XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search Systemyeast
工程的酵母细胞模拟CD19+癌症控制CAR T细胞激活
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。它是制作
范围范围的定量转录组和蛋白质组揭示了酵母中基因表达变异的明显遗传控制
基因表达的调节对应于基因组中编码的信息转化为表型的过程中的关键步骤。尽管已经对转录水平变化的遗传起源进行了广泛的分析，但我们的知识仍然非常有限，因为人群水平上蛋白质丰度变异的遗传起源。在这里，我们生成了近一千个天然酵母菌株的定量蛋白质组。通过与其转录组相比，我们的分析共同表明，转录组和蛋白质组显然是两种不同的调节水平，受自然种群中不同遗传基础的控制。在一起，我们的结果突出了访问这两个级别的基因表达以更好地理解基因型 - 表型关系的相关性。
通过工程生物传感器
高价值蛋白质和酶的分泌是合成生物学经济的基础；允许在生产过程中连续发酵和蛋白质纯化而无需细胞裂解。大多数真核蛋白分泌由N末端信号肽编码；但是，信号肽序列变化对给定蛋白的分泌效率的强大影响尚未很好地定义。尽管天然信号肽序列多样性高，但大多数重组蛋白分泌系统仅采用少数表征良好的信号肽。此外，启动子和终止剂的选择可以显着影响分泌效率，但筛选众多遗传构建体以使最佳序列效率低下。在这里，我们调整了酵母G蛋白偶联受体生物传感器，以测量与任何感兴趣蛋白共归因于肽的肽标签的浓度。蛋白质分泌效率可以通过诱导受体激活下游的荧光报告基因来量化。此功能可以使用一锅组合金门克隆组装，对6000多个启动子，信号肽和终结器的6000多个组合进行高通量筛选。我们证明了这种生物传感器可以快速识别分泌和量化分泌水平的最佳组合。
使用非六氢酒酵母的机会...
Résumé。气候变化以及有机和更可持续的酿酒的趋势强调了使用生物学方法论的必要性。减少了SO 2的使用，减少葡萄酒乙醇含量的需求以及减少或避免使用化学植物学产品的需求促使人们寻求替代实践。在这种情况下，使用非糖果酵母有望实现环境，经济和健康可持续性目标。在这里，在整个酿酒链中，非糖酵母酵母的各种可能用途，从葡萄园进行植物学保护和控制葡萄微生物群的控制到在发酵前和发酵阶段的生物控制阶段，以减少杂种含量的使用，以减少葡萄酒的使用，以减少葡萄酒的使用，以减少葡萄酒的含量，以便在葡萄酒中使用葡萄酒的含量，以便在葡萄酒中使用葡萄酒的含量特殊葡萄酒和收获后。文献充分证明了这些用途，也与葡萄酒的感觉分析概况的改善和复杂性的提高有关。
研究人员开发出基于酵母的羟基脲替代品用于 DNA 研究
该研究成果发表在《美国国家科学院院刊》上，由科罗拉多州立大学生物化学和分子生物学系助理教授 Grant Schauer 领导。该研究重点研究羟基脲，这是一种用于临床治疗癌症的化疗药物，也经常用于研究以阻止细胞发育周期。这样做可以让研究人员更好地探索基因组 DNA 在细胞分裂前准确复制的复杂过程。
sumoylation调节酵母和胰腺导管腺癌细胞中的EIF5A活性
©作者2024。Open Access本文是根据Creative Commons Attribution 4.0 International许可获得许可的，该许可允许以任何媒介或格式使用，共享，适应，分发和复制，只要您对原始作者和来源提供适当的信誉，请提供与创意共享许可证的链接，并指出是否进行了更改。本文中的图像或其他第三方材料包含在文章的创意共享许可中，除非在伴侣的信用额度中另有说明。如果本文的创意共享许可中未包含材料，并且您的预期用途不受法定法规的允许或超过允许的用途，则您需要直接从版权所有者那里获得许可。要查看此许可证的副本，请访问http：// creativecommons.org/licenses/4.0/。
最终合成酵母染色体完成，为生物技术进步铺平道路
该项目的共同负责人、澳大利亚研究理事会合成生物学卓越中心主任、杰出教授伊恩·保尔森 (Ian Paulsen) 表示：“通过成功构建和调试最终的合成染色体，我们帮助完成了一个强大的工程生物学平台，这可能会彻底改变我们生产药品、可持续材料和其他重要资源的方式。”
酵母合成基因组学中 DNA 突变对核小体位置影响的全基因组预测
如今，基因改造基因组经常用于许多基础和应用研究领域。在许多研究中，编码或非编码区域被故意修改，以改变蛋白质序列或基因表达水平。修改基因组中的一个或多个核苷酸也会导致基因表观遗传调控的意外变化。因此，在设计具有许多突变的合成基因组时，能够预测这些突变对染色质的影响将非常有用。我们在此开发了一种深度学习方法，可以量化每个可能的单个突变对整个酿酒酵母基因组上核小体位置的影响。这种类型的注释轨道可用于设计改良的酿酒酵母基因组。我们进一步强调了该轨道如何为驱动核小体在体内位置的序列依赖机制提供新的见解。关键词——深度学习、基因组学、酿酒酵母、突变、合成生物学、核小体、DNA 基序
酵母β-葡萄糖1,3/1,6
抽象引入酵母β-葡聚糖（YBG）通过激活巨噬细胞增强免疫系统而被认可，这是一种关键的防御机制。鉴于上呼吸道感染（URTI）对生产力和医疗保健成本的全球患病率和影响，YBG已将有望作为反复呼吸道感染的潜在治疗和预防策略。然而，关于YBG在较低剂量下与URTI，疲劳，免疫反应和它们如何影响肠道菌群组成的不确定性有关的YBG的疗效知之甚少。方法和分析这个为期12周的随机，双盲，安慰剂控制，平行组临床试验旨在评估YBG 1,3/1,6对呼吸道感染，疲劳，免疫标记和肠道健康的疗效。这项研究涉及198名18-59岁年龄的成年人，其应力量表10（评分14-26）和患者健康问卷9（得分≥9）进行了评估；在过去的6个月中，使用杰克逊冷量表评估了普通感冒的症状。这些参与者将被随机分为三组，以120 mg，204 mg或安慰剂接收YBG 1,3/1,6。结果措施包括呼吸道感染症状，疲劳，情绪状态和使用威斯康星州上呼吸道症状量表评估的生活质量，多维疲劳清单，情绪状态的概况和Short Form Form 36健康调查调查问卷。此外，还将进行全血分析和免疫，炎症和氧化应激生物标志物的评估。次要结果包括使用16S rRNA测序的粪便样品进行肠道菌群分析。伦理和传播该研究的研究方案已由马来西亚大学研究伦理委员会审查和批准（UKM/PPI/111/8/JEP-2023-211）。这些发现将被传播给参与者，医疗保健专业人员
酵母 synIX 菌株中端粒酶相关适应性缺陷和染色体替代技术的后果
Build-A-Genome 课程的作者：Breeana G. Anderson、Abena Apaw、Pavlo Bohutskyi、Erin Buchanan、Daniel Chang、Melinda Chen、Eric Cooper、Amanda Deliere、Kallie Drakos、Justin Dubin、Christopher Fernandez、Zheyuan Guo、Thomas Harrelson、Dongwon Lee、Jessica McDade、Scott Melamed、Héloise Muller、Adithya Murali、José U. Niño Rivera、Mira Patel、Mary Rodley、Jenna Schwarz、Nirav Shelat、Josh S. Sims、Barrett Steinberg、James Steinhardt、Rishi K. Trivedi、Christopher Von Dollen、Tianyi Wang、Remus Wong、Yijie Xu、Noah Young、Karen Zeller 和 Allen Zhan。 1 纽约大学朗格尼健康学院系统遗传学研究所和生物化学与分子药理学系，纽约，纽约州 10016，美国 2 约翰霍普金斯大学彭博公共卫生学院环境健康与工程系，美国马里兰州巴尔的摩 21205，美国 3 欧洲分子生物学实验室 (EMBL)，基因组生物学部，德国海德堡 69117 4 爱丁堡大学生物科学学院，英国爱丁堡 EH9 3BF 5 爱丁堡大学信息学院，英国爱丁堡 EH8 9AB 6 约翰霍普金斯大学惠廷工程学院生物医学工程系，美国马里兰州巴尔的摩 21218，美国 7 约翰霍普金斯大学克里格艺术与科学学院生物学系，美国马里兰州巴尔的摩 21218，美国 8 化学与生物分子工程系，约翰霍普金斯大学怀廷工程学院，美国马里兰州巴尔的摩 21218 9 洛克菲勒大学细胞与结构生物学实验室，美国纽约州纽约 10065 10 格罗宁根大学医学中心欧洲老龄化生物学研究所，荷兰格罗宁根 11 哈佛医学院麻省总医院病理学系，美国马萨诸塞州波士顿 02114 12 约翰霍普金斯大学医学院医学系/传染病科，美国马里兰州巴尔的摩 21205 13 约翰霍普金斯大学医学院高通量生物学中心，美国马里兰州巴尔的摩 21205 14 斯坦福大学斯坦福基因组技术中心，美国加利福尼亚州帕洛阿尔托 94304 15 斯坦福大学医学院遗传学系，美国加利福尼亚州斯坦福 94305 16 纽约大学生物医学工程系Tandon 工程学院，纽约布鲁克林 11201，美国 17 现地址：欧莱雅研究与创新，新泽西州克拉克 07066，美国 18 现地址：Pondicherry Biotech Private Limited，Pondicherry 工程学院校区，East Coast Road，Pillaichavady，Puducherry 605014，印度 19 现地址：哈佛大学陈曾熙公共卫生学院生物统计学系，马萨诸塞州波士顿 02115，美国 20 现地址：Neochromosome，Inc.，纽约长岛市 11101，美国 21 现地址：科学与工业研究中心，基因组学与综合生物学研究所，Sukhdev Vihar，Mathura Road，新德里 110025，印度 22 这些作者贡献相同 23 主要联系人 * 通讯：weimin.zhang@nyulangone.org (WZ)，jef.boeke@nyulangone.org (JDB), chandra@jhmi.edu (SC)