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World File Search System半乳糖
益生菌编程：工程化布拉氏酵母菌中的饮食反应性基因表达和定植控制
摘要：布拉氏酵母菌 (Sb) 是一种新兴的益生菌底盘，用于将生物分子递送到哺乳动物肠道，作为唯一的真核益生菌，具有独特的优势。然而，精确控制 Sb 中的基因表达和肠道停留时间仍然具有挑战性。为了解决这个问题，我们开发了五个配体响应基因表达系统并修复了 Sb 中的半乳糖代谢，从而实现了该菌株中的可诱导基因表达。通过设计这些系统，我们可以构建 AND 逻辑门，控制蛋白质的表面展示，并启动小鼠肠道对饮食糖的反应，从而产生蛋白质。此外，修复半乳糖代谢扩大了 Sb 在肠道内的栖息地，并实现了对肠道停留时间的半乳糖响应控制。这项工作通过控制其体内基因表达水平和胃肠道内的定位，为 Sb 精确给药开辟了新途径。关键词：合成生物学、酵母、微生物组 ■ 简介
一种抗原触发Guillain – Barr´e -Stohl综合征
由支原体肺炎感染已被认为是Guillain - Barr E - Stohl综合征的先前因素。Guillain - Barr E - Stohl综合征是由对主要糖脂的免疫反应触发的，并且已经假定肺炎支原体感染会触发该综合征，原因是该综合征是由于半乳糖膜的生产而引起的。在这里，我们对104种支原体物种的224个基因组序列进行了广泛的比较，以表征半乳乳脑化生物合成的遗传决定因素。隐藏的马尔可夫模型用于分析甘草转移酶，从而鉴定出功能性蛋白质结构域的识别，称为M2000535，该蛋白质结构域大约在三分之一的研究基因组中出现。该结构域似乎与潜在的UDP-葡萄糖表达酶相关，该酶将UDP-葡萄糖融合到UDP-半乳糖中，这是半乳糖苷的生物合成的主要基础。这些发现阐明了强调Guillain - Barr E - Stohl综合征的致病机制。肺炎感染。
机器学习可以识别替代酵母菌利用率途径
基因组差异如何促进表型差异是生物学的主要问题。最近在酵母菌saccharomycotina中，来自1,049种真菌物种（几乎所有已知）的122个来源和条件的新生长基因组，隔离环境和定性模式提供了一个强大的，复杂但复杂的数据集来解决此问题。我们使用了对这些基因组，代谢和环境数据训练的随机森林算法，以高精度预测几种碳源的增长。已知的结构基因涉及这些来源的收集和其他来源中生长的存在/不存在模式是有助于预测准确性的重要特征。通过进一步检查半乳糖的生长，我们发现它可以从基因组（92.2％）或生长数据（82.6％）（82.6％）的准确度中进行预测，但不能从隔离环境数据（65.6％）中进行预测。预测准确性甚至更高（93.3％）。在GAL ACTOSE利用基因之后，预测半乳糖生长的最重要特征是半乳酸上的生长，提出了一个假设，即在两个阶，血清中心和皮基亚菌中的几种物种（分别包含Auris的新兴病原体念珠菌和ogataea属）缺少了GALACTOWAY的替代途径，因为它们缺乏GALACE GENES。生长和生化分析证实，这些物种的数量通过替代氧化剂D-半乳糖途径利用半乳糖，而不是规范的GAL途径。机器学习方法对于研究酵母基因型 - 表型图的演变非常有力，即使在良好的研究性状中，它们的应用也会发现新颖的生物学。
具有肝脏靶向和pH响应释放功能的介孔硅纳米粒子用于肝癌治疗中的靶向药物输送
摘要：本文旨在研发一种载阿司匹林双修饰纳米递送系统用于治疗肝细胞癌。本文采用“一锅两相成层法”制备介孔二氧化硅纳米粒子（MSN），以多巴胺自聚合形成聚多巴胺（PDA）作为pH敏感涂层。通过Michael加成反应将半乳糖胺（Gal）和活性靶向半乳糖胺（Gal）连接到PDA包覆的MSN上，合成半乳糖胺修饰的PDA修饰纳米粒子（Gal-PDA-MSN）。对所制备的纳米粒子的尺寸、粒径分布、表面形貌、BET比表面积、介孔尺寸和孔体积进行了表征，并研究了其体外载药量和药物释放行为。Gal-PDA-MSN具有pH敏感和靶向性。 MSN@Asp与PDA-MSN@Asp、Gal-PDA-MSN@Asp的释放曲线不同，PDA-MSN@Asp、Gal-PDA-MSN@Asp的药物释放随酸度增加而加快。体外实验表明，三种纳米药物对人肝癌HepG2细胞的毒性和抑制效果均高于游离Asp。该药物递送系统有利于控制释放和靶向治疗。
使用基于13C的蛋白质组学
交叉进食是微生物群落多样性和功能的基础。但是，由于代谢和生物合成中间体的普遍性，跨食式元标志的识别通常是具有挑战性的。在这里，我们在肽中使用13 C同位素追踪来阐明酿酒酵母和乳酸乳酸乳酸菌的共培养中的跨食代谢产物。社区是在乳糖上种植的，作为主要碳源，其分子的葡萄糖或半乳糖分数为13C。数据分析允许可能产生数百种肽的大量偏移，我们可以为这两种物种分配具有认同性的物种和标记程度。标记模式表明，酵母菌利用半乳糖，在较小程度上，乳酸乳杆菌作为碳源共有的乳酸。虽然酵母正如预期的那样向细菌提供必需的氨基酸，但数据还发现了复杂的氨基酸交换模式。在共培养上清液中的代谢产物标记进一步支持了交叉喂养的代谢产物的身份，并且通过社区中半乳糖阴性酵母突变体的适应性降低。一起，我们的结果证明了13 C基于微生物相互作用的13 C蛋白质组学的实用性。
双歧杆菌对不同糖的发酵
双歧杆菌的属脱颖而出，因为它是食品应用中最常用的益生菌之一。对双歧杆菌物种的鉴定仍然难以捉摸，现在使用特异性PCR引物的生化测试来鉴定双歧杆菌菌株的菌株。The aim of this study is to identify of some Bifidobacteria strains by chemical tests non the method of PCR, in this study it's found the ability of four strains of Bifidobacteria ( Bifidobacterium longum ATCC 15707 , Bifidobacterium bifidum LMGD 10645 , Bifidobacterium animalis and Bifidobacterium angulotum ).由葡萄糖，半乳糖，果糖，淀粉，乳糖，蔗糖，核糖和甘露醇发酵。在基底液体培养基（BLM）中进行碳水化合物发酵测试。 孵育后黄色的发展被认为是阳性结果。 此搜索中的所有菌株均发酵所有糖，我们发现B. bifidum和B. lotum可以发酵核糖，半乳糖和甘露醇或不能发酵。在基底液体培养基（BLM）中进行碳水化合物发酵测试。孵育后黄色的发展被认为是阳性结果。此搜索中的所有菌株均发酵所有糖，我们发现B. bifidum和B. lotum可以发酵核糖，半乳糖和甘露醇或不能发酵。
通过将 CRISPR/Cas9 系统电穿孔到体外受精的受精卵中有效生成 GGTA1 缺陷猪
背景：异种抗原是种间异种移植成功的主要问题。GGTA1 编码 α 1,3-半乳糖基转移酶，该酶对半乳糖基-α 1,3-半乳糖的生物合成至关重要，而半乳糖是导致超急性排斥的主要异种抗原。因此，GGTA1 修饰猪是猪对人异种移植的有希望的供体。在本研究中，我们开发了一种通过电穿孔将 CRISPR/Cas9 系统引入体外受精猪受精卵以生成 GGTA1 修饰猪的方法。结果：我们设计了五种针对 GGTA1 中不同位点的向导 RNA (gRNA)。通过电穿孔将 Cas9 蛋白与每一种 gRNA 一起引入后，评估了受精卵发育成的囊胚中的基因编辑效率。使用基因编辑效率最高的 gRNA 生成 GGTA1 编辑猪。在用 Cas9/gRNA 复合物转移电穿孔受精卵后，两头受体母猪产下六头仔猪。深度测序分析显示，六头仔猪中有五头在 GGTA1 的目标区域携带双等位基因突变，没有脱靶事件。此外，用异凝集素 B4 染色证实了 GGTA1 双等位基因突变猪的 GGTA1 功能缺陷。
方案1- gacose凝胶电泳
GAROSE是一种线性聚合物，由A-（L-73）和糖苷键连接的交替残基和L-半乳糖组成。L-半乳糖残留物具有三个至六个位置之间的避别桥（请参见图5-1）。琼脂糖的链形成螺旋纤维，将半径为20-30 nm的超螺旋结构聚集。琼脂糖的凝胶化会导致三维通道的网格，其直径从50 nm到> 200 nm（Norton等人。1986;有关审查，请参见Kirkpatrick 1990）。 商业制备的琼脂糖聚合物被认为每个链中包含半乳糖残基。 但是，琼脂糖不是均匀的：多糖链的平均长度因批量而异，从制造商到制造商。 此外，琼脂糖的较低等级可能会被其他多糖以及盐和蛋白质污染。 这种变异能力可以影响琼脂糖溶液的胶凝温度，DNA的筛分以及从凝胶中回收的DNA的能力，可作为酶促反应中的底物。 可以使用特殊的琼脂糖等级来最大程度地减少这些潜在的问题，这些琼脂糖被筛选为抑制剂和核酸酶的存在以及用溴化乙锭染色后的最小背景荧光。1986;有关审查，请参见Kirkpatrick 1990）。商业制备的琼脂糖聚合物被认为每个链中包含半乳糖残基。但是，琼脂糖不是均匀的：多糖链的平均长度因批量而异，从制造商到制造商。此外，琼脂糖的较低等级可能会被其他多糖以及盐和蛋白质污染。这种变异能力可以影响琼脂糖溶液的胶凝温度，DNA的筛分以及从凝胶中回收的DNA的能力，可作为酶促反应中的底物。可以使用特殊的琼脂糖等级来最大程度地减少这些潜在的问题，这些琼脂糖被筛选为抑制剂和核酸酶的存在以及用溴化乙锭染色后的最小背景荧光。
基于天然多糖的自然生物及其潜在应用
后生物学，代表生物学家族的最新成员，是由于乳酸细菌（LAB）在de Man，Rogosa和Sharpe（MRS）中的发酵而产生的代谢产物，其中包括蛋白质，糖和矿物质。生物后的成分包括外多糖（EPS），短链脂肪酸（SCFA），细菌素，抗氧化剂和代谢酶。几项研究表明，生物学后具有多种特性，例如抗菌，免疫调节，抗氧化剂，抗炎，抗肥胖，抗糖尿病和抗肿瘤特性。天然多糖是指从包括藻类，植物，动物和微生物在内的生物生物中获得的多糖。多糖是分支或线性大分子，由几种主要和一些次要的单糖组成，包括葡萄糖，果糖，果糖，甘露糖，阿拉伯糖，半乳糖糖，半乳糖酸酯，半乳糖醛酸，葡萄糖糖胺，半乳糖胺或衍生物。类似于生物后，多糖也表现出抗炎，抗菌，抗肿瘤，抗病毒，免疫调节和抗氧化特性。尽管由于缺乏特定的酶，人体不能直接消化多糖，但可以通过肠道遗留细菌（包括但不限于实验室）消化它们。最近的研究表明，大量的非淀粉多糖，例如藻酸盐，富藻酸酯，壳聚糖，角叉菜胶和瓜尔胶可以降解为低分子量的寡糖寡糖，这反过来又可以为人类健康提供健康益处。这些新发现激发了我们提出基于多糖后的后生物学，也称为糖培养基及其潜在应用。我们建议可以通过益生菌发酵多糖，随后的细菌去除将提高其生产的代谢产物的安全性，包括寡糖，二糖，单糖和衍生物。这些基于多糖的后生物学可能模仿体外多糖的代谢，从而扩大了生物后的应用。诸如Akkermansia Muciniphila和其他细菌等非刺激药也可以用于糖生物生产，从而为人类健康提供了新的应用。
