肠道微生物组成是动态的,直接受多种因素影响,其中饮食是最重要的因素之一。11,12 从分类学上讲,肠道细菌分为门、纲、目、科、属和种。图 1 显示了肠道中六大最主要的细菌门,其中芽孢杆菌门和拟杆菌门(以前称为厚壁菌门和拟杆菌门)占健康人肠道微生物的 90%。13,14 斯坦福大学等人对 CKD 患者肠道微生物组成差异进行了系统评价。15 与健康对照组相比,CKD 患者的普氏菌科和 Roseburia 属的相对丰度较低,而肠杆菌科、链球菌科和肠球菌属的潜在致病菌数量明显较高。 15 由于样本量较小,关于血液透析 (HD) 和腹膜透析 (PD) 患者微生物群差异的研究报告有限。尽管如此,他们还是报告了
摘要:本研究进行了系统回顾,以探索人工智能 (AI) 在移动学习中的应用,以支持马来西亚的土著社区。它还研究了在教育中更广泛使用的人工智能技术。本研究的主要目的是调查人工智能 (AI) 在支持移动学习和教育方面的作用,并提供一个分类法,显示本研究中使用的过程阶段,并介绍在移动学习和教育中使用的主要人工智能应用。为了确定相关研究,使用预定的纳入/排除标准系统地搜索了四个知名数据库——ScienceDirect、Web of Science、IEEE Xplore 和 Scopus。这一筛选过程产生了 50 项研究,这些研究进一步分为几类:人工智能技术(19 项研究)、机器学习(11 项)、深度学习(8 项)、聊天机器人/ChatGPT/微信(4 项)和其他(8 项)。对结果进行了分类分析,以提供一个结构化框架来理解人工智能在移动学习和教育中的各种应用。本评论总结了当前的研究并将其组织成一个分类法,揭示了使用人工智能支持移动学习的趋势和技术,特别是针对马来西亚的土著群体。
非生物胁迫对农业构成严重威胁,因为它会对细胞稳态产生负面影响,并最终阻碍植物的生长和发育。由于气候变化,干旱和过热等非生物胁迫因素预计在未来会更频繁地出现,这将降低玉米、小麦和水稻等重要作物的产量,并可能危及人类的粮食安全。植物微生物组是一个与植物相连的多样化、分类学上组织的微生物群落。通过为植物提供营养和水分,并调节其生理和新陈代谢,植物微生物群经常帮助植物发育和耐受非生物胁迫,从而提高非生物胁迫下的作物产量。在本研究中,我们重点关注温度、盐和干旱胁迫,描述了非生物胁迫如何影响植物、微生物组、微生物-微生物相互作用和植物-微生物相互作用的最新发现,以及微生物如何影响植物的新陈代谢和生理。我们还探讨了在面临非生物胁迫的农业实践中应用植物微生物组必须采取的关键措施。
自然生态系统藏有大量的分类学微生物,这对植物生长和健康很重要。土壤微生物及其复杂的相互作用的大量多样性使确定对生命支持功能重要的主要参与者可以为植物提供重要的挑战,包括增强对(a)生物应激因素的耐受性。设计简化的微生物合成群落(Syncoms)有助于降低这种复杂性,从而揭示特定微生物组功能的分子和化学基础和相互作用。尽管已经成功地使用了Syncom来剖析微生物相互作用或再现微生物组相关的表型,但这些社区的组装和重建通常是基于通用的丰度模式或分类的认同,并共同出现的,但仅由功能特征提供了很少的信息。在这里,我们回顾了有关设计功能性阴谋的最新研究,以揭示共同的原理并讨论社区设计的多维方法。我们提出了一种基于与微生物菌株的高通量实验测定和其功能能力的计算基因组分析的集成,以定制功能性触体设计的策略。
自然生态系统藏有大量的分类学微生物,这对植物生长和健康很重要。土壤微生物及其复杂的相互作用的大量多样性使确定对生命支持功能重要的主要参与者可以为植物提供重要的挑战,包括增强对(a)生物应激因素的耐受性。设计简化的微生物合成群落(Syncoms)有助于降低这种复杂性,从而揭示特定微生物组功能的分子和化学基础和相互作用。尽管已经成功地使用了Syncom来剖析微生物相互作用或再现微生物组相关的表型,但这些社区的组装和重建通常是基于通用的丰度模式或分类的认同,并共同出现的,但仅由功能特征提供了很少的信息。在这里,我们回顾了有关设计功能性阴谋的最新研究,以揭示共同的原理并讨论社区设计的多维方法。我们提出了一种基于与微生物菌株的高通量实验测定和其功能能力的计算基因组分析的集成,以定制功能性触体设计的策略。
DNA条形码是加速物种鉴定和补充物种划界的绝佳工具。此外,DNA条形码参考文献是生物多样性监测,保护或生态学中任何元法编码研究的决定性主链特征。但是,在某些分类单元中,DNA条形码不能以令人满意的成功率产生,因此这些群体将在任何基于条形码的物种清单中都在很大程度上缺少。在这里,我们为eurytomidae(膜翅目,沙尔西多德亚)提供了定制的DNA条形码向前底漆,将高质量DNA条形码的成功率从33%提高到88%。eurytomidae是一种严重研究的,分类学上具有挑战性的,物种丰富的群,主要是寄生的黄蜂。较高的物种数量,多样化的生态作用以及广泛和共同存在确定Eurytomidae是陆地生态系统中众多关键家庭之一。现在可以在研究和监测陆地动物区系时包括eurytomidae,强调基于条形码的方法将需要定期使用不同的引物来避免其数据和推论中的偏见。新的DNA条形码方案也是我们对小组的综合分类研究的先决条件,旨在划界和表征Central
这项研究的目的是评估从土耳其Tulum分离的乳杆菌科的益生菌特性。十种乳杆菌科的菌株。在分类学上识别如下:lactiplantibacillus plantarum subsp。plantarum(6),乳酸乳杆菌(2),乳酸酶乳杆菌(1)和乳酸乳酶casei(1)。评估了它们的益生菌特性,抗菌活性以及对模拟胃肠道状况(例如低pH,胃蛋白酶,胰岛素和胆汁盐)的耐受性。结果表明,10种乳酸细菌菌株具有较高的自动聚集,凝聚和疏水性能。抗生素耐药性和溶血活性确定用于菌株的安全评估。 还检测到表现出高抗菌活性的选定分离株和去除胆固醇的能力。 这些细菌也具有抗氧化活性。 因此,这十种提取的乳酸细菌是有望用作益生菌的潜在候选者。 在这项综合研究中,发现了Plantarum Sm27,L。plantarum S74和L. paracasei Ru39-7具有最好的益生菌特性。 有关从传统发酵的图卢姆奶酪中分离出的乳酸杆菌科的益生菌和功能特性的重要信息,这些乳酸菌株可用作丰富的益生菌细菌来源。 发现可以将益生菌细菌与传统发酵奶酪分离。抗生素耐药性和溶血活性确定用于菌株的安全评估。还检测到表现出高抗菌活性的选定分离株和去除胆固醇的能力。这些细菌也具有抗氧化活性。因此,这十种提取的乳酸细菌是有望用作益生菌的潜在候选者。在这项综合研究中,发现了Plantarum Sm27,L。plantarum S74和L. paracasei Ru39-7具有最好的益生菌特性。有关从传统发酵的图卢姆奶酪中分离出的乳酸杆菌科的益生菌和功能特性的重要信息,这些乳酸菌株可用作丰富的益生菌细菌来源。发现可以将益生菌细菌与传统发酵奶酪分离。
植物相关的微生物包括细菌,古细菌,真菌和病毒的分类学多样化群落,它们与宿主植物建立了不可或缺的生态关系,并构成了植物 - 微生物组。植物微生物组不仅在植物的正常生长和发育中做出贡献,而且在非生物胁迫条件下维持植物稳态中起着至关重要的作用。由于其巨大的代谢潜力,植物 - 微生物组为宿主植物提供了通过各种机制来减轻非生物应激的能力,例如产生抗氧化剂,植物生长激素,生物活性化合物,有害化学物质和毒素,毒素,反应性氧气和其他免费阳性质量和其他X。对植物 - 微生物组的结构和功能的更深入了解以及植物 - 微生物组介导的降低非生物压力的复杂机制将使其用于减轻作物植物的非生物压力的利用和抗胁迫作物的发展。本评论旨在探索植物植物中植物菌,热,盐度和重金属压力的潜力,并找到可持续的解决方案以提高农业生产力。总结了对植物生物体在赋予植物的非生物胁迫耐受性中作用的机理见解,这将有助于新型生物调节剂的发展。涉及候选基因鉴定和靶向基因修饰的高通量现代方法,例如基因组学,转录组学,代谢组学和基于植物 - 微生物基的基因基因工程,并在不断增强的气候抗性农作物的需求中得到了不断增强。
摘要:快速鉴定和表征来自极端环境的分离物目前是一项挑战,但对于探索地球的生物多样性却非常重要。由于这些分离物原则上可能与已知物种有远亲关系,因此需要采用技术来可靠地鉴定它们所属的生命分支。通过串联质谱法对这些环境分离物进行蛋白质分型提供了一种快速且经济有效的方法,可以使用它们的肽谱进行鉴定。在本研究中,我们记录了第一种用于环境嗜极菌和嗜盐菌分离物的高通量蛋白质分型方法。微生物是从智利高原高海拔安第斯山脉湖泊(海拔 3700 - 4300 米)的样本中分离出来的,这些湖泊代表的地球环境与其他星球的条件相似。总共培养了 66 种微生物,并通过蛋白质分型和 16S rRNA 基因扩增子测序进行了鉴定。两种方法对所有分离物都揭示了相同的属鉴定结果,但三种分离物除外,这三种分离物可能代表尚未根据其肽组进行分类学表征的生物。蛋白质分型能够表明副球菌科和 Chromatiaceae/Alteromonadaceae 科中存在两个潜在的新属,而这些属仅被 16S rRNA 扩增子测序方法所忽略。本文强调,蛋白质分型有可能发现来自极端环境的未描述的微生物。关键词:串联质谱蛋白质分型、阿塔卡马沙漠、高原、高海拔安第斯山脉湖泊、极端微生物、嗜盐菌■简介
布朗利水库是一个受汞 (Hg) 污染的水力发电水库,具有动态水文和地球化学条件,位于美国爱达荷州的赫尔斯峡谷综合体内。鱼类中的甲基汞 (MeHg) 污染是该水库令人担忧的问题。虽然甲基汞的产生历来被归因于硫酸盐还原菌和产甲烷古菌,但携带 hgcA 基因的微生物在分类学和代谢上是多样的,驱动汞 (Hg) 甲基化的主要生物地球化学循环尚不清楚。在本研究中,在连续四年 (2016-2019) 的分层时期测量了整个布朗利水库的汞形态和氧化还原活性化合物,以确定甲基汞产生的地点和氧化还原条件。对一组样本进行了宏基因组测序,以表征具有 hgcA 的微生物群落,并确定生物地球化学循环与甲基汞产生之间的可能联系。生物地球化学概况表明,原位水柱汞甲基化是甲基汞的主要来源。这些概况与以携带 hgcA 的微生物为重点的基因组解析宏基因组学相结合,表明该系统中的甲基汞生成发生在硝酸盐或锰还原条件下,而这些条件以前被认为可以阻止汞甲基化。利用这种多学科方法,我们确定了水文年际变化对氧化还原状态、微生物代谢策略、汞甲基化剂的丰度和代谢多样性以及最终对整个水库的甲基汞浓度的连锁效应。这项工作扩展了已知的有利于产生甲基汞的条件,并表明在某些地方通过硝酸盐或锰修正来缓解汞甲基化的努力可能会失败。
