留表型敏感性，国际抗菌剂杂志 (2023)，doi：https://doi.org/10.1016/j.ijantimicag.2023.106737