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Crispr2vec：机器学习模型预测 CRISPR 系统的脱靶切割
成簇的规律间隔短回文重复序列 (CRISPR)/CRISPR-Cas 系统彻底改变了基因编辑，可应用于治疗、诊断、农业和开发疾病模型。然而，CRISPR-Cas 存在脱靶效应——即在使用过程中导致基因组中出现非预期的遗传修饰。在这项工作中，我们提出了 crispr2vec：一种用于嵌入 CRISPR 单向导 RNA (sgRNA) 序列并预测脱靶切割的深度度量学习方法。给定一个固定的靶序列，我们表明我们学习到的嵌入可以忠实地表示潜在的脱靶。我们提出了一种专门针对 CRISPR 序列的新型三重采样策略，可提高嵌入的质量。我们表明，生成的嵌入可推广到不同的脱靶切割检测分析中。最后，我们证明了深度度量学习方法在预测脱靶切割方面的优势，与之前的文献相比，该方法在不同数据集上对可见和未可见的 sgRNA 进行交叉折叠验证。
薄玻璃切割中时间空气脉冲的效率
薄玻璃切割中的时间空气脉冲效率 Madalin-Stefan Radu、Cristian Sarpe、Elena Ramela Ciobotea、Bastian Zielinski、Radu Constantinescu、Thomas Baumert 和 Camilo Florian* *通讯作者电子邮件：camilo.florian@uni-kassel.de。这是以下文章的预印本：Radu、Madalin-Stefan、Sarpe、Cristian、Ciobotea、Elena Ramela、Zielinski、Bastian、Constantinescu、Radu、Baumert、Thomas 和 Florian、Camilo。 “时间艾里脉冲在薄玻璃切割中的效率” Zeitschrift für Physikalische Chemie，2024 年。最终认证和印刷版本可在线获取：https://doi.org/10.1515/zpch-2024- 0911 超短脉冲激光源是用于微和纳米加工大带隙介电材料的有用工具。这些脉冲的最大优势之一是能够达到高强度峰值，即使在对激光波长透明的材料中也能促进吸收。此外，如果修改脉冲时间分布，能量吸收可以烧蚀直径小、深度大的孔。在这项工作中，我们提出了初步结果，将三种类型的脉冲作为玻璃切割的前体：带宽受限（785 nm 时为 30 fs）、正色散和负色散时间艾里脉冲 (TAP)。所选材料为厚度为 170 μm 的钠钙玻璃，在不同激光能量和扫描速度下，以 1 kHz 的重复率在紧密（50 倍物镜）和松散（20 倍物镜）聚焦条件下进行刻划。激光加工后，使用自制的四点弯曲台通过机械应力对玻璃进行切割。我们分析了三种激光脉冲在表面和横截面上的刻划线质量以及断裂后所需的断裂力。我们报告称，与其他实施的脉冲相比，正 TAP 在玻璃样品上产生了整齐、平整的切割边缘。关键词：玻璃切割；超短脉冲激光；高纵横比结构；激光加工；时间脉冲整形；薄玻璃
复杂结构中单细胞的激光捕获显微切割...
激光捕获显微切割 (LCM) 是一种用于从组织切片中选择和获取细胞簇的新方法。一旦捕获，DNA、RNA 或蛋白质就可以轻松地从分离的细胞中提取出来，并通过常规 PCR、逆转录 (RT)-PCR 或聚丙烯酰胺凝胶电泳进行分析，包括蛋白质酶谱分析特定的大分子变化。在 LCM 中，附着在刚性支撑物上的热塑性聚合物涂层 [乙烯醋酸乙烯酯 (EVA)] 与组织切片接触。近红外激光脉冲精确激活微观选择的细胞簇上的 EVA 聚合物，然后将其结合到目标区域。从组织切片上移除 EVA 及其支撑物可获取选定的细胞聚集体以进行分子分析。这种使用平面转移 EVA 薄膜的初始 NIH LCM 方法最近已商业化，并已被证明是一种有效的常规显微切割技术，可用于许多实验室的后续大分子分析 -
用于高热负荷光束的金刚石通道切割晶体……
下一代高亮度 X 射线光子源需要新的 X 射线光学器件。我们在此展示了在尖端高重复率 X 射线自由电子激光 (XFEL) 设备中使用单片金刚石通道切割晶体作为高热负荷光束复用窄带机械稳定 X 射线单色仪的可能性，该单色仪具有高功率 X 射线光束。这些研究中制造和表征的金刚石通道切割晶体设计为双反射布拉格反射单色仪，分别将 15 meV 带宽内的 14.4 或 12.4 keV X 射线引导至 57 Fe 或 45 Sc 核共振散射实验。晶体设计允许带外 X 射线以最小的损失传输到其他同时进行的实验中。入射的 100 W X 射线束中只有不到 2% 被 50 m 厚的第一块金刚石晶体反射器吸收，从而确保单色器晶体高度稳定。预计金刚石槽切割晶体将用于其他 X 射线光学应用。
增强的纳米装修（ENP）改善玻璃切割质量
边缘强度提高边缘强度（ES）是评估玻璃边缘质量的关键因素。标准的纳米填料（NP）切割技术通常取决于60至90 MPa的B10边缘强度值，具体取决于玻璃成分和供应商。尽管此性能目前符合客户的期望，但人们对Edge强度在未来应用中的重要性的认识越来越大。在图4中，将增强的纳米装修（ENP）的边缘强度与康宁大猩猩非离子交换（Niox）玻璃的标准过程进行了比较。与标准过程相比，ENP过程表明，B10边缘强度的250％显着增加。重要的是要注意，边缘强度改善的程度取决于各种因素，例如特定的玻璃材料，涂层涂料，玻璃板尺寸，零件几何形状，玻璃板上的零件密度和过程速度。这些因素会影响激光参数的最佳范围，以实现最大边缘强度增强。
利用飞秒光纤激光器进行微孔钻孔和切割
摘要。利用飞秒光纤激光器在环境空气中实现了微孔钻孔和切割。首先，研究了透明（玻璃）和不透明（金属和组织）材料中的微孔钻孔。利用光学和扫描电子显微镜对孔的形状和形貌进行了表征和评估。演示了长宽比为 8 ∶ 1 的无碎片、圆度好且无热损伤的微孔。还演示了在硬组织和软组织中无裂纹或附带热损伤的微孔钻孔。然后，研究了不同材料的沟槽微加工和切割，并研究了激光参数对沟槽性能的影响。获得了笔直、干净的沟槽边缘，没有热损伤。© 作者。由 SPIE 根据知识共享署名 3.0 未移植许可证发布。分发或复制本作品的全部或部分内容需要完全署名原始出版物，包括其 DOI。 [DOI：10.1117/1.OE .53.5.051513]
RNA触发的CRISPR-CAS12A2优先和合作切割侧支DNA
。cc-by 4.0国际许可（未经Peer Review尚未获得认证）是作者/资助者，他已授予Biorxiv的许可证，以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人，该版本发布于2025年1月5日。 https://doi.org/10.1101/2025.01.05.631166 doi：Biorxiv Preprint
利用飞秒光纤激光器进行微孔钻孔和切割
摘要。利用飞秒光纤激光器在空气中钻孔和切割微孔。首先，研究了透明（玻璃）和不透明（金属和组织）材料中的微孔钻孔。用光学和扫描电子显微镜对孔的形状和形貌进行了表征和评估。演示了长宽比为 8 ∶ 1 的无碎片、圆度好、无热损伤的微孔。还演示了在硬组织和软组织中钻孔微孔，没有裂纹或附带热损伤。然后，研究了不同材料的沟槽微加工和切割，并研究了激光参数对沟槽性能的影响。获得了笔直、干净的沟槽边缘，没有热损伤。© 作者。由 SPIE 根据知识共享署名 3.0 未移植许可证发布。分发或复制本作品的全部或部分需要完全署名原始出版物，包括其 DOI。 [DOI: 10.1117/1.OE .53.5.051513 ]
利用飞秒光纤激光器进行微孔钻孔和切割
摘要。利用飞秒光纤激光器在空气中钻孔和切割微孔。首先，研究了透明（玻璃）和不透明（金属和组织）材料中的微孔钻孔。用光学和扫描电子显微镜对孔的形状和形貌进行了表征和评估。演示了长宽比为 8 ∶ 1 的无碎片、圆度好、无热损伤的微孔。还演示了在硬组织和软组织中钻孔微孔，没有裂纹或附带热损伤。然后，研究了不同材料的沟槽微加工和切割，并研究了激光参数对沟槽性能的影响。获得了笔直、干净的沟槽边缘，没有热损伤。© 作者。由 SPIE 根据知识共享署名 3.0 未移植许可证发布。分发或复制本作品的全部或部分需要完全署名原始出版物，包括其 DOI。 [DOI: 10.1117/1.OE .53.5.051513 ]