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基于新的有效遗传算法 - 塔古奇...
库存路由问题源于车辆路由问题和供应商管理的库存问题的组合。在本文中，我们提出了一种数学模型和一种用于解决多个周期库存路由问题的新型遗传算法。目标是在给定时间范围内向分散客户提供产品，同时管理客户库存以避免短缺并最大程度地减少总库存和运输成本。为代表此问题的解决方案，我们引入了一种新的染色体结构。此结构在编码和解码解决方案，保持交叉和突变操作后保持可行性，在一个步骤中解决路由和库存管理，并全面合并有关每个解决方案方法的信息。使用Taguchi方法对算法参数，包括跨界和突变率，人口大小，迭代次数和选择压力进行微调。为了评估算法效率，我们利用文献中的标准实例。我们的结果表明，与以前的方法相比，所提出的算法表现出色。
他汀类药物与其他药物联合治疗卵巢癌的进展
新型抗癌药物不断被研发出来，特别是靶向药物，虽然这些药物取得了显著的临床疗效，但在卵巢癌中并不能发挥显著的作用，而且这类药物的研究周期和费用往往巨大，传统药物的重新定位逐渐成为关注点。他汀类药物作为传统的降脂药物，主要通过抑制HMGCR发挥作用，近年来流行病学研究和体外实验证实了其抗癌作用，特别是抗卵巢癌的作用。卵巢癌中TP53的突变率高达95%，而HMGCR往往在TP53突变的肿瘤中高表达，但前瞻性临床试验的效果并不理想。这个结果似乎可以理解，因为降脂药物完全抑制肿瘤生长似乎不太现实，因此他汀类药物在卵巢癌的治疗中起着更多的协同作用。由于卵巢癌是一种高度异质性的肿瘤，深入了解他汀类药物在卵巢癌治疗中的作用机制，并将其与其他药物联合实现精准治疗可能是一个不错的选择。
卷心菜（Brassica oleracea var. capitata L.）的优化……
基因组编辑技术，例如成簇的规律间隔短回文重复序列/CRISPR 相关系统 (CRISPR/Cas9)，无疑正在成为改良粮食作物和应对农业挑战不可或缺的工具。在本研究中，评估了影响转化效率的关键因素，例如 PEG4000 浓度、孵育时间和质粒量，以实现将 CRISPR/Cas9 载体有效递送到卷心菜原生质体中。使用扩增子测序，我们证实了 PEG4000 浓度和孵育时间对诱导的目标突变有显著影响。通过优化转化方案，以 40 µg 质粒和 50% PEG4000 孵育 15 分钟，实现了 26.4% 的编辑效率。虽然这些因素强烈影响突变率，但转化原生质体的活力仍然很高。我们的发现将有助于成功编辑卷心菜和其他芸苔属植物的基因组，也有助于依赖原生质体瞬时转化方法的基因功能分析和亚细胞定位等研究领域。
水稻受精卵、成熟胚、未成熟胚再生植株突变的全基因组序列分析
通过全基因组测序，研究了由单个母株的合子、成熟胚和未成熟胚再生的水稻植株 (Oryza sativa L.，‘Nippon-bare’) 的体细胞克隆变异。还对母株和其种子繁殖子代进行了测序。在子代中检测到了 338 个母株序列变异，平均值范围从种子繁殖植株的 9.0 到成熟胚再生体的 37.4。利用种子繁殖植株中的变异计算出的自然突变率为 1.2 × 10 –8，与之前报道的值一致。种子繁殖植株中变异的单核苷酸变异 (SNV) 比例为 91.1%，高于之前报道的 56.1%，且与再生体中的差异不显著。总体而言，如前所述，再生体中 SNV 的转换与颠换比率较低。成熟胚再生的植物的变异明显多于不同子代类型。因此，在水稻遗传操作过程中，使用受精卵和未成熟胚可以减少体细胞克隆变异。
使用靶向和全基因组测序对 SCLC 患者的循环游离 DNA 进行分析
SCLC 肿瘤的基因组分析已发现大量拷贝数变异 (CNA) 和高突变率。 4、5 肿瘤抑制基因肿瘤蛋白 p53 基因（ TP53 ）和视网膜母细胞瘤 1 基因（ RB1 ）几乎普遍失活和普遍丢失，转录调节因子（SRY-box 转录因子 2 基因 [ SOX2 ]、核因子 IB 基因 [ NFIB ]、v-myc 禽类粒细胞瘤病毒致癌基因肺癌衍生同源基因 [ MYCL1 ]、v-myc 禽类粒细胞瘤病毒致癌基因神经母细胞瘤衍生同源基因 [ MYCN ] 和 v-myc 禽类粒细胞瘤病毒致癌基因同源基因 [ MYC ]）频繁扩增，Notch 和组蛋白乙酰转移酶基因（CREB 结合蛋白基因 [ CREBBP ] 和 E1A 结合蛋白 p300 基因 [ EP300 ]）反复突变。 4-6 肿瘤活检，尤其是连续活检，对于 SCLC 来说是一项重大挑战，7,8
展开微生物群-Iris -Eperto
作者没有宣布潜在的利益冲突。摘要癌症的特征是失去了保留多细胞生物体内稳态的调节机制，例如受控的增殖，细胞 - 细胞粘附和组织分化。多细胞规则的崩溃伴随着“自私”，单细胞样的生活特征的激活，这与癌细胞展示的环境变化的适应性增加有关。压力反应的机制类似于在单细胞生物中观察到的机制，由哺乳动物癌细胞积极利用，以提高遗传多样性并增加在不利条件下的生存机会，例如缺乏氧气/营养或暴露于药物。在压力条件下的单细胞生物（例如抗生素治疗）停止复制或缓慢分裂并瞬时增加其突变率以促进多样性，这一过程称为自适应突变性。类似地，暴露于药物的肿瘤细胞进入了持久表型，并可以减少DNA复制保真度，从而促进了遗传多样性。自适应进化的含义与理解对抗癌疗法的抵抗力相关。
水稻受精卵、成熟胚、未成熟胚再生植株突变的全基因组序列分析
通过全基因组测序，研究了由单个母株的合子、成熟胚和未成熟胚再生的水稻植株 (Oryza sativa L.，‘Nippon-bare’) 的体细胞克隆变异。还对母株和种子繁殖子代进行了测序。在子代中检测到了 338 个母株序列变异，平均值范围从种子繁殖植株的 9.0 到成熟胚再生体的 37.4。利用种子繁殖植株中的变异计算出的自然突变率为 1.2 × 10 –8，与之前报道的值一致。种子繁殖植株中变异的单核苷酸变异 (SNV) 比例为 91.1%，高于之前报道的 56.1%，且与再生体中的差异不显著。总体而言，如前所述，再生体中 SNV 的转换与颠换比率较低。成熟胚再生的植物的变异明显多于不同子代类型。因此，在水稻遗传操作过程中，使用受精卵和未成熟胚可以减少体细胞克隆变异。
COMPASS 亚基 Spp1 通过限制 DNA 对核酸酶的利用来保护 Tus/Ter 复制叉屏障处的新生 DNA
同源重组因子在 DNA 复制过程中对保护新生 DNA 起着至关重要的作用，但染色质在此过程中的作用尚不清楚。在这里，我们使用了已知可在酿酒酵母中诱导位点特异性复制叉停滞的细菌 Tus/Ter 屏障。我们报告称，Set1C 亚基 Spp1 被募集到停滞的复制叉后面，与其与 Set1 的相互作用无关。Spp1 染色质募集依赖于其 PHD 结构域与沉积在停滞叉后面的 H3K4me3 亲本组蛋白的相互作用。它的募集通过限制 Exo1 的访问来防止 ssDNA 在停滞叉处积累。我们进一步表明，删除 SPP 1 会增加屏障上游的突变率，有利于微缺失的积累。最后，我们报告称 Spp1 保护 Tus/Ter 停滞复制叉处的新生 DNA。我们认为 Spp1 限制了叉的重塑，最终限制了新生 DNA 对核酸酶的利用。
核小体中的DNA修复：来自组蛋白修饰和突变体的见解
摘要：DNA修复途径在基因组稳定性中起关键作用，但是在真核细胞中，它们必须在染色质的紧凑和纠结环境中进行修复DNA病变。先前的研究表明，将DNA包装到核小体中，构成了染色质的基本构件，对DNA修复具有深远的影响。在这篇综述中，我们讨论了有关染色质DNA修复的原理和机制。我们关注组蛋白翻译后修饰（PTM）在修复中的作用，以及组蛋白突变体影响细胞对DNA损伤剂和染色质修复活性的分子机制。重要的是，这些机制被认为会显着影响人类癌症的体细胞突变率，并有可能导致癌变和其他人类疾病。例如，许多主要在酵母中研究的组蛋白突变体已被确定为不同癌症中酒精酮突变的候选者。本综述强调了这些联系，并讨论了DNA修复在染色质中的潜在重要性。
了解胶质母细胞瘤的基因组概况
摘要。胶质母细胞瘤 (GBM) 被世界卫生组织 (WHO) 归类为 4 级胶质瘤，是一种致命的中枢神经系统肿瘤。随着特定基因异常的发现，GBM 分类已被多次修改，以提供更好的诊断和预后准确性。尽管目前的治疗方式包括手术切除、辅助化疗和放疗相结合，可以短暂控制肿瘤进展，但生存结果仍然令人沮丧。GBM 仍然具有侵袭性，并且复发的主要原因是存在一群独特的无法治疗的胶质母细胞瘤干细胞 (GSC)。高突变率和转录景观失调增加了 GSC 对常规化疗和放射疗法的抵抗力，导致 GBM 患者的预后不佳。因此，GSC 已成为新 GBM 治疗模式的关注目标。因此，了解它们的独特特性（例如 GSC 与缺氧微环境的相互作用，从而促进其生长）非常重要。信号通路的表观基因组调节剂和基本分子成分是胶质母细胞瘤治疗的潜在靶点。在这篇综述中，我们旨在