当前的研究在临床研究中的全面综述中引起了人们的研究,以证明糖尿病伴有肌肉骨骼(MSK)并发症的患病率和最相关的临床方面。,揭示了疾病的早期症状,这种病理潜伏在并发症背后及其最佳管理。在糖尿病中,MSK并发症很常见,很大程度上是由于导致与糖尿病相关的内部器官并发症导致导致慢性低强度炎症过程的类似的致病因素。MSK疾病由血管病,神经病,关节炎或上述组合形成,这些疾病并非特定于糖尿病。然而,糖尿病的患病率显着增加,并导致残疾损害患者的生活质量。运动疾病影响大约34.4–83.5%的患有2型糖尿病的患者。几种肌肉骨骼异常(Cheir-rohrothopathy,Dupuytren的缔约方,触发手指,ECT。)可以在体格检查后诊断出,尽管某些症状(肩部,神经源性关节炎,化脓性关节炎等)需要考虑鉴别诊断注意事项。关于治疗中特征性症状的早期鉴定,减轻炎症和疼痛,随后越来越剧烈的运动疗法与最佳治疗碳水化合物代谢保持一致,这对于减轻MSK并发症是必不可少的。
摘要 细胞转录本编码了有关细胞身份和疾病状态的重要信息。响应 RNA 生物标志物而激活 CRISPR 有可能以时空精度控制 13 CRISPR 活性。这将能够将 CRISPR 活性限制在表达目标 RNA 生物标志物的特定细胞类型,同时防止其他细胞中出现不必要的活性。在这里,我们提出了一个简单而具体的平台,用于通过工程化脓性链球菌 Cas9 单向导 RNA (sgRNA) 来调节响应 RNA 检测的 CRISPR 活性。sgRNA 被设计成折叠成复杂的二级结构,在基态下抑制其活性。识别互补 RNA 后,工程化的 sgRNA 19 被激活,使 Cas9 能够发挥其功能。我们的方法使 CRISPR 20 在 HEK293T 细胞和斑马鱼胚胎中响应 RNA 检测而激活。迭代 21 设计优化允许开发用于生成能够检测所选 RNA 序列的 sgRNA 22 的计算工具。机制研究表明,工程 23 sgRNA 在 RNA 检测过程中被切割,并且我们确定了受益于 24 化学修饰的关键位置,以提高工程 24 sgRNA 在体内的稳定性。我们的传感器为使用 26 CRISPR 激活来响应内源性 RNA 生物标志物开发新的研究和治疗应用开辟了新的机会。 27
用于调整内源基因表达的抽象工具是确定各种细胞表型的遗传基础的关键。尽管在弓形虫中可以使用合成的可调节性,但基因表达的靶向和组合下调的可扩展方法(如RNA干扰)尚未得到发展。为了研究CRISPR介导的转录调控的可行性,我们研究了来自甲状腺链球菌和嗜热链球菌的两个催化无活性Cas9(DCAS9)直系同源物的功能。在添加靶向启动子的单个指定RNA(SGRNA)和表面抗原基因SAG1的5 9个未翻译区域(UTR)后,我们对靶基因的蛋白质刺激蛋白质的变化通过流量细胞仪的蛋白质刺激变化,用于转录报告基因和immu-immu-nosu-nosu-noce。我们发现DCAS9直系同源物产生了一系列靶基因表达水平,并且抑制程度持久且稳定地遗传。因此,化脓性链球菌和嗜热链球菌DCAS9可以有效地产生弓形虫中的基因表达水平。两个DCAS9的独特的SGRNA支架要求允许通过转录调制,基于显微镜的研究标记或其他基于DCAS9的方法同时检查两个不同的基因座。利用新近获得的基因组转录起始站点数据,这些工具将有助于开发弓形虫的新功能筛查方法。
抗 CRISPR (Acrs) 是抑制 CRISPR-Cas 酶的 RNA 引导 DNA 靶向活性的小蛋白。Acrs 由噬菌体和噬菌体衍生的细菌基因编码,可阻止 CRISPR 介导的噬菌体感染抑制,还可以阻止真核细胞中 CRISPR-Cas 介导的基因组编辑。为了确定能够抑制金黄色葡萄球菌 Cas9 (SauCas9)(最常用的基因组编辑蛋白化脓性链球菌 Cas9 (SpyCas9) 的替代品)的 Acrs,我们使用了自靶向 CRISPR 筛选和关联基因组搜索策略。在这里,我们描述了三种有效的 SauCas9 抑制剂,我们将其命名为 AcrIIA13、AcrIIA14 和 AcrIIA15。这些抑制剂具有一个保守的 N 端序列,该序列对于 DNA 切割抑制是可有可无的,并且具有不同的 C 端,在每种情况下,这些 C 端都是抑制 SauCas9 催化的 DNA 切割所必需的。在人类细胞中,我们观察到 AcrIIA13 对 SauCas9 诱导的基因组编辑具有强烈的抑制作用,而 AcrIIA14 和 AcrIIA15 则具有中等程度的抑制作用。我们还发现 AcrIIA13 – AcrIIA15 的保守 N 端结构域与这些 Acr 基因启动子中的反向重复序列结合,这与其预测的螺旋-转角-螺旋 DNA 结合结构一致。这些数据证明了一种有效的 Acr 发现策略,并确立了 AcrIIA13 – AcrIIA15 作为 SauCas9 的独特双功能抑制剂。
越来越多的研究报告说,细菌DNA甲基化具有重要的功能,超出了其在限制性修饰系统中的作用,包括影响临床相关的表型,例如毒力,宿主定殖,孢子孢子,生物膜形成等。尽管有洞察力,但此类研究在很大程度上具有临时的性质,并且将从系统的策略中受益,从而实现微生物学界对细菌甲基瘤的联合功能表征。在这种意见中,我们建议高度保守的DNA甲基转移酶(MTases)代表了细菌表观基因组学研究的独特机会。这些MTases在细菌中很常见,跨越各种分类法,并且存在于多种人类病原体中。除了具有良好特征的核心DNA MTase,例如来自Vibrio Cholera,Salmonella Enterica,梭状芽胞杆菌艰难梭菌或化脓性链球菌的核心MTase,在许多人类病原体中也发现了多个高度保守的DNA MTase,其中包括属于Burkholderia属的人和阿科氏菌。我们讨论了为什么以及如何优先考虑这些MTase,以使社区范围内的综合方法进行功能基氏症研究。最终,我们讨论了一些高度保守的DNA MTases如何成为开发新型表观遗传抑制剂以用于生物医学应用的有希望的靶标。
摘要:连接性大疱性表皮松解症 (JEB) 是一种严重的起泡性皮肤病,由编码皮肤完整性所必需的结构蛋白的基因突变引起。在本研究中,我们开发了一种适用于研究 JEB 相关 COL17A1 基因表达的细胞系,该基因编码 XVII 型胶原蛋白 (C17),C17 是一种跨膜蛋白,参与连接基底角质形成细胞和皮肤下层真皮。利用化脓性链球菌的 CRISPR/Cas9 系统,我们将 GFP 的编码序列与 COL17A1 融合,导致 GFP-C17 融合蛋白在人类野生型和 JEB 角质形成细胞中在内源性启动子的控制下组成性表达。我们通过荧光显微镜和蛋白质印迹分析证实了 GFP-C17 的准确全长表达和定位到质膜。正如预期的那样,GFP-C17 mut 融合蛋白在 JEB 角质形成细胞中的表达未产生特定的 GFP 信号。然而,在表达 GFP-COL17A1 mut 的 JEB 细胞中,CRISPR/Cas9 介导的 JEB 相关移码突变修复导致 GFP-C17 恢复,这在融合蛋白的全长表达、其在角质形成细胞单层质膜内以及 3D 皮肤等效物的基底膜区内的准确定位中显而易见。因此,这种基于荧光的 JEB 细胞系有可能作为筛选个性化基因编辑分子和体外应用以及在适当的动物模型中体内应用的平台。
ADA 抗药物抗体 AE 不良事件 ANCA 抗中性粒细胞胞质抗体 ARDS 急性呼吸窘迫综合征 C5a 补体因子 5a CH50 总溶血补体活性 CHMP 人用药品委员会 COVID-19 2019 年冠状病毒病 CT 计算机断层扫描 DNA 脱氧核糖核酸 ECDC 欧洲疾病控制中心 ECMO 体外膜氧合 EEA 欧洲经济区 EMA 欧洲药品管理局 EPAR 欧洲公共评估报告 EU 欧盟 EUA 紧急使用授权 FDA 食品药品管理局 HS 化脓性汗腺炎 ICU 重症监护病房 IG 免疫球蛋白 IMV 有创机械通气 INN 国际非专有名称 IV 静脉 MA 上市许可 MAC 膜攻击复合物 NIH 美国国立卫生研究院 NYHA 纽约心脏协会 PaO 2 /FiO 2 动脉氧分压与吸入氧分数之比 PD 药效学 PG坏疽性脓皮病 PIP 儿科调查计划 PK 药代动力学 PL 包装说明书 PSMF 药物警戒系统主文件 PSUR 定期安全更新报告 RMP 风险管理计划 SARS-CoV-2 严重急性呼吸综合征冠状病毒 2 SmPC 产品特性总结 US 美国 VR 残留量 [肺] WHO 世界卫生组织
摘要 增强 RNA 引导的 CRISPR-Cas9 核酸酶 (RGN) 的细胞内递送和性能仍然有需求。在这里,我们表明常用的化脓性链球菌 Cas9 (SpCas9) 蛋白的核转位并不理想。因此,我们通过为高特异性 eSpCas9(1.1) 核酸酶 (eCas9.2NLS) 赋予额外的核定位信号 (NLS) 来生成 eCas9.4NLS。我们证明与原型或优化的引导 RNA 偶联的 eCas9.4NLS 可实现有效的靶向 DNA 切割,并探究具有不同 NLS 组成的 SpCas9 蛋白在异染色质和真染色质中嵌入的靶序列上的性能。此外,在腺病毒载体 (AdV) 介导的 SpCas9 表达单元转移后,无偏定量免疫荧光显微镜显示 eCas9.4NLS 核富集水平比高特异性 eCas9.2NLS 的核富集水平高 2.3 倍。这种改进的核易位反过来在非同源末端连接修复靶向双链 DNA 断裂后产生了强大的基因编辑。具体而言,AdV 将 eCas9.4NLS 递送到肌肉祖细胞中,导致有缺陷的 DMD 等位基因(导致杜氏肌营养不良症 (DMD))的编辑频率明显高于编码亲本 eCas9.2NLS 蛋白的 AdV 所实现的编辑频率。总之,这项工作为整合病毒载体和优化的基因编辑技术以增强 RGN 递送和性能提供了强有力的理论基础。
摘要背景:化脓性链球菌 CRISPR 系统由 Cas9 内切酶 (Sp Cas9) 和含有靶标特异性序列的单链向导 RNA (gRNA) 组成。理论上,Sp Cas9 蛋白可以切割与基因组中结合的 gRNA 一样多的靶标位点。结果:我们引入了一种无 PCR 的多 gRNA 克隆系统来编辑植物基因组。该方法包括两个步骤:(1)在 pGRNA 载体中的 tRNA 和 gRNA 支架序列之间克隆两个单链寡核苷酸片段的退火产物,该片段的每条链上都含有互补的靶标结合序列;(2)使用 Golden Gate 组装方法将来自几个 pGRNA 载体的 tRNA-gRNA 单元与含有 Sp Cas9 表达盒的植物二元载体组装在一起。我们通过进行靶向深度测序验证了多重 gRNA 表达系统在野生烟草(Nicotiana attenuata)原生质体和转化植物中的编辑效率和模式。Sp Cas9-gRNA 的两次近端切割大大提高了编辑效率,并在两个切割位点之间诱导了较大的缺失。结论:这种多重 gRNA 表达系统能够高通量生产单个二元载体,并提高植物基因组编辑的效率。关键词:CRISPR-Cas9、金门组装、多重 gRNA、植物基因组编辑
摘要 细胞转录本编码有关细胞身份和疾病状态的重要信息。响应 RNA 生物标志物激活 CRISPR 有可能以时空精度控制 CRISPR 活性。这将能够将 CRISPR 活性限制在表达目标 RNA 生物标志物的特定细胞类型,同时防止其他细胞中出现不必要的活性。在这里,我们提出了一个简单而具体的平台,用于通过工程化脓性链球菌 Cas9 单向导 RNA (sgRNA) 来调节响应 RNA 检测的 CRISPR 活性。sgRNA 被设计成折叠成复杂的二级结构,在基态下抑制其活性。工程化的 sgRNA 在识别互补 RNA 后被激活,从而使 Cas9 能够发挥其功能。我们的方法使 CRISPR 能够在 HEK293T 细胞和斑马鱼胚胎中响应 RNA 检测而激活。迭代 21 设计优化允许开发用于生成能够检测所选 RNA 序列的 sgRNA 22 的计算工具。机制研究表明,工程 23 sgRNA 在 RNA 检测过程中被切割,并且我们确定了受益于 24 化学修饰的关键位置,以提高工程 sgRNA 在体内的稳定性。我们的传感器为使用 CRISPR 26 激活来响应内源性 RNA 生物标志物开发新的研究和治疗应用开辟了新的机会。 27