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lon蛋白酶在细菌适应中
抽象蛋白水解是维持所有活细胞中蛋白质稳态的重要组成部分。lon是细菌中高度保守的AAA+蛋白酶，可对细胞的需求进行蛋白质质量控制以及调节作用。尽管有越来越多的证据证明了其在细菌生存和适应中的重要性，但我们对其中几种途径如何受到LON的调节以及LON介导的蛋白水解本身如何控制的几个途径存在重大差距。这些问题即使在诸如铜绿假单胞菌和花椰菜菌的良好模型生物中仍然存在。在铜绿假单胞菌中，已知LON会影响许多途径，但很少有人知道底物。此外，一种名为ASRA的隆隆蛋白在很大程度上没有表征，没有已知的底物。在C. crescentus中，尽管已经发现了几种底物，但尚无LON特异性调节剂。本文旨在填补其中一些差距，是三项研究的集合。在研究I中，我们使用定量蛋白质组学在铜绿假单胞菌中搜索LON底物，从而列出了假定的底物。我们通过体外测定确认了九种以前未知的底物，其中大多数是与运动相关的蛋白质。通过研究LON功能丧失突变体及其表型，我们观察到细胞分裂和运动性的缺陷，以及底物蛋白SULA的积累，SOS反应的控制下的细胞分裂抑制剂。我们对其底物进行了全球搜索，从而列出了推定的底物。通过抑制剂突变分析，我们发现LON在最佳条件下通过SULA间接调节运动性，直接通过降解鞭毛蛋白，大概是在抑制运动条件下。在研究II中，我们通过在硅和体外研究中以生化为特征，得出的结论是，它是一种活跃的蛋白酶，其功能与LON不同。通过此，我们发现Asra通过其底物QSLA（LASR的抗激活剂）调节法定人数的PQS途径。这种降解在体外抑制了ASRA的潜在调节剂，ASRA的潜在调节剂是由与Asra相邻的基因编码的ICP的蛋白质。我们还表明，在热震条件下，ASRA对于铜绿假单胞菌的存活至关重要。一起，这项研究表明，ASRA是一种重要的蛋白酶，它进化为占据铜绿假单胞菌中蛋白水解调节的不同壁ni。在研究III中，我们报道了对C. crescentus中名为Lara的新型LON调节剂的发现和生化研究，该调节剂在蛋白毒性应激下增强了LON介导的降解。我们通过体外测定法分析了其DEGRON的可转移性，并得出结论，其疏水C末端脱基龙很重要，但不足以调节LON。总而言之，我们报告了将LON与铜绿假单胞菌运动联系起来的新底物和途径，ASRA的表征调节了群体传感和热震反应，以及Lara作为C. C. C. C. c. c. c. c. c. c. c. c. c. c. cc. c. cc. c. cc. cc. cotc。。综上所述，本文中报道的研究扩展了我们对两个模型生物中LON蛋白酶的三种同源物的底物，细胞作用和调节机制的理解。这项研究的集合可能是研究细菌蛋白水解对环境和医疗保健研究的影响和潜力的宝贵资源。
细菌能力的诱导和遗传转化
摘要 本研究的目的是评估细菌能力的诱导以便随后进行转化。细菌转化是重组DNA技术中的关键过程。在自然界中，细菌在极其特殊的情况下以短暂的方式从环境中捕获游离DNA。诱导这种转移的体外方法首先需要使细菌具有随后进行转化的能力。因此，这项工作对两个步骤都进行了体外测试。所有协议均在 UTFPR 蓬塔格罗萨校区的生物工程实验室进行。使用大肠杆菌DH5-alpha菌株进行能力诱导，并使用质粒pUC19进行转化。所得结果表明转化细胞成功生长，可以在选择性培养基中选择出对质粒所具有的抗生素具有抗性的细胞。这些技术对分子生物学和基因工程具有重要意义，可以对细菌遗传物质进行控制操作，以用于各种生物技术应用，例如生产异源蛋白质，从而在扩展遗传知识和开发新生物技术方面发挥着重要作用。关键词：分子生物学；生物技术；基因转化。
细菌假设蛋白可能具有功能性
基因组分析是许多微生物学研究人员日常工作的一部分。这些分析经常揭示以不确定功能编码蛋白质的基因，对于许多细菌物种，这些未知基因构成了其基因组编码序列的显着比例。由于这些基因没有定义的功能，因此在分析中通常会忽略它们。实验确定基因的功能可能具有挑战性；但是，生物信息学工具的持续进步，尤其是在蛋白质结构分析中，使得逐渐更容易地将功能分配给假设序列。利用各种互补工具和自动化管道来注释假设序列，最终可以增强我们对微生物功能的理解，并为新的实验室实验提供方向。
肠道微生物组和代谢组，以发现强直性脊柱炎的致病细菌和益生菌
结果：使用宏基因组测序系统和填充微生物群落分类学组成，总共注释了7,703种，而使用代谢物促进液则鉴定了50,046个代谢物。AS和健康对照患者之间发现了差异微生物和代谢物。此外，TNFI得到了确认，以部分恢复肠道菌群和代谢产物。对菌群和代谢产物进行了多词分析，以确定差异微生物和代谢产物之间的关联，鉴定出与抑制病原菌细菌ruminococcoccus gnavus以及促进促进性细菌细菌的抑制相关的化合物，这些化合物（如羟硫素醇和生物素）相关。通过实验研究，进一步确定了微生物与代谢产物之间的关系，并且探索了这两种类型的微生物对肠上皮细胞的影响以及炎症性细胞因子介绍介物-18（IL-18）。
噬菌体在冰河流生物膜上微生物细菌群落的作用
病毒调节微生物群落的多样性和活性。然而，对它们在流细菌生物膜群落结构中的作用知之甚少。在这里，我们介绍了有关瑞士三种横向冰山的各种流病毒群落多样性和组成的见解。冰期流的特征是极端的环境条件，包括近冻结温度和超寡聚营养。这些条件选择了几个但适应良好的细菌进化枝，这些进化枝在生物膜群落中占主导地位，并通过微生物菌株占据了壁ni。我们使用元基因组测序揭示了这些流中各种生物膜病毒组合。在不同的流量和流中，病毒群落组成与细菌宿主的组成紧密结合，细菌宿主的宿主是由一般高的宿主特定城市强调的。将噬菌体相互作用的预测与辅助代谢基因（AMG）相结合，我们确定了通过感染微生变化枝成员的噬菌体共享的特定AMG。我们的工作为更好地理解细菌之间的复杂相互作用和噬菌体在一般情况下的噬菌体和噬菌体之间提供了一步。
大黄蜂微生物群在暴露于室外环境时显示时间继承和乳酸细菌的增加
问题：大的地球大黄蜂（Bombus terrestris）保持了社会核心肠道微生物，与蜜蜂相似，蜜蜂对宿主的健康和抵抗起着重要作用。在实验室条件下使用商业蜂箱进行的实验仅限于垂直传播的微生物和忽视环境因素的影响或微生物的外部收购。各种环境和景观水平因素可能会影响授粉昆虫的肠道菌群，这对农业生态系统的授粉媒介健康和舒适性产生了影响。仍然，尚不完全清楚是否可以对大黄蜂微生物群具有重要影响。在这里，我们在半场实验中进行了测试，如果大黄蜂微生物群在暴露于户外笼子内不同型号多样性时随着时间的流逝而变化。我们使用商业蜂箱分别与巢环境或暴露的外部环境区分垂直和水平传播的细菌。
促进细菌和非生物因子的植物生长的作用
根结线虫（Meloidogyne spp。，rkn）是全球最具破坏性的内寄生虫线虫之一，通常导致作物生长和产量的降低。洞悉宿主-RKN相互作用的动力学，尤其是在不同的生物和非生物环境中，对于设计新型的RKN缓解措施可能是关键的。植物促进生长细菌（PGPB）涉及不同的植物生长增强活动，例如生物铜质化，病原体抑制和全身耐药性的诱导。我们总结了有关PGPB和非生物因素（例如土壤pH，质地，结构，水分等）作用的最新知识。在调节RKN-host相互作用中。rkn直接或间接地受到不同PGPB的影响，相互作用中的非生物因子相互作用以及对RKN感染的宿主反应。我们强调了（i）PGPB直接和间接影响RKN-宿主相互作用的三方（host-rkn-pgpb）现象； （ii）宿主对根际PGPB的选择和富集的影响； （iii）土壤微生物如何增强RKN寄生虫； （iv）宿主在RKN-PGPB相互作用中的影响，以及（v）非生物因子在调节三方相互作用中的作用。此外，我们讨论了不同的农业实践如何改变相互作用。最后，我们强调将三方互动知识纳入集成的RKN管理策略的重要性。
超细菌的抵抗机制及其健康影响
I.厄瓜多尔基托大学的大学生普通外科医生。 div>II。 div>旋转医学内部，厄瓜多尔基多·卡尔德隆（Calderón）通用教学医院。 div>iii。 div>旋转医学内部，厄瓜多尔基多·卡尔德隆（Calderón）通用教学医院。 div>iv。 div>旋转医学内部，厄瓜多尔基多·卡尔德隆（Calderón）通用教学医院。 div>V.旋转医学，厄瓜多尔基多·卡尔德隆（Calderón）通用教学医院。 div>vi。 div>旋转医学内部，厄瓜多尔基多·卡尔德隆（Calderón）通用教学医院。 div>
细菌和线粒体超氧化物歧化酶之间的序列同源性
1969 年，人们发现一种以前未知功能的牛红细胞蛋白具有催化超氧化物自由基歧化活性 (1-3)。这种酶，即超氧化物歧化酶，是一种金属蛋白，每分子含有 2 (1.8-2.0) 个铜原子和 2 (1.7-1.9) 个锌原子，分子量为 33,000，由两个大小相同的亚基组成 (4, 5)。从其他真核生物中纯化的铜锌歧化酶在分子量、亚基结构、氨基酸组成、铜锌含量以及对纯化所用的氯仿-乙醇混合物的稳定性方面与牛红细胞歧化酶相似 (2, 3)。细菌来源的酶代表一类独特的超氧化物歧化酶，其每个分子含有 1-2 个锰原子作为金属辅因子，对氯仿-乙醇处理不稳定，其氨基酸组成与铜锌歧化酶明显不同（2、3、6-8）。细菌酶的分子量约为 40,000，每个酶含有两个分子量为 20,000 的亚基。最近又分离出两种超氧化物歧化酶，其稳定性、纯化特性和氨基酸组成与细菌锰歧化酶相似。一种来自鸡肝线粒体（8）的超氧化物歧化酶每个分子含有 2.3 个锰原子，虽然它是四聚体，但其亚基分子量与细菌含锰酶相同。另一种是含有铁（每个分子约 1 个原子）而不是锰的，已从大肠杆菌中分离出来（9），是一种二聚体，其亚基大小相同（分子量 19,000）。已在各种需氧、厌氧和耐氧厌氧微生物中测量了超氧化物歧化酶活性水平（10）。从观察到的相关性来看，
细菌感染的发病机制、疫苗和免疫
本专业版块的宗旨是为读者提供最高质量的文章，这些文章涉及细菌致病机制和毒力、感染免疫力和疫苗等相互关联的主题。我们的精神在本版块开头的专业大挑战概述中得到了简洁的表达（ Christodoulides，2022 年）。研究主题包括来自编辑委员会成员的广泛文章，重点关注导致人类疾病的重要革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌病原体，即嗜肺军团菌、假鼻疽伯克霍尔德菌、葡萄球菌属、鼠疫耶尔森菌、铜绿假单胞菌和淋病奈瑟菌。铜绿假单胞菌是一种代谢灵活的革兰氏阴性菌，是引起院内感染的主要机会性病原体（Dolan，2020），由于全球卡巴培南类抗生素耐药性增加，世界卫生组织将其列为开发和引进新抗菌药物和疫苗的“高优先级”菌（World Health Orgainisation，2024）。铜绿假单胞菌是一种强大的细菌，可表达多种毒力因子、类型分泌系统、群体感应途径和胞外多糖，以及核心耐药机制，如药物渗透屏障、染色体编码的 AmpC 酶和六个多药流出泵超家族（Miller and Arias，2024）。流出泵在铜绿假单胞菌感染的发病机制以及对治疗和清除的抵抗中起着重要作用。在他们的小型评论中，Fernandes 和 Jorth 讨论了铜绿假单胞菌流出泵在毒力调节中具有争议和对立的作用。流出泵的主要功能是从细菌细胞中排出抗生素，尽管有证据表明这些泵可能具有影响铜绿假单胞菌毒力的其他功能。流出泵是公认的治疗干预目标（Fernandes 和 Jorth），也是疫苗开发的潜在抗原（Silva 等人，2024 年）。作者得出结论，在抗生素耐药性和细菌致病机制的背景下，针对流出泵可能会产生意想不到的后果，在开发治疗方法时必须考虑到这些后果。疫苗研究的代表论文是关于革兰氏阴性菌鼠疫耶尔森菌和淋病奈瑟菌。鼠疫耶尔森菌是一种自有记载以来就一直困扰着人类的细菌。它对公众健康构成重大风险，并且可能