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比较 QIAseq 肿瘤突变负担面板中的 TMB 评分和 MSI 状态
此外，DHS-8800Z QIAseq Targeted DNA panel 涵盖了可用于推断微卫星不稳定性状态的有用基因位点。该状态测量几个微卫星基因位点长度分布的统计变化，并将测试样本的统计变化与正常样本基线（包含在 QIAGEN 参考数据集中，可在 Workbench 中下载）进行比较。如果不稳定性微卫星基因位点的比例高于预定义阈值，则认为样本不稳定。许多 MSI-High 肿瘤患者对免疫疗法产生了积极的反应。此外，美国食品药品监督管理局 (FDA) 已加速批准 pembrolizumab 用于治疗微卫星不稳定性 (MSI)-High 的儿童和成人患者，这使其成为首个获批用于治疗具有这种生物标志物的实体瘤的药物，无论肿瘤来源如何 [ Chang et al., 2018 ]。
晚期 BRAFV600E 突变微卫星稳定性结肠癌患者停止接受达拉非尼、曲美替尼和西妥昔单抗三线治疗后持续完全缓解：病例报告和文献综述
转移性 BRAF V600E 突变结直肠癌与较差的总体生存率和对标准疗法的适度疗效相关。此外，生存率受微卫星状态的影响。在结直肠癌的广泛基因亚群中，微卫星稳定和 BRAF V600E 突变结直肠癌患者的预后最差。在此，我们介绍了一个患者案例，该病例使用达拉非尼、曲美替尼和西妥昔单抗作为后线治疗，对一名 52 岁患有晚期 BRAF V600E 突变、微卫星稳定结肠癌的女性表现出令人印象深刻的治疗效果。该患者在接受三联疗法 1 年后获得完全缓解。由于皮肤毒性为 3 级，且粘膜毒性导致尿路感染反复发作，治疗降级为达拉非尼和曲美替尼，并继续进行双重治疗 41 个月，持续完全缓解。1 年来，患者停止治疗，目前仍处于完全缓解状态。
左撇子外科医生的微创手术
对于晚期转移性CRC而言，严峻（2）。微卫星不稳定性（MSI）是由于不匹配修复缺陷（DMMR）导致的微卫星序列（主要是1-6个核苷酸的串联重复DNA序列）内的复制误差，导致误差积累和微卫星不稳定性高（MSI-H），这是MetAstic Crc（3％）（3％）（3％）（MSI）（MSI-H）。微卫星不稳定性高（MSI-H）患者在肿瘤细胞中的DNA突变积累导致肿瘤新抗原的产生，从而增强肿瘤免疫原性，促进免疫细胞浸润并刺激抗肿瘤的免疫反应（5）。对于晚期CRC的管理，依赖于系统治疗，包括化学疗法，靶向治疗和免疫疗法（6）。对于患有MSI-H/DMMR的晚期CRC患者，主题演讲177研究发现，pembrolizumab单药治疗在客观反应率（43.8％vs. 33.1％）和无进展生存期（16.5 vs. 8.2个月）中明显好于全身化疗。这些结果表明，Pembrolizumab可以被视为MSI-H/DMMR晚期CRC患者的初始治疗选择（7,8）。在此，我们提出了双主要CRC的案例。通过下一代测序（NGS）确定两个病变为MSI-H。不同的免疫治疗结局，如在直肠病变中达到的完全临床反应（CCR），而在结肠病变中考虑了对免疫疗法的主要耐药性。此案例研究对主要免疫疗法抗性问题提供了更深入的分析
非小细胞肺癌靶向治疗检测 AHS - M2030
非小细胞肺癌 (NSCLC) 是一组异质性癌症，包括除小细胞肺癌 (SCLC) 之外的任何类型的上皮性肺癌，小细胞肺癌起源于肺的上皮细胞，包括鳞状细胞癌、大细胞癌和腺癌 (Thomas, et al., 2023)。最近，NSCLC 中的致癌作用与表皮生长因子受体 (EGFR) 的突变或间变性淋巴瘤激酶 (ALK) 基因或 ROS1 基因的重排有关 (Sequist & Neal, 2024)。有关在 NSCLC 中使用循环肿瘤细胞的指导，请参阅政策 AHS-G2054 液体活检。有关肿瘤突变负荷测试 (TMB) 和/或微卫星不稳定性 (MSI) 分析的指导，请参阅 AHS-M2178 微卫星不稳定性与肿瘤突变负荷测试政策。相关政策：AHS-G2054 液体活检 AHS-M2029 皮肤黑色素瘤分子检测 AHS-M2078 RET 原癌基因种系突变基因检测 AHS-M2160 肺部疾病分子检测 AHS-M2178 微卫星不稳定性与肿瘤突变负荷测试
大肠癌
摘要 - 背景：结直肠癌病例的一部分是由于DNA不匹配修复系统中的修改而发生的，这些修饰系统负责微卫星的不稳定性。这种改变导致结直肠癌的非常规表型模式。目的：描述结直肠癌患者的流行病学，组织病理学和分子特征，这些患者在参考医院接受了手术治疗。方法：这是一项具有定量方法的横断面回顾性研究，其中包括对接受结直肠癌肿瘤学手术的患者病历的审查。结果：总共确定了122例结直肠癌病例，其中8.2％的样本中检测到了微卫星的不稳定性。性别分布相似，男性为52.46％，加权平均年龄为63岁（标准偏差±11.65）。但是，在微卫星不稳定性组中，主要年龄低于60岁。关于组织学类型，腺癌未另有指定的占病例的80.33％，在两组中最普遍，而在不稳定性情况下，粘液类型更为频繁。PT3病理分期（46.72％）是最主要的。地形在左侧更为普遍（60.66％），但是与微卫星不稳定性的组相比，有显着差异，其中80％的肿瘤位于右侧（p = 0.006）。结论：在微卫星不稳定性样本中发现的年龄和肿瘤截图的差异突出了该疾病的独特表现模式。认识到这些特征对于制定预防策略是必不可少的，除了早期和准确的结直肠癌诊断。标题：微卫星不稳定性。结直肠肿瘤。DNA修复酶。
针对三种目标化合物的 Azacryptand 结构优化...
串联重复序列，或广义上的卫星序列，是基因组普遍性和功能相关性研究最多的重复序列。卫星序列这一术语于 1961 年诞生，因为在平衡沉降实验中，这些序列分布在主体 DNA 带的上方和下方。 [3] 卫星序列根据其大小可分为：i）微卫星序列或短串联重复序列 (STR)，既短（每个模式 2 到 6 bp 长的序列），又丰富（约覆盖我们基因组的 3%），代表性例子是端粒微卫星 d[TTAGGG] n ，重复序列 >10 kb；ii）微卫星序列/模式长约 15 bp，阵列长度高度可变（从 0.5 到 30 kb）； iii）卫星（约 200 bp 长的序列/模式）构成了着丝粒和着丝粒周围和亚端粒区域的大部分，其中 α 卫星最为丰富（约占卫星 DNA 的 50% 和所有 DNA 重复的 10%）；以及 iv）大卫星（> 1 kb 长的序列/模式）代表大的染色体区域。[4]
与5-羟色胺再摄取抑制剂相关的高血压
当前用于生产三倍体大西洋鲑鱼的当前方法通常是可靠但不可靠的，并且必须验证每批三倍体以确保消费者信任和许可符合性。微卫星最近被证明可以在商业环境中提供更便宜，更方便的替代方案，用于三倍验证。然而，将鸡蛋至少孵化至微卫星验证的眼期阶段会带来挑战，例如在剥离季节从后期鸡蛋产生的三倍体的质量和性能降低。为了解决这些问题，我们提出了另一种选择：从最近受精卵中提取DNA与微卫星验证结合使用。为了实现这一目标，我们开发了一种优化的热门提取方案，可以从大西洋鲑鱼鸡蛋中说出易于且便宜地提取DNA，然后可以将其用于通过微卫星的三倍验证。我们的方法提供了一种更简单，更具成本效益的方式来验证三倍体，而无需熟练的解剖或昂贵的套件。
有害等位基因频率、遗传搭便车和连锁不平衡的变化揭示了非洲水牛在大陆范围内的高遗传负荷
高遗传负荷会对种群生存力产生负面影响，并增加对疾病和其他环境压力源的易感性。之前对南非两个非洲水牛 (Syncerus caffer) 种群进行的微卫星研究表明，由于有害等位基因的高频率出现，全基因组遗传负荷很大。本研究评估了这些等位基因在大部分水牛分布范围内的出现情况，它们对雄性身体状况和牛结核病抗性产生负面影响。利用来自 34 个地方（从南纬 25 度到北纬 5 度）1,676 头动物的现有微卫星数据（2-17 个微卫星位点），我们发现了与上述雄性特征相关的整个大陆的微卫星等位基因频率梯度。频率在从南到北的纬度范围内下降（每个位点的平均 Pearson r = -0.22）。频率变化与多位点杂合性变化相一致（调整后的 R 2 = 0.84），与东非相比，南部非洲的杂合性下降幅度高达 16%。此外，在五个连锁位点对上检测到了大陆范围的连锁不平衡 (LD)，其特点是雄性有害性状相关等位基因之间存在较高的正位点间关联比例（0.66，95% CI：0.53，0.77）。我们的研究结果表明，早期观察到的性染色体减数分裂驱动系统驱动了大陆范围和基因组范围内的雄性有害等位基因选择，导致频率变化、搭便车效应导致的杂合性降低以及由于雄性有害等位基因在单倍型中同时出现而导致的广泛 LD。所涉及的选择压力必须很高，以防止等位基因频率谱系和单倍型因 LD 衰减而遭到破坏。由于大多数水牛种群是稳定的，这些结果表明，自然哺乳动物种群（取决于其遗传背景）可以承受较高的遗传负荷。