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RecT 重组酶表达可实现高效的基因...
摘要 屎肠球菌是一种普遍存在的革兰氏阳性细菌，可从环境、食物和哺乳动物的微生物群中分离得到。屎肠球菌的共生菌株可对宿主的生理和免疫产生有益影响，但抗生素的使用已从牲畜和人类中产生了抗生素耐药性和致病性分离株。然而，由于基因编辑方法效率低下，对屎肠球菌功能和机制的解析受到限制。为了解决这些限制，我们在此报告，屎肠球菌 RecT 重组酶的表达可显著提高重组工程技术在屎肠球菌的共生菌株和抗生素耐药菌株以及其他肠球菌种（如 E. durans 和 E. hirae）中的效率。值得注意的是，RecT 与成簇的规律间隔短回文重复序列 (CRISPR)-Cas9 和向导 RNA (gRNA) 的结合表达能够实现高效的无瘢痕单链 DNA 重组，从而在屎肠球菌中产生特定的基因编辑突变体。此外，我们证明屎肠球菌 RecT 表达促进了编码抗生素选择标记的双链 DNA 模板的染色体插入，从而产生了基因缺失突变体。作为进一步的原理证明，我们使用 CRISPR-Cas9 介导的重组敲除屎肠球菌中的两个分选酶 A 基因，以进行下游功能表征。此处描述的通用 RecT 介导的重组方法应能显著增强对屎肠球菌和其他密切相关物种的遗传研究，以进行功能和机制研究。
磷酸盐缓冲盐水，pH 7.4，1x
尿路感染是影响尿路部分的细菌感染。尿路感染的常见症状是紧迫性和排尿的频率，并带有相关的不适或疼痛。The common condition is cystitis, due to infection of the bladder with a uropathogenic bacterium, which most frequently is Escherichia coli, but sometimes Staphylococcus saprophyticus or especially in hospital-acquired infections, Klebsiella species, Proteus mirabilis , other coliforms, Pseudomonas aeruginosa or Enterococcus faecalis (1).hicrome™UTI琼脂是根据Pezzlo（2）Wilkie等人（3），Friedman等人（4），Murray等人（5），Soriano和Ponte（6）和Merlino等（7）制定的。建议这些培养基用于检测Hicrome™uti琼脂作为分离各种微生物的一般营养琼脂的广泛应用，以检测这些培养基。它促进并加快鉴定某些革兰氏阴性细菌和某些革兰氏阳性细菌的鉴定，基于由属或物种特异性酶与两种染色体底物的反应产生的不同对比菌落颜色。发色底物是由肠球菌，大肠杆菌和大肠菌群产生的酶特异性裂解的。存在蛋白酶的氨基酸和色氨酸等氨基酸的存在有助于检测色氨酸脱氨酶活性，表明存在蛋白酶种类，摩根菌种和普罗维生症。通过肠球菌具有β-葡萄糖苷酶裂解一个成色的底物，从而形成了蓝色菌落。e.coli由于酶裂解其他发色底物而产生的粉红色菌落。可以通过执行吲哚测试来进一步确认大肠杆菌。大肠菌群由于两种发色底物的裂解而产生紫色的菌落。菌落显得棕色。peptone Special提供氮，碳质化合物，长链氨基酸，维生素和其他必要的生长营养素。可以通过补充抗生素来检测与医院传播感染相关的微生物的抗生素来选择性。
乳腺酸脂蛋白和裂解性cilliersae cabrera sp。十一月。 （...
在寻找特定的自然敌人时，可以控制来自南美的两种侵入性水生植物（IAP），路德维亚grandiflora subsp。十六世纪（Onagraceae）和Myrio phyllum水生（Haloragaceae），与两个lysathiabechyné相关的分类挑战，1959年（Chrysomelidae; Alticini）种类必须解析。溶解脂蛋白（Boheman，1859年）表现出显着的形态变化，对这两种IAP造成严重损害，并且由于宿主之间的系统发育差距可能代表多个物种。此外，一种未描述的溶解菌种（以前以溶解度为lysathiasp。）已成功用作南非水生的控制剂。采用了结合遗传学和形态分析的综合分类方法。graptodera flavipes boheman，1859年的门型和副型。系统发育研究表明，乳杆菌具有比最初描述的更大的遗传和形态变异，并且没有证据表明黄乳杆菌代表了与其宿主植物相关的物种复合物。结果，物种描述扩大了。另一方面，遗传和形态学差异（例如体型，化学和生殖器结构）进一步支持了lysathia cilliersae cabrera的描述，sp。nov。及其与其他密切相关的物种的分化，包括黄乳杆菌和L. ludoviciana（秋季，1910年）。L. cilliersae sp。的标本。nov。阿根廷在米苏（Misiones）收集，与南非的人相匹配。遗传序列与形态和生殖器的传奇凭证，图像和图像以及新的分布记录相关。这项研究有助于溶解属的分类知识，并支持在应用昆虫学环境（例如生物控制程序）中准确的物种鉴定。
摘要。 Siahaan P，Mangais RER，Kolondam B，Tangapo A，Mambu S. 2023。与East Dumog的各种主机隔离
摘要。Siahaan P，Mangais RER，Kolondam B，Tangapo A，Mambu S.2023。metarhizium sp。的遗传多样性。与印度尼西亚北苏拉威西东杜莫加的各种寄主分离。生物多样性24：6888-6896。metarhizium tungus是一种已知杀死许多害虫的昆虫病作用真菌。这意味着metarhizium sp。在生态系统中具有重要的生态作用，尤其是在控制昆虫种群和回收养分方面。研究元族种类的遗传多样性及其与昆虫宿主的关系提供了对害虫管理和研究其分类法的见解。这项研究旨在通过检查其各自的宿主类型来研究metarhizium真菌之间的遗传变异性，该类型可以用作分类学研究，种质保护工作和PEST Management的基本数据。探索结果表明，三种昆虫物种被Metarhizium sp真菌，即Scotinophara coarctata，Nilaparvata Lugens和Recilia recilia tosalis感染。系统发育分析的结果表明，与来自Genbank的四个可比较的牛hiasopliae分离株在同一组中，相似性水平为100％，而lugens和R. redorsalis隔离株与四个metarhizium huainamdanmdanmdanmdanmdanmdanmdanmdanmdanmdanmdanmdanmdangense sellige sellimes sellime sellime sellime sellime sellime sellime sellime sellime sellime sellime sellime sellime sellime sellime sellime sellime sally群。99％和三个分离株的表示相似性98％。分子分析证实，从颈链链球菌分离的元族是弧菌菌种，而从lugens和R. dorsalis分离的元则是m。真菌。Huainamdangense物种。已证明宿主昆虫的差异可以为metarhizium sp提供遗传变异。
如何引用：Espina-Patiluna Mle和Demayo CG。 2024。使用
COWRIE（Cypraeidae）由于其美丽和相对可用性而在壳收藏家中很受欢迎。某些种类的牛里物种在壳体市场中具有很高的收集价值，但是这导致种类的数量增加和分类名称的不必要的扩散，几乎没有有关其形态的信息。因此，进行了这项研究是为了描述菲律宾辛丹甘湾获得的蛋黄壳之间的形态变化。壳形态属性（例如外壳形状，颜色，带，带模式），形态计量特征（例如外壳长度，宽度，身高，牙齿数量等。）和形状的表征是使用基于距离（Coriandis）的轮廓和里程碑的几何形态分析（GM）和相关分析产生的相对经过的分数。检查并分析了113种样本的16（16）个形态学和十（10）个单位特征。主要观察到颜色，带状图案，横向边缘，横向线，横向线，尖刺，牙齿，尺寸和形状的变化。相对经线分析显示，塞普雷氏菌种之间的壳形变化显着。相关分析显示塞浦路德家族物种之间的形态，大小和形状差异。相关分析中揭示的，观察到的大小变化与形状显着相关。观察到的差异可能是由于许多因素，包括遗传，生物和非生物因素。生物对独特环境的反应中的发展过程和生理学。因此，几何形态计量学和Coriandis帮助我们了解了塞浦路德家族的多样性的性质。需要进一步研究环境异质性，种群分布中的物种位置以及观察到的表型多样性的遗传基础。这种重点会导致有关Cypraeidae家族物种的系统研究中的其他信息。
垃圾渗滤液厌氧反应器中微生物多样性变化调查
摘要 一个年轻的垃圾填埋场渗滤液含有高浓度的总氨，通常高达 2,700 mg/l，在两个不同的实验室规模厌氧反应器中进行了 1,015 天的厌氧处理，这两个反应器配置为污泥床和混合床。本文介绍了这项长期厌氧可处理性研究的最后 265 天。通过使用 FISH（荧光原位杂交）、克隆、DGGE（变性梯度凝胶电泳）和形态分析来识别优势微生物，将高氨浓度对反应器性能的影响与微生物多样性的变化相关联。结果表明，如果在氨浓度高时对反应器进水进行临时 pH 调节，则可以使用 UASB 或混合床反应器成功处理高氨垃圾填埋场渗滤液。因此，COD 去除效率与微生物多样性和反应器配置无关，而是取决于渗滤液的可生物降解部分。在这种情况下，低乙酸盐水平的反应器的稳定性由甲烷菌群的丰富性支持。在这两个反应器中，还检测到了一些甲烷杆菌科种群，而其他产甲烷菌种几乎不存在。然而，在第 860 天终止 pH 调节之后，由于游离氨浓度突然增加到 400 毫克/升，反应器立即变得不稳定。混合床的 COD 去除效率下降到 42%，UASB 反应器的 COD 去除效率下降到 48%。抑制持续时间不足以严重损害大量的甲烷菌细胞；因此，在两次游离氨抑制之后，许多甲烷菌细胞才再次被鉴定出来。然而，随后，甲烷菌细胞的长丝状形态转变为较短的丝状，并失去了聚集特性。关键词克隆；DGGE；FISH；游离氨；垃圾渗滤液；产甲烷菌
由口腔微生物群失调引起的犬尿氨酸，由……引起
摘要 背景 慢性束缚应激 (CRS) 是一种促癌因素。但其潜在机制尚不清楚。目的 我们旨在研究 CRS 是否通过改变口腔微生物群和相关代谢物来促进头颈部鳞状细胞癌 (HNSCC)，以及犬尿氨酸 (Kyn) 是否通过调节 CD8 + T 细胞来促进 HNSCC。设计 4-硝基喹啉-1-氧化物 (4NQO) 处理的小鼠暴露于 CRS。用 4NQO 处理的无菌小鼠接受来自 CRS 或对照小鼠供体的口腔微生物群移植。对小鼠唾液、粪便和血浆样本进行 16S rRNA 基因测序和液相色谱-质谱分析，以研究其微生物群和代谢物的变化。使用 4NQO 诱导的 HNSCC 小鼠模型研究了 Kyn 对 HNSCC 的影响。结果 CRS 小鼠的 HNSCC 和口腔微生物失调发生率高于无 CRS 对照小鼠。在 CRS 暴露下，假单胞菌和韦荣球菌种增多，而某些口腔细菌（包括棒状杆菌和葡萄球菌种）减少。此外，在暴露于 4NQO 治疗的无菌小鼠中，CRS 改变的口腔微生物群促进了 HNSCC 的形成，导致口腔和肠道屏障功能障碍，并诱导宿主代谢组转变，导致血浆 Kyn 增加。在应激条件下，我们还发现 Kyn 激活了肿瘤反应性 CD8 + T 细胞中的芳烃受体 (AhR) 核易位和去泛素化，从而促进 HNSCC 肿瘤发生。结论 CRS 诱导的口腔微生物群失调在 HNSCC 中起促肿瘤发生作用，并可影响宿主代谢。从机制上讲，在压力条件下，Kyn 通过去泛素化稳定 AhR，从而促进 CD8 + T 细胞耗竭和 HNSCC 肿瘤发生。
植物相关微生物在植物健康和发育中的作用：以沙雷氏菌属为例
摘要 沙雷氏菌属是肠杆菌科的一种菌种，存在于多种生态环境中。近年来，沙雷氏菌已成为促进植物生长和防御植物病虫害的多方面贡献者。本综述探讨了沙雷氏菌诱导植物生长和缓解非生物和生物胁迫的机制。沙雷氏菌与植物生态系统的无缝整合使沙雷氏菌能够产生群体感应分子 N-酰基高丝氨酸内酯 (AHL)，促进植物组织的定植并利用植物分泌物中的营养。这种错综复杂的通讯网络使沙雷氏菌能够产生植物激素并分解土壤中的必需营养物质供植物吸收。面对生态竞争对手，许多沙雷氏菌菌株表现出非凡的适应性，产生多种水解酶和抗菌、抗真菌或杀虫化合物，有效控制有害细菌、真菌和害虫。此外，有益的沙雷氏菌菌株还分别使用诱导系统抗性 (ISR) 和耐受性 (IST) 来缓解生物和非生物胁迫。沙雷氏菌的各种农业应用包括直接使用细菌细胞进行种子包衣、叶面喷洒和土壤接种，或将其生物活性化合物单独或与其他材料结合应用于植物的各个部位。这些努力旨在增强植物健康、抑制疾病和控制害虫种群。尽管应用前景广阔，但有报道称植物和动物具有机会性致病性。因此，应考虑几种安全方法和使用毒力因子突变菌株。沙雷氏菌在农业中的应用趋势预计将持续下去。
Komagataella phaffii（毕赤酵母）作为一种强大的酵母...
Komagataella phaffii (K. phaffii) (Pichia pastoris)，也称为生物技术酵母，是一种在生物技术和制药行业中具有多种应用的酵母菌种。这种甲基营养酵母作为重组蛋白的生产平台引起了人们的极大兴趣。它具有许多优点，包括有效的分泌表达，便于纯化异源蛋白，细胞密度高，生长迅速，翻译后变化，以及整合到基因组中的稳定基因表达。在过去的三十年里，K. phaffii 还被精炼为一个适应性强的细胞工厂，可以在实验室环境和工业规模上生产数百种生物分子。事实上，迄今为止，使用 K. phaffii 表达方法已经生成了 5000 多种重组蛋白，占细胞总蛋白的 30% 或总释放蛋白的 80%。除了已获得许可的 300 多种工业工艺外，K. phaffii 还用于制造 70 多种商业产品。其中包括对工业生物技术有用的酶，包括木聚糖酶、甘露聚糖酶、脂肪酶和植酸酶。其他是生物制药，包括人血清白蛋白、胰岛素、乙肝表面抗原和表皮生长因子。与其他表达系统相比，这种酵母还被认为是合成亚单位疫苗的特殊宿主，而亚单位疫苗最近已被替代疫苗类型所取代，例如灭活/杀死和减毒活疫苗。此外，通过多层次优化方法，如密码子偏好、基因剂量、启动子、信号肽和环境因素，可以实现重组蛋白的高效生产。因此，尽管 K. phaffii 表达系统高效、简单且工艺流程明确，但仍需确定理想条件，因为这些条件会根据目标蛋白而变化，以确保最高的重组蛋白生成量。本综述介绍了 K. phaffii 表达系统、其在工业和生物制药蛋白质生产中的重要性，以及一些高效蛋白质生产的生物加工和遗传改造策略。K. phaffii 最终将继续作为一种强大的表达系统在研究领域和工业应用中做出贡献。
Labagnara等人，响应...
葡萄酒酵母的生物多样性，以应对环境压力Labagnara T.，Carrozza G. P.，Toffanin A.，Dipartimento di scienze agrarie，Alro-bambientali，agro-bambientali，Universitàdipisa pisa atoffan@agr.unipi.it.unipi.it.unpi.unipi.it suroforum in eenoforum 2013，7-9-7-9-9-9-9-9。引言在发酵过程中描述了微生物群落在世界上的几个葡萄酒种植区域进行了描述（Baleiras Couto等，2005; Fernandez等，1999; Ganga and Martinez，2004; Gonzales et; Gonzales et al。，2007; Hierro等人。2006b; Lopandic等。; 2008）。发酵过程中物种及其活性的数量取决于几个因素（Longo等，1991； Pretorius等，1999）。结果是从地区到地区的葡萄酒质量变化，但也从一年到另一年。可变性使自发发酵的结果难以预测（Pretorius，2000）。葡萄酒酵母在两组中是不同的：在发酵的第一阶段生长的非糖类酵母，而葡萄糖菌种则在乙醇浓度增加时占主导地位。在酒精发酵过程中，葡萄酒酵母遭受无数的环境压力。实际上，进行性营养耗竭，升高酒精浓度，温度和添加可能会影响其生长和发酵变异性。营养限制，例如氮缺乏症，乙醇和S0 2的添加是发酵发酵的主要原因。此外，生物动力学酿酒师倾向于最大程度地减少从葡萄园到最终产品的每种干预措施。2。生物动力葡萄酒农场的天然葡萄酒通常以少量添加剂的使用，不添加营养和在酒精发酵过程中不使用商业葡萄酒酵母。因此，生物多样性在生物动力葡萄酒农场中起着核心作用。在自发发酵过程中，微生物种群的动力学导致不同物种/菌株的连续。尽管酵母多样性可观，但通常只有有限数量的Saccharomyces spp。菌株完全主导着酒精发酵。酿酒酵母的菌株被分离出来，并从托斯卡纳的两个生物动力葡萄酒农场中表征。进行了与环境压力对生物多样性的结果有关的研究。我们的结果表明，即使在低浓度下，亚硫酸盐的作用以及高水平的乙醇的存在会引起菌株之间的显着差异。材料和方法2.1酵母