1 蛋白质科学、蛋白质组学和表观遗传信号实验室(PPES)和综合个性化和精准肿瘤学网络(IPPON),安特卫普大学生物医学科学系,Campus Drie Eiken,Universiteitsplein 1,2610 Wilrijk,比利时;chandra.ace@gmail.com(CSC);claudina.pereznovo@uantwerpen.be(CP-N.);kendeclerck90@hotmail.com(KD);ajaypalagani@gmail.com(AP);xaveer.vanostade@uantwerpen.be(XVO)2 安特卫普可持续性和医学应用等离子体实验室(PLASMANT),安特卫普大学化学系,2610 Wilrijk,比利时;priyanka.shaw@uantwerpen.be(PS); annemie.bogaerts@uantwerpen.be (AB) 3 PamGene International BV, 5211 Hertogenbosch, 荷兰;srangarajan@pamgene.com 4 安特卫普生物医学信息学网络(Biomina),安特卫普大学信息学系,2610 Wilrijk,比利时;bart.cuypers@uantwerpen.be (BC);nicolas.deneuter@uantwerpen.be (NDN);kris.laukens@uantwerpen.be (KL) 5 新加坡南洋理工大学李光前医学院淋巴细胞信号研究实验室,新加坡 1308232,新加坡;fazil.turabe@gmail.com (FMHUT);nkverma@ntu.edu.sg (NKV) 6 根特大学内科系血液学系,9000 根特,比利时; fritz.offner@ugent.be 7 根特大学生物分子医学系,9000 根特,比利时;pieter.vanvlierberghe@ugent.be * 通信地址:emilie.logie@uantwerpen.be (EL);wim.vandenberghe@uantwerpen.be (WVB);电话:+32-3265-2318 (EL) † 这些作者对本文的贡献相同。
1北京北京北京北京癌症医院和研究所(北京癌症医院)淋巴瘤淋巴瘤的致癌与转化研究的关键实验室; 2中国郑州大学和河南癌症医院附属癌症医院内科学系; 3中国南部肿瘤学的州主要实验室,孙子森大学癌症中心,中国广东广东广东的癌症医学合作中心4上海汤吉大学医学院上海医学院医学肿瘤学系,中国上海; 5中国哈尔滨的哈尔滨医科大学癌症医院; 6中国科学院癌症医院(IBMC)淋巴瘤系(IBMC)(IBMC),中国科学院(Zhejiang癌症医院),中国科学院,Hangzhou,P.R。中国; 7国家临床血液疾病研究中心实验血液学国家主要实验室,细胞生态系统实验室,中国; 7国家临床血液疾病研究中心实验血液学国家主要实验室,细胞生态系统实验室,
摘要:生物大分子之间的相互作用(主要是非共价相互作用)支撑着生物过程。然而,生物特异性化学的最新进展使得在体外和体内生物分子之间能够形成特定的共价键。本综述追溯了蛋白质中生物特异性化学的演变,强调了遗传编码的潜在生物反应性氨基酸的作用。这些氨基酸通过邻近生物反应性与相邻的天然基团选择性反应,从而实现有针对性的共价键。我们探索了旨在靶向不同蛋白质残基、核糖核酸和碳水化合物的各种潜在生物反应性氨基酸。然后,我们讨论了这些新型共价键如何驱动具有挑战性的蛋白质特性并捕获体内瞬时蛋白质 - 蛋白质和蛋白质 - RNA 相互作用。此外,我们还研究了共价肽作为潜在治疗剂和天然抗体位点特异性结合物的应用,强调了它们与靶分子形成稳定连接的能力。重点关注近距离反应疗法 (PERx),这是共价蛋白疗法的一项开创性技术。我们详细介绍了它在免疫疗法、病毒中和和靶向放射性核素治疗中的广泛应用。最后,我们介绍了生物特异性化学领域目前面临的挑战,并讨论了这一快速发展领域未来探索和进步的潜在途径。
当 1,3,5-三苯甲醛和 2,5-二氨基苯磺酸通过席夫碱缩合反应发生反应时,只需将溶剂从 DMF 切换到 DMSO,即可合成两种不同形态的双功能共价有机聚合物,从而得到包含花型(F-COP DMF)和环状(C-COP DMSO)形态的共价有机聚合物(COP)。通过使用 TEM、SEM、XRD、FT-IR 和 XPS 分析技术进行表征,比较了合成 COP 的化学和形态性质。除了形态各异之外,还发现这两种聚合物材料具有相似的化学性质,都带有质子酸 - SO 3 H 和路易斯碱 - C=N 官能团。随后,对这两种 COP 进行了评估,用于通过果糖脱水合成羟甲基糠醛(HMF),以研究其形态依赖的催化活性。
摘要:迫切需要改进治疗方法以更好地控制正在发生的 COVID-19 大流行。主要蛋白酶 M pro 在 SARS-CoV-2 复制中起着关键作用,因此成为抗病毒开发的一个有吸引力的靶点。我们寻求识别新型亲电弹头以有效共价抑制 M pro 。通过比较安装在普通支架上的一组弹头对 M pro 的功效,我们发现末端炔烃可以共价修饰 M pro 作为潜在弹头。我们的生化和 X 射线结构分析揭示了炔烃和 M pro 的催化半胱氨酸之间不可逆形成的乙烯基硫化物键。开发了基于炔烃抑制剂的可点击探针来测量目标参与、药物停留时间和脱靶效应。最好的含炔烃抑制剂在细胞感染模型中有效抑制了 SARS-CoV-2 感染。我们的研究结果凸显了炔烃作为潜在弹头的巨大潜力,可以靶向病毒及其他物质中的胱氨酸蛋白酶。■ 简介
(未通过同行评审认证)是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此预印本版的版权持有人于2023年11月19日发布。 https://doi.org/10.1101/2023.11.12.566743 doi:Biorxiv Preprint
对表面上的冰和石灰尺度晶体的不必要积聚是对重大经济和可持续性的长期挑战。被动抑制液体液体表面的糖霜和缩放通常不足,在恶劣条件下容易受到表面衰竭的影响,并且不适合长期/现实生活中的使用情况。这样的表面通常需要多种功能,例如光学透明度,可靠的冲击电阻以及防止低表面能液体污染的能力。不幸的是,最有前途的进步依赖于使用生物持久性和/或剧毒的每种氟化化合物。在这里表明有机,网状介孔结构,共价有机框架(COF)可能是溶液。通过利用无缺陷COF的简单且可扩展的合成和合理的合成后功能化,制备了精确的纳米齿状(形态学)的纳米涂层,可以抑制分子水平的成核而不会损害相关污染的预防和鲁棒性。结果是一种简单的策略,以利用纳米配置效应,这显着延迟了表面上冰和尺度形成的成核。冰核被抑制至-28°C,在过饱和条件下避免了尺度的形成> 2周,并且在韦伯数字上影响的有机溶剂的射流> 10 5也被抗光透明度(> 92%)的表面抵抗。
用于治疗各种临床适应症,包括癌症、抗感染、胃肠道、中枢神经系统和心血管疾病。1–3 例如,阿司匹林是一种已使用了 100 多年的止痛药,它共价乙酰化环氧合酶-1 (COX-1) 的活性丝氨酸残基,而 COX-1 是一种在前列腺素生物合成中起关键作用的酶。4–6 除阿司匹林外,青霉素类抗生素是另一个经典的共价抑制剂例子,其中 β-内酰胺支架不可逆地与细菌 DD-转肽酶 (也称为青霉素结合蛋白) 的活性位点丝氨酸结合,从而使负责细菌细胞壁合成的酶失活。 7,8 尽管共价药物取得了成功,但在 2013 年首个共价激酶抑制剂依鲁替尼获批之前,共价药物在药物化学和药物开发中一直被忽视。人们之所以不愿使用共价药物,主要是因为人们担心由于反应性混乱、半抗原化和特异性药物相关毒性而导致的潜在脱靶毒性。9–11 研究表明,化学反应性药物代谢物可以与肝脏蛋白共价结合,从而引起肝毒性。12,13 放射性标记研究表明,产生的反应性物质与各种细胞蛋白共价结合,这可能导致细胞毒性。14 在某些情况下,反应性药物代谢物与蛋白质的共价结合可能具有免疫原性,导致患者出现过敏反应。1,15
为了确定基板的切口,XRD 用于精确测量布拉格角(衍射角)的变化,因为基板的旋转角度相对于入射的 X 射线束会发生变化。如果布拉格角随基板的旋转角度而变化,则表明晶圆上有切口。非零晶圆切口会导致 Omega 峰位随着晶圆旋转而增加或减少,因为晶面与晶圆表面并不完全平行。当晶圆旋转到平面朝向 X 射线束倾斜到最大值时,Omega 衍射峰将位于比布拉格角低一个角度,该角度的幅度等于切口的大小。例如,朝向 X 射线束的 1° 切口晶圆的 Omega 峰位将比布拉格角预测的低 1°。同样,如果切口大小相同但相对于光束的方向相反,Omega 峰值的角度将比布拉格角大 1°。当晶圆在光束中旋转时,切口会导致 Omega 峰值从最小值平稳移动到最大值,并且可以观察到 Omega 峰值在这些极限之间的偏移。
摘要:分子靶向放射性核素疗法 (TRT) 难以平衡疗效和安全性,因为目前增加肿瘤吸收的策略通常会改变药物药代动力学以延长血液循环和正常组织照射时间。我们在此报告了第一个共价蛋白 TRT,它通过与靶标发生不可逆反应,增加了肿瘤的放射性剂量,而不会改变药物的药代动力学特征或正常组织的生物分布。通过遗传密码扩展,我们将潜在的生物反应性氨基酸设计成纳米抗体,该抗体与其靶蛋白结合并通过邻近反应形成共价键,在体外、癌细胞和体内肿瘤上不可逆地交联靶标。放射性标记的共价纳米抗体显着增加了肿瘤中的放射性同位素水平并延长了肿瘤的停留时间,同时保持了快速的全身清除。此外,与 α 发射体锕-225 结合的共价纳米抗体比非共价纳米抗体更有效地抑制肿瘤生长,而不会引起组织毒性。这种化学策略将基于蛋白质的 TRT 从非共价模式转变为共价模式,改善了肿瘤对 TRT 的反应,并且可以很容易地扩展到针对广泛肿瘤靶点的多种蛋白质放射性药物。■ 简介