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利用活细胞中的 ADAR 编辑进行模块化和可编程的 RNA 传感
随着单细胞转录组的可用性不断提高，RNA 特征为靶向活细胞提供了有希望的基础。分子 RNA 传感器将能够在不同情况下研究和治疗干预特定细胞类型/统计数据，特别是在人类患者和非模型生物中。在这里，我们描述了一种使用作用于 RNA 的腺苷脱氨酶 (RADAR) 进行活体 RNA 传感的模块化和可编程设计。我们验证并扩展了我们的基本设计，表征了其性能，并彻底分析了其与人类/小鼠转录组的兼容性。我们还确定了进一步提高输出水平和改善动态范围的策略。我们表明 RADAR 是可编程和模块化的，并且独特地支持紧凑的 AND 逻辑。除了定量之外，RADAR 还可以区分与疾病相关的点突变。最后，我们证明 RADAR 是一个独立的系统，具有在各种生物体中发挥作用的潜力。
在石油中揭示古老的DNA：洞悉地球隐藏的生活事件和
（未通过同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此预印本版的版权持有人于2025年2月13日发布。 https://doi.org/10.1101/2025.02.13.638097 doi：Biorxiv Preprint
5mC 选择性脱氨酶的发现及其在碱基分辨率甲基化位点超灵敏直接测序中的应用
摘要 挖掘噬菌体中的新酶活性对于开发新的生物技术工具仍然很重要。在本研究中，我们使用 MetaGPA（一种将宏基因组数据中的基因型与表型联系起来的方法）来识别脱氧胞苷脱氨酶，这是一种与宏病毒组中的胞嘧啶修饰高度相关的蛋白质家族。出乎意料的是，这些脱氨酶的一个子集在单核苷酸和单链 DNA 底物中都表现出对 5-甲基胞嘧啶 (5mC) 的偏好，而不是胞嘧啶 (C)。在甲基化组测序工作流程中，这些酶优先脱氨 5mC，这使得甲基化胞嘧啶能够直接转化，同时完全消除任何未修饰胞嘧啶的背景脱氨。这种直接转换允许以单碱基分辨率精确识别甲基化位点，具有无与伦比的灵敏度，为基因组和甲基化组的同时测序提供了广泛的应用。
巨噬细胞中对OSMO敏感的LRRC8阴离子通道的激活对于微晶蛋白关节炎症很重要
沉积单钠和焦磷酸钙（MSU和CPP）微晶体负责痛风和软骨钙化中的疼痛和复发性炎症。在这些病理学中，炎症反应是由于巨噬细胞的激活引起的，负责释放包括IL-1β在内的各种细胞因子。IL-1β的成熟是由多蛋白质NLRP3插度介导的。在这里，我们发现晶体通过晶体的激活和IL-1β的同时产生的激活取决于细胞体积通过激活OSMO敏感的LRRC8阴离子通道的调节。LRC8的药理抑制和遗传沉默消除了晶体在体外和晶体诱导的胞内肿块模型中的浮游性激活。MSU/CPP晶体暴露时LRRC8激活诱导ATP释放，P2Y受体的激活和NLRP3炎性流向膜体激活和IL-1β成熟所必需的细胞内钙升高。在关节晶体诱导的炎症的背景下，我们确定了LRRC8 OSMO敏感的阴离子Channels具有病理生理相关性的功能。
通过绿色合成Nio -Sio2复合材料与柑橘柠檬皮提取物
Ihsan Ali Mahar，Aneela Tahira，Mehnaz Parveen，Ahmed Ali Hulio，Zahoor Ahmed Ibupoto等。 材料科学杂志：电子学中的材料，2024，35（7），pp.490。 10.1007/S10854-024-12156-9。 hal-04577661Ihsan Ali Mahar，Aneela Tahira，Mehnaz Parveen，Ahmed Ali Hulio，Zahoor Ahmed Ibupoto等。材料科学杂志：电子学中的材料，2024，35（7），pp.490。10.1007/S10854-024-12156-9。hal-04577661
免疫原性细胞死亡对PD-1/PD-L1封锁敏感的临床证据
法国维勒维夫的古斯塔夫·鲁西癌校园的代谢组学和细胞生物学平台； B Inserm，U1138，法国巴黎； C Equipe 11由法国巴黎的Cordeliers研究中心全国反对癌症联盟标记； D大学巴黎大学/巴黎诉法国巴黎的索邦·塞特（Sorbonne ParisCité）；他的皮埃尔（Pierre）和玛丽·居里（Marie Curie University）/法国巴黎巴黎六世（Paris VI）； f法国维勒维夫（Vilejuif）的古斯塔夫·鲁西（Gustave Roussy）癌症校园（RCC）医学肿瘤学系； G Inserm U1015，法国Villejuif； H大学巴黎大学，巴黎 - 萨克莱大学，古斯塔夫·鲁西（Gustave Roussy）癌症校园（GRCC）；我在法国维勒纽夫（Vilejuif）的癌症生物治疗（CICBT）临床研究中心； j医学学院，巴黎分校/巴黎XI，法国Le Kremlin-Bicêtre；苏州系统医学研究所，中国医学科学院，中国苏州；欧洲医院乔治·庞皮杜（Georges Pompidou），法国巴黎AP-HP的生物杆；瑞典斯德哥尔摩Karolinska大学医院的妇女和儿童健康部
设计光敏化合物的新型量子经典计算方案可以加速材料发现
最近，量子化学计算与机器学习的结合在加速新材料发现方面表现出了巨大的潜力。虽然这种混合方法与传统方法相比消耗的资源和时间更少，但它仍然面临着根本性的挑战。这些挑战包括训练数据集的大小和质量限制，以及使用离散优化技术有效探索大型化学空间的困难。
在二维材料的纳米结构膜中调整电子和热传输，用于高性能化学感测和
化学传感和热量管理都代表着主要技术，可以在可穿戴设备中进行远程医疗保健，这在大流行社会中非常重要。石墨烯和相关的2D材料（GRM）具有可穿戴电子产品的新型电气和热性能的巨大潜力。特别是基于GRM的溶液的纳米结构GRM膜（图1A）的低温产生和沉积对于印刷柔性和可穿戴电子产品极为有吸引力。[1，2]已经开发了来自具有不同电子性能的2D材料的电子油墨来打印设备的不同元素：活性层中的半导体或半金属油墨，用于介电墨水的磁铁和用于电极的墨水[3，4]。单层六角硼硝酸硼（H-BN）是一种宽带2D半导体，具有出色的声子传输[5]，这是用于热导电糊的有前途的聚合物填充剂。[6]在本次演讲中，我将描述表面活性剂和无溶剂和无溶剂喷墨印刷的薄膜薄膜设备的电荷传输机制，这些薄膜的薄膜设备（半金属），二钼钼（MOS 2，半导体，半导体）和钛金属MXEN（TI 3 C 2，METATIENT）的电气依赖性和磁场依赖于温度和磁场，并将其用于温度和磁场。[7]印刷几层MXENE和MOS 2设备中的电荷传输由组成薄片的固有运输机理主导。另一方面，印刷的几层石墨烯设备中的电荷传输主要由不同薄片之间的传输机构主导。[8][7]然后，我将讨论H-BN和Ti 3 C 2的纳米结构膜中的热传输，并报告与Wiedmann-Franz Law背道而驰，为在有效冷却电子电路和OptoelectRonic设备中的电气冷却和智能管理式智能处理和热量管理和智能处理中的电气和热导电涂料铺平了道路。
CHOPOFF：符号比对可实现快速灵敏的 CRISPR 脱靶检测
然而，尽管 CRISPR/Cas 技术具有革命性的地位，但它也存在明显的局限性和缺陷。CRISPR/Cas 最重要的限制是可能出现脱靶编辑，即 CRISPR/Cas 在非预期的位置切割 DNA。这种脱靶（OT）编辑会扭曲功能实验的解释，引入噪音和变异性，从而降低实验结果和功能性结论的可靠性。重要的是，OT 活性在 CRISPR 的治疗应用中尤其危险，在这种情况下，即使非常低频率的 OT 编辑也可能产生极其灾难性的后果 2,3 。为了应对这一挑战，该领域的许多努力都集中在改进 guideRNA（gRNA）设计以确保靶标特异性 4 和设计具有更高保真度的 Cas 变体 5 。同时，测量 OT 效应的方法，例如 GUIDE-seq 6 、CIRCLE-seq 7 和 SITE-seq 8 ，也有助于提高我们量化和合理化 OT 编辑的能力。此外，预测 OT 的能力对于该领域来说越来越重要，从而导致开发出各种用于预测 OT 位点的计算方法。