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World File Search System裂解
深入了解全球海洋表皮和中质社区的假定藻酸盐裂解酶
藻酸盐裂解酶和寡聚酸酯裂解酶催化藻酸盐的糖苷键的裂解，藻酸盐，这是由棕色藻类和其他生物体合成的酸性多糖。这些酶高度多样，目前已分为15个碳水化合物活性酶（Cazy）数据库的家族。我们探讨了结构和分类学的多样性，基因和转录本的生物地理分布以及来自全球海洋上层皮科浮游物社区的假定藻酸盐降解酶的潜在环境驱动因素。首先使用序列相似性网络对确定的序列进行分析，以评估其与Cazy成员的关系。与PL5，PL6，PL7，PL17和PL38家族有关的序列具有较高的基因和转录物丰度，温度是携带假定藻酸盐裂解酶基因的社区成员结构的关键驱动力。PL5同源物包括活性位点的关键残基中的变体，分配给“ candidatus pelagibacter”的序列显示出高基因和转录物丰度，与无机磷浓度负相关。序列分配给了黄杆菌和/或γ-细菌类别主导了PL6，PL7和PL17家族，尤其是与未经文化的偏光杆菌和Alteromonas Australica密切相关的序列。在PL38家族中，虽然从planctomycetota，verrucomicrobiota和Bacteroidota的序列分配给分类群，在大多数区域和深度上显示出最高的相对基因丰度，而高表达水平在高纬度的序列中观察到序列中的序列，分配给了euukaryota（例如eukaryota（e.g.，e.g.，phaeocystica）。总体而言，这项研究中发现的推定酶可能参与了各种生理过程，包括藻酸盐同化和生物合成。
PNA辅助dnazymes裂解双链DNA，用于具有高序列保真度的基因工程
摘要：Dnazymes已被广泛用于许多传感和成像应用中，但是自1994年发现以来，很少使用基因工程，因为它们的底物范围主要限于单链DNA或RNA，而遗传信息则存储在双链DNA（DSDNA）中。为了克服这一主要局限性，我们在这里报告了肽核酸（PNA）辅助双链DNA通过dnazymes（Panda）辅助的DNA迹象，这是将Dnazyme活性扩展到DSDNA的第一个例子。我们表明，熊猫在有效划痕或导致靶dsDNA上有双链破裂是可以编程的，靶DsDNA模仿了蛋白质核酸酶，并且可以充当分子克隆中的限制酶。除了比蛋白质酶小得多，在我们测试的条件下，熊猫还具有更高的序列保真度，这证明了其作为基因工程和其他生化应用的新型替代工具的潜力。
阿尔茨海默氏病中Aβ肽和tau蛋白的锌（锌）修饰的清除和裂解
Zinc(Ⅱ) can prevent on pre-stage, mild cognitive impairment (MCI) and pathological AD for AD MCI and prevention that an- tibodies prevent MCI, zinc homeostasis, ZnCl2, zinc transporter (ZnT) prevent MCI and AD, ZnT-6 prevents MCI and AD that ZnT-6 is a likely site of Aβ generation through cleavage of amy- loid precursor protein （APP）和用锌 - 金甲肽酶降解酶（IDE）可预防AD。清除率和裂解阶段涉及MMP-2，MMP-2，MMP-2，MMP-2，MMP-3，CAN CAN属于MMP-2，MMP-2，MMP-2，MMP-2，MMP-2，MMP-2，MMP-2，MMP-2，MMP-3，属于Zinc-9）可以降解MMPS，MMP2，MMP9 MMPS，MMP2，MMP9）涉及ADAβ肽聚集阶段。淀粉样β蛋白质清除和降解（ABCD）和具有锌烯型肽酶的胰岛素降解酶（IDE）可以切割多种小肽。清除率和裂解阶段涉及锌指蛋白，锌指蛋白转录因子（ZFP-TFS）可以减少tau的持续抑制作用。生物活性化合物清除，锌-BDNF剥夺会引起AEP的影响和切割tau，并且可以在tau蛋白中切割锌离子。取决于ADAβ毒性的清除和切割阶段，涉及锌金属蛋白酶酶，可以在Aβ和TAU上裂解锌金属蛋白酶酶，膳食生物活性化合物，锌 - 米克罗糖酸锌和tau，通过Aβ和TAU清除和abeave cleaveance和debevenance和taus neb s cleaine s Agrance shep and n s Agn s Agrance shecance shep s Agn and s rep shep s rep shecance。 锌（ⅱ）结合清除和的分子机制取决于ADAβ毒性的清除和切割阶段，涉及锌金属蛋白酶酶，可以在Aβ和TAU上裂解锌金属蛋白酶酶，膳食生物活性化合物，锌 - 米克罗糖酸锌和tau，通过Aβ和TAU清除和abeave cleaveance和debevenance和taus neb s cleaine s Agrance shep and n s Agn s Agrance shecance shep s Agn and s rep shep s rep shecance。锌（ⅱ）结合清除和锌诱导的有毒反应氧（ROS）产生导致过度磷酸的TAU损害和氧化应激增加，以引起TAU高磷酸化并加剧神经元死亡。锌诱导的有毒反应氧（ROS）产生导致过度磷酸的TAU损害和氧化应激增加，以引起TAU高磷酸化并加剧神经元死亡。
使用组织型纤溶酶原激活剂诱导的血浆血浆凝块裂解时间
f i g u r e 3可溶性血栓瘤蛋白（STM）和组织型纤溶酶原激活剂诱导的血浆凝块裂解时间（TPA-PCLT）与脓毒症分发的血管内凝血凝血凝血凝结患者在STM治疗前后的血管凝集患者的血浆中的血浆（TPA-PCLT）的变化。在重组STM（RSTM）处理后（PRE）之前（前）和24小时，在不同时间和24小时获得血浆样品。（a）显示了等离子体STM水平。（b）在存在和不存在RSTM和活化的凝血酶活化的纤维结构抑制剂（TAFIA）抑制剂的情况下，TPA-PCLT（Th）。数据表示为重复数据的平均TPA-PCLT时间。开放圈：tpa-pclt（th）;闭环：TPA-PCLT（TH） + RSTM;开放三角：TPA-PCLT（TH） + TAFIA抑制剂；闭合三角形：TPA-PCLT（TH） + RSTM + TAFIA抑制剂。
DNA提取所有试剂盒
1。根据表4获取裂解样品。2。彻底混合裂解溶液。3。在每个1.5 mL微输出管或包含样品的板的孔中添加一卷裂解溶液。基于样本类型和样品数量的体积，请参见表4。4。移液管上下以混合裂解溶液和每个管子中的样品。5。盖管或用粘合剂盖密封板，然后短暂离心管或板。
10x 单细胞多组 ATAC + 基因表达测序的细胞核分离方法
- 裂解稀释缓冲液 - 1X 裂解缓冲液 - 0.1X 裂解缓冲液 - 洗涤缓冲液 - 稀释的细胞核缓冲液 II。注意 - 在制备稀释的细胞核缓冲液之前，先将细胞核缓冲液 (20X) 从 -20 中取出，并使其平衡至室温。 - 来自 Chromium Next GEM 单细胞多组 ATAC + 基因表达用户指南 (CG000338) 的转座混合物需要与稀释的细胞核缓冲液同时制备。裂解稀释缓冲液体积 (μL)
Zymobiomics magbead DNA/RNA
•样品来源 - 细菌，真菌，原生动物，病毒，病毒，线粒体和宿主DNA和RNA与≤50mg的土壤，哺乳动物/植物/种子，5-20 mg（湿重1）的真菌/细菌细胞，生物细胞，生物纤维，生物纤维，水和瑞巴群有效分离。•样品均质化 - Zymobiomics™创新裂解系统确保对微生物细胞壁的完全裂解和准确的微生物分析，无偏见。分别提供裂解管（S6012-50）和96孔裂解架（S6002-96-7）。•样品保存 - DNA/RNA Shield™裂解细胞，使核酸酶和感染剂失活，是在环境温度下样品存储和运输的理想选择。•大小 - DNA和总RNA，包括小/microRNA（≥17nt）。
Magna Pure 96系统协议
为了获得更好的结果，Roche提供了各种外部裂解缓冲液：Magna Pure CFNA缓冲套件（CAT。否。07 794 398 001），Magna纯外裂解缓冲区（Cat。否。06 374 913 001），Magna纯细菌裂解缓冲液（Cat。否。06 374 921 001），Magna纯DNA组织裂解缓冲液（Cat。否。06 640 702 001），Magna Pure FFPET缓冲区集†（Cat。否。08 447 144 001），Magna Pure RNA组织裂解缓冲液（Cat。否。03 604 721 001）和S.T.A.R.缓冲区§（CAT。否。03 335 208 001）。请参阅使用手册的说明以获取更多详细信息。
通过计算机模拟和体外药物再利用策略靶向弗林蛋白酶活性以抑制 SARS-CoV-2 刺突糖蛋白的裂解
开辟了快速识别潜在新型治疗方法的新途径 58,59 。分子建模技术和虚拟筛选可以明确地帮助药物重新定位工作。因此，面对 COVID-19 大流行的情况以及缺乏经过验证的治疗方法或疫苗，我们决定使用不同的生物信息学方法和我们新收集的约 8,000 种已批准和正在研究的化合物来寻找新型的潜在弗林蛋白酶抑制剂。抗真菌剂 Sulconazole 是在结构分析后确定的，并进一步发现它可以抑制主要细胞表面的成熟
在微生物组中微生物裂解中的遗传潜能与代谢调节和表达之间的解耦
抽象的宏基因组学，元文字组学和元蛋白质组学用于探索酶分泌的微生物能力，但是在生态系统中，pro tein te-tein编码基因与相应的转录本/蛋白之间的联系是毫无疑问的。By conducting a multi-omics comparison focusing on key enzymes (carbohydrate-active enzymes [CAZymes] and peptidases) cleaving the main biomole cules across distinct microbiomes living in the ocean, soil, and human gut, we show that the community structure, functional diversity, and secretion mechanisms of microbial secretory CAZymes and peptidases vary drastically between微生物组在主质，元文字和元蛋白质组水平上。由于主要参与者对有机物物质源和浓度的不同反应，这种变化导致cazymes与肽酶之间从遗传潜能到蛋白质表达的decouper质关系。我们的结果强调了对有机物上微生物裂解的因素进行系统分析的需求，以更好地将OMICS数据与生态系统过程联系起来。