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World File Search System水解酶
不同植物中常见的免疫反应节点
二核苷酸糖基水解酶 (NADase) 可产生多种核苷酸衍生的信号分子 ( 5 , 6 )。这些衍生物被进一步加工成短寿命产物，根据其结构，这些产物可作为选择性配体，驱动由脂肪酶样蛋白 EDS1 (增强疾病易感性 1) 和 SAG101 (衰老相关基因 101) 或 PAD4 (植物抗毒素缺乏 4) ( 5 , 6 ) 组成的预先形成的蛋白质异二聚体发生特定重排。然后，两种类型的 EDS1 异二聚体会选择性地募集所谓的“辅助 NLR”，在 EDS1-PAD4 的情况下称为 ADR1（激活抗病性 1），在 EDS1-SAG101 的情况下称为 NRG1（氮必需基因 1）。然后 NRG1 和 ADR1 寡聚化并形成膜定位钙通道，从而激活下游免疫反应，特别是对于 NRG1 而言，导致受感染植物细胞死亡（7,8）。
对卫生政策/实践/研究/医学教育的影响：本研究报告了Yacon抗糖尿病活动的潜力（Smallan
简介：糖尿病（DM）是一种慢性疾病，具有自由基和碳水化合物 - 水解酶在其进展中起关键作用。Yacon或Smallanthus sonchifolius（poepp。）H.ROB是一种低糖作物，已显示出有希望的生物活性。这项研究旨在探索Yacon Tuber提取物（YTE）的抗糖尿病和抗氧化潜力。Methods: YTE's antioxidant and enzyme inhibitory activities were assessed using 2,2-diphenyl- 1-picrylhydrazyl (DPPH) at concentrations of 6.25, 12.5, 25, 50, 100, 200 µg/mL, hydrogen peroxide (H₂O₂) scavenging activity at 12.5, 25, 50, 100, 200, 400 µg/mL, 3-乙基苯甲噻唑啉-6-磺酸（ABT）和铁降低抗氧化能力（FRAP），在1.56、3.13、6.25、12.5、25、25、50 µg/ml。抑制α-淀粉酶，α-葡萄糖苷酶（6.25、12.5、25、50、100、100、200 µg/ml）和葡萄糖6-磷酸酶（G6Pase）（5.51，11.03，22.6，22.6，22.6，44.12，44.12，844.12，88.24，176.47 g/ml）。植物化学分析确定了关键的生物活性化合物，并确定了IC₅₀值以量化YTE的抗氧化剂和抗糖尿病电位。结果：YTE包含类黄酮，萜类，三萜和酚类化合物。与其他浓度相比，它在200、50、400和50 µg/ml的DPPH，ABTS，H₂O₂和FRAP测定中显示出最高的抗氧化活性（P <0.05）。在DPPH，H₂O₂和ABTS分析中，IC₅₀值分别为105.77μg/ml，726.64μg/ml和61.03μg/ml。以50 µg/ml的速度为338.68μm/μgfe（II）。yte还抑制了174.95μg/ml，222.17μg/ml和112.51μg/mL的IC₅₀值的α-淀粉酶，α-葡萄糖苷酶和G6Pase。结论：YTE表现出显着的抗氧化特性，并抑制了碳水化合物 - 水解酶，表明其作为抗糖尿病剂的潜力。
Neoadjuvant Nivolumab加化学疗法，然后在HPV阴性头颈癌中反应分离化的化学放疗治疗。
背景：肠道菌群是一个复杂的生态系统，在人类健康和疾病中起着至关重要的作用。但是，肠道菌群与烧伤引起的肠道损伤之间的关系尚不清楚。肠粘膜层对于维持肠道稳态和提供针对细菌侵袭的生理障碍至关重要。本研究旨在研究肠道菌群对烧伤后肠道粘液的合成和降解的影响，并探索烧伤损伤的潜在治疗靶标。方法：采用了修改的组织病理学分级系统来研究烧伤损伤对小鼠结肠组织和肠道粘液屏障的影响。随后，使用16S核糖体RNA测序分析燃烧后第1至10天的肠道菌群的变化。基于此，对在第1、5和10天收集的样品进行了宏基因组测序，以研究与粘液相关的微生物群的变化并探索潜在的潜在机制。结果：我们的发现表明粘液屏障被破坏，小鼠烧伤后第3天发生细菌易位。此外，从烧伤后的第1到第3天，小鼠中的肠道菌群显着破坏，但随着疾病的进展，逐渐恢复到正常。特别是，在燃烧后的第1天，与粘蛋白降解相关的共生和致病细菌的丰度显着增加，但第5天的丰度恢复了正常。相反，与粘蛋白合成相关的益生菌丰度在相反的方向上发生了变化。进一步的分析表明，在烧伤损伤后，能够降解粘液的细菌可能利用糖苷水解酶，叶叶菌和内膜分解粘液层，而合成粘液的细菌可能通过促进短链脂肪酸的产生来帮助恢复粘液层。结论：烧伤损伤导致肠结肠粘液屏障和肠道菌群的营养障碍。一些共生和致病性细菌可能通过糖苷水解酶，叶酸，内膜等参与粘蛋白降解。益生菌可以提供短链脂肪酸
bis（单乙酰甘油） - 磷酸盐假设
溶酶体分解并回收脂质和其他生物分子，以维持各种营养环境中的细胞稳态。溶酶体脂质分解代谢依赖于BIS（Monoacylglycero）磷酸盐（BMP）的刺激活性，这是一种神秘的脂质，其在众多溶酶体相关疾病中都会改变其左旋脂质。在这里，我们回顾了半个世纪前对BMP的发现及其结构特性，可促进脂质水解酶的激活和募集其共激活因子。我们进一步讨论了对BMP分解代谢和合成代谢的当前但不完整的理解。To conclude, we discuss its role in lysosome-associated diseases and the potential for modulating its levels by pharmacologically activating and inhibiting the BMP synthase to therapeu- tically target lysosomal storage disorders, drug-induced phospholipidosis, Alzheimer's disease, Parkinson's disease, frontotemporal dementia, cancer, and viral infection.
1博士学位论文评估报告
写道：“在肠道前，一项研究表明，唾液和中肠分泌物中的消化酶不仅提供糖和氨基酸作为居民微生物群的底物，而且还提供了消化生物量。”这意味着宿主（或前肢中的少数微生物，见下文）可能会产生内源性酶以降解聚合物。这是正确的吗？第1.6.1节还问为什么微生物如此糟糕地殖民了千足派的前肢？这是否表明动物编码这些提到的活动，或者表明前肢降解木质纤维素中相对较少的微生物？论文1中提出的遗传能力也是间接证据。因此，千足虫无法消化的木质纤维素的证据尚无定论。19。溶菌酶活动呢？为了访问微生物/真菌生物量，宿主除了上述糖苷水解酶外，可能还需要上调这些酶。
高活性转座酶的发现和语言模型指导设计
传统上，合成生物学仅限于在自然界中进行生物勘探，然后进行重构和优化。随着生成式 AI 方法应用于蛋白质设计的发展，可以增强采样的自然多样性，以生成自然界中未见过的功能序列 8–10。例如，RFdiffusion 11 与设计催化位点的新方法相结合，创造了具有新折叠的活性合成丝氨酸水解酶 12。有趣的是，最近使用蛋白质大语言模型来生成 CRISPR-cas9，这是一种与 DNA 和 RNA 结合的非常复杂的多结构域蛋白质，它在自然界中并不存在，但在基因编辑应用中效果很好 8。此类模型的发展为扩展自然目录之外的生物多样性以及利用生成式 AI 为生物技术创建具有更高活性的基因编写器开辟了非常令人兴奋的机会。
TIR 结构域酶活性是植物免疫的核心
摘要 Toll/白细胞介素-1/抗性 (TIR) 结构域蛋白有助于所有细胞界的先天免疫。TIR 模块由自关联激活，在植物、哺乳动物和细菌中，一些 TIR 具有对抗病和/或细胞死亡至关重要的酶功能。许多植物 TIR 独有蛋白和病原体效应物激活的 TIR 结构域 NLR 受体都是 NAD + 水解酶。生化、结构和功能研究表明，对于植物 TIR 蛋白类型和某些细菌 TIR，NADase 活性都会产生促进抗性的生物活性信号中间体。发现了一组植物 TIR 催化核苷酸异构体，它们与 EDS1 复合物结合并激活，促进它们与共同发挥作用的辅助 NLR 相互作用。跨界 TIR 酶分析填补了了解病原体干扰如何诱导 TIR 调节的免疫反应的重要空白。
atxn3：一种参与多谷氨酸疾病脊髓脑性共济失调3
atxn3是一种泛素水解酶（或去泛素酶，DUB），ATXN3基因的产物，在包括周围和神经元组织在内的各种细胞类型中表达，并参与多种细胞途径。重要的是，ATXN3基因内CAG三核苷酸的扩展导致编码蛋白中的聚谷氨酰胺结构域扩展，该蛋白质已与脊椎小脑共济失调的3型发作相关，这也是Joseph病 - 也称为Machado - Joseph Disease，是最常见的Joseph疾病，是最常见的占主导地位的共生性共济失因Worldwordiide Worldword Worldweldiide。ATXN3几十年来一直在进行密集调查中。在这篇综述中，我们总结了ATXN3在蛋白质，DNA修复和转录调节中的主要功能，以及在调节染色质结构中的新兴作用。在病理扩展的ATXN3形式的背景下，还审查了提到的ATXN3的分子函数。
直接和间接突变分析I：PCR
•细胞裂解和核酸酶灭活后，可以通过过滤或离心轻松从裂解物中除去细胞碎片。•接下来是去除蛋白质和RNA。•通常，通过用蛋白水解酶（例如蛋白酶K）消化大多数蛋白质，该蛋白酶K具有活性，而蛋白酶K具有广泛的天然蛋白质。•大部分RNA被切开时释放的RNass切割。•DNA提取物中RNA的存在不是主要问题，因为这不会干扰PCR或限制消化。•在某些情况下，重要的是要分离不含RNA的DNA，以便能够使用分光光度计准确地量化DNA产量。•浓缩DNA最广泛使用的方法是用乙醇沉淀。•用酒精（通常是乙醇或异丙醇）沉淀DNA。由于DNA不溶于这些酒精，因此会聚集在一起，在离心时给出颗粒。此步骤还去除了酒精可溶性盐
有效地从cubriadus nantongensis x1t中的有机磷杀虫剂降解基因opdb通过红色系统
摘要：Cupriavidus Nantongensis X1 T是Cupriavidus属的一种菌株，可以降解八种有机磷杀虫剂（OPS）。Cupriavidus物种中的常规遗传操作是耗时，难以控制的。簇状的定期间隔短的短滴虫重复（CRISPR）/相关蛋白9（CAS9）系统已成为用于原核生物和真核生物的基因组编辑的强大工具，这是由于其简单，效率和准确性。在这里，我们将CRISPR/ CAS9与红色系统相结合，以在X1 T菌株中执行无缝的遗传操纵。构建了两个质粒，PACASN和PDCRH。 PACASN质粒含有CAS9核酸酶和红色重组酶，PDCRH质粒包含X1 T菌株中有机磷的水解酶（OPDB）的双单引导RNA（SGRNA）。 对于基因编辑，将两个质粒转移到X1 T菌株中，并在其中发生了遗传重组的突变菌株，从而导致OPDB的靶向缺失。 同源重组的发生率超过30％。 生物降解实验表明，OPDB基因负责有机磷杀虫剂的分解代谢。 这项研究是第一个使用CRISPR/ CAS9系统来靶向Cupriavidus属的基因靶向的，它进一步了解了我们对X1 T菌株中有机磷杀虫剂降解过程的理解。构建了两个质粒，PACASN和PDCRH。PACASN质粒含有CAS9核酸酶和红色重组酶，PDCRH质粒包含X1 T菌株中有机磷的水解酶（OPDB）的双单引导RNA（SGRNA）。对于基因编辑，将两个质粒转移到X1 T菌株中，并在其中发生了遗传重组的突变菌株，从而导致OPDB的靶向缺失。同源重组的发生率超过30％。生物降解实验表明，OPDB基因负责有机磷杀虫剂的分解代谢。这项研究是第一个使用CRISPR/ CAS9系统来靶向Cupriavidus属的基因靶向的，它进一步了解了我们对X1 T菌株中有机磷杀虫剂降解过程的理解。