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腺相关病毒(AAV)是将基因疗法递送到靶器官的重要车辆。因此,控制其靶向是极大的治疗兴趣。通常,在搜索具有理想的对流的AAV病毒的过程中,筛选了突变的衣壳的大量库。但是,在任何一个实验中筛选的衣壳的数量通常远小于搜索的序列空间。因此,一开始将搜索空间限制为那些会产生可行病毒的衣壳将是有用的。在这里,我们介绍了在此过程中设计为助手的机器学习模型的结果。他们预测了氨基酸序列的生产拟合度,用于在可变区域中的AAV Capsid蛋白VP1中携带插入突变的AAV9病毒8。我们演示了模型的性能,并展示了它们如何用作预筛选工具,以构建具有高平均生产适应性和高度多样性的热带主义筛查的衣壳库。

AAV生产拟合建模的机器学习

AAV生产拟合建模的机器学习PDF文件第1页

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