分子表示学习(MRL)长期以来在药物发现和材料科学领域至关重要,并且由于自然语言处理(NLP)和图形神经网络(GNN)的发展,它取得了重大进展。nlp将分子视为一维顺序令牌,而GNN则将它们视为二维拓扑图。基于通过不同的消息传递算法,GNN在检测化学环境和预测分子特性方面具有各种性能。在此,我们提出了定向的图形注意力网络(D-GAT):具有定向键的表达性GNN。我们策略成功的关键是按照指示图处理分子图,并通过缩放的点 - 产物注意机制来更新键状态和原子状态。这使模型可以更好地捕获分子图的子结构,即官能团。与其他GNN或消息传递神经网络(MPNN)相比,D-Gats的表现优于15个重要分子属性预测基准中的13个。
Bioc 3321。生物化学。(3 cr。; A-F或审计;每年秋天)在本课程中,学生通过积极学习,以学生为中心的方法来感谢生物化学当前知识的广度和深度。学生检查生命必不可少的大分子的结构(包括蛋白质,脂质和碳水化合物)。此分析对分子结构指示功能的方式进行了特殊考虑。此外,学生检查了负责大分子合成和降解的酶促途径,催化这些反应的酶的调节以及在这些过程中消耗或产生的能量。这种途径包括碳水化合物代谢(糖酵解,糖异生,柠檬酸周期),脂质代谢(β-氧化,脂质合成)和氧化磷酸化。学生将这些概念应用于该领域的解决问题,同时还通过基于团队的合作活动对他/她的生化原理进行信心。prereq:c或以下所有以下内容:生物2311; Chem 2231,2333;数学1120
13.简化子结构对撞击载荷的实验研究,A. Krogstad,NTNU 14.水动力载荷建模对小水深浮动风力涡轮机及其系泊系统响应的影响,Kun Xu,NTNU 15.单桩基础海上风力涡轮机的 GPS/加速度计集成轮毂位置监测算法,Z. Ren,NTNU 16.浮动海上风电子结构的供应链 - TLP 示例,H.Hartmann,罗斯托克大学 17.海上风电场部署浮动支撑结构的批判性评论,M Leimeister,REMS,克兰菲尔德大学 18.对海上风力涡轮机最先进的 ULS 设计程序的评估子结构,C. Hübler,汉诺威莱布尼茨大学 19。海上浮动平台:运动缓解解决方案分析,A.Rodriguez Marijuan,Saitec Offshore Technologies 20。LIFES50+ OO-Star Wind Floater Semi 10MW 浮动风力涡轮机的最新模型,A. Pegalajar-Jurado,DTU 21。LIFES50+ OO-Star Wind Floater Semi 10MW 的 CFD 模型验证和粘性流效应研究,H. Sarlak,DTU 22。非线性波浪载荷对单桩风力涡轮机结构的影响,M. Mobasheramini,皇后大学,Bryden 中心 23。设计浅水深度的 FOWT 系泊系统,V. Arnal,LHEEA,Centrale Nantes 24。整体混凝土柱浮标平台批量生产的建造可能性,C. Molins,UPC-Barcelona Tech 25。使用扩展轮廓线方法对海上风力涡轮机进行极端响应估计,J-T.Horn,NTNU 26。OO-Star 风力浮子的制造和安装,T.Landbø,Dr.techn.Olav Olsen 会议 F 27。分析尾流和下游涡轮机性能建模的实验验证,F. Polster,柏林工业大学 28。用于预测 NACA0015 翼型周围气动升力的降阶模型,M.S.Siddiqui,NTNU 29。快速发散一致的流降阶模型,E. Fonn,SINTEF Digital
1。Xu Y,Chiang YH,HO PC,Vannini N:线粒体决定HSC和T细胞的功能和命运。2023 CANCAR IMMUNOL RES 2。Girotra M, Chiang YH, Charmoy M, Ginefra P, Hope HC, Bataclan C, Yu YR, Schyrr F, Franco F, Geiger H, Cherix S, Ho PC, Naveiras O, Auwerx J, Held W, Vannini N: Induction of mitochondrial recycling reverts age-associated decline of the hematopoietic and immune系统。2023 NAT老化3。Wilkinson AC,Ishida R,Nakauchi H,Yamazaki S:小鼠造血干细胞的长期离体扩张。 2020 NAT ProtoC 4。 Wang Y,Backman TWH,Horan K,Girke T:FMCSR:不匹配的最大最大常见子结构搜索R. 2013 Bioinformatics 5。 Hennig C:_FPC:clustering_的灵活过程。 2024 cran.r- project.org/package=fpc 6。 Maechler,M.,Rousseeuw,P.,Struyf,A.,Hubert,M.,Hornik,K:集群:聚类分析基础知识和扩展。 2023 cran.r-project.org/package=cluster 7。 Ritz,C.,Baty,F.,Streibig,J.C.,Gerhard,D:使用R 2015 PLOS ONE 8。的剂量反应分析 Landrum G等人:RDKIT:开源化学信息学。 2024 doi.org/10.5281/zenodo.591637Wilkinson AC,Ishida R,Nakauchi H,Yamazaki S:小鼠造血干细胞的长期离体扩张。2020 NAT ProtoC 4。Wang Y,Backman TWH,Horan K,Girke T:FMCSR:不匹配的最大最大常见子结构搜索R. 2013 Bioinformatics 5。Hennig C:_FPC:clustering_的灵活过程。2024 cran.r- project.org/package=fpc 6。Maechler,M.,Rousseeuw,P.,Struyf,A.,Hubert,M.,Hornik,K:集群:聚类分析基础知识和扩展。2023 cran.r-project.org/package=cluster 7。Ritz,C.,Baty,F.,Streibig,J.C.,Gerhard,D:使用R 2015 PLOS ONE 8。Landrum G等人:RDKIT:开源化学信息学。2024 doi.org/10.5281/zenodo.591637
摘要。对于海上风力涡轮机的设计和优化,了解现实环境条件和利用有充分依据的模拟约束非常重要,因为两者都会影响数值模拟中的结构行为和功率输出。然而,真正的高质量数据,特别是用于研究目的的数据,很少可用。这就是为什么在这项工作中,使用 FINO 研究平台的数据得出北海和波罗的海风力涡轮机位置的 13 个环境条件的综合数据库。对于模拟约束,如模拟长度和初始模拟瞬态时间,文献中也有充分依据的建议。然而,众所周知,模拟长度和初始瞬态时间的选择从根本上影响模拟的质量和计算时间。因此,对两个参数的收敛性进行了研究,以根据子结构类型、风速和考虑的载荷(疲劳或极限)确定适当的值。由于数据库和模拟约束的主要目的是为概率设计方法提供现实数据,并作为进一步研究的指导,以实现更现实和准确的模拟,因此所有结果都是免费提供的并且易于应用。
摘要:很少的石墨烯具有低能载体,其表现为巨大的费米子,在运输和光散射实验中都表现出有趣的特性。将共振拉曼光谱的激发能降低至1.17 eV,我们将这些巨大的准粒子靶向在靠近K点的分裂带中。低激发能量削弱了可见的一些拉曼过程,并诱发了双层和三层样品中共振2D峰的子结构的更清晰的频率分离。我们遵循每个子结构强度的激发能量依赖性,并将双层石墨烯的实验测量与从头算的理论计算进行比较,我们追溯了对探测电子散布接近的电子散布和增强电子 - 唱机元件元素元素的关节效应的此类修改。关键字:石墨烯,拉曼,电子 - 声子,巨大的狄拉克费米,运输
纳米生物传感器和生物分析应用小组(NanoB2A)、加泰罗尼亚纳米科学与纳米技术研究所(ICN2)、CSIC、BIST 和 CIBER-BBN,贝拉特拉,08193,巴塞罗那,西班牙。电子邮件:maria.soler@icn2.cat b 大分子结构系,国立生物技术中心,高级科学研究委员会(CNB-CSIC),Darwin 3,Campus Cantoblanco UAM,28049 Madrid,西班牙 c 微生物生物技术系,国立生物技术中心,高级科学研究委员会(CNB-CSIC),Darwin 3,Campus Cantoblanco UAM,28049 Madrid,西班牙 d 综合系统生物学研究所(I2SysBio),瓦伦西亚大学-CSIC,46980,瓦伦西亚,西班牙 e 国家传染病研究所“L. Spallanzani”IRCCS,Via Portuense 292,00149,罗马,意大利 † 当前隶属关系:圣卡米勒国际健康科学大学,意大利罗马 Sant'Alessandro 大街 8 号,00131; IRCCS Sacro Cuore Don Calabria 医院,地址:via Don A. Sempreboni 5, 37024, Negrar di Valpolicella(维罗纳),意大利。
在之前的两项研究中,我们确定化合物 1 是一种中等强度的 GroEL/ES 抑制剂,对革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌具有弱至中等抗菌活性,包括枯草芽孢杆菌、耐甲氧西林金黄色葡萄球菌、肺炎克雷伯菌、鲍曼不动杆菌和 SM101 大肠杆菌(其脂多糖生物合成途径受损,使细菌对药物更具渗透性)。基于这些研究,我们开发了两系列类似物,其关键子结构与已知抗菌剂相似,即硝基喹啉(羟基喹啉部分)和硝呋喃妥因/硝基呋喃妥因(双环-N-酰腙骨架)。通过生化和细胞分析,我们鉴定出有效的 GroEL/ES 抑制剂,这些抑制剂可选择性阻断屎肠球菌、金黄色葡萄球菌和大肠杆菌的增殖,且对人结肠和肠道细胞的细胞毒性较低。最初,我们仅发现含羟基喹啉的类似物在我们的 GroEL/ES 介导的
分子设计包括构建具有期望特征的分子,是计算药物发现中的关键任务。o ly需要保存某些SCA ot olds或核心化学子结构,它们是设计过程的骨干,保留这些群体的动机和约束通常源于它们在分子生物学活性中的关键作用。然而,当依靠传统的分子弦表示(例如简化的分子输入线进入系统(Smiles))等传统分子字符串表示时,对这种约束的不利可能性可能具有挑战性。尽管微笑在化学和药物发现中起着至关重要的作用,但它无法提供分子亚结构的连续代表。这种限制阻碍了任务,例如将结构添加到分子的旧片段并连接碎片,从而限制了其在改善潜在药物候选物的有用性,尤其是在铅优化效果期间。应对这些挑战需要开发分子增强的线符号,该分子可以保留分子sca o的完整性和片段的完整性,同时又具有从头分子设计的差异。
摘要:本文提出了一种基于数字孪生信息更新海上风力涡轮机子结构可靠性的概率框架。具体来说,从数字孪生获得的信息用于量化和更新疲劳损伤累积中与结构动力学和载荷建模参数相关的不确定性。更新后的不确定性包含在用于更新结构可靠性的疲劳损伤累积概率模型中。更新后的可靠性可用作输入,以优化现有结构的运行和维护以及新结构设计的决策模型。该框架以两个具有代表性的海上风力涡轮机的数值案例研究和从先前建立的数字孪生中获取的信息为基础。在此背景下,研究了更新土壤刚度和波浪载荷的影响,这两个参数构成了两个高度不确定和敏感的参数。研究发现,更新土壤刚度会显著影响靠近泥线的接头的可靠性,而更新波浪载荷会显著影响位于溅区局部的接头的可靠性。用于更新波浪载荷的虚拟传感会增加不确定性,从而降低结构可靠性。