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World File Search System单细胞
Cellartis IPSC单细胞克隆Def-CS培养基...
在DEF-CS系统中，人IPS细胞的预期形态DEF-CS技术与特定涂层结合使用了基于酶的传递，以促进单细胞生存，快速扩张和更容易传播。将IPS单元素转移到该系统时，您会注意到某些单元格特性与您以前系统中培养的IPS细胞的特性不同。与常用的基于菌落的培养系统相反，Def-CS培养系统产生了均匀间隔细胞的单层。在Def-CS培养系统中生长的新传递的细胞倾向于散布。然而，随着细胞的增殖，培养物变得更密集，细胞显示出典型的未分化的干细胞形态（即高核与细胞质比，定义的边界和突出的核仁）。
ICP-MS 超越单细胞金属药物分析
1 伯尔尼大学医院诊断、介入和儿科放射学系，伯尔尼大学，3010 伯尔尼，瑞士；audrey.gale@students.unibe.ch（AG）；martin.hungerbuehler@dbmr.unibe.ch（MNH）；christoph.kempf@dbmr.unibe.ch（CK）；johannes.heverhagen@insel.ch（JTH）；hendrik.vontengg@dbmr.unibe.ch（HvT-K.）2 伯尔尼大学生物医学研究系 DBMR，3008 伯尔尼，瑞士 3 巴伊兰大学纳米技术与先进材料研究所及化学系，精确科学学院，拉马特甘 5290002，以色列；hofmmal@biu.ac.il 4 伯尔尼大学化学、生物化学和制药科学系（DCBP），3012 伯尔尼，瑞士； nicola.luedi@unibe.ch * 通讯地址：peter.broekmann@unibe.ch (PB)；nico.ruprecht@dbmr.unibe.ch (NR)；电话：+41-(0)31-684-4317 (PB)；+41-(0)31-632-4923 (NR)
单细胞RNA测序时代的癌症免疫治疗
免疫治疗彻底改变了癌症治疗，为肿瘤免疫学带来了新的视角。有效的免疫治疗需要使用合适的靶抗原，优化抗原肽、APC 和 T 细胞之间的相互作用，同时抑制抑制免疫治疗效果和产生耐药性的负调控过程。肿瘤异质性及其微环境是患者产生耐药性的主要原因。近年来，随着单细胞 RNA 测序技术的兴起及其与免疫治疗的结合，我们现在可以通过检测免疫检查点的转录活性、筛选高转录水平的新抗原、识别稀有细胞和其他重要过程，在单细胞分辨率下专门评估肿瘤面对免疫治疗药物的机制。本综述重点介绍 scRNA-seq，特别是其在癌症免疫治疗中的应用。
单细胞拷贝数更改签名分析揭示了1
此预印本版的版权持有人于2025年3月4日发布。 https://doi.org/10.1101/2025.03.02.641098 doi：Biorxiv Preprint
NIDAP上的CCBR单细胞RNA-SEQ工作流程
•用条形码凝胶珠划分的细胞•cDNA末端的细胞条形码和唯一分子标识符（UMI）•〜2000的中位基因平均检测到每个细胞的平均测序读数〜50,000个平均测序读数•基因级数数据
使用单细胞分析解码器官复杂性
帕金森氏病（PD）是全球增长最快的神经退行性疾病（Ou Z.等，2021），大多数病例是零星的，5-15％是由于在SNCA和LRRK2等单个基因中稀少的高碳化性突变而是家族性的（Kim C.等，2017）。对这些稀有形式的研究为线粒体功能障碍和蛋白质错误折叠等细胞机制提供了重要的见解。在零星的PD中，越来越多地认识到低频遗传变异的贡献。研究确定了编码MiRO1的Rhot1基因中的PD患者，这是一种对线粒体动力学和钙稳态至关重要的蛋白质，它与PD-相关蛋白（如PINK1和α-核蛋白（Berenguer-Escuder C. berenguer-Escuder C.等）相互作用。Chemla A.等。 （2023），来自卢森堡大学的研究小组，使用了IPSC衍生的多巴胺能神经元和3D中脑器官，以证明P.R272Q miRO1突变会增加活性氧物种，从而改变了线粒体生物性生物性生物性生物性含量，从而提高了α-核蛋白水平，并提高了ne努力。 这些发现表明，突变体Miro1足以在体外和体内准确地对PD进行建模，从而突出了其在PD发病机理中的作用。Chemla A.等。（2023），来自卢森堡大学的研究小组，使用了IPSC衍生的多巴胺能神经元和3D中脑器官，以证明P.R272Q miRO1突变会增加活性氧物种，从而改变了线粒体生物性生物性生物性生物性含量，从而提高了α-核蛋白水平，并提高了ne努力。这些发现表明，突变体Miro1足以在体外和体内准确地对PD进行建模，从而突出了其在PD发病机理中的作用。
单细胞测序在发现微生物中的作用...
阿尔茨海默氏病（AD）是一种神经退行性疾病，其特征在于大脑中淀粉样蛋白斑块和神经原纤维缠结的积累。尽管进行了数十年的研究，但AD的根本原因仍然知之甚少。然而，最近的证据表明，微生物感染可能在AD的发展和发展中起作用。随着单细胞测序（SCS）技术的出现，研究人员现在拥有一个强大的工具，可以以高分辨率研究AD Brains的微生物群落。本评论文章重点介绍了SC在研究微生物感染与AD之间关系中的作用的最新研究。通过启用特定微生物物种的鉴定和表征及其与AD大脑中宿主细胞的相互作用，SCS为AD的复杂微生物景观提供了新的见解。此外，该技术有可能通过揭示新的治疗干预靶标来影响AD的诊断和治疗。最后，我们还讨论了SCS技术的挑战，局限性，道德和翻译考虑因素以及该领域的未来研究方向。SCS对了解AD中微生物感染的潜在影响很大，并且可能导致对这种毁灭性疾病的新疗法和预防措施的发展。总而言之，这篇综述强调了SCS在促进我们对AD复杂微生物群落的理解及其潜在参与疾病发病机理方面所起的重要作用。
Rubella病毒tropism和人类的单细胞反应...
抽象风疹病毒是一种重要的人类病原体，在怀孕期间收缩时会导致发育中的胎儿神经缺陷。尽管在美洲和许多发达国家进行了成功的疫苗接种计划，但在全球许多地区，风疹仍然存在，并且在人口免疫不足的情况下发生。强烈的兴趣以来，自1962年首次分离风疹病毒以来，感染后，我们对临床结果的理解却破坏了胎儿神经发育的关键过程。然而，仍然未知脑中的哪些细胞类型是针对的。我们表明，在人脑切片中，风疹病毒主要感染小胶质细胞。这种感染发生在异质种群中，但在没有其他细胞类型的情况下不存在于高度胶质细胞的单一培养物中。通过使用类器官 - 微神经模型，我们进一步证明了风疹病毒感染会导致非微神经细胞（包括神经元和神经祖细胞）的干扰素反应深刻，并且这种反应因小胶质细胞的存在而减弱。
糖尿病肺免疫细胞的单细胞分析......
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可证永久有效。它以预印本形式提供（未经同行评审认证），作者/资助者已授予 bioRxiv 许可，可以在该版本中显示预印本。版权所有者于 2025 年 2 月 6 日发布了此版本。；https://doi.org/10.1101/2024.10.24.619799 doi：bioRxiv 预印本
小鼠耳蜗的单细胞转录组分析
耳蜗的功能分子表征主要由神经性耳聋遗传结构的解析所驱动。因此，寻找听力领域极为缺乏的治愈性治疗方法已成为一个可能实现的目标，特别是通过耳蜗基因和细胞疗法。为此，一份完整的耳蜗细胞类型清单以及对其基因表达谱直至最终分化的深入表征是必不可少的。因此，我们基于对出生后第 8 天 (P8) 的 120,000 多个细胞的分析，生成了小鼠耳蜗的单细胞转录组图谱，这些细胞处于听力前期，P12 对应于听力开始，P20 对应于耳蜗成熟几乎完成。通过将全细胞和核转录分析与广泛的原位 RNA 杂交试验相结合，我们表征了涵盖几乎所有耳蜗细胞类型的转录组特征并开发了细胞类型特异性标记。发现了三种细胞类型；其中两种构成了容纳主要听觉神经元和血管的耳蜗轴，第三种细胞由内衬前庭阶的细胞组成。结果还揭示了基底膜生物物理特性的声音梯度的分子基础，而这种梯度是耳蜗被动声频分析的关键基础。最后，我们还揭示了几种耳蜗细胞类型中被忽视的耳聋基因表达。该图谱为破译控制耳蜗细胞分化和成熟的基因调控网络铺平了道路，这对于开发有效的靶向治疗方法至关重要。