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成绩单
第三轨道 行人：你好，警官！我叫 Do-Yun，我是这个城市的新人。 警官：很高兴认识你。有什么可以帮你的吗？ 行人：我可以问你一些关于行人规则的问题吗？ 警官：当然可以，你首先应该知道的是，司机在人行横道和儿童过街处、掉头以及进入或离开车道时必须给行人让路。 行人：司机应该怎么做才能照顾到老年人？ 警官：老年人可能比其他行人慢，可能直到你非常接近时才看到你。司机必须放慢速度，给他们额外的时间过马路。 行人：我总是帮助老年人过马路。 购物中心附近有什么针对司机的具体规则吗？ 警官：是的，购物中心附近行人可能不会注意路况，所以司机必须放慢速度，注意任何可能踏上马路的人。 行人：行人在路上行走有什么规则吗？ 警官：如果有人行道，行人必须使用人行道。行人：如果没有人行道怎么办？警官：那么他们就可以在路上行走，只要他们沿着来车的方向行走即可。行人：所有规则都和我镇上的一样，谢谢警官。我一定会遵守所有规则。
使用基于抗体的新技术对细胞和病毒转录本上的假尿苷残基进行定位
伪尿苷 ( Ψ ) 是哺乳动物非编码 RNA (ncRNA)（包括 rRNA、tRNA 和 snRNA）中最常见的非规范核糖核苷，占总尿苷水平的 ∼ 7%。然而，Ψ 仅占 mRNA 上尿苷的 ∼ 0.1%，其对 mRNA 功能的影响仍不清楚。研究表明，Ψ 残基会抑制宿主先天免疫因子对外源 RNA 转录物的检测，因此病毒可能通过破坏宿主伪尿苷合酶 (PUS) 将 Ψ 残基添加到 mRNA 中来抑制受感染细胞的抗病毒反应。在这里，我们描述并验证了一种新型的基于抗体的 Ψ 映射技术，即光交联辅助 Ψ 测序 (PA- Ψ -seq)，并用它来映射不仅在多个细胞 RNA 上而且在 HIV-1 编码的 mRNA 和基因组 RNA 上的 Ψ 残基。我们描述了 293T 衍生细胞系，其中先前报道的人类 PUS 酶会将 Ψ 残基添加到人类 mRNA 中，特别是 PUS1、PUS7 和 TRUB1/PUS4，通过基因编辑被灭活。令人惊讶的是，虽然这使我们能够将细胞 mRNA 上的几个 Ψ 添加位点分配给这三种 PUS 酶中的每一种，但 HIV-1 转录本上的 Ψ 位点仍然不受影响。此外，PUS1、PUS7 或 TRUB1 功能的丧失并没有显著降低在人类总 mRNA 上检测到的 Ψ 残基水平（低于野生型细胞中的约 0.1% 水平），因此意味着将大量 Ψ 残基添加到人类 mRNA 中的 PUS 酶仍有待确定。
锌指抗病毒蛋白 ZAP 限制人类巨细胞病毒并选择性结合和破坏病毒 UL4/UL5 转录本
摘要 干扰素刺激基因产物 (ISG) 在早期感染控制中起着至关重要的作用。ISG 锌指 CCCH 型抗病毒蛋白 1 (ZAP/ZC3HAV1) 通过与富含 CG 的 RNA 序列结合来对抗多种 RNA 病毒，而其对 DNA 病毒的影响尚不明确。在这里，我们揭示了 ZAP 在人类巨细胞病毒 (HCMV) 感染中的作用，该病毒是一种疱疹病毒，与免疫抑制个体和新生儿的高发病率有关。我们表明，在 HCMV 感染期间会诱导 ZAP 的两种主要亚型 ZAP-S 和 ZAP-L 的表达，并且这两种亚型都会对 HCMV 复制产生负面影响。转录组和蛋白质组分析表明，ZAP 的表达会导致病毒 mRNA 和蛋白质水平降低，并减缓 HCMV 感染的进展。代谢 RNA 标记与高通量测序 (SLAM-seq) 相结合表明，感染后期的大多数基因表达变化是由 HCMV 的普遍减弱引起的。此外，在感染的早期阶段，ZAP 通过破坏一组独特的病毒 mRNA（尤其是来自之前未表征的 UL4-UL6 HCMV 基因位点的 mRNA）来限制 HCMV。通过增强交联免疫沉淀和测序分析 (eCLIP-seq)，我们将从该 HCMV 位点表达的转录本确定为 ZAP 的直接靶标。此外，我们的数据显示 ZAP 不仅优先识别 CG，还优先识别其他富含胞嘧啶的序列，从而扩大了其靶标特异性。总之，本报告首次揭示了 HCMV 感染过程中 ZAP 的直接靶点，这强烈表明来自 UL4-UL6 基因座的转录本可能在 HCMV 复制中发挥重要作用。
医疗相关人工智能论文作者的最佳实践
自 2017 年成立以来，npj 数字医学吸引了大量关于人工智能应用的报告手稿。过去几年，该领域发展迅速。最初人们对算法本身（机器学习、深度学习、卷积神经网络）很着迷，并使用这些算法做出的预测往往超越了现行的基准。随着学科的成熟，人们开始关注这些算法输出中的异常现象。具体来说，人们广泛批评称，算法开发的模型可能由于对训练数据的过度拟合而具有有限的通用性，并且可能系统地延续训练数据中固有的各种形式的偏见，包括种族、性别、年龄和健康状况或体能水平（Challen 等人，BMJ Qual. Saf. 28:231 – 237，2019 年；O'neil，数学毁灭性武器：大数据如何加剧不平等并威胁民主，Broadway Book，2016 年）。鉴于我们对发表最高质量论文的兴趣以及使用 AI 算法的投稿数量的不断增长，我们提供了一份标准列表，作者在向 npj Digital Medicine 提交论文之前应考虑这些标准。
练习册答案和抄本
成绩单 1 对方球队表现不佳，我们很快就进了三个球。但后来我们放松了，我想。我们想，“这很容易！我们会赢。完全没问题。”但是，在下半场，对方球队进了三个球，所以比分是 3-3。只剩下五分钟了。但幸运的是，我们在最后一分钟进球并赢得了比赛。 2 我昨晚约好了和男朋友杰克见面，但他提前一小时发短信说对不起，他很忙。我回短信说，“忙？你在做什么？”“我要呆在家里。真的很抱歉。明天见，”他说。但后来莎莉在城里看到他和莉齐在一起。反正她就是这么说的。那么，他呆在家里了吗？我不知道。 3 我们班上有一个男生什么都好。他所有科目都得了最高分，而且他似乎不太努力。他也非常擅长运动，是足球队的队长。而且他长得帅，很受女孩子欢迎！他是怎么做到的？！ 4 昨晚我和姐姐大吵了一架。她未经我同意就借了我的牛仔裤，我有点生气，她也很生气。我只是累了，感觉不太舒服。这很愚蠢，因为我们经常互相借衣服。我对此感到很难过。我回家后会马上道歉。
S:\Organizations\Staff\HIST\HIST_Program\History Manuscripts\DMSP\DMSP PDF copy for print.prn.pdf
国防气象卫星（如本专著中的图16.）允许地理学家和社会科学家对各个地区的人口密度做出明智的估计。参见 C. D. Elvidge、K. E. Baugh、E. A. Kihn 和 E. R. Davis，“使用 DMSP 操作线扫描系统的夜间数据绘制城市灯光”，摄影测量工程与遥感，第63，第6，1997 年，第727-734 页；Paul Sutton、Dar Roberts、Chris Elvidge 和 Hank Meij，“美国大陆夜间卫星图像与人口密度比较”，摄影测量工程与遥感，第63，No.11，1997，页1303-1313；Paul Sutton，“利用夜间卫星图像和 GIS 建模人口密度”，计算机、环境和城市系统，Vol.21，No.3/4，1997，页227-244。
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国防气象卫星（如本专著中的图16.）允许地理学家和社会科学家对各个地区的人口密度做出明智的估计。参见 C. D. Elvidge、K. E. Baugh、E. A. Kihn 和 E. R. Davis，“使用 DMSP 操作线扫描系统的夜间数据绘制城市灯光”，摄影测量工程与遥感，第63，第6，1997 年，第727-734 页；Paul Sutton、Dar Roberts、Chris Elvidge 和 Hank Meij，“美国大陆夜间卫星图像与人口密度比较”，摄影测量工程与遥感，第63，No.11，1997，页1303-1313；Paul Sutton，“利用夜间卫星图像和 GIS 建模人口密度”，计算机、环境和城市系统，Vol.21，No.3/4，1997，页227-244。