1 Respucation of ResjudmentBioMédicen Red de Enfermedes Raras(Ciberer),西班牙巴塞罗那; 2大学庞贝·法布拉大学(UPF),西班牙巴塞罗那; 3西班牙巴塞罗那科学技术研究所(Bisti)基因组调节中心(CNAG-CRG)的Centro NacionaldeAnálisisGenómica(CNAG-CRG); 4 Isglobal,西班牙巴塞罗那; 5西班牙巴塞罗那巴塞罗那科学技术学院基因组监管中心(CRG); 6 CiberEpidemiologíay SaludPública(Ciberesp),西班牙巴塞罗那; 7医学基因组学集团,圣地亚哥大学,西班牙圣地亚哥·德·孔波斯特拉; 8英国布拉德福德的布拉德福德教学医院NHS基金会信托基金Bradford健康研究所; 9大学格勒诺布尔(Grenoble Alpes),Inserm,CNRS,环境流行病学团队,用于繁殖和呼吸遗产,法国格勒诺布尔; 10日环境科学系,立陶宛Kaunas Vytautas Magnus University; 11挪威挪威公共卫生学院环境卫生部;挪威; 12社会医学系,克里特岛克里特大学,希腊克里特岛; 13美国南加州大学凯克医学院预防医学系,美国洛杉矶,美国; 14 Medicine Genomics Group,Ciberer,Santiago de Compostela大学,西班牙圣地亚哥De Costela; 15加利西亚州基因组医学基金会,西班牙圣地亚哥·德·波多拉(Santiago de Costela); 16定量基因组医学实验室(QGENOMICS),西班牙巴塞罗那的埃斯普尔·德尔·洛布雷加; 17 Departoment de Biomedicine,DeNeurociències,巴塞罗那大学,巴塞罗那大学,西班牙
多摩学数据的集成可以提供有关来自不同层的生物分子的信息,以系统地说明复杂的生物学。在这里,我们建立了一个多摩斯图集,其中包含132,570个转录本,44,473种蛋白质,19,970个磷蛋白和12,427架乙酰蛋白质,跨小麦植物和生殖相。使用此地图集,我们阐明了转录调节网络,翻译后修饰(PTM)的贡献以及转录水平对蛋白质丰度的贡献,以及小麦中的同性恋表达和PTM有偏见。与小麦发育和疾病有关的基因/蛋白质进行了系统的分析,从而确定了控制小麦晶粒质量和抗病性相关基因的种子蛋白的磷酸化和/或乙酰化修饰。最后,覆盖了Tahda9的独特蛋白质模块TAHDA9-TAP5CS1,该模块由TAHDA9指定TAP5CS1的去乙酰化,可通过增加的脯氨酸含量来调节对小麦冠状腐烂的抗小麦抗性。我们的Atlas对小麦和相关农作物中的分子生物学和育种研究具有巨大的希望。
这项研究的主要目的是评估失眠症 - 焦虑合并症与大型前瞻性队列中2型糖尿病(T2D)的关联。我们从法国Nutrinet-Santé同类中选择了没有糖尿病的成年人,他们完成了Spielberger州特征焦虑量表的特质焦虑量表(STAI-T,2013–2016)和睡眠问卷(2014年);失眠是根据既定标准定义的。使用多变量COX模型,我们比较了4组的T2D风险:没有失眠或焦虑(参考),单独失眠,单独焦虑(STAI-T≥40)以及合并症的焦虑和失眠。在35,014名参与者中(平均基线年龄:52.4±14.0岁; 76%的女性),378(1.1%)在平均5.9±2.1岁的平均随访中发展了T2D。总体而言,28.5%的样本单独患有焦虑症,仅7.5% - 单独使用症状,而12.5%则是疾病。在完全调整的模型中,较高的T2D风险与焦虑 - 刺激性合并症有关(HR = 1.40; 95%CI 1.01,1.94),但与没有失眠或焦虑的组相比,每种疾病分别与每个疾病相比。这些发现支持了成年人群的合并症与入射T2D之间的正相关。使用精神障碍临床诊断的未来研究可以证实发现的结果,并指导糖尿病预防计划。
最初是公共场所:Werhahn,Julia E; Smigileski,卢克斯; SACU,SEDA;穆尔,苏珊娜; Wirelinger,David;没事,吉利;母亲,Le-Andra M; Glennon,Jeffrey C; Firstra,Peter J; Dietrich,Andrea;拖延,蕾妮·斯莫尔; Acgregin,Pascal M;霍尔兹(Holz),纳西(Nathie E);京,莎拉; Banaschewski,Tobias; Sume,Melanie C; Schulze,Ulrike M e; Lythgo,David J; Sethi,Arjun;克雷格,迈克尔; Mastroiani,数学; Sagar-Ouryhli,伊利亚斯; Santush,Paramaa J;罗莎,米雷亚;巴尔加罗,努里亚; Castro-Fornis,Josefina; Arango,Celso; Penzol,Maria J; Switch,Marcel P;弗兰克斯,巴拉拉;通常,Jan K;苏珊(Susanne)沃尔兹(Waltza);丹尼尔·布兰奇(Brange)(2023)。不同的全脑功能连通性相关性或儿童和青少年白人破坏性行为的反应性侵略性和死亡的反应性特征。神经图像:临床,40:103542。doi:https://doi.org/10,1016/j.nicl
图1:我们方法的示意图描述。要描述平衡f,我们需要以下步骤:(1)确定缩放参数ε并重新分发分布f满足的方程; (2)将分布F转换为U.转化的分布u是密度F的对数,在无性繁殖情况下按比率ε归一化,在无穷小的性繁殖案例中由ε2归一化; (3)将U的极限方程式确定为ε→0(橙色框),并推断出宏观特性(绿色框),例如平均适应度λ0,种群中的平均相对表型z ∗ 0,进化滞后| z ∗ 0 |或平衡VAR(F)处的表型方差。
预测人口适应不断变化的环境对于评估人类活动对生物多样性的影响至关重要。许多理论研究通过对围绕最佳表型稳定选择的定量性状的演变进行建模,从而解决了这个问题,该定量性状的进化是在最佳表型周围稳定选择的,该表型的价值随着时间的流逝而连续地转移。在这种情况下,人口命运是由于性状的平衡分布而引起的,相对于移动最佳效果。这样的分布可能随选择形状,繁殖系统,基因座数量,突变内核或其相互作用而变化。在这里,我们开发了一种方法,该方法可以直接从表型分布的整个概况直接从表型分布的整个概况中进行定量测量,而没有任何先验的形状。我们研究了两个不同的繁殖系统(无性和无穷小的性模型),具有各种形式的选择。
注意力/多动症(ADHD)是一种异性神经发育状况,同时发生条件的流行率很高,导致长期管理中的困难增加。全基因组关联研究已经鉴定了多动症和同时发生的psy-哲学疾病之间共享的变体。但是,遗传机制尚未完全理解。我们将基因表达和空间组织数据整合到了胎儿和成人皮质组织中推定的因果ADHD基因的两样本的孟德尔随机研究中。我们在皮质组织中鉴定了多动症的四个基因(胎儿:ST3GAL3,PTPRF,PIDD1;成人:ST3GAL3,TIE1)。蛋白质 - 与因果ADHD基因所鉴定的生物学途径相结合的蛋白质相互作用数据库,这些途径将这些基因与条件(例如类风湿关节炎)和生物标志物(例如淋巴细胞计数)联系起来,但已知与ADHD相关,但没有先前显示的遗传关系。在成年肝组织上重复进行分析,在成年肝组织中,假定的因果ADHD基因ST3GAL3与胆固醇特征有关。此分析提供了对组织依赖性的时间关系,同时存在性状和生物标志物之间的依赖性时间关系。重要的是,它提供了先前研究和未研究的同时存在条件之间的遗传相互作用的证据。
热应激是影响全球小麦产生和生产力的关键因素。在这项研究中,在500种研究的种质系中,分析了126种小麦基因型在十二个不同的环境条件下生长的小麦基因型。使用五个生化参数,包括谷物蛋白含量(GPC),谷物淀粉糖含量(GAC),谷物总溶解糖(TSS),晶粒铁(FE)和六含锌(Zn)含量分析(六)多型GWAS(M),使用35 K单核苷酸多态性(SNP)基因分型测定和性状数据(包括谷物蛋白含量(GPC),谷物淀粉糖含量(GAC),谷物总糖(TSS),六个多型GWAS(M)含量GWAS(M),这揭示了与晶粒质量参数相关的67个稳定的定量性状核苷酸(QTN),解释了在热应激条件下的3%至44.5%的表型变化。通过考虑至少三个GWAS模型和三个位置的共识结果,最终的QTN被降低至16个,其中12个是新的发现。值得注意的是,分别通过高素质等位基因聚合酶链反应(KASP)方法验证了两个分别与晶粒Fe和Zn相关的新标记,即AX-94461119(AX-94461119(染色体2A)和AX-95220192(染色体7D)。候选基因,包括含P环的核苷三磷酸水解酶(NTPases),Bowman-Birk型蛋白酶抑制剂(BBI)和NPSN13蛋白。这些基因可以作为增强质量特征和未来小麦改善计划中耐热性的潜在目标。
抽象背景:磷是所有生物体中必不可少的营养素,目前,由于其全球稀缺,磷从排泄物产生的环境影响以及由于其以植物中的植物形式存储而引起的消化率较低。在家禽中,磷利用受到回肠菌群和宿主遗传学的组成的影响。在我们的研究中,我们分析了宿主遗传学对回肠菌群组成的影响,以及回肠细菌属的相对丰度与日本鹌鹑中磷的相对丰度与磷利用和相关定量性状的关系。用4K基因组的单核苷酸多态性(SNP)对758个鹌鹑的F2交叉进行了基因分型,并使用靶扩增子测序对回肠菌群的组成进行了表征。遗传性,并针对可遗传的属进行了宿主的定量性状基因座(QTL)链接映射。使用结构方程模型估算了细菌属和定量性状之间的表型和遗传相关性以及递归关系。采用基因组最佳线性无偏预测(GBLUP)和微生物(M)BLUP全息素选择方法,用于评估基于宿主基因组和基于ileum Microbobiota组成的可遗传的磷利用的繁殖可行性。结果:在检查的59个细菌属中,有24个显示出显着的遗传力(名义P≤0.05),范围从0.04到0.17。对于这些属,绘制了六个全基因组显着的QTL。发现了显着的递归效应,从而通过鹌鹑回肠中的微生物群组成来支持间接宿主遗传对宿主定量性状的影响。交叉验证的微生物和基因组预测准确性证实了微生物组成和宿主遗传学对宿主定量性状的强烈影响,因为基于基于传统的微生物介导的成分的GBLUP精确度与基于基于基因组范围Snps的常规GBLUP的精确度相似。结论:我们的结果表明,宿主遗传学对回肠微生物群的组成产生了显着影响,并证实了回肠微生物群的宿主遗传学和组成对宿主的定量性状有影响。这提供了基于宿主基因组和回肠菌群组成的可遗传部分改善磷利用的可能性。