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摘要:快速鉴定和表征来自极端环境的分离物目前是一项挑战,但对于探索地球的生物多样性却非常重要。由于这些分离物原则上可能与已知物种有远亲关系,因此需要采用技术来可靠地鉴定它们所属的生命分支。通过串联质谱法对这些环境分离物进行蛋白质分型提供了一种快速且经济有效的方法,可以使用它们的肽谱进行鉴定。在本研究中,我们记录了第一种用于环境嗜极菌和嗜盐菌分离物的高通量蛋白质分型方法。微生物是从智利高原高海拔安第斯山脉湖泊(海拔 3700 - 4300 米)的样本中分离出来的,这些湖泊代表的地球环境与其他星球的条件相似。总共培养了 66 种微生物,并通过蛋白质分型和 16S rRNA 基因扩增子测序进行了鉴定。两种方法对所有分离物都揭示了相同的属鉴定结果,但三种分离物除外,这三种分离物可能代表尚未根据其肽组进行分类学表征的生物。蛋白质分型能够表明副球菌科和 Chromatiaceae/Alteromonadaceae 科中存在两个潜在的新属,而这些属仅被 16S rRNA 扩增子测序方法所忽略。本文强调,蛋白质分型有可能发现来自极端环境的未描述的微生物。关键词:串联质谱蛋白质分型、阿塔卡马沙漠、高原、高海拔安第斯山脉湖泊、极端微生物、嗜盐菌■简介

通过先进的原型技术探索安第斯高海拔湖泊极端微生物

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