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让它发光细菌转化迷你实验室
水平和垂直基因转移是细菌获取遗传物质的两种基本方式。垂直基因转移是指在细胞分裂过程中，遗传信息从亲本细菌传递给其后代。这一过程本质上相当于细菌在更复杂的生物体中的遗传。当细菌细胞通过二分裂分裂时，它会复制其 DNA，每个子细胞都会收到一份这种遗传物质的副本。这种方法确保遗传特性（例如负责代谢过程的基因）能够持续地代代相传，从而使种群保留有利于生存的适应性。水平基因转移是指质粒从一个细菌传递到另一个细菌。这种情况可能发生在自然界和实验室中，在实验室中称为转化。
评估γH2AX核焦点数和大小...
摘要：这项研究的目的是评估在两个相关的辐射敏感性CHO10B2和IRS-20细胞（DNA-PKC中有缺陷）的两个相关细胞系中低和高线性能量转移辐射引起的DNA损伤。双链断裂。焦点的数量是细胞系和辐射类型的剂量的函数。然而，IRS-20细胞显示出比亲本cho10b2更高的焦点。在锂照射后，两种细胞系都观察到了焦点大小的增加。这可以归因于DNA损伤的簇。此外，锂诱导的每个核的较大焦点的数量随剂量增加，并与每个核的预期命中次数拟合。结论，γH2AX焦点大小提供了一种潜在的工具，可以表征与DNA损伤相关的细胞的内在放射敏性并比较不同质量辐射的影响。
单倍体胚胎：像妈妈还是像爸爸？
单倍体胚胎只含有一组亲本染色体（n），而不是经典的两组染色体（2n），一组来自母亲，一组来自父亲。尽管如此，单倍体胚胎及其随后的单倍体幼苗代表了双单倍体（DH）技术的基础，而双单倍体（DH）技术是一种重要的植物育种工具[1,2]。DH技术可以简单地概括为：（i）生产单倍体胚胎，以及（ii）复制（复制粘贴）单倍体基因组以恢复正常倍性状态。DH技术可以实现高效的植物育种周期，主要是通过缩短创建固定遗传物质（自交系）的时间来实现的，因为只需要两代就可以获得纯合植物，而使用常规杂交则需要六代或更多代[1,2]。因此，DH流程可以快速评估植物的表型性状
技术数据表：MDCK.STAT1KO
图 1：STAT1 KO MDCK 细胞中产生的甲型流感病毒 (H1N1；ATCC ® VR-1736 ™)。 (A) WT 亲本和 MDCK.STAT1 KO 细胞产生的病毒上清液的免疫染色 TCID 50。 细胞以 0.01 的 MOI 感染甲型流感病毒。 感染后 48 小时收集上清液，并按照指示的稀释度重新感染 WT MDCK 细胞。 绿色 - 抗甲型流感病毒染色，蓝色 - 核染色。 细胞以 0.01 的 MOI 感染甲型流感病毒 48 小时，然后 (B) 计算感染后 48 小时 MDCK.STAT1KO 细胞中产生的甲型流感病毒上清液的 TCID 50。 (C) 感染后 48 小时 MDCK.STAT1KO 细胞中产生的甲型流感病毒基因组的 RT-PCR 定量。
MeiraGTx 的 AI 驱动启动子优化
合成了具有最高预测效力的构建体并在 HEK293T 细胞中进行了测试。第一代的结果表明，大多数增强子+启动子构建体的性能与母体 C6 启动子一样好或更好。特别是，构建体 C120 和 C124 分别表现出约 30% 和约 40% 的提高效力。同样，一些点突变导致性能提高 10% 到 30%。超突变构建体（采用迭代或贪婪方法）破坏了 HEK293T 细胞中的启动子活性。根据第一代的结果，我们合理地设计了一组新的构建体，这些构建体基于体外表达最高的构建体的组合。第二代在 HEK293T 细胞中进行了测试，所有构建体都表现出比亲本 C6 更高的表达。特别是，与原始 C6 构建体相比，构建体 C187 达到了约 2 倍的改善。
DNA——实验室、测试、品种
DNA – 实验室、测试、品种 DNA 测试，NKK 将结果集中注册在挪威养犬俱乐部的数据库中 DogWeb 在列表中找不到您的品种/测试？联系您的品种俱乐部 – 中央注册申请必须来自品种俱乐部的董事会。黄色标记的测试：在 NKK 注册幼犬时需要对亲本进行 DNA 测试。有关各个实验室的更多信息，请访问其自己的网站：NMBU 兽医学院：www.nmbu.no 瑞典农业科学大学：www.slu.se 哥本哈根大学：www.ku.dk 乌得勒支大学：www.uu.nl 汉诺威大学：www.uni-hannover.de 伯尔尼大学：www.unibe.ch MyDogDNA：www.mydogdna.com Laboklin：www.labogen.com/en OFA：www.offa.org NCSU（北卡罗来纳州立大学）：www.cvm.ncsu.edu 加州大学戴维斯分校：https://vgl.ucdavis.edu/ 2024 年 12 月 4 日更新
无性异源多倍体根结线虫的分阶段染色体规模基因组组装揭示了复杂的亚基因组结构
我们展示了异源多倍体根结线虫Meloidogyne javanica的染色体级基因组组装。我们发现M . javanica基因组主要是异源多倍体，包含两个亚基因组A和B，最有可能起源于两个祖先亲本物种的杂交。使用全长非嵌合转录本、与参考数据库的比较和从头算预测技术对组装进行了注释，并使用祖先k聚体谱分析对亚基因组进行了分阶段。亚基因组B似乎显示染色体重叠群的分裂，虽然亚基因组之间存在大量同源性，但我们还确定了缺乏同源性的区域，这些区域可能在杂交之前或之后在祖先基因组中发生了分化。这种带注释和分阶段的基因组组装为了解这些全球重要植物病原体的起源和遗传学提供了重要资源。
经基因证实，这是两种截然不同的古老蛇类——阿斯特里克斯 (Natrix astreptophora) 和毛拉蛇 (N. maura) 的杂交品种
利用两个线粒体 DNA 片段和六个核基因，我们确认了在西班牙西南部安达卢西亚（韦尔瓦市）捕获的一条形态中间的蛇，是雌性 Natrix astreptophora 和雄性 N. maura 的 F1 杂交种。这两个亲本物种在 2150 万年前分化，这就是它们的杂交能力惊人的原因。由于 N. astreptophora 的稀有性和西班牙西南部 N. maura 的数量丰富，使得 N. astreptophora 雌性很难找到同种雄性，因此促成了种间交配。面对之前发表的 N. astreptophora 和 N. maura 之间古老基因流动的基因组特征，我们的发现提出了一个问题：偶尔的杂交是否仍有助于这两个深度分化的古老类群之间持续交换遗传信息。
DIPA-CRISPR 是一种简单易行的昆虫基因编辑方法
目前昆虫基因编辑的方法需要将材料微注射到早期胚胎中。这严重限制了基因编辑在大量昆虫物种中的应用，特别是那些生殖系统无法获得早期胚胎进行注射的昆虫物种。为了克服这些限制，我们报告了一种简单易用的昆虫基因编辑方法，称为“直接亲本”CRISPR（DIPA-CRISPR）。我们表明，将 Cas9 核糖核蛋白 (RNP) 注射到成年雌性的血腔中可有效地在发育中的卵母细胞中引入可遗传的突变。重要的是，市售的标准 Cas9 蛋白可直接用于 DIPA-CRISPR，这使得这种方法非常实用和可行。DIPA-CRISPR 能够在无法应用传统方法的蟑螂和模型甲虫 Tribolium castaneum 中实现高效的基因编辑。由于其简单性和可及性，DIPA-CRISPR将极大地扩展基因编辑技术在各种昆虫中的应用。
顺式作用，亲和力调节IL-21免疫细胞免疫疗法的免疫细胞因子
尽管细胞因子疗法在某些癌症患者中表现出治愈作用，但由于伴随全身给药的炎症毒性特征，临床用途仍然有限。下一代细胞因子方法包括特定的靶向和条件信号传导，重点是肿瘤微环境或特定的免疫细胞群体。在这里，我们共享一种新的方法，用于使用Alphaseq平台来设计IL-21治疗候选者，具有提高稳定性并降低对IL-21受体的亲和力。当与CD8靶向抗体融合时，这些失调的候选者对亲本IL-21和强细胞偏置信号传导的分析有所改善。虽然父母IL-21导致鼠MC38肿瘤模型中的剂量限制性毒性，但局部局部在CD8+细胞或Tigit+细胞的IL-21引起了强烈的抗肿瘤反应。结合使用，Alphaseq Lab Platform和Alphabind ML平台允许发现和优化各种生物制剂。