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番茄中 SlDMR6-1 的敲除促进了抗旱...
霜霉病抗性 6 (DMR6) 蛋白是一种 2-氧戊二酸 (2OG) 和 Fe(II) 依赖性加氧酶，参与水杨酸 (SA) 代谢。SA 被认为是一种非生物胁迫耐受性增强剂，在番茄中发现 DMR6 的失活会增加其水平并诱导对多种病原体的抗病性。通过应用 CRISPR/Cas9 技术，我们生成了 Sldmr6-1 番茄突变体并测试了它们对干旱和晚疫病的耐受性。野生型番茄品种‘San Marzano’及其 Sldmr6-1 突变体被剥夺了 7 天的水。WT植物表现出严重的枯萎，而T 2 Sldmr6-1突变体叶片肿胀，并保持较高的土壤相对含水量。生态生理测量表明，Sldmr6-1突变体采取了节水行为，通过降低气孔导度来降低蒸腾速率。在干旱胁迫下，同化率也降低，导致气孔下腔中的CO 2浓度没有改变，并提高了水分利用效率。此外，在Sldmr6-1突变体中，干旱胁迫诱导抗氧化相关基因SlAPX和SlGST的上调以及参与ABA分解代谢的SlCYP707A2基因的下调。最后，我们首次在番茄中强调，Sldmr6-1 突变体对晚疫病的病原菌致病菌的敏感性降低。
范可尼贫血核心复合物促进 CtIP-...
在修复链间交联 (ICL) 期间，会产生 DNA 双链断裂 (DSB)。范康尼贫血症 (FA) 核心复合物被募集到 ICL，通过同源重组 (HR) 促进该 DSB 的高精度修复。然而，FA 核心复合物是否也促进 ICL 独立 DSB（例如由电离辐射或核酸酶诱导的 DSB）的 HR 仍存在争议。在这里，我们在基于 CRISPR/Cas9 的筛选中将 FA 核心复合物成员 FANCL 和 Ube2T 鉴定为 HR 促进因子。使用同源细胞系模型，我们进一步证明了 FANCL 和 Ube2T 及其泛素化底物 FANCD2 的 HR 促进功能。我们表明 FANCL 和 Ube2T 以 FANCM 依赖的方式定位在 DSB 上，并且是 FANCD2 在 DSB 上积累所必需的。从机制上讲，我们证明 FANCL 泛素连接酶活性是 CtIP 在 DSB 上积累所必需的，从而促进末端切除和 Rad51 加载。总之，这些数据表明 FA 核心复合物和 FANCD2 在促进 ICL 和 DSB 修复方面具有双重基因组维护功能。
SUMO促进DNA修复蛋白协作，以支持在没有PML
端粒（ALT）途径的替代延长可在很大一部分癌症中保持端粒长度，这些癌症与临床不良结局相关。因此，对于为Alt Cancer制定新的治疗策略，对ALT机制有更好的了解。SUMO修饰端粒蛋白与Alt端粒相关PML体（APB）的形成，其中端粒聚集并富含DNA修复蛋白，以促进ALT中的同源性远距离DNA合成。但是，仍然未知（如果是这样），Sumo是否支持ALPB形成。在这里，我们表明，含有DNA修复蛋白的相扑凝结物在没有APB的情况下可以维持端粒。在缺乏APB的PML基因敲除Alt细胞系中，我们发现表现为PML和APB的ALT特征所必需的Sumoylation。化学诱导的端粒靶向相扑会在PML无效细胞中产生冷凝物的形成和ALT特征。这种效应需要Sumoylation和Sumo相互作用基序（SIMS）之间的相互作用。从机械上讲，Sumo诱导的效应与端粒处的DNA修复蛋白的积累有关，包括Rad52，Rad51AP1，RPA和BLM。此外，rad52可以以相关方式与BLM解旋酶合作，在端粒上富集相分离，并在端粒上富集Sumo，并促进端粒DNA合成。共同表明，Sumo凝结物形成了DNA修复因子之间的协作，以支持没有PML的ALT端粒维护。鉴于Sumoylation抑制剂在癌症治疗中的有前途的影响，我们的发现表明它们在扰动端粒癌细胞中的驱动端粒维持中的潜在使用。
长的非编码RNA leene促进了血管生成和...
引言血管生成是微血管内皮细胞（MVEC）的独特功能，涉及生长因子，膜受体和信号传导分子之间高度精心策划的相互作用（1，2）。虽然生理刺激，例如缺氧，但可能会产生血管生成，而糖尿病等病理状况可能会引起内皮病，这表明是一氧化氮（NO）生物利用度受损和干扰血管生成（3）。这种受损的EC功能是一种至关重要的机制，其基础是各种与降低性相关的心血管疾病，包括外周动脉疾病（PAD）。在多种垫子的危险因素中，直径是最突出的，因为它与PAD的风险增加及其最严重的形式，临界肢体缺血（CLI）（4）有关。尽管有强烈的临床意义，但分子基础 -
低度三体术21镶嵌促进早期发作的阿尔茨海默氏病
神经病学系，慕尼黑大学的诊所，路德维希·马克西米利人 - 慕尼黑，马尔马克尼奥特。15，81377慕尼黑，德国B palliative医学系，慕尼黑大学诊所，路德维希·马克西米利安人 - 慕尼黑，马尔马克尼因斯特。 15，81377慕尼黑，德国C核医学系，慕尼黑大学诊所，路德维希·马克西米利安人 - 慕尼黑，马尔马克尼翁郡。 15，81377慕尼黑，德国D核医学系，大学医院莱比锡，利比格斯特。 18，04103莱比锡，德国E德国神经退行性疾病中心（DZNE），Feodor-Lynen-STR。 17，81377慕尼黑，德国F核医学系，Inselspital Bern，Freiburgstr。 18，18，3010瑞士G慕尼黑系统神经病学集群，慕尼黑，德国H代谢生物化学，生物医学中心（BMC），医学院，路德维希 - 马克西米利亚人 - 慕尼黑慕尼黑，81377，慕尼黑，德国，德国，>/div>>/div>>/div>15，81377慕尼黑，德国B palliative医学系，慕尼黑大学诊所，路德维希·马克西米利安人 - 慕尼黑，马尔马克尼因斯特。15，81377慕尼黑，德国C核医学系，慕尼黑大学诊所，路德维希·马克西米利安人 - 慕尼黑，马尔马克尼翁郡。15，81377慕尼黑，德国D核医学系，大学医院莱比锡，利比格斯特。 18，04103莱比锡，德国E德国神经退行性疾病中心（DZNE），Feodor-Lynen-STR。 17，81377慕尼黑，德国F核医学系，Inselspital Bern，Freiburgstr。 18，18，3010瑞士G慕尼黑系统神经病学集群，慕尼黑，德国H代谢生物化学，生物医学中心（BMC），医学院，路德维希 - 马克西米利亚人 - 慕尼黑慕尼黑，81377，慕尼黑，德国，德国，>/div>>/div>>/div>15，81377慕尼黑，德国D核医学系，大学医院莱比锡，利比格斯特。18，04103莱比锡，德国E德国神经退行性疾病中心（DZNE），Feodor-Lynen-STR。17，81377慕尼黑，德国F核医学系，Inselspital Bern，Freiburgstr。 18，18，3010瑞士G慕尼黑系统神经病学集群，慕尼黑，德国H代谢生物化学，生物医学中心（BMC），医学院，路德维希 - 马克西米利亚人 - 慕尼黑慕尼黑，81377，慕尼黑，德国，德国，>/div>>/div>>/div>17，81377慕尼黑，德国F核医学系，Inselspital Bern，Freiburgstr。18，18，3010瑞士G慕尼黑系统神经病学集群，慕尼黑，德国H代谢生物化学，生物医学中心（BMC），医学院，路德维希 - 马克西米利亚人 - 慕尼黑慕尼黑，81377，慕尼黑，德国，德国，
肠道微生物组和健康：机械见解
摘要目的轴突引导途径的失调在胰腺导管腺癌（PDAC）中很常见，但是我们对其生物学相关性的理解受到限制。在这里，我们研究了轴突引导提示SEMA3A在支持PDAC进程中的功能作用。设计，我们整合了人类PDAC的大量和单细胞转录组数据集，以及患者组织的原位杂交分析，以评估PDAC分子亚型中的SEMA3A表达。进行了PDAC细胞系中功能实验的增益和丧失，以剖析SEMA3A如何有助于定义生物学上具有攻击性的表型。导致PDAC组织，SEMA3A由基质元素表达，并选择性地富集在基底/鳞状上皮细胞中。因此，SEMA3A在PDAC细胞中的表达是由基底样表型的细胞中性和细胞脱连的决定因素诱导的。在体外，Sema3a促进细胞迁移以及厌氧性。 在分子水平上，这些表型通过规范SEMA3A-NRP1轴的焦点粘附激酶信号传导增加。 SEMA3A为小鼠PDAC细胞具有更大的转移能力，并有利于肿瘤中与肿瘤相关巨噬细胞的肿瘤内浸润和T细胞密度降低。 从机械上讲，SEMA3A充当巨噬细胞的化学吸引力，并将其极化偏向于M2样表型。 在SEMA3A高肿瘤中，巨噬细胞的耗竭会导致CD8+T细胞的肿瘤内浸润更大，并通过抗肿瘤治疗更好地控制疾病。在体外，Sema3a促进细胞迁移以及厌氧性。在分子水平上，这些表型通过规范SEMA3A-NRP1轴的焦点粘附激酶信号传导增加。SEMA3A为小鼠PDAC细胞具有更大的转移能力，并有利于肿瘤中与肿瘤相关巨噬细胞的肿瘤内浸润和T细胞密度降低。从机械上讲，SEMA3A充当巨噬细胞的化学吸引力，并将其极化偏向于M2样表型。在SEMA3A高肿瘤中，巨噬细胞的耗竭会导致CD8+T细胞的肿瘤内浸润更大，并通过抗肿瘤治疗更好地控制疾病。的结论，我们表明SEMA3A是一个应激敏感的基因座，它通过细胞中的和细胞外在机制促进基底样PDAC的恶性表型。
Mark2/Mark3激酶是YAP的催化共依赖性...
胰腺导管腺癌（PDA）是一种潜在的致命疾病，缺乏有效的治疗。其免疫抑制性肿瘤微环境（TME）使其能够逃避宿主的免疫监视，并限制对免疫疗法的反应。在这里，使用小鼠KRT19-缺陷（SGKRT19-编辑）PDA模型，我们发现需要天然杀伤剂T（NKT）细胞的肿瘤内积累来建立免疫活性的TME。从机械上讲，肿瘤内NKT细胞促进I型干扰素（IFN）产生产生抗肿瘤的适应性免疫反应，并策划T细胞，树突状细胞，天然杀伤细胞和髓样细胞的肿瘤内浸润，并产生抑制细胞。在分子水平上，NKT细胞通过其CD40L与髓样细胞上CD40的相互作用促进I型IFN的产生。为了评估这些观察结果的治疗潜力，我们发现对携带PDA的小鼠的叶酸给药会增加TME中的NKT细胞，并改善其对抗PD -PD -1抗体治疗的反应。总之，NKT细胞在对小鼠PDA的免疫反应中具有重要作用，并且是免疫疗法的潜在靶标。
这是ELF1的存储库副本，可促进Rad26与病变降落的POL II的相互作用进行转录耦合修复。
转录 - 耦合的核苷酸切除修复（TC -NER）是一种高度保守的DNA修复途径，可去除转录基因组中的笨重病变。Cockayne综合征B蛋白（CSB）或其酵母直系同源物RAD26以DEC的闻名，可以在病变中起重要作用 - TC -NER的识别步骤。最近将另一种保守的蛋白质ELOF1或其酵母直系同源物ELF1鉴定为核心转录 - 耦合修复因子。RAD26如何区分RNA聚合酶II（POL II）在DNA病变或其他障碍物处停滞不前，以及ELF1在此过程中的作用何种作用仍然未知。在这里，我们提出了Pol II -Rad26复合物的冷冻结构，该结构停滞在不同的障碍物处，表明Rad26使用一种共同的机制来识别停滞的Pol II，当Pol II在病变处逮捕时，其他相互作用进行了其他相互作用。病变的冷冻 - EM结构 - 被捕的Pol II -RAD26与ELF1结合的rad26表明ELF1诱导了Rad26和病变之间的进一步相互作用 - 被捕的Pol II。生化和遗传数据支持TC -NER启动中ELF1和RAD26之间相互作用的重要性。一起，我们的结果提供了重要的机理见解，即如何在初始病变识别步骤的转录识别步骤 - 耦合修复的初始病变识别步骤中一起工作。
一种新的抗CRISPR基因促进了毒品的传播......
1 上海交通大学医学院微生物与免疫学系，上海 200025 2 中国科学院上海植物生理生态研究所，中国科学院合成生物学重点实验室，中国科学院植物设计国家重点实验室，中国科学院分子植物科学卓越创新中心，上海 200032 3 中国科学院大学，北京 100049 4 上海交通大学医学院附属仁济医院上海免疫治疗研究所，上海 200025 5 上海交通大学医学院基础医学核心实验室，上海 200025 6 复旦大学上海市公共卫生临床中心上海噬菌体研究所，上海 201508 7 上海交通大学医学院国家热带疾病研究中心全球健康学院，上海 200025 8 国家卫生健康委员会寄生虫与媒介生物学重点实验室中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所，上海 200025
LncRNA NFYC-AS1 通过自噬、细胞凋亡和 MET/c-Myc 致癌蛋白促进肺腺癌的发展
肺癌是全球最常见的癌症之一，也是癌症死亡的主要原因（1）。大约10年前，在没有靶向药物的情况下，晚期肺癌的总生存期（OS）仅为10-12个月。随着越来越多靶向药物的不断应用，接受靶向治疗的晚期肺癌患者的OS延长至3年以上（2,3）。在EGFR突变的早期肺癌患者中，使用EGFR TKI作为辅助化疗也出现了同样的趋势（4,5）。靶向治疗的前提是发现更有针对性的驱动基因。长链非编码RNA（lncRNA）是一类RNA分子。它们不会翻译成蛋白质，通常长度超过200个核苷酸。LncRNA与癌症的发展密切相关（6-9）。异常表达的lncRNA已被发现是多种癌症的致癌基因（10-12）。然而，大多数 lncRNA 的功能仍不清楚。阐明它们在致癌作用中的功能和机制可能提供新的治疗靶点（13）。Li 等人分析了 Cancer Genome Atlas (TCGA) 数据库中肺腺癌 (LAUD) 的 RNA-seq 数据和 miRNA-seq 数据，以识别关键 lncRNA 并确定分子发病机制。核转录因子 Y 亚基 C 反义 RNA 1 (NFYC-AS1) 被发现是一种潜在的预后生物标志物 (14)。然而，作者并没有进一步验证 NFYC-AS1 在肺癌细胞系中的作用。关于 NFYC- AS1 功能的研究很少。例如，van der Plaat 等人通过分析全基因组关联研究 (GWAS) 数据发现 NFYC- AS1 可能在从不吸烟者的气流阻塞中发挥作用 (15)。然而，作者也没有在细胞系或动物模型中进一步验证NFYC-AS1的功能。到目前为止，还没有关于NFYC-AS1基因的分子功能、表型、动物模型、miRNA、转录因子靶点或HOMER转录等的数据。以下分子检测表明，NFYC-AS1可能通过自噬和凋亡以及MET / c-Myc致癌蛋白促进LAUD的增殖。有报道称，癌症中的自噬既是肿瘤抑制因子，也是肿瘤促进因子（16）。针对自噬相关途径可能是癌症治疗的一种有前途的策略。众所周知，细胞凋亡在癌症中起着关键作用