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癌症治疗中的个性化医学旨在根据癌症患者的遗传序列进行独特的治疗，与传统方法相比，它是一种更有效的方法，与传统方法相比，涉及以相同的一般方式治疗每种类型的癌症。但是，个性化治疗需要一旦促成癌症相关的基因进行分类，这是一项高度劳动密集型且耗时的任务，对于病理学家来说，使个性化医学在全球范围内采取了缓慢的进步。在本文中，我们提出了一种智能多级分类系统，该系统结合了自然语言处理（NLP）技术和机器学习算法，以使用基于文本的医学文献中的证据自动对临床上可行的遗传突变进行自动分类。从纪念斯隆·凯特林癌症中心获得了分类器的训练数据集，并将随机森林算法与TF-IDF一起使用，以进行特征提取和截短的SVD，以减少尺寸。结果表明，所提出的模型在准确性和精度得分方面优于先前的研究，精度得分约为82％。该系统有可能彻底改变癌症治疗并导致癌症治疗的显着改善。
减少大脑犬尿酸合成可阻止犬尿氨酸
图 1 急性犬尿氨酸刺激后，血浆和脑区犬尿酸 (KYNA) 水平升高，而在用犬尿氨酸氨基转移酶 II (KAT II) 抑制剂 PF-04859989 预处理后逆转。 （a）截短的犬尿氨酸途径 (KP) 示意图，展示了本研究中使用的关键代谢物和药理学工具。 成年大鼠在时间赋予时间 (ZT) 0 时外周注射犬尿氨酸 (100 mg kg 1 ) 以诱导从头 KYNA 形成。 在 ZT 23.5 前 30 分钟给予全身活性 KAT II 抑制剂 PF-04859989 (30 mg kg 1 )。 在 ZT 2 时收获组织。 评估了以下部位的 KYNA 水平：（b）血浆；（c）小脑；（d）脑干； (e) 下丘脑；(f) 基底前脑；(g) 海马；(h) 皮质；(i) 额叶皮质。所有数据均为平均值 ± SEM。双向方差分析：^ p < 0.05，^^ p < 0.01，^^^^ p < 0.0001；Bonferroni 事后检验：* p < 0.05，** p < 0.01，*** p < 0.001，**** p < 0.0001。每组 N = 9 – 12。
在有限温度下的真实频率图蒙特卡洛
图解扩展是处理相关电子系统的中心工具。在热平衡下，它们最自然地定义了Matsubara形式主义。但是，从Matsubara计算中提取任何动态响应函数最终需要从虚构到实频域到实频域的错误分析延续。最近提出了[物理学。修订版b 99，035120（2019）]，可以使用符号代数算法分析进行任何相互作用膨胀图的内部Matsubara总结。总结的结果是复杂频率而不是Matsubara频率的分析函数。在这里，我们应用了此原理并开发了一种示意的蒙特卡洛技术，该技术直接在实际频率轴上产生。我们介绍了在非平凡参数方面的掺杂32x32环状方晶格哈伯德模型的自我能量σ（ω）的结果，其中pseudogap的特征似乎靠近antinode。我们讨论了在实频轴上的扰动序列的行为，尤其表明，在使用截短的扰动系列上使用最大熵方法时，必须非常小心。在分析延续很困难的情况下，我们的方法对将来的应用具有巨大的希望，而中阶扰动理论可能会融合结果。
时间谐波最佳控制问题的确切而近似的Schur补体方法
在[1，7]中的时间依赖性通过截短的傅立叶膨胀来处理，这使我们能够为每个频率获得单独的线性系统。在那里，提出了有效的求解线性系统的预处理方法，其中预核心是具有区块 - diagonal的，并且是较低的三角形形式。在[2]中使用了完整的两二个块结构的预处理，进一步称为PRESB，在续集中定义。[3]中的研究提供了不同结构的预处理（遮挡型，块 - 三角形和PRESB形式）之间的比较。比较是根据相应预处理矩阵及其数值性能的光谱正确的。数值实验表明，相对于正则化参数的频率范围，问题大小和值，PERB形式的预处理更加健壮。可以在[10]中找到对这些预调节器和一些修改形式的信息。[9]研究中的工作又是块形式形式的另一个预处理，并分析了双重预处理，适合于离散状态的向量形式。在[8]中考虑了（2）的非线性形式，其中为线性化问题提出了完整的两乘两块形式的预处理，可以将其分解和解决，以块 - 二进制预处理的成本，并且相对于问题大小和测试频率的范围是可靠的。
使用由人类肠道病毒 71 截短肽产生的融合蛋白候选疫苗进行免疫可保护小鼠免受致命的肠道病毒 71 感染
背景：预防性疫苗对于预防主要由人肠道病毒 71 (EV71) 感染引起的手足口病 (HFMD) 至关重要。5 岁以下儿童特别容易感染 EV71。除了开发含有灭活病毒的疫苗外，含有重复抗原的病毒样颗粒 (VLP) 的疫苗也是预防 EV71 感染的有效策略，具有安全性和生产率优势。我们之前开发了一种由截短的 EV71 衣壳蛋白肽组成的融合蛋白，这些肽组装成球形颗粒。本研究旨在评估这种融合蛋白作为疫苗候选物在 EV71 感染小鼠模型中的免疫保护作用。方法：为了评估融合蛋白疫苗候选物的保护作用，免疫雌性小鼠所生的新生小鼠以及两次免疫的正常新生小鼠感染了 EV71 病毒。随后，测量了存活率、临床评分和病毒载量。结果：高剂量及加强免疫可诱导小鼠血清中产生较高滴度的特异性抗体，并转移到新生小鼠体内，从而有效抵抗EV71感染；免疫后新生小鼠也产生了主动免疫反应。
人类 RNA 聚合酶 I 结构揭示了 HMG-...
RNA 聚合酶 (Pol) I 对核糖体 RNA 前体的转录是细胞生长的主要决定因素，并且在许多癌症类型中都观察到了失调。在这里，我们展示了从携带最大亚基上的基因组 GFP 融合的细胞中纯化人类 Pol I，从而可以跨物种进行酶的结构和功能分析。与酵母相反，人类 Pol I 带有单亚基柄，体外转录表明校对活性降低。在接近天然状态下确定人类 Pol I 低温电子显微镜重建可合理化疾病相关突变的影响，并揭示内置于 Pol I 亚基 RPA1 序列中的额外结构域。这个“dock II”结构域类似于无法与 DNA 结合的截短的 HMG 盒，可作为后生动物的下游转录因子结合平台。生化分析、原位建模和 ChIP 数据表明，拓扑异构酶 2a 可通过域被募集到 Pol I，并与包含因子 UBF 的 HMG 盒域协同作用。这些后生动物 Pol I 转录系统的适应性可能允许有效释放在转录泡下游积累的正 DNA 超螺旋。
Tagraxofusp 治疗母细胞性浆细胞样树突状细胞肿瘤
母细胞性浆细胞样树突状细胞肿瘤 (BPDCN) 是一种罕见的血液系统恶性肿瘤，表现为特征性的深紫色皮肤丘疹、斑块和肿瘤，但也可能影响骨髓、血液、淋巴结和中枢神经系统。该疾病通常影响老年男性，但也可能出现在儿童中，与独特的免疫表型有关，包括普遍表达 CD123，即白细胞介素 3 受体的 α 链。最近，tagraxofusp 是一种 CD123 靶向药物，由 CD123 的配体白细胞介素 3 与截短的白喉毒素有效载荷结合而成，已获批用于治疗 BPDCN。这是首个专门针对 BPDCN 的药物，也是肿瘤学中首个针对 CD123 的药物。在这里，我们回顾了 tagraxofusp 的开发，以及导致其获批的关键临床前见解和临床数据。 Tagraxofusp 治疗与一种独特的毒性——毛细血管渗漏综合征 (CLS) 有关，这种症状可能很严重，但只要选择和监测患者、早期识别和进行有针对性的干预，这种症状是可以控制的。我们概述了使用 Tagraxofusp 的方法，并讨论了 BPDCN 治疗中的未决问题。总体而言，Tagraxofusp 是一种独特的靶向疗法，是满足这种罕见疾病患者未满足需求的一步。
tick和tick传播疾病
墨西哥湾海岸tick虫，Amblyomma Maculatum，居住在美国东南部与墨西哥，墨西哥湾和其他中美洲国家接壤的美国。最近，其美国范围已向亚利桑那州和东北部延伸至纽约州和康涅狄格州。这是立克帕克里（Rickettsia Parkeri）和赫帕托津（Hepatozoon Americanum）的矢量。该壁虱物种已成为研究tick/人力体相互作用的模型。为了提高我们对大曲霉的基本生物学的了解，我们在这里报告了该tick的基因组草案，并对其蛋白质组进行了广泛的功能分类。单个雄性tick的DNA用作基因组来源，10倍基因组学方案确定了28,460个脚手架，其脚手架具有相等或大于10 kb，总计1.98 GB。N50脚手架的大小为19,849 kb。Braker管道用于在组装的A. maculatum基因组上找到蛋白质编码基因边界，发现237,921 CD。在修剪和分类可转座元件，细菌污染物和截短的基因后，将一组25,702个注释并分类为核心基因产物。BUSCO分析显示83.4％的完整Buscos。提供了超链接的电子表格，可以浏览单个基因产品及其匹配到几个数据库。
使用 Cas9 和 AAV 研究全长 CFTR cDNA 替换引起的不利基因组和调控变化
一种替代全长 CFTR cDNA 的“通用策略”可治疗 99% 以上的囊性纤维化 (pwCF) 患者，无论他们的具体突变如何。基于 Cas9 的基因编辑被用于在气道基底干细胞的 CFTR 基因座处插入 CFTR cDNA 和截短的 CD19 (tCD19) 富集标签。该策略将 CFTR 功能恢复到非 CF 水平。在这里，我们通过评估 CFTR cDNA 插入后的基因组和调控变化来研究这种方法的安全性。首先通过使用 CAST-seq 量化基因重排来评估安全性。在验证编辑和富集的气道细胞中恢复的 CFTR 功能后，使用 ATAC-seq 表征 CFTR 基因座开放染色质谱。使用 scRNA-seq 评估编辑细胞中的再生潜力和差异基因表达。 CAST-seq 发现 0.01% 的等位基因发生易位，主要发生在非致癌脱靶位点，1% 的等位基因发生大量插入缺失。分化气道上皮细胞的开放染色质谱除 CFTR cDNA 和 tCD19 盒对应的区域外，没有出现明显变化，表明基因调控没有可检测到的变化。编辑后的干细胞产生的气道细胞类型与对照相同，基因表达的改变最小。总体而言，通用策略显示出轻微的不良基因组变化。
核糖体 DNA 不稳定性是核型进化的潜在原因
核型是指基因组构成一组染色体的结构。物种间的核型差异预计会阻碍各种生物过程，如染色体分离和减数分裂染色体配对，从而可能导致不相容性。核型可以在近缘物种之间甚至同一物种的不同种群之间迅速变化。然而，人们对驱动核型进化的力量了解甚少。在这里，我们描述了从塞舌尔群岛分离出来的果蝇品系的独特核型。该品系丢失了 X 染色体上的核糖体 DNA (rDNA) 位点。由于 Y 染色体是唯一其他携带 rDNA 的染色体，所以所有雌性都携带至少一条 Y 染色体作为 rDNA 的来源。有趣的是，我们发现该品系还携带一条截短的 Y 染色体 (YS )，尽管它无法支持男性生育能力，但它在种群中稳定维持。我们的建模和细胞学分析表明，Y 染色体对雌性适应度的负面影响大于 YS 染色体。此外，我们生成了一个独立的菌株，该菌株缺乏 X rDNA，其核型为 XXY 雌性和 XY 雄性。该菌株迅速进化出多种核型：两个新的截短 Y 染色体（类似于 YS ），以及两个独立的 X 染色体融合，其中包含 Y 衍生的 rDNA 片段，从而消除了雌性对 Y 染色体的依赖。考虑到罗伯逊融合经常发生在人类的 rDNA 基因座上，我们提出 rDNA 基因座不稳定性可能是核型进化的驱动力之一。