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分析使我们能够选择一个病毒寡肽序列,其侧面的可变区域(VR)作为合适的目标(图。1a)用于使用SELEX隔离和识别适体(如图1b)。在筛选期间,
1.1通过CRISPR/CAS9通过特定地点的双链断裂(DSB)靶向DNA的基因组编辑(DSB)体现了现代生物技术的基石。随着新工具的发现和开发(例如工程核酸酶),对目标位点的挑战不断降低,随着时间的流逝,挑战[1]。 CRISPR/CAS9系统及其两个组件设置以及简单的目标程序构成可用工具箱中当前的金标准。 在该系统中,CAS9核酸酶的复合物和引导RNA(GRNA)介导了选定的目标位点的DSB诱导。 GRNA具有主要相关性,一方面介导靶DNA接收和结合,另一方面是Cas9的靶DNA裂解[2]。 GRNA的可变区域(指南)确定目标DNA结合的位点,并可以调整为感兴趣的序列。 采用该系统,诸如单一和多重编辑,表观遗传和转录调控,基因组基因局的可视化以及基础编辑的应用在大量生物中是可行的(有关详细信息,请参见评论[3-6])。 目标选择仅需要挑战[1]。CRISPR/CAS9系统及其两个组件设置以及简单的目标程序构成可用工具箱中当前的金标准。在该系统中,CAS9核酸酶的复合物和引导RNA(GRNA)介导了选定的目标位点的DSB诱导。GRNA具有主要相关性,一方面介导靶DNA接收和结合,另一方面是Cas9的靶DNA裂解[2]。GRNA的可变区域(指南)确定目标DNA结合的位点,并可以调整为感兴趣的序列。采用该系统,诸如单一和多重编辑,表观遗传和转录调控,基因组基因局的可视化以及基础编辑的应用在大量生物中是可行的(有关详细信息,请参见评论[3-6])。目标选择仅需要
本文定量探索了带有和没有PCM的可变面积直鳍的散热器的热性能。研究了不同的鳍几何形状(恒定面积直鳍,可变面积直鳍,圆形销钉鳍,半球形销钉鳍和椭圆销鳍),不同的雷诺数和鳍密度对增强电子冷却性能的效果。这项研究的目的是开发用于电子冷却技术的最佳鳍几何形状。这项研究表明,改变的鳍密度可以改善散热器的热性能,同时减少散热器的重量。发现散热器的基本温度在可变面积直鳍中较低。与PCM进行热传递的替代配置相比,结果表明,可变面积直鳍散热器最有效。散热器的热阻力降低了9%。关键字:可变区域直鳍,雷诺号,PCM,CFD
腺相关病毒(AAV)是将基因疗法递送到靶器官的重要车辆。因此,控制其靶向是极大的治疗兴趣。通常,在搜索具有理想的对流的AAV病毒的过程中,筛选了突变的衣壳的大量库。但是,在任何一个实验中筛选的衣壳的数量通常远小于搜索的序列空间。因此,一开始将搜索空间限制为那些会产生可行病毒的衣壳将是有用的。在这里,我们介绍了在此过程中设计为助手的机器学习模型的结果。他们预测了氨基酸序列的生产拟合度,用于在可变区域中的AAV Capsid蛋白VP1中携带插入突变的AAV9病毒8。我们演示了模型的性能,并展示了它们如何用作预筛选工具,以构建具有高平均生产适应性和高度多样性的热带主义筛查的衣壳库。
结果:使用物种特异性或特异性PCR方法的靶向测试证实了所有菌株/物种的身份。虽然将40个菌株鉴定为应变水平,但仅由于缺乏应变特异性鉴定方法,将60个菌株识别为物种水平。在基于扩增子的HTS中,针对两个16S rRNA基因的可变区域。基于V5 – V8区域数据,〜每个样品的总读数的〜99%与目标物种相对应,并且未检测到未宣布的物种。基于V3 – V4区域数据,〜95%–97%的每个样品总读数占目标物种,而约有2%–3%的读取未申报的物种(proteus物种),但是,试图培养Proteus的尝试证实,所有批次都没有可行的Proteus物种。从成品的所有五个批次中读取到所有10个目标菌株的基因组的SMS读取。
引言慢性淋巴细胞性白血病(CLL)是西方世界成年人中最常见的白血病,占所有白血病病例的30%以上(Siegel等人,2020年)。在40-60%的患者中可能是无症状的疾病,被意外诊断出医疗常规检查,而其余患者可能带有淋巴结炎,脾肿大,复发性感染和/或自身免疫性疾病(例如溶血性炎症或诱发性炎症或动荡的症状)等症状。 Al。,2016)。cll是一种恶性肿瘤,其特征是CD5+ B细胞的克隆膨胀,它们在形态成熟的外观上表现出血液,骨髓和继发性淋巴组织,导致淋巴细胞增多,导致骨髓不足,脑骨髓内部,淋巴细胞疗法和脾气暴躁(Kipps et al.Kipps等)。CLL具有高度异质的临床过程,从懒惰的行为到侵略性疾病,在几乎30%的病例中需要及时治疗。这些差异与白血病细胞的许多标记有关,包括染色体畸变,免疫球蛋白重链可变区域基因(IGHV)的突变状态,TP53失活,CD38和ZAP-70表达(Hallek等,2018)。但是,
摘要针对人表皮生长因子受体2(PL85“ M)的鼠单克隆抗体MUMAB4D5,特别抑制了过表达P185HER2的人类肿瘤细胞的增殖。但是,MUMAB4D5在人类癌症治疗中的功效可能受到人类抗小鼠抗体反应和缺乏效应功能的限制。一种“ HUM”抗体Humab4d5-1,仅包含来自MUMAB4D5的抗原结合环和人类可变区域框架残基以及IgG1常数DO。使用311-MER和361-MER预组装的寡核苷酸分别通过“基因转换诱变”在一个步骤中模拟了光和重链变量区域。Humab4d5-1变体并未阻止人类乳腺癌SK-BR-3细胞的产生,尽管抗原结合紧密(KD = 25 nm),但它过表达PL85mm。通过分子建模(Humab4d5-8)挖掘七个添加的Humai变体之一(HUMAB4D5-8)分别比Humab4d5-1和Mumab4d5结合了PL85“ IM2抗原250倍和3倍。此外,Humab4d5-8在阻断SK-BR-3细胞增殖方面具有与UINRE抗体相当的效力。此外,Humab4d5-8在支持抗体依赖性细胞毒性对SK-BR-3细胞方面的效率要高得多,而不是MUMAB4D5,但并不能有效地杀死WI-38细胞,WI-38细胞在较低水平上表达P185HFR。
遗传和产前环境因素塑造了后来的胎儿发育和心脏代谢健康。遗传和产前环境因素的关键靶标是胎盘的表观组,这是一种与胎儿生长和以后疾病有关的器官。这项研究有两个目的:(1)识别和功能表征胎盘可变区域(VMR),它们是表观基因组中具有高个体间甲基化变异性的区域; (2)研究胎儿遗传基因座和12个产前环境因素(母体心脏代谢,心理社会,人口统计学和与产科相关)对甲基化的贡献。akaike的信息标准用于选择四个模型中的最佳模型[仅产前环境,仅基因型,基因型和产前环境(G + E)的添加效应以及它们的相互作用效果(G×E)]。我们在胎盘中确定了5850 VMR。在70%的VMR中甲基化最好用G×E解释,其次是基因型(17.7%)和G + E(12.3%)。单独的产前环境最好仅解释了0.03%的VMR。我们观察到95.4%的G×E模型和93.9%的G + E模型包括孕妇年龄,均衡,递送模式,孕产妇抑郁症或妊娠体重增加。VMR甲基化位点及其调节性遗传变异含量(p <0.05),对于已知与调节功能和复杂性状联系的基因组区域。这项研究提供了胎盘中VMR的全基因组目录,并强调指出,通过整合遗传和产前环境因素,最好阐明胎盘DNA甲基化的胎盘DNA甲基化的变化,而仅通过环境因素而言,可以最好地阐明胎盘DNA甲基化的变化。