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World File Search System丙氨酸
对具有生成AI和密度引导的替代状态中的冷冻EM结构进行建模
建模原子坐标为目标冷冻电子显微镜图是结构确定的关键步骤。尽管最近进步，但具有多个功能状态的蛋白质仍然是一个挑战 - 尤其是当某些状态无法使用合适的分子模板时，地图分辨率不足以构建从头模型。这是一种常见的情况，例如，在药理学相关的膜结合受体和转运蛋白中。在这里，我们介绍了一种改进方法，其中i）几个初始模型是通过Alphafold2中多个序列比对（MSA）空间的随机次采样生成的，ii）将对基于结构的聚类进行基于结构的群集，iii）密度引导的分子动力学模拟从中心结构和IV中进行了模型，并在模型中进行了模型。与三种膜蛋白（降钙素受体样受体，L型氨基酸转运蛋白和丙氨酸 - 二孢菌碱转运蛋白）相比，这种方法提高了拟合精度。我们的结果表明，使用生成AI和基于模拟的精炼结合使用的集合结构有助于在几种膜蛋白家族中建立替代状态。
LY4066434 - 礼来肿瘤学管道数据库
缩写：EGFR=表皮生长因子受体；ERK=细胞外信号调节激酶；G12A=位置 12 的甘氨酸突变为丙氨酸；G12C=位置 12 的甘氨酸突变为半胱氨酸；G12D=位置 12 的甘氨酸突变为天冬氨酸；G13D；位置 13 的甘氨酸突变为天冬氨酸；G12R=位置 12 的甘氨酸突变为精氨酸；G12S=位置 12 的甘氨酸突变为丝氨酸；G12V=位置 12 的甘氨酸突变为缬氨酸；GDP=鸟苷二磷酸；GTP=鸟苷三磷酸；HRAS=Harvey 大鼠肉瘤病毒；KRAS=Kirsten 大鼠肉瘤病毒；LY=LY4066434； MEK=丝裂原活化蛋白激酶；NRAS=神经母细胞瘤 RAS 病毒致癌基因同源物；RAF=快速加速纤维肉瘤；RTK=受体酪氨酸激酶。参考文献：1. Kano Y 等人。Nat Commun。2019；10(1):224。2. Hofmann MH 等人。Cancer Discov。2022；12(4):924-937。3. Ostrem JML 等人。Nat Rev Drug Discov。2016；15(11):771-785。4. Prieto Vallejo L 等人。海报展示于：AACR 2023。摘要 B116。
非洲乙肝出生剂量疫苗接种介绍：
ALT 丙氨酸氨基转移酶 抗乙肝核心抗原的抗 HBc 抗体 抗乙肝 e 抗原的抗 HBe 抗体 抗乙肝表面抗原的抗 HBs 抗体 AST 天冬氨酸氨基转移酶 CGHE 全球消除肝炎联盟 CPAD 紧凑型预填充自毁装置 DALY 伤残调整生命年 DNA 脱氧核糖核酸 DTP 白喉、破伤风、百日咳 GDP 国内生产总值 GHSS 全球卫生部门战略 HBeAg 乙肝 e 抗原 HBIG 乙肝免疫球蛋白 HBsAg 乙肝表面抗原 HBV 乙肝病毒 HBV DNA 乙肝病毒脱氧核糖核酸 HCC 肝细胞癌 HepB 乙肝疫苗 HepB3 三剂乙肝婴儿疫苗 HepB-BD 乙肝出生剂量 HIV 人类免疫缺陷病毒 ICER 增量成本效益比 IgG免疫球蛋白 G IgM 免疫球蛋白 M mIU/ml 毫国际单位每毫升 MTCT 母婴传播 NITAG 国家免疫技术咨询组 rDNA 重组脱氧核糖核酸 TFGH 全球卫生工作组 U/L 单位每升 ULN 正常上限 UN 联合国 US CDC 美国疾病控制与预防中心 WHO 世界卫生组织 WHO AFRO 世界卫生组织非洲区域办事处
sibiricum saponin乳酸菌酸性细菌组合通过调节氨基酸代谢
摘要：一些研究表明，植物提取物和益生菌的组合可能是治疗2型糖尿病（T2DM）的更好方法，而不是单个干预措施。但是，在这方面，相对较少的相关报告仍然相对较少。因此，本研究旨在研究sibiricum saponin（PSS）和乳酸细菌（LAB）组合的治疗是否可以更好地管理T2DM。和组合的抗糖尿病机制是从葡萄糖代谢，微生物组和代谢组的角度研究的。结果表明，PSS+LAB可以更好地提高FBG水平，胰岛素敏感性，脂质代谢障碍和肝功能。蛋白质分析表明，PSS+LAB治疗显着增加了T2DM小鼠肝脏中P-PI3K/PI3K，P-AKT/AKT，GLUT2，IRS2和GSK-3β的表达，同时抑制FOXO1的表达。这种组合对肠道菌群的组成和丰度进行了积极调节。代谢组分析表明，与仅PSS治疗相比，该组合治疗的肠道微生物群代谢产物的变化更多。实验室+PSS对肠道菌群的改变导致丙氨酸，天冬氨酸和葡萄糖代谢途径的显着变化。这项研究可能为植物提取物和益生菌在T2DM的管理中的联合应用提供理论基础。
OMA1氧化还原站点控制线粒体稳态，肉瘤生长和免疫原性
侵袭性肿瘤通常表现出线粒体功能障碍。在氧化应激后，线粒体通过OMA1介导的融合效应子OPA1的裂解会经历填充。在酵母中，氧化还原传感开关参与OMA1激活。OMA1的 3D建模慰问了半胱氨酸403可能参与哺乳动物细胞中类似传感器的观念。 使用Prime编辑，我们开发了一种小鼠肉瘤细胞系，其中OMA1半胱氨酸403在丙氨酸中突变。 突变细胞显示出对应激的线粒体反应受损，包括ATP产生，减少术，对凋亡的耐药性和增强的线粒体DNA释放。 这种突变阻止了肿瘤的发育，但不能具有裸体或CDC1树突状细胞 - 有效的小鼠。 这些细胞在突变肿瘤中积聚的主要CD8 +淋巴细胞，而它们的耗竭延迟肿瘤控制。 因此，OMA1失活增加了抗肿瘤免疫的发展。 患有复杂基因组软组织肉瘤的患者在OMA1和OPA1转录本水平上显示出变化。 OPA1在原发性肿瘤中的高表达与手术后的无转移生存期和抗肿瘤免疫特征的低表达相关。 靶向OMA1活性可能会增强肉瘤的免疫原性。3D建模慰问了半胱氨酸403可能参与哺乳动物细胞中类似传感器的观念。使用Prime编辑，我们开发了一种小鼠肉瘤细胞系，其中OMA1半胱氨酸403在丙氨酸中突变。突变细胞显示出对应激的线粒体反应受损，包括ATP产生，减少术，对凋亡的耐药性和增强的线粒体DNA释放。这种突变阻止了肿瘤的发育，但不能具有裸体或CDC1树突状细胞 - 有效的小鼠。这些细胞在突变肿瘤中积聚的主要CD8 +淋巴细胞，而它们的耗竭延迟肿瘤控制。因此，OMA1失活增加了抗肿瘤免疫的发展。 患有复杂基因组软组织肉瘤的患者在OMA1和OPA1转录本水平上显示出变化。 OPA1在原发性肿瘤中的高表达与手术后的无转移生存期和抗肿瘤免疫特征的低表达相关。 靶向OMA1活性可能会增强肉瘤的免疫原性。因此，OMA1失活增加了抗肿瘤免疫的发展。患有复杂基因组软组织肉瘤的患者在OMA1和OPA1转录本水平上显示出变化。OPA1在原发性肿瘤中的高表达与手术后的无转移生存期和抗肿瘤免疫特征的低表达相关。 靶向OMA1活性可能会增强肉瘤的免疫原性。OPA1在原发性肿瘤中的高表达与手术后的无转移生存期和抗肿瘤免疫特征的低表达相关。靶向OMA1活性可能会增强肉瘤的免疫原性。
一种遗传的mtDNA突变重塑巨噬细胞和体内炎症细胞因子反应
巨噬细胞中线粒体生物能的受损可能会驱动高炎性细胞因子反应1-6，但是是否也可能是由遗传的mtDNA突变引起的。在这里，我们使用一种多摩变方法来解决这个问题，该方法将超分辨率成像和代谢分析整合到来自丙氨酸7的线粒体trNA中异质质突变（M.5019a> g）的线粒体疾病的小鼠模型中的巨噬细胞。这些M.5019a> G巨噬细胞在呼吸链复合物中表现出缺陷，并且由于中骨内部翻译减少而导致氧化磷酸化（OXPHOS）。以适应这种代谢应激，线粒体融合，还原性谷氨酰胺代谢和有氧糖酵解均增加。在炎症激活后，I型干扰素（IFN-I）释放得到增强，而在M.5019a> G巨噬细胞中限制了促炎性细胞因子和黄磷脂的产生。最后，使用M.5019a> G小鼠的体内内毒素性模型显示IFN-I水平和疾病行为升高。总而言之，我们的研究确定了响应致病性mtDNA突变的先天免疫信号传导的意外失衡，对MTDNA疾病患者的病理发展具有重要意义。8。
合作。 Emreİnak教授lect。博士学位AlperDemïrhan个人信息
lect。Phd Alper Demirhan Personal Information EMAIL: Demirhana@ankara.edu.tr Web: https://avesis.ankara.edu.tr/demirhana International Researcher IDS ORCID: 0000-0001-6326-874x SCOPUSID: 57212485719 ID: 403078 Education Information Doctorate, Cranfield University, Defense and Security, England 2019 - 2023年研究生，EGE大学，生物技术，土耳其，2018年至2021年，本科生，Dokuz Elekil大学，工程学院，电子工程系，土耳其，2016年 - 2016年学科，IMPEDIMETIMETIMETIMETRIC HEMOGLOBIBIN HYMOGLOBIN HAMEUNOSESOR，用于胃肠道，CRANFIENN BLEEDINED，CRANFIEND PORTSTIRE，CRANFIEND PORTSTARN，CRANFIEND PORTSTRABLE，SECUCITY，SECUCITY，SECUCIANT 3022333。生物分子互动的电化学应用，EGE大学，2021年设备，生物医学工程，电气和电子工程发表的期刊文章，由SCI，SSCI和AHCI I. 血红蛋白的低成本微型免疫传感器作为胃肠道出血Demirhan A.，Chianella I.，Patil S. B.，Khalid A. Analyst，第149卷，第4期，第1081-1089页，2024年（SCI-Expected）II。 低成本的高分辨率预静毒仪，用于核酸和生物分子相互作用的电化学检测Demirhan A.，EksïnE。，Kilic Y.，Erdem A. Micromines，第13卷，第13卷，第1022222222222页，第2022页（Sci-Expand）iii。 定量测定H2O2用于检测丙氨酸氨基转移酶薄膜薄膜薄膜薄膜，orakci B.，Koprulu M.，Demirhan A.，ilhan-ayisi E.Phd Alper Demirhan Personal Information EMAIL: Demirhana@ankara.edu.tr Web: https://avesis.ankara.edu.tr/demirhana International Researcher IDS ORCID: 0000-0001-6326-874x SCOPUSID: 57212485719 ID: 403078 Education Information Doctorate, Cranfield University, Defense and Security, England 2019 - 2023年研究生，EGE大学，生物技术，土耳其，2018年至2021年，本科生，Dokuz Elekil大学，工程学院，电子工程系，土耳其，2016年 - 2016年学科，IMPEDIMETIMETIMETIMETRIC HEMOGLOBIBIN HYMOGLOBIN HAMEUNOSESOR，用于胃肠道，CRANFIENN BLEEDINED，CRANFIEND PORTSTIRE，CRANFIEND PORTSTARN，CRANFIEND PORTSTRABLE，SECUCITY，SECUCITY，SECUCIANT 3022333。生物分子互动的电化学应用，EGE大学，2021年设备，生物医学工程，电气和电子工程发表的期刊文章，由SCI，SSCI和AHCI I.血红蛋白的低成本微型免疫传感器作为胃肠道出血Demirhan A.，Chianella I.，Patil S. B.，Khalid A.Analyst，第149卷，第4期，第1081-1089页，2024年（SCI-Expected）II。低成本的高分辨率预静毒仪，用于核酸和生物分子相互作用的电化学检测Demirhan A.，EksïnE。，Kilic Y.，Erdem A. Micromines，第13卷，第13卷，第1022222222222页，第2022页（Sci-Expand）iii。定量测定H2O2用于检测丙氨酸氨基转移酶薄膜薄膜薄膜薄膜，orakci B.，Koprulu M.，Demirhan A.，ilhan-ayisi E.
通过线粒体对小胶质细胞的神经元控制
源自蓝细菌的微生物毒素β -N-甲基氨基氨基 - L-丙氨酸（BMAA）靶向神经元线粒体，从而激活神经元的先天免疫，从而激活神经元素。尽管已知会调节脑部炎症，但异常小胶质功能在神经退行性过程中的精确作用仍然难以捉摸。为了确定神经元是否信号小胶质细胞，我们用BMAA处理了原发性皮质神经元，然后将其与N9小胶质细胞系共同培养。我们的观察结果表明，小胶质细胞激活需要初始神经元启动。与皮质神经元中观察到的相反，BMAA无法激活N9细胞中的炎症途径。我们观察到小胶质细胞激活取决于BMAA处理的神经元信号的线粒体功能障碍。在这种情况下，由于N9细胞中的线粒体损伤，NLRP3促炎途径被激活。这些结果表明，在BMAA存在下的小胶质细胞激活取决于神经元信号传导。这项研究提供了证据，表明神经元可能触发小胶质细胞激活和随后的神经炎症。此外，我们至少在初始阶段至少在改善神经元的先天免疫激活中可能具有保护作用。这项工作通过将主要作用分配给神经元来挑战当前对神经炎症的理解。
探索阿哌林作为口服的有希望的自然疗法
口服鳞状细胞癌（OSCC）是一种头颈癌，对患者的生活质量有害。手术，放射线和化学疗法是标准治疗程序，通常具有不良反应并且有效性受到限制，因此需要寻求其他治疗技术。植物化学物质Aparine目前被认为是OSCC的潜在有效治疗方法。根据文献，阿哌arine的葡萄碱具有广泛的化学元素，包括槲皮素和鲁丁等类黄酮，菊痛，如芦糖苷和甲核酸蛋白酶，以及氯仿和咖啡酸等酚类酸。这些化学物质具有抗氧化剂，抗癌和免疫调节特性，这使得丙氨酸成为OSCC的潜在自然处理。预先研究证明了其通过诱导凋亡和/或调节免疫反应的凋亡和/或体内抑制癌细胞发育的能力。此外，G.Aparine提取物已被用作各种恶性肿瘤中的肝保护剂，包括乳腺癌和黑色素瘤。这是AparineExtracts的Galium aparineExtracts被证明的抗氧化剂和抗癌特性的结果，在体内，我们最终可以拥有类似的属性。为了充分了解其作用方式，并可能对改善口服鳞状细胞癌患者的结局产生影响，需要进行更多的研究和临床试验。该论文概述了阿帕林级的生物学活性，组成和作为强大的抗癌药物的作用，以及潜在的未来研究方向。
AASLD 非酒精性脂肪性肝病临床评估和管理实践指南
缩写：AASLD，美国肝病研究协会；AI，人工智能；ALT，丙氨酸氨基转移酶；AST，天冬氨酸氨基转移酶；AUROC，受试者工作特征曲线下面积；BMI，身体质量指数；CAP，控制衰减参数；CKD，慢性肾病；cT1，校正 T1；CVD，心血管疾病；DM，糖尿病；DNL，从头脂肪生成；DPP-4，二肽基肽酶-4；ELF，增强型肝纤维化；FAST，FibroScan-AST；FDA，美国食品药品监督管理局；FIB-4，纤维化-4 指数；GH，生长激素；GLP-1RA，胰高血糖素样肽-1 受体激动剂；LDL-C，低密度脂蛋白胆固醇；LSM，肝脏硬度测量；MAST，来自 MRI-PDFF、MRE 和血清 AST 的评分； MEFIB，MRE 与 FIB-4 联合使用；MRE，磁共振弹性成像；NIT，无创性检查；OSA，阻塞性睡眠呼吸暂停；PCOS，多囊卵巢综合征；PDFF，质子密度脂肪分数；PIVENS，吡格列酮、维生素 E 和安慰剂治疗非糖尿病性 NASH 患者的疗效对比；RCT，随机对照试验；SGLT-2，钠葡萄糖协同转运蛋白-2；T2DM，2 型糖尿病；TM6SF2，跨膜 6 超家族成员 2；UDCA，熊去氧胆酸；VCTE，振动控制弹性成像