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减少 pegRNA 内固有的自抑制相互作用可提高主要编辑效率
Prime 编辑系统能够在不引入双链断裂的情况下在基因组内进行精确编辑。先前的研究根据序列组成定义了 pegRNA 的最佳引物结合位点 (PBS) 长度约为 13 个核苷酸。然而，最佳 PBS 长度表征是基于使用质粒或慢病毒表达系统的 Prime 编辑结果。在本研究中，我们证明，对于 Prime 编辑器 (PE) 核糖核蛋白复合物，PBS 和间隔序列之间的自抑制相互作用会影响 pegRNA 结合效率和靶标识别。通过降低 PBS-间隔区之间的互补性来破坏这种自抑制相互作用可提高多种 Prime 编辑格式中的 Prime 编辑效率。对于末端保护的 pegRNA，在哺乳动物细胞中，较短的 PBS 长度且 PBS-靶标链熔化温度接近 37 ◦ C 是最佳的。此外，在 PE-pegRNA 递送后对细胞进行短暂冷休克处理可进一步提高具有优化 PBS 长度的 pegRNA 的 prime 编辑结果。最后，我们表明使用这些改进的参数设计的 pegR-NA 编程的 prime 编辑器核糖核酸蛋白复合物可有效纠正患者来源的成纤维细胞中的疾病相关基因突变，并有效地在原代人类 T 细胞和斑马鱼中安装精确编辑。
化疗引起的毒性：成像入门
化疗一直是治疗恶性肿瘤的一种长期选择。近年来，传统的癌症治疗已转向精准医疗，新的化疗药物针对肿瘤特定的基因或分子特征，以减少治疗副作用并最终提高治疗效果。2019 年冠状病毒病 (COVID-19) 大流行导致加拿大癌症治疗的交付严重延迟。随着疫苗接种运动在全球范围内持续获得支持以及随之而来的恢复正常，未来几个月许多患者将被诊断出患有癌症并开始接受治疗。因此，我们预计放射科医生遇到化疗相关毒性的概率将高于过去几年。本综述的目的是为普通放射科医生提供有关化疗引起的毒性的各种影像学表现的统一资源。
在农业供应链中使用区块链
供应链已经成为世界经济的基础，为社会和行业带来了各种好处，并且可以在几乎所有市场，在它们运营的领域中使用，通常包括从原材料到产品交付的所有流程和活动。特定的供应链可以合并各种实体，例如运营商，供应商，工厂和配送中心。越来越多的人想知道他们消耗的东西的起源，如何处理和制造。供应链被带到了极限，并感到需要增长和不断管理。符合这些需求，公司试图使用最好，最先进的技术，以确保它们的安全性，管理和信誉。区块链超越加密硬币，成为许多具有巨大潜力的领域的最新技术。您的操作方式与供应链完全吻合，而不论该部门如何。这项工作旨在概念化区块链及其运营，讨论应用于农业供应链的优势和挑战以及实施中的挑战。
一个具有零排放的新过程，用于真正的生物降解...评估环境DNA的五个引物对...
作者格式，未经同行评审的文档发布于2023年3月31日。doi：https：//doi.org/10.3897/arphapreprints.e104185
表Si.定量RT-PCR的序列序列。
a，siRNA名称/方向序列atp6v1b1_＃1 sense 5' - gacaacuucgccaucgucu-3'反义5'-agacgauggcgaaguugu -3'atp6v1b1_＃2 ′ B, qPCR primers Gene/direction Sequence ATP6V1B1 Fw 5 ′ -CAGCAGGCTCAGACACTGG-3 ′ Rev 5 ′ -CCCAGGCCTGCTGTCTATCTC-3 ′ Cyclin D1 Fw 5 ′ -CCGTCCATGCGGAAGATC-3 ′ Rev 5 ′ -ATGGCCAGCGGGAAGAC-3 ′ p21 Fw 5 ′ -AGTCAGTTCCTTGTGGAGCC-3 ′ Rev 5 ′ -CATTAGCGCATCACAGTCGC-3 ′ GAPDH Fw 5 ′ -AGAAGGCTGGGGCTCATTTG-3 ′ Rev 5 ′ -AGGGGCCATCCACAGTCTTC-3 ′ AccuTarget Negative Control siRNAs, catalogue no.SN-1013（Bioneer Corporation）。fw，前进； REV，反向； siRNA，小干扰RNA； ATP6V1B1，ATPase H+运输V1亚基B1。
肿瘤类器官用于研究胃食管癌：入门指南
胃食管癌是癌症死亡的主要原因。尽管我们开始识别特定的可靶向基因突变和途径，但我们采用基于分子的治疗方法的尝试进展缓慢且无效。显然，我们不应再将所有胃食管癌视为同质性疾病，而这正是我们使用非特异性化疗时所做的。然而，我们目前无法监测成功的基因/途径靶向，也无法了解肿瘤如何/何时产生耐药性，也无法预测哪些患者将获得最大益处。为了改善结果，我们必须精确地详细描述这些肿瘤的异质性，然后个性化癌症治疗，并开发新途径来研究和预测个体患者的治疗效果。为此，患者衍生的类器官（其中来自个体患者的肿瘤细胞在培养皿中生长）是一种新的多功能系统，可及时扩展、详细分子表征和基因操作，并有望实现对治疗反应的预测性评估。在这篇综述中，我们将探索类器官生成的发展和基本技术，并讨论这项激动人心的技术在研究致癌基础科学和预测/指导临床癌症患者护理中的当前和未来潜在应用。
RCAD-LTH-SHPD-L1，一种具有增强抗肿瘤免疫力的双基因重组癌腺病毒，可增加淋巴细胞浸润并重塑肿瘤微环境
使用简单的外周血样本来早期诊断癌症，获取有关肿瘤基因组特征的信息，并预测预后和对治疗的反应可能性，使研究人员和临床医生多年来着迷。从周围血液或癌症患者的其他体液中分离和分析循环肿瘤DNA（CTDNA）的技术的改进正在转化在临床上相关的诊断方法中的这一引人入胜的假设。液体活检在肿瘤药物开发和临床护理中的应用不断扩大。液体活检在肿瘤学中的第一次临床应用是检测EGFR突变非小细胞肺癌（NSCLC）患者中的抗性突变。1 CTDNA测试目前被认为是任何肿瘤类型的肿瘤基因组分析的替代方法。2在患有晚期癌症患者中，CTDNA的存在是公认的负预后因素。3同样，ctDNA的动力学确实与对任何类型的全身疗法的反应（即，靶向治疗，化学疗法和免疫疗法）相关。3–5重要的是，液体活检的应用现在正朝着疾病的早期阶段迈进，从早期诊断到在接受原发性肿瘤手术切除的患者中对最小残留疾病（MRD）的鉴定。美国FDA的Vellanki等人6的评论文章以准确，详细的方式描述了液体活检在精确肿瘤学领域的可能应用。更重要的是，作者强调了从研究仅研究CTDNA测试的应用到临床实践所需的进一步证据，甚至可能将其用作临床试验的早期终点。后一种方法的阀门对于加速新药的批准至关重要。
主要编辑应用的最新进展
Prime editing（PE）是基于CRISPR-Cas9系统“搜索和替换”方式的一种精准基因组操作技术，同时不需要外源供体DNA，也不需要造成DNA双链断裂（DSB）。相比于碱基编辑技术，Prime editing的编辑范围得到了广泛的扩展。目前Prime editing已在多种植物细胞、动物细胞和模式微生物大肠杆菌中得到成功应用，在动植物育种与基因组功能研究、疾病治疗、微生物菌株改造等方面展现出良好的应用潜力。本文简要介绍了Prime editing的基本策略，并从多个物种的应用角度对其研究进展进行了总结和展望，并概述了提高Prime edit效率和特异性的多种优化策略。
遇到微生物之间的主要相互作用
微生物群落的特性从微生物之间的相互作用以及微生物及其环境之间的相互作用出现。在生物体的规模上，微生物相互作用是由细胞或细胞 - 资源相遇引发的多步骤过程。微生物相互作用的定量和合理设计需要量化相遇率。通常可以通过相遇内核来量化遇到的率 - 捕获相遇率对细胞表型的依赖性的数学公式，例如细胞大小，形状，密度或运动性以及环境条件，例如湍流强度或粘度。虽然已经研究了一个多世纪的遭遇内核，但通常在微生物种群的描述中没有足够的意见。此外，仅在少数典型的遭遇场景中才知道内核公式。然而，遇到内核可以通过阐明遭遇率如何取决于关键表型和环境变量来指导实验努力来控制微生物相互作用。遭遇内核还提供了在微生物种群生态模型中使用的参数的物理基础估计。我们通过审查传统和最近确定的内核来描述微生物相互作用的这种面向相互作用的观点，这些内核描述了微生物之间的相遇以及水生系统中的微生物和资源之间的相遇。
遇到微生物之间的主要相互作用
微生物群落的特性从微生物之间的相互作用以及微生物及其环境之间的相互作用出现。在生物体的规模上，微生物相互作用是由细胞或细胞 - 资源相遇引发的多步骤过程。微生物相互作用的定量和合理设计需要量化相遇率。通常可以通过相遇内核来量化遇到的率 - 捕获相遇率对细胞表型的依赖性的数学公式，例如细胞大小，形状，密度或运动性以及环境条件，例如湍流强度或粘度。虽然已经研究了一个多世纪的遭遇内核，但通常在微生物种群的描述中没有足够的意见。此外，仅在少数典型的遭遇场景中才知道内核公式。然而，遇到内核可以通过阐明遭遇率如何取决于关键表型和环境变量来指导实验努力来控制微生物相互作用。遭遇内核还提供了在微生物种群生态模型中使用的参数的物理基础估计。我们通过审查传统和最近确定的内核来描述微生物相互作用的这种面向相互作用的观点，这些内核描述了微生物之间的相遇以及水生系统中的微生物和资源之间的相遇。