慢性粒细胞白血病 (CML) 是一种罕见的癌症,由 9 号和 22 号染色体之间的相互易位引起。这种易位导致骨髓造血干细胞中形成一种新的异常染色体,称为费城染色体 (1)。在大多数情况下,CML 被诊断为慢性期,最终会发展到晚期,后者包括加速期 (AP) 和急变期 (BP)。目前,慢性粒细胞白血病 (CP-CML) 患者的标准治疗方法是酪氨酸激酶抑制剂 (TKI) (2)。对 TKI 无反应的患者将改用另一种 TKI。
神经营养受体参与了脑发育和神经塑性的调节,因此可以作为抗癌和中风恢复药物,抗抑郁药等的靶标。需要阐明各种状态下TRK蛋白结构域在各种状态下的结构,以允许合理的药物设计。然而,关于trk受体的跨膜和叶膜结构域的构象知之甚少。在本研究中,我们采用NMR光谱来解决脂质环境中TRKB二聚体跨膜结构域的结构。我们使用诱变并确认该结构对应于受体的活性状态。随后研究TRKB与抗抑郁药氟西汀的相互作用和抗精神病药物氯丙嗪提供了一种明确的自谐模型,描述了氟西汀通过与其跨膜结构结合而激活受体的机制。
细胞浆 DNA 在被环鸟苷酸环化酶 (cGAMP) 检测到后会促进炎症反应。有研究表明,cGAS 下调是肿瘤细胞利用的一种免疫逃逸策略。在这里,我们使用了 cGAS 水平无法检测到的胶质母细胞瘤细胞来解决其他 DNA 检测途径是否可以促进促炎信号传导。我们表明 DNA-PK DNA 修复复合物 (i) 驱动不依赖于 cGAS 的 IRF 3 介导的 I 型干扰素反应,以及 (ii) 它的催化活性是 cGAS 依赖的 cGAMP 产生和最佳下游信号传导所必需的。我们进一步表明,DNA-PK 和 cGAS 之间的协同作用有利于趋化因子的表达,这些趋化因子可在胶质母细胞瘤模型中促进肿瘤微环境中的巨噬细胞募集,这一过程会损害早期肿瘤发生,但与胶质母细胞瘤患者的不良预后有关。因此,我们的研究支持 cGAS 依赖性信号是在肿瘤发生过程中获得的,并且应协同分析 cGAS 和 DNA-PK 活性以预测旨在增强肿瘤免疫原性的策略的影响。
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Machine learning prediction of enzyme optimum pH Japheth E. Gado, 1,2,3,4 Matthew Knotts, 4 Ada Y. Shaw, 4 Debora Marks, 4,5 Nicholas P. Gauthier, 4,6 Chris Sander, 4,5 Gregg T. Beckham 1,2,3* 1 Renewable Resources and Enabling Sciences Center, National Renewable Energy Laboratory, Golden, CO,美国2瓶财团,美国加利福尼亚州埃默里维尔的敏捷生物基础,美国4个系统生物学系,美国马萨诸塞州波士顿,哈佛医学院。5哈佛大学和麻省理工学院,美国马萨诸塞州剑桥市6数据科学系,达纳 - 法伯癌症研究所,美国马萨诸塞州波士顿 *通信:gregg.beckham@nrel.gov摘要pH和酶催化活性之间的关系,尤其是最佳pH(phopt),eNzyme ph(phopt)的关系至关重要。因此,预测PHOPT的计算方法将通过促进准确鉴定在特定pH水平上最佳起作用的酶,并阐明序列 - 功能功能关系,从而增强酶的发现和设计。在这项研究中,我们提出并评估了预测PHOPT,进行广泛的超参数优化以及培训11,000多个模型实例的各种机器学习方法。我们的结果表明,利用语言模型嵌入的模型在预测PHOPT时明显超过其他方法。我们提出了预测PHOPT的表现最好的模型Ephod,这使研究人员公开使用。从序列数据中,以ephod直接学习与PHOPT相关的结构和生物物理特征,包括残基与催化中心的接近度以及溶剂分子的可及性。总体而言,Ephod提出了PHOPT预测的有希望的进步,并有可能加快酶技术的发展。引言酶活性受反应环境的pH值的显着影响,通常由于催化失活和结构不稳定而超出特定pH范围的活性下降。1,2虽然大多数特征性的酶具有最佳的活性pH值(PHOPT)接近7.0的中性值,但某些酶在极度酸性或碱性条件下最佳起作用,酸性或碱性PHOPT值分别低至1.0或高达1.0或高至12.5。3–5在工业生物化学过程中,酶经常被使用或希望使用,远离其PHOPT,从而大大减少了活性。结果,人们对发现和工程酶具有增强的pH耐受性,以克服这些限制。
摘要。背景/目标:甲状腺塑性甲状腺癌(ATC)的预后很差,目前尚无既定治疗方法来改善其结果。我们先前报道说,Zeste同源2(EZH2)的增强子在ATC中高度表达,并且可能是治疗靶标。但是,EZH2对ATC增长的影响目前尚不清楚。材料和方法:我们研究了EZH2抑制剂(DZNEP)对四种ATC细胞系(8305C,KTA1,TTA1和TTA2)的影响。我们对所有ATC细胞系进行了基因面板分析,以识别细胞系之间DZNEP敏感性的差异。为了研究DZNEP对分化恢复的影响,我们评估了使用PCR进行DZNEP处理之前和之后甲状腺分化标记(TDM)的变化。结果:EZH2在所有ATC细胞系中均表示。在所有ATC细胞系中都检测到DZNEP的细胞还原作用,并且在KTA1细胞中最强,然后是TTA2细胞。TTA1和8305C细胞系显示了弱细胞减少作用,具有TP53突变。在任何ATC细胞系中均未观察到TDM的变化。结论:EZH2抑制剂DZNEP对ATC细胞的生长产生了抑制作用
结合酪氨酸激酶抑制剂Cabozantinib和MTORC1/2抑制剂Sapanisertib阻断ERK途径的活性并抑制肾细胞癌中的肿瘤生长1,2,Siqi Chen 1,2,Siqi Chen 1,2,Siiaolu Yang Yang sato 1,Kazuhito 1,2 , Michael C. Wendl 1,2,4,5 , Tina M. Primeau 1 , Yanyan Zhao 1 , Alanna Gould 1 , Hua Sun 1,2 , Jacqueline L. Mudd 1 , Jeremy Hoog 1 , R. Jay Mashl 1,2 , Matthew A. Wyczalkowski 1,2 , Chia-Kuei Mo 1,2 , Ruiyang Liu 1,2 , John M. Herndon 6,7 , Sherri R. Davies 1,Di Liu 1,Xi ding 1,Yvonne A. Evrard 8,Bryan E. Welm 9,David Lum 9,Mei Yee Koh 9,Alana L. Welm 9,Jeffrey H. Chuang 10,Jeffrey H. Chuang 10,Jeffrey A.Moscow 11 1,Ryan C. Fields 4,Kian-Huat Lim 1,4,Cynthia X. Ma 1,4,Hui Zhang 3,Li ding 1,2,4,6和Feng Chen 1,4
摘要 背景:表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂 (EGFR-TKIs) 药物是晚期非小细胞肺癌 (NSCLC) 患者常用的靶向治疗方法。目的:本研究旨在概述 Dharmais 癌症医院接受 EGFR-TKIs 靶向治疗的 NSCLC 患者的皮肤病副作用和生活质量指数。方法:本研究采用横断面设计。纳入标准为 2023 年 9 月至 10 月接受 EGFR-TKIs 靶向治疗(即吉非替尼、厄洛替尼和阿法替尼)的患者,他们愿意成为研究对象,并且没有医疗紧急情况的患者。总共有 52 名患者通过访谈和医疗记录填写了皮肤病生活质量指数 (DLQI) 问卷。数据评估以百分比的形式描述性地进行。结果:最常见的皮肤副作用是皮肤过敏反应,轻度(1 级)占 59.6%,中度(2 级)占 19.2%,重度(3 级)占 1.9%,无药物皮肤副作用占 19.2%。相比之下,大多数 DLQI 属于不影响患者生活的类别。一般来说,副作用有中度(2 级)和重度(3 级)。当已经使用外用皮质类固醇药物或与口服抗生素和抗组胺药联合使用时,严重程度会降低到轻度(1 级)。结论:最严重的副作用是 1 级,对患者的生活质量影响不大。有必要对副作用进行教育和监测以及对症状进行管理,以降低严重程度并改善患者的生活质量。关键词:皮肤副作用;DLQI;EGFR-TKI;非小细胞肺癌 (NSCLC) 简介
a 暨南大学第一附属医院普通外科,广州,中国 b 暨南大学医学院生物活性分子与药物活性评价国家重点实验室、肿瘤分子生物学教育部重点实验室、精准肿瘤医学与病理研究所,广州,中国;暨南大学珠海研究所,中国珠海 c 暨南大学附属第一医院胸外科,中国广州 d 荷兰格罗宁根大学医学中心格罗宁根大学血液科 e 汕头大学医学院,中国汕头 f 暨南大学附属第一医院泌尿外科,中国广州 g 上海市浦东新区公利医院病理科,中国上海 h 长治医学院和平医院病理科,中国长治 i 费城骨科医学院生物医学系,美国宾夕法尼亚州费城 j 汕头大学医学院第二附属医院甲状腺、乳腺和疝外科,中国汕头 k 德克萨斯大学 MD 安德森癌症中心急诊医学科,美国德克萨斯州休斯顿 l 德克萨斯大学 MD 安德森癌症中心内分泌肿瘤和激素紊乱科,美国德克萨斯州休斯顿 m 公利医院病理科上海市浦东新区生物活性分子与药物活性评价国家重点实验室、肿瘤分子生物学教育部重点实验室、暨南大学医学院精准肿瘤医学与病理研究所,广州,暨南大学附属第一医院普通外科,广州,汕头大学医学院第二附属医院甲状腺、乳腺和疝外科,汕头,
调查奥古斯塔免疫效率,自身弹药和自身免疫性疾病(RITA)中心],巴塞罗那大学,巴塞罗那,西班牙,西班牙7 Neuroscience Research Group(Neuros),Neurovitae Center,Escuela de Medicine y Medicincina y Ciencias y Ciencias y Ciencias y Ciencias y Ciencias y Ciencias y Ciencias y Ciencias y Ciencias y Ciencias y Ciencias y Ciencias y Ciencias y Ciencias y Ciencias y Ciencias y Ciencias西班牙巴斯克大学。西班牙,10意大利锡耶纳大学