XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System等位基因
等位基因多样性的探索揭示了一种新的 FAD2（油酸...
摘要：印度芥菜（Brassica juncea）是印度食用油供应的重要来源。传统的印度芥菜品种在种子中含有高比例的 18C 多不饱和脂肪酸（亚油酸和亚麻酸）和大量的长链单不饱和脂肪酸，主要是芥酸。油酸去饱和酶 (FAD2) 调节细胞膜中 18C PUFA 和种子油中 TAG 的组成。本研究旨在深入了解印度芥菜中 FAD2 基因的等位基因多样性。对三个印度芥菜品种的克隆 FAD2 基因的分析发现了一个新的 FAD2 基因，由于插入和长度上的几个 SNP，该基因具有更长的 ORF（1167 bp），这与更普遍的天然 FAD2 基因有所区别。总体而言，印度芥菜品种拥有三种 FAD2 等位基因，但不同品种中每种 FAD2 类型的成员之间的核苷酸多样性有限，这表明所检查品种之间的遗传多样性较窄。
等位基因特异性 CRISPR/Cas9 编辑使与胶原蛋白 1 相关的单核苷酸变体失活
105 并且也可根据 CC0 许可使用。（未经同行评审认证）是作者/资助者。本文是美国政府作品。根据 17 USC，它不受版权保护
入围的预先提交完整项目建议的预先列表*战略领域“植物中的生物技术，基因组学，代谢组学和等位基因采矿
主题：授予C.Kannan。，Pr。 科学家，ICAR - 印度水稻研究所，海得拉巴，用于在Bacteriolog5r Arturolo falaschi Falaschi国际基因工程与生物技术中心（ICGEB）（ICGEB）的Bacteriolog5r，意大利，意大利，来自0110412024至3010612024到3010612024（排除旅程）的意大利。 先生，我被指示将主管部门的批准转达给C. 博士的外国访问。 Kannan。，Pr。 科学家，ICAR - 印度水稻研究所，用于在细菌学奖学金课程中，在细菌学Arturo Falaschi Falaschi Intemational cenetic Engineering and Biotechnology（ICGEB），Trieste，意大利，从0110412024到30/0612024（Upluding Joumey Time）。 缺乏科学家的时期将通过授予应有的休假和可接受的假期。 2。 访问的资金将是Arnro Falaschi Intemational基因工程与生物技术中心（ICGEB）的Bome。 这具有ofas＆fa vide dy。 编号 56/f/fa的日期为15.03.24，遵守（i）所有相关规则和代码手续； （ii）对DARE/ICAR/LNSTITUTE（III）的DARE/ICAR/LNSTITUTE的相关指南无需财务责任。 3。 完成前出发手续后，申请人可能会得到解释。 他可能被指示在FVMS PO上上传代表报告（包括ICAR和Institute的可行项目）（AL，并将同一副本提交给ICAR的SMD副本，新德里，新德里和ADG（IR），ICAR，ICAR，新德里，新德里，该计划结束了。Kannan。，Pr。科学家，ICAR - 印度水稻研究所，海得拉巴，用于在Bacteriolog5r Arturolo falaschi Falaschi国际基因工程与生物技术中心（ICGEB）（ICGEB）的Bacteriolog5r，意大利，意大利，来自0110412024至3010612024到3010612024（排除旅程）的意大利。 先生，我被指示将主管部门的批准转达给C. 博士的外国访问。 Kannan。，Pr。 科学家，ICAR - 印度水稻研究所，用于在细菌学奖学金课程中，在细菌学Arturo Falaschi Falaschi Intemational cenetic Engineering and Biotechnology（ICGEB），Trieste，意大利，从0110412024到30/0612024（Upluding Joumey Time）。 缺乏科学家的时期将通过授予应有的休假和可接受的假期。 2。 访问的资金将是Arnro Falaschi Intemational基因工程与生物技术中心（ICGEB）的Bome。 这具有ofas＆fa vide dy。 编号 56/f/fa的日期为15.03.24，遵守（i）所有相关规则和代码手续； （ii）对DARE/ICAR/LNSTITUTE（III）的DARE/ICAR/LNSTITUTE的相关指南无需财务责任。 3。 完成前出发手续后，申请人可能会得到解释。 他可能被指示在FVMS PO上上传代表报告（包括ICAR和Institute的可行项目）（AL，并将同一副本提交给ICAR的SMD副本，新德里，新德里和ADG（IR），ICAR，ICAR，新德里，新德里，该计划结束了。科学家，ICAR - 印度水稻研究所，海得拉巴，用于在Bacteriolog5r Arturolo falaschi Falaschi国际基因工程与生物技术中心（ICGEB）（ICGEB）的Bacteriolog5r，意大利，意大利，来自0110412024至3010612024到3010612024（排除旅程）的意大利。先生，我被指示将主管部门的批准转达给C.Kannan。，Pr。 科学家，ICAR - 印度水稻研究所，用于在细菌学奖学金课程中，在细菌学Arturo Falaschi Falaschi Intemational cenetic Engineering and Biotechnology（ICGEB），Trieste，意大利，从0110412024到30/0612024（Upluding Joumey Time）。 缺乏科学家的时期将通过授予应有的休假和可接受的假期。 2。 访问的资金将是Arnro Falaschi Intemational基因工程与生物技术中心（ICGEB）的Bome。 这具有ofas＆fa vide dy。 编号 56/f/fa的日期为15.03.24，遵守（i）所有相关规则和代码手续； （ii）对DARE/ICAR/LNSTITUTE（III）的DARE/ICAR/LNSTITUTE的相关指南无需财务责任。 3。 完成前出发手续后，申请人可能会得到解释。 他可能被指示在FVMS PO上上传代表报告（包括ICAR和Institute的可行项目）（AL，并将同一副本提交给ICAR的SMD副本，新德里，新德里和ADG（IR），ICAR，ICAR，新德里，新德里，该计划结束了。Kannan。，Pr。科学家，ICAR - 印度水稻研究所，用于在细菌学奖学金课程中，在细菌学Arturo Falaschi Falaschi Intemational cenetic Engineering and Biotechnology（ICGEB），Trieste，意大利，从0110412024到30/0612024（Upluding Joumey Time）。缺乏科学家的时期将通过授予应有的休假和可接受的假期。2。访问的资金将是Arnro Falaschi Intemational基因工程与生物技术中心（ICGEB）的Bome。这具有ofas＆fa vide dy。编号56/f/fa的日期为15.03.24，遵守（i）所有相关规则和代码手续； （ii）对DARE/ICAR/LNSTITUTE（III）的DARE/ICAR/LNSTITUTE的相关指南无需财务责任。3。完成前出发手续后，申请人可能会得到解释。他可能被指示在FVMS PO上上传代表报告（包括ICAR和Institute的可行项目）（AL，并将同一副本提交给ICAR的SMD副本，新德里，新德里和ADG（IR），ICAR，ICAR，新德里，新德里，该计划结束了。
杂交杨组织培养中芽器官发生过程中等位基因特异性DNA甲基化和基因表达
植物组织再生对于遗传转化和基因组编辑技术至关重要。在再生过程中，表观遗传修饰的变化伴随着细胞命运的转变。然而，两种单倍型中的等位基因特异性 DNA 甲基化如何影响再生过程中的转录动力学仍不清楚。在这里，我们应用跨物种杂交杨（Populus alba × P. glutumoosa cv. 84 K）作为一个系统，在等位基因水平上表征从头芽器官发生过程中的 DNA 甲基化景观。直接和间接芽器官发生均显示全基因组 DNA 甲基化的降低。在基因水平上，与表达基因相比，未表达基因的甲基化程度较高。在 DNA 甲基化水平与基因表达之间表现出显著相关性的基因中，75% 的基因的表达模式与 CG 环境中的 DNA 甲基化呈负相关，而 CHH 环境中的相关性模式则相反。等位基因偏向的DNA甲基化在芽器官发生过程中是一致的，等位基因特异性甲基化区域偏移的概率不到千分之一。等位基因特异性表达分析表明，在再生过程中只有1909个基因表现出相位依赖性的等位基因偏向表达，其中启动子区域转录因子结合位点差异较大的等位基因对表现出较大的等位基因表达差异。我们的研究结果表明，在芽器官发生过程中，两个亚基因组中的转录调控相对独立，这是由顺式作用基因组和表观基因组变异所致。
acanthamoeba序列类型和意大利临床和不同环境源分离株中的等位基因变化
摘要：Acanthamoeba属包括分布在各种环境中的自由生活的变形虫。这些变形虫具有临床意义，导致人类和其他动物的机会性感染。尽管如此，意大利的Acanthamoeba序列类型和等位基因的数据有限。在本研究中，我们分析了从意大利沉积的所有acanthamoeba序列，这些序列来自有症状的AK病例的新的Acanthamoeba临床样品，以概述来自意大利环境中不同来源的遗传变异的空间模式。总共获得了137个acanthamoeba序列。鉴定了六种序列类型：T2/6，T3，T4，T11，T13和T15。在两个来源中都只有T4和T15。发现Acanthamoeba T4序列类型在所有区域中都是最普遍的，占所分析的意大利样品的73％（100/137）。T4序列类型显示出显着的等位基因多样性，有30个不同的等位基因与临床和/或环境样本。这些结果使人们可以更好地了解整个意大利的阿斯塔木菌分离株的分布，从而重申了其众所周知的普遍存在。acanthamoeba分离株分离株的角膜炎，以及环境菌株监测，可能会提供有关不同基因型扩散的重要信息。这对于定义不同流行病学量表的人体角膜炎的传播途径可能很有用。
Atara Biothapeutics和Pierre Fabre实验室宣布在Stease 3等位基因Tab-cel®数据中发表在柳叶刀肿瘤学中的数据
，加利福尼亚州和法国康斯特雷斯 - 2024年1月31日，Atara Biotherapeutics，Inc。（NASDAQ：ATRA），T-Cell免疫疗法的领导者，利用其新型的同种异体Epstein-Barr病毒（EBV）T-Cell的新型T-Cell Platform开发用于癌症和全球疾病的患者的癌症和piare ease anse ande sre ease ande sre ease ance ande ande sre，以及 and responsible for worldwide commercialization of tabelecleucel (tab-cel ® or EBVALLO ® ), today announced that data from the pivotal Phase 3 ALLELE study of tab-cel, approved in the European Union in adults and children two years of age and older with relapsed or refractory (r/r) Epstein-Barr virus positive post-transplant lymphoproliferative disease (EBV+ PTLD) following solid organ移植（SOT）或造血细胞移植（HCT）首次在网上发表在柳叶刀肿瘤学上。，加利福尼亚州和法国康斯特雷斯 - 2024年1月31日，Atara Biotherapeutics，Inc。（NASDAQ：ATRA），T-Cell免疫疗法的领导者，利用其新型的同种异体Epstein-Barr病毒（EBV）T-Cell的新型T-Cell Platform开发用于癌症和全球疾病的患者的癌症和piare ease anse ande sre ease ande sre ease ance ande ande sre，以及 and responsible for worldwide commercialization of tabelecleucel (tab-cel ® or EBVALLO ® ), today announced that data from the pivotal Phase 3 ALLELE study of tab-cel, approved in the European Union in adults and children two years of age and older with relapsed or refractory (r/r) Epstein-Barr virus positive post-transplant lymphoproliferative disease (EBV+ PTLD) following solid organ移植（SOT）或造血细胞移植（HCT）首次在网上发表在柳叶刀肿瘤学上。
工程性动物模型的多余jak2 v617f突变体等位基因负担
多性疾病Vera（PV）是一种慢性骨髓增生性新血浆（MPN），其特征是红细胞过量。超过95％的PV患者疾病是由JAK2 V617F突变驱动的。虽然JAK2 V617F突变小鼠模型为PV生物学提供了机械见解，但这些模型中的大多数呈现出比在PV患者中发现的JAK2 V617F的变体等位基因频率（VAF）高得多的突变细胞负担。因此，当前的PV小鼠模型对PV DE Velopment的最早阶段的了解有限，包括疾病表现所需的最小突变细胞负担是什么。为了避免这些局限性，我们开发了一种使用CRISPR/CAS9同源指导修复（HDR）的PV的工程模型，以使JAK2 V6717F突变突变到人类CD34 +细胞的内源性基因座。Xenograftage靶向细胞进入NSGS小鼠，在体内概括了人类PV病理。我们使用此工具来解决两个问题：（i）生成PV病理所需的最小突变体VAF是什么，并且（ii）起源细胞的发育环境会影响MPN的疾病轨迹。该模型提供了一种有价值的临床前工具，可以在体内测试新的PV疗法，并在主要患者样品受到限制或不可用时研究PV的开发和进展。脊髓增生性肿瘤（MPN）是由造血干细胞和祖细胞（HSPC）中获得的体细胞突变驱动的，其特征是一个或多个髓样谱系的异常增殖。JAK2 V617F突变是MPN的反复驱动器。1,2 MPN可以作为多性心血症垂直（PV；过量的红细胞），必需的血小板细胞（ET；多余的血小板）或骨髓纤维化（MF；骨髓纤维化）。3-5然而，JAK2 V617F突变细胞的负担在患者中差异很大，并且可以诱导VAF非常低的临床表型。6,7在PV中，超过95％的患者将JAK2 V617F作为驱动致病性突变，但在某些患者中，突变负担可能低于3％VAF。 8尚不清楚这种低突变细胞负担如何产生MPN病理。 当前的JAK2 V617F小鼠建模策略利用复古病毒转导，9,10个转基因等位基因，11或遗传敲入（KI）模型。 12,13然而，这些模型中的大多数产生了高JAK2 V617F突变频率，这些突变频率不能准确反映PV患者的克隆轨迹。 为了超越小鼠模型的局限性，我们最近开发了从MPN患者移植CD34 +细胞的方法，以产生患者衍生的异种移植物（PDX）。 在MF的情况下，对患者衍生的CD34 +细胞的异型范围能够传播基因型，表型和关键患者病理，例如PDX中的网状纤维化。 14然而，尝试从PV患者产生PDX的尝试不太成功，植入率很差和可获得的CD34 +细胞数量有限6,7在PV中，超过95％的患者将JAK2 V617F作为驱动致病性突变，但在某些患者中，突变负担可能低于3％VAF。8尚不清楚这种低突变细胞负担如何产生MPN病理。当前的JAK2 V617F小鼠建模策略利用复古病毒转导，9,10个转基因等位基因，11或遗传敲入（KI）模型。12,13然而，这些模型中的大多数产生了高JAK2 V617F突变频率，这些突变频率不能准确反映PV患者的克隆轨迹。为了超越小鼠模型的局限性，我们最近开发了从MPN患者移植CD34 +细胞的方法，以产生患者衍生的异种移植物（PDX）。在MF的情况下，对患者衍生的CD34 +细胞的异型范围能够传播基因型，表型和关键患者病理，例如PDX中的网状纤维化。14然而，尝试从PV患者产生PDX的尝试不太成功，植入率很差和可获得的CD34 +细胞数量有限
使用等位基因特异性PCR
这项研究范围内的改进是可能的，包括将测定法应用于早期繁殖线，最初通过病原体测试验证标记呼叫和更快的提取技术。KASP标记如果我们可以在人口达到近亲状态之前为其选择它们，将特别有用。f2至F4选择是理想的选择，因为杂合子和那些纯合子与易感性连接标记等位基因的纯合子可以立即被丢弃。在随后的几代人中较少的植物/线条将节省繁殖计划中的时间和空间。病原体测试
针对视力丧失的等位基因特异性基因编辑方法......
摘要 突变型 RHO 是常染色体显性视网膜色素变性 (adRP) 最常见的遗传原因。在此，我们开发了一种等位基因特异性基因编辑治疗药物，以选择性地靶向人类 T17M RHO 突变型等位基因，同时首次保持野生型 RHO 等位基因完好无损。我们鉴定出一种金黄色葡萄球菌 Cas9 (SaCas9) 引导 RNA，它对人类 T17M RHO 等位基因具有高活性和特异性。使用 HEK293T 细胞和患者特异性诱导多能干细胞 (iPSC) 进行的体外实验显示出活性核酸酶活性和高特异性。将单个腺相关病毒血清型 2/8 包装的 SaCas9 和单个引导 RNA (sgRNA) 视网膜下递送到 RHO 人源化小鼠的视网膜下，表明这种治疗药物选择性地靶向突变型等位基因，从而下调突变型 RHO mRNA 表达。施用这种治疗药物可使杂合突变人源化小鼠的视网膜功能长期（治疗后长达 11 个月）改善，并保存光感受器。我们的研究表明，体内治疗效果具有剂量依赖性。在全基因组测序水平上未观察到不良的脱靶效应。我们的研究为进一步开发这种有效的治疗药物来治疗 RHO - T17M 相关 adRP 提供了强有力的支持，也为开发基因编辑医学提供了一个可推广的框架。此外，我们成功恢复了患有 RHO 人源化小鼠的视力，验证了基于等位基因特异性 CRISPR/Cas9 的药物对其他常染色体显性遗传视网膜营养不良的可行性。