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将 CRISPR 扫描与使用双链 DNA 脱氨酶进行靶向染色质可及性分析相结合
基因组编辑可以对内源性顺式调控元件进行序列功能分析，从而推动对其机制的理解和基因疗法的发展。然而，这些方法不能与染色质结构和长单分子染色质纤维可及性的直接可扩展读数相结合。在这里，我们利用双链 DNA 胞嘧啶脱氨酶通过靶向 PCR 和长读测序以高深度和分辨率分析内源性目标基因座的染色质可及性，我们将这种方法称为靶向脱氨酶可及染色质测序 (TDAC-seq)。TDAC-seq 凭借目标基因座的高序列覆盖率，可以与 CRISPR 扰动独特地整合，从而实现顺式调控元件的功能解剖，其中遗传扰动及其对染色质可及性的影响叠加在同一单个染色质纤维上并以单核苷酸分辨率解析。我们利用 TDAC-seq 解析了在红细胞分化过程中激活人类 CD34+ 造血干细胞和祖细胞中胎儿血红蛋白的 CRISPR 编辑，以及在合并的 CRISPR 和碱基编辑筛选中平铺控制珠蛋白位点的增强子。总之，TDAC-seq 能够通过基因组编辑实现单分子染色质纤维的高分辨率序列功能映射。
（缺少）DNA双链断休息途径在V（d）J重组期间选择
DNA双链断裂（DSB）是可以通过多种DNA修复途径修复的剧毒病变。多个因素可能会影响修复对给定途径的选择和限制，以保证维持基因组完整性。在V（D）J重组期间，RAG诱导的DSB（几乎）是通过非同理端连接（NHEJ）途径仅修复的，以实现抗原受体基因多样性的益处。在这里，我们回顾了将RAG生成的DSB修复到NHEJ的各种参数，包括RAG核酸酶产生的DNA DSB末端的特殊性，裂解后突触复合物的建立和维护，以及DNA末端的DNA末端的末端抗切除和（Microtro）的人体学修复。在这种生理背景下，我们强调某些DSB的DNA修复途径选择有限。
通过DNP增强固态NMR N-H键长度测量的双链DNA中的氢键
许多生物学过程和机制取决于DNA中碱基配对和氢键的细节。氢键由于难以可视化氢原子位置而通过X射线晶体学和冷冻EM进行量化，但可以通过溶液中的NMR光谱探测到位点特异性，而固态的固态，后者特别适合大型，缓慢滚动的DNA复合物。最近，我们表明低温动态核极化（DNP）增强的固态NMR是在本机样条件下在各种DNA系统中区分Hoogsteen碱基对（BPS）与规范的Watson-Crick BPS的有价值工具。在此使用12型摩尔DNA双工，在Watson-Crick或Hoogsteen确认中含有两个中央腺嘌呤 - 胸腺氨酸（A-T）BPS，我们证明了DNP固态NMR测量值，这些NMR的测量值是胸腺胺N3-H3键的长度，这些长度与N-H-H-H的详细信息敏感，并允许NH-H·n-H·的n-H·n-H·的水性键合敏感。相同的DNA序列上下文。对于此DNA双链体，对于Watson-Crick A-T和HOOGSTEEN A-T和HOOGSTEEN A（SYN）-T碱基对的有效相同的TN3-H3键长的长度为1.055±0.011Å和1.060±0.011Å，相对于参考磁键长度为1.015±0.010Å，分别为N-Acety-ny-acetyl ny-acetyl ny-acetyl ny-acetyl，分别为watson-Crick a-t和hoogsteen a（syn）a（syn）-t碱基对。非常明显的是，在模型DNA双链体的背景下，这些结果表明，watson-Crick和Hoogsteen BP构型构象异构体之间N-H··N-t a-t氢键没有显着差异。考虑到零点运动的先前量子化学计算预测有效较长的肽n-h键长度为1.041Å，与溶液和环境温度下的肽和蛋白质的固态NMR研究一致，以促进这些早期的研究tn3-h3键长度的直接比较。 Watson-Crick A-T和Hoogsteen A（Syn）-t BPS相对于1.041Å参考肽N-H键长。更一般地，基于低温DNP固态NMR的方法对N-H键长度进行高精度测量有望促进对一系列DNA复合物和基本配对环境的氢键的详细比较分析。
PNA辅助dnazymes裂解双链DNA，用于具有高序列保真度的基因工程
摘要：Dnazymes已被广泛用于许多传感和成像应用中，但是自1994年发现以来，很少使用基因工程，因为它们的底物范围主要限于单链DNA或RNA，而遗传信息则存储在双链DNA（DSDNA）中。为了克服这一主要局限性，我们在这里报告了肽核酸（PNA）辅助双链DNA通过dnazymes（Panda）辅助的DNA迹象，这是将Dnazyme活性扩展到DSDNA的第一个例子。我们表明，熊猫在有效划痕或导致靶dsDNA上有双链破裂是可以编程的，靶DsDNA模仿了蛋白质核酸酶，并且可以充当分子克隆中的限制酶。除了比蛋白质酶小得多，在我们测试的条件下，熊猫还具有更高的序列保真度，这证明了其作为基因工程和其他生化应用的新型替代工具的潜力。
监测时空时间分数的动态行为和光学解决方案双链脱氧核糖核酸模型考虑了Atangana'
摘要。DNA或脱氧核糖核酸都在每个单元中都发现，并且是细胞的主要信息存储介质。DNA存储了所有生物体的遗传信息，包括其生长，分裂和生活所需的指示。DNA由称为核苷酸碱基的四个不同的构件组成：腺嘌呤（A），胸腺胺（T），胞嘧啶（C）和鸟嘌呤（G）。基因组在体外进行了测序，利用编码策略（例如将一个键对对为0标记为0，而将数字信息存储为1）。在这项研究中，考虑了Atangana的合格分数衍生物，研究了双链DNA动力学系统的分数差分顺序。 将符合的子方程方法应用于系统。 分析导致了该模型的一些有趣的新精确解决方案。 一溶解溶液，多氧化解决方案和周期性波解决方案是可用于描述结果的三个广泛类别。 为了更好地了解发现的解决方案，我们在视觉上研究了其中一些。 可以看到DNA链的孤立和反态波，证明了系统的非线性动力学。 收集的数据可用于进行申请评估并提出进一步的科学发现。在这项研究中，考虑了Atangana的合格分数衍生物，研究了双链DNA动力学系统的分数差分顺序。将符合的子方程方法应用于系统。分析导致了该模型的一些有趣的新精确解决方案。一溶解溶液，多氧化解决方案和周期性波解决方案是可用于描述结果的三个广泛类别。为了更好地了解发现的解决方案，我们在视觉上研究了其中一些。可以看到DNA链的孤立和反态波，证明了系统的非线性动力学。收集的数据可用于进行申请评估并提出进一步的科学发现。
对后加热处理对由电弧添加剂制造制造的双链不锈钢机械性能和腐蚀行为的影响
在这项研究中，分析了热处理对由线弧添加剂进行的2209双不锈钢晶体的微观结构和机械性能的影响。发现，在1100°C下进行溶液处理2小时，在300°C下进行2小时的回火可以有效地改善2209双式不锈钢的晶粒不均匀性，消除γ2和有害的脆性相，并考虑机械性能和耐腐蚀性。与原始沉积状态相比，硬度和屈服强度增加了10％和31.8％，达到245.6 hv和499.7 MPa，满足工程螺旋桨的要求。电子背裂片衍射研究表明，晶粒变得精致，奥斯丁岩在溶液热处理后保持<101> // z方向。在原始样品和实心溶液中都存在许多小角度的晶界，但是进一步的回火将小角度的晶界转化为大角度的晶界。关键字：弧添加剂制造； 2209双面不锈钢；热处理；微观结构属性
