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World File Search System嵌合
体细胞染色体嵌合体的动态特性、遗传-环境相互作用以及疾病和衰老的治疗机会
背景：体细胞染色体嵌合体是指个体中存在染色体组（例如正常和异常）不同的细胞群。染色体嵌合体与多种疾病状况和衰老有关。研究表明，体细胞基因组变异的染色体异常细胞数量可能不稳定。因此，嵌合率在个体发育过程中会动态变化。此外，疾病严重程度和嵌合率之间似乎存在相关性。高嵌合率通常与严重的疾病表型有关，而低水平嵌合通常见于较轻的疾病表型或可能未受影响的个体。在此，我们假设体细胞染色体嵌合体的动态性质可能是由遗传-环境相互作用引起的，从而为相关疾病和衰老创造了治疗机会。结论：遗传-环境相互作用似乎促成了体细胞嵌合体的动态性质。因此，对细胞群的外部影响可能会改变核型正常和异常细胞的比例，有利于增加没有染色体重排的细胞数量。考虑到体细胞染色体嵌合体在健康和疾病中的作用，我们假设人为改变体细胞嵌合体率可能对患有相关疾病和/或行为或生殖问题的个体有益。此外，此类治疗程序可能有助于抗衰老策略（即通过降低染色体嵌合体水平来实现年轻化），从而延长寿命。最后，该假设似乎适用于任何类型的体细胞嵌合体。
carvykti
背景Carvykti（Ciltacabtagene Autoleucel）是B细胞成熟抗原（BCMA）指导的，转基因自体T细胞免疫疗法，涉及将患者自身的T细胞重新编程，并用经过嵌合的嵌合抗原受体（CAR）来识别和消除BCCA的嵌合抗原受体（CAR），以表达BCMA。与表达BCMA的细胞结合后，CAR促进了T细胞激活，扩张和消除靶细胞（1）。调节状态FDA批准的指示：CARVYKTI是B细胞成熟抗原（BCMA）指导的遗传修饰的自体T细胞免疫疗法，以治疗成年患者的复发或耐火多发性多发性骨髓瘤，至少接受了1次先前的疗法，包括蛋白酶的蛋白酶，包括蛋白酶蛋白酶蛋白酶，及其蛋白酶蛋白酶蛋白酶，及其蛋白酶蛋白酶蛋白酶蛋白酶蛋白疗法及其蛋白酶蛋白酶蛋白酶蛋白酶及其蛋白酶蛋白酶素及其蛋白酶蛋白酶素及其蛋白酶反射剂及其蛋白酶反射剂及其抑制作用。 Lenalidomide（1）。CARVYKTI已发出有关：（1）
电穿孔介导的牲畜受精卵基因组编辑
传统上，将基因组编辑试剂引入哺乳动物受精卵是通过细胞质或原核微注射完成的。这一耗时的过程需要昂贵的设备和高水平的技能。受精卵电穿孔提供了一种简化和更精简的方法来转染哺乳动物受精卵。有许多研究检查了小鼠和大鼠受精卵电穿孔中使用的参数。在这里，我们回顾了已报道的小鼠和大鼠的电穿孔条件、时间和成功率，以及关于牲畜受精卵（特别是猪和牛）的少数报道。在受精时或受精后不久引入编辑试剂可以帮助降低嵌合率，即个体细胞中存在两种或更多种基因型；引入核酸酶蛋白而不是编码核酸酶的 mRNA 也可以。嵌合在世代间隔较长的大型牲畜物种中尤其成问题，因为通过繁殖获得非嵌合的纯合后代可能需要数年时间。通过非同源末端连接途径实现的基因敲除已得到广泛报道，并且使用电穿孔成功实现的基因敲除比基因敲入更多。将大型 DNA 质粒递送到受精卵中会受到透明带 (ZP) 的阻碍，并且大多数通过电穿孔实现的基因敲入都使用短单链 DNA (ssDNA) 修复模板，通常小于 1 kb。在不使用细胞质注射的情况下，将长达 4.9 kb 的较大供体修复模板与基因组编辑试剂一起递送到受精卵中最有希望的方法是使用重组腺相关病毒 (rAAV) 与电穿孔相结合。但是，与用于递送成簇的规律间隔回文重复序列 (CRISPR) 基因组编辑试剂的其他方法类似，这种方法也与高水平的嵌合性有关。最近的研究成果是利用编辑过的生殖系能力细胞补充生殖系消融个体，从而避免基因组编辑创始系生殖系中出现嵌合现象。即使通过电穿孔介导将基因组编辑试剂递送至哺乳动物受精卵，基因组编辑流程中仍存在其他瓶颈，目前阻碍了非嵌合基因组编辑牲畜的可扩展生产。
错误、嵌合体、偏差和 GC 含量对扩增子测序准确性的影响
摘要 靶向扩增子测序广泛应用于微生物生态学研究。然而，测序伪影和扩增偏差令人担忧。为了确定这些伪影的来源，我们使用由来自 33 种细菌菌株的 16S rRNA 基因组成的模拟群落进行了系统分析。我们的结果表明，虽然测序错误通常只发生在低丰度操作分类单元中，但嵌合序列是伪影的主要来源。单序列和双序列主要是嵌合体。嵌合序列的形成与目标序列的 GC 含量显着相关。低 GC 含量的模拟群落成员表现出较低的嵌合序列形成率。GC 含量对序列恢复也有很大影响。定量能力明显有限，恢复率差异很大，预期和观察到的菌株丰度之间的相关性较弱。GC 含量较高的模拟群落菌株的恢复率高于 GC 含量较低的菌株。由于引物亲和力的差异，还观察到了扩增偏差。两步 PCR 策略将嵌合序列的数量减少了一半。此外，基于模拟群落的比较分析表明，几种广泛使用的序列处理流程/方法，包括DADA2、Deblur、UCLUST、UNOISE和UPARSE，在伪影去除和稀有物种检测方面各有优缺点。这些结果对于提高测序质量和可靠性以及开发新的算法来处理目标扩增子序列具有重要意义。
自体细胞疗法：关键挑战和生物处理创新
*Other/unknown vector type used to generate the cell therapy **Other/unknown includes immune cells such as dendritic cells and natural killer cells, CAR-M, CAR-B and other cells such as skin, tumor and muscle cells ***Stem cells primarily includes hemopoietic stem cells, mesenchymal stem cells and induced pluripotent stem cells ^Other therapeutic areas include cardiology, dermatology, hematology, infectious disease and没有特定治疗区域的资产^^主要五只血都是B-NHL，AML，多发性骨髓瘤和慢性淋巴细胞性白血病：CAR-M = CAR-M =嵌合抗原受体巨噬细胞； CAR-B =嵌合抗原受体B细胞； til =肿瘤浸润淋巴细胞； TCR = T细胞受体； CAR-T =嵌合抗原受体T细胞； gi =胃肠道；全部=急性淋巴细胞性白血病； B-NHL = B细胞非霍奇金淋巴瘤； AML =急性髓细胞性白血病来源：L.E.K.分析Citeline的药物数据库
CD19 嵌合抗原受体 T 细胞疗法在治疗 B 细胞恶性肿瘤中提高疗效的关键因素叙述性回顾
最近，Turtle 等人报道，在淋巴细胞清除化疗后，使用 CD19 CAR-T 细胞治疗 B-ALL 的 29 名患者中，有 27 名（93%）在骨髓 (BM) 中实现了白血病原始细胞缓解 (14)。Bhoj 等人报道了一项关于 CTL019 治疗患者中 CD19-CAR T 持久性的临床试验 (13)。他们的研究表明，几种疫苗在治疗后至少 6-12 个月内保持相对稳定。此外，自体受体（平均 201 天）和同种异体受体（51 天）之间的 CAR T 细胞持久性不同 (12)。然而，不同研究的临床结果各不相同。在 Brudno 的研究中，20 名患者中只有 8 名获得缓解，其中包括两次部分缓解 (15)。提高疗效的关键因素仍不清楚。在这篇综述中，我们讨论了影响
内脏肥胖发病机制中可能的关键因素
背景和目的：心血管、肾脏和脂肪组织中血管紧张素 II 型受体相关蛋白 (ATRAP) 表达失调与高血压、心脏肥大、动脉粥样硬化、肾脏损伤和代谢紊乱的病理有关。此外，ATRAP 在骨髓来源的免疫细胞中高度表达；然而，免疫细胞 ATRAP 在肥胖相关病理中的功能作用仍不清楚。因此，我们试图使用饮食诱导的肥胖小鼠模型来确定免疫细胞 ATRAP 在内脏肥胖和肥胖相关代谢紊乱发展中的病理生理意义。方法：首先，我们检查了高脂饮食 (HFD) 诱导的肥胖对野生型小鼠免疫细胞 ATRAP 表达的影响。随后，我们进行了骨髓移植以产生两种类型的嵌合小鼠：骨髓野生型嵌合 (BM-WT) 和骨髓 ATRAP 敲除嵌合 (BM-KO) 小鼠。这些嵌合小鼠被提供 HFD 来诱导内脏肥胖，然后研究免疫细胞 ATRAP 缺乏对嵌合小鼠生理参数和脂肪组织的影响。结果：在野生型小鼠中，HFD 引起的体重增加与免疫细胞 ATRAP 表达增加有关。在骨髓移植实验中，与 BM-WT 小鼠相比，BM-KO 小鼠表现出 HFD 引起的体重增加和内脏脂肪扩张的改善，脂肪细胞较小。此外，与 HFD 上的 BM-WT 小鼠相比，HFD 上的 BM-KO 小鼠在白色脂肪组织代谢、炎症、葡萄糖耐受性和胰岛素抵抗方面表现出显着改善。对白色脂肪组织的详细分析表明，通过改善 BM-KO 小鼠脂肪组织中 CD206 + 巨噬细胞的积聚，显着抑制了 HFD 诱导的转化生长因子-β 信号的激活，这是内脏肥胖的关键因素。这一发现为 BM-KO 小鼠在 HFD 上表现出的抗肥胖表型提供了相关机制。最后，单核细胞的转录组分析表明，基因变化（例如单核细胞水平上干扰素-γ 反应的增强）可能会影响 BM-KO 小鼠的巨噬细胞分化。
通过 CRISPR 介导的同源性定向修复和双 AAV6 转导系统将嵌合抗原受体靶向递送到 T 细胞中
摘要：CAR-T 细胞疗法涉及通过在 T 细胞表面添加嵌合抗原受体 (CAR) 对 T 细胞进行基因改造，使其识别和攻击肿瘤细胞。在本研究中，我们使用 AAV 血清型 6 (AAV6) 的双重转导将抗 CD19 CAR 整合到人类 T 细胞的已知基因组位置。第一个病毒载体表达 Cas9 内切酶和针对 T 细胞受体 alpha 恒定基因座的向导 RNA (gRNA)，而第二个载体携带用于同源介导的 CAR 插入的 DNA 模板。我们评估了三种 gRNA 候选物并确定了它们在产生插入/缺失方面的效率。AAV6 成功地在体外传递了 CRISPR/Cas9 机制，双重转导的分子分析表明 CAR 转基因整合到了所需位置。与通常用于生成 CAR-T 细胞的随机整合方法相比，靶向整合到已知基因组位点可以降低插入诱变的风险，并提供更稳定的 CAR 表达水平。至关重要的是，这种方法还可以敲除内源性 T 细胞受体，从而允许从同种异体供体中提取靶细胞。这带来了令人兴奋的“现成”通用免疫疗法的可能性，这将大大简化 CAR-T 细胞的生产和给药。
嵌合抗原受体T细胞疗法受体中的巨细胞病毒感染：一项观察性研究，重点是肿瘤学结局
CAR-T治疗通常与细胞因子释放Syn Drome（CRS）或免疫效应细胞相关的神经毒性综合征（ICANS）有关；患者通常需要用Toci lizumab，类固醇或Anakinra治疗来减轻这些并发症[7]。此外，CAR-T疗法可能导致由于B细胞发育不全引起的低血糖双血症，随后感染率更高[6-9]。感染是CAR-T治疗后最常见的直接直接原因之一[10]。使用Tocilizumab或类固醇治疗CRS和/或ICAN后，这种风险增加，在CAR-T治疗时年龄高龄，并且在CAR-T治疗之前进行了多种治疗方法[7，9，11]。降低CAR-T治疗的大多数病毒感染来自呼吸道病毒和甲状腺病毒（CMV）[9]。
94 个 CRISPR-Cas9 表达 T0 转基因烟草株系的基因编辑谱揭示了目标基因的高嵌合编辑频率
摘要：嵌合编辑是基因编辑中经常报道的技术。为了评估嵌合编辑的普遍情况，我们构建了携带标记β-葡萄糖醛酸酶基因（gusA）的转基因烟草品系，并将CRISPR-Cas9编辑载体引入转基因烟草品系中以敲除gusA，然后研究T0代及后续代中gusA的编辑效率。编辑载体携带一个由花椰菜花叶病毒35S启动子驱动的Cas9基因，以及两个引导RNA，gRNA1和gRNA2，分别由拟南芥U6（AtU6）和U3（AtU3）启动子驱动。两个gRNA被设计用于敲除gusA编码区的一个42个核苷酸的片段。利用农杆菌介导的转化和潮霉素选择将编辑载体转化到含有gusA的烟草叶中。使用抗潮霉素的独立 T 0 转基因株系通过组织化学 GUS 测定、聚合酶链式反应 (PCR) 和 PCR 扩增子的下一代测序来评估 gusA 编辑效率。94 个 T 0 转基因株系的靶序列图谱显示，这些株系是由未经编辑的细胞再生而来的，随后进行了编辑，并在再生期间或之后在这些株系中产生了嵌合编辑细胞。其中两个株系的 42 bp 核苷酸对的靶片段被去除。详细分析表明，在 4.3% 和 77.7% 的 T 0 转基因株系中分别发现了 AtU6-gRNA1 位点和 AtU3-gRNA2 位点的靶突变。为了解决 T 0 株系中编辑效率极低的问题，我们从嵌合株系进行了第二轮芽诱导，以提高获得所有或大多数细胞都经过编辑的株系的成功率。 T 0 转基因系中的突变谱为理解利用组成型表达的 CRISPR-Cas9 和 gRNA 进行植物细胞中的基因编辑提供了宝贵的信息。