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World File Search System超家族
ICAM在免疫，细胞间粘附和交流中
摘要：白细胞和白细胞与免疫相关辅助细胞之间的相互作用是免疫反应的重要特征，需要涉及细胞粘附分子（CAM）。在免疫系统中，凸轮包括与涉及细胞发育，激活，分化和迁移的不同结构和功能家族有关的广泛成员。中，β2整合素（LFA-1，MAC-1，P150,95和αDβ2）主要参与同型和异型白细胞粘附。β2整联蛋白与属于免疫球蛋白超家族（IGSF）cam的肌动蛋白细胞骨架连接受体结合，由白细胞和血管细胞和血管内皮细胞表达，实现白细胞活化和跨胸膜迁移。β2整联蛋白长期以来一直被视为最重要的ICAMS伴侣，从而传播了β2整合素 - ICAM粘附受体相互作用的细胞内信号传导。在这篇综述中，我们提出了先前的开创性研究证据，以及更多最新发现，支持ICAM在信号转导中的重要作用。我们还讨论了免疫ICAMS（ICAM -1，-2和-3）对互相细胞信号传导和功能的贡献，在该过程中，β2整合素据称含有铅的含量，特别注意T细胞激活，分化和迁移。
实体瘤管道
缩写：1L，第一行； 2L，第二行； 3L，第三行； 4-1BB，肿瘤坏死因子受体超家族成员9; ADC，抗体 - 药物结合； BSAB，双特异性抗体； CCR8，C-C基序趋化因子受体8； CD16A，FC受体FCγRIIIA; CD3，分化3群； CDAC，嵌合降解激活化合物； CEA，癌脑抗原； DGKζ，二酰基甘油激酶ζ； DLL3，类似三角洲的配体3; EGFR，表皮生长因子受体； ES-SCLC，广泛的小细胞肺癌； FGFR2B，成纤维细胞生长因子受体2，同工型IIIB； GBRCAM，种系乳腺癌基因（BRCA）突变；胃肠道，胃肠道； GPC3，Glypican-3; IL-15，白介素15; Kras，Kirsten大鼠肉瘤病毒； LS-SCLC，有限阶段的小细胞肺癌； MCRPC，转移性cast割前列腺癌； MTX，维护处理； MUC1，粘蛋白1; PARP 1/2，聚（ADP-核糖）聚合酶1和2； PRMT5，蛋白精氨酸甲基转移酶5； PSOC，铂敏感的卵巢癌； SCLC，小细胞肺癌； STEAP1，前列腺1的六跨膜上皮抗原。
伪cospora ulei的高质量基因组组装对天然橡胶树的主要威胁
伪cospora ulei是南美叶枯萎病（SALB）的因果，这是影响hevea brasiliensis橡胶树的主要疾病，这是亚马逊的本地物种。橡胶树是南美国家的主要农作物，SALB疾病控制策略将受益于真菌病原体的基因组资源的可用性。在这里，我们组装并注释了P. ulei基因组。使用第二代和第三代测序技术进行shot弹枪测序。我们介绍了第一个P. ulei高质量的基因组组件，是Mycosphaerellaceae中最大的，具有93.8 MBP，包括215个脚手架，N50的2.8 MBP和BUSCO基因完整性为97.5％。我们在P. Ulei基因组中鉴定了12,745个蛋白质编码基因模型，其中756个基因编码了分泌的蛋白质和113个编码效应子候选物的基因。大多数基因组（80％）由吉普赛超家族的逆转录子主导的重复元素组成。ulei在Mycosphaerellaceae中具有最大的基因组大小，TE含量最高。总而言之，我们为对ULEI和相关物种的广泛研究建立了基本资源。
非典型钙粘蛋白 FAT1 在... 中的作用的最新进展
摘要。FAT 非典型钙粘蛋白 1 (FAT1) 基因是果蝇脂肪基因的直系同源物，编码原钙粘蛋白 FAT1。FAT1 属于钙粘蛋白超家族，这是一组含有钙粘蛋白样重复序列的全长膜蛋白。在各种类型的人类癌症中，FAT1 是最常见的突变基因之一，被认为是一种新兴的癌症生物标志物和新疗法的潜在靶点。然而，FAT1 的生物学功能及其介导的精确下游信号通路仍有待充分阐明。本综述讨论了有关 FAT1 的当前文献，重点关注 FAT1 突变和表达水平，以及它们对各种类型癌症的信号通路和机制的影响，包括实体肿瘤和血液系统恶性肿瘤，例如食管鳞状细胞癌、头颈部鳞状细胞癌、肺鳞状细胞癌、肝细胞癌、神经胶质瘤、乳腺癌、急性淋巴细胞白血病、急性髓细胞白血病、淋巴瘤和骨髓瘤。本综述旨在为未来关于 FAT1 作为致癌因子或肿瘤抑制因子的研究提供进一步的见解和研究方向。
文章 结构生物学AI时代的ABC跨膜蛋白结构综合收集与预测
摘要：过去四年中，独特的跨膜 (TM) 蛋白质结构的数量翻了一番，这可以归因于低温电子显微镜的革命。此外，AlphaFold2 (AF2) 还提供了大量高质量的预测结构。但是，如果研究的对象是特定的蛋白质家族，那么尽管存在通用和蛋白质域特定的数据库，收集该家族成员的结构仍然极具挑战性。在这里，我们证明了这一点，并评估了通过 ABC 蛋白质超家族自动收集和呈现蛋白质结构的适用性和可用性。我们的流程使用 PFAM 搜索识别和分类跨膜 ABC 蛋白质结构，并旨在根据特殊几何测量 conftors 确定它们的构象状态。由于 AlphaFold 数据库仅包含单个多肽链的结构预测，我们对作为二聚体发挥作用的人类 ABC 半转运蛋白进行了 AF2-Multimer 预测。我们的 AF2 预测警告称，有关相互作用伙伴的一些生化数据的解释可能存在歧义，需要进一步进行实验和实验结构确定。我们通过网络应用程序提供了我们预测的 ABC 蛋白质结构，并加入了 3D-Beacons 网络，通过 PDBe-KB 等平台覆盖更广泛的科学界。
网络孟德尔随机化分析揭示 2 型糖尿病与胃肠道疾病之间的蛋白质通路联系
图 3 (A) 在发现数据集 (deCODE) 中，基因预测的 T2D 与循环蛋白质水平之间的 MR 关联的火山图。标记蛋白质是 464 种发现的蛋白质中的 69 种，FDR <0.05，在 UKB-PPP 和 Fenland 数据集中方向一致且保持名义显著 (p < 0.05)。 (B) 使用来自 UKB-PPP 和 Fenland 的蛋白质数据复制的关联热图。在热图中，p 值 <0.05 但 FDR 校正的 p 值 ≥ 0.05 的关联标记为 *，而 FDR 校正的 p 值 <0.05 标记为 **。FDR 在每个数据集的所有蛋白质中都表现出来。ADH1B，酒精脱氢酶 1B；ADH4，酒精脱氢酶 4；ENPP7，外核苷酸焦磷酸酶/磷酸二酯酶家族成员 7； EPHA1，肝配体 A 型受体 1；FDR，错误发现率；GI，胃肠道；GUSB，β-葡萄糖醛酸酶；INSL5，胰岛素样肽 INSL5；NCAN，神经胶质蛋白核心蛋白；SULT2A1，胆汁盐磺基转移酶；T2D，2 型糖尿病；TNFSF12，肿瘤坏死因子配体超家族成员 12。
凝血蛋白酶驱动的癌症免疫逃避
摘要：血液凝血和癌症本质上是连接的，在某些类型的癌症中通常观察到与高凝相关的血栓并发症，通常会导致癌症患者的生存率下降。除了在凝血中的共同作用外，凝血蛋白酶通常通过激活G蛋白偶联的repeptor超家族蛋白酶来触发各种癌症的细胞内信号传导：蛋白酶激活的受体（PARS）。尽管PAR的作用在某些类型的癌症的发展和进展中已经建立了良好，但它们对癌症免疫反应的影响只是出现。本评论强调了凝血蛋白酶驱动的PAR信号如何在调节先天和适应性免疫反应中起关键作用。这是关于凝血蛋白酶诱导的信号在癌症免疫逃避的贡献的详细讨论，从而支持某些肿瘤的生长和发育。审查的一个特殊部分展示了凝血蛋白酶，凝血酶，因子VIIA和XA因子在癌症免疫逃避中的作用。靶向凝血蛋白酶引起的信号传导可能是一种潜在的治疗策略，可以提高宿主对抗癌症的免疫监视机制，从而增加靶向免疫治疗方案的临床后果。
濒危Aye- ...
Aye-aye（Daubentonia Madagascariensis），史普西尔希恩（Strepsirrhine）到马达加斯加（Madagascar），是多拜顿莫迪（Daubentoniidae）灵长类动物家庭的唯一成员。尽管表现出柠檬碱超家族中最广泛的地理分布（Sterling 1994）和很少的天然捕食者（Richard and Dewar 1991），但自1980年代以来，迅速的栖息地破坏（Suzzi-Simmons 2023）已在急剧的人口下降量下降了≥50％（Louis等人（Louis et and。2020）。通过人类狩猎活动的剥削进一步威胁着该物种的生存，不仅将Aye-Ayes作为食物来源，并限制他们消耗的农作物的损失，而且还因为地区的Malagasy Cul Tural信念，即Aye-Ayes是Aye-ayes是不幸的，病，疾病，疾病，Andriamasimamananaana，1994年）。由于这些正在进行的垂体趋势，预计在接下来的3代人口将进一步下降（即在10 - 24年之内），根据国际自然和自然资源保护委员会生存委员会灵长类动物专家小组（Schwitzer等人）的国际自然和自然资源物种生存委员会（Schwitzer等人）的说法，使Aye-ayes成为25种世界最濒危的灵长类动物之一（Schwitzer等人。2013;路易等人。2020;并查看Gross 2017中的讨论）。
单个...
抽象的解旋酶利用三磷酸核苷酸（NTP）水解沿单链核酸（NA）易位并放开双链体。在细胞中，解旋酶在其他NA相关蛋白（如单链DNA结合蛋白）的背景下起作用。这种遭遇调节了解旋酶功能，尽管潜在的机制在很大程度上未知。甲状腺酸虫甲状腺酸性色素D组D（XPD）解旋酶是理解超家族2B解旋酶的分子机制的模型，并且其活性通过认知单链单链DNA DNA的DNA结合蛋白重复蛋白A 2（RPA2）增强。在这里，在RPA2存在下，单个XPD解旋酶的放松活性的光学陷阱测量揭示了一种机制，在该机制中，XPD在两个具有不同过程的状态之间互动，并且瞬态RPA2相互作用稳定了更为方便的状态，从而激活了XPD中的潜在“过程开关”。XPD上调节DNA结合位点的点突变类似地激活了此开关。这些发现提供了对辅助蛋白调节解旋酶调节机制的新见解。
破译经典雌激素受体在胰岛素抵抗和2型糖尿病中的作用：从分子机制到临床证据
摘要雌激素的生物学作用是由雌激素受体α或β（ERα或ERβ）介导的，这些雌激素受体α或β（ERα或ERβ）是广泛的核受体超家族的成员。大量体内和体外研究表明，经典ERα和ERβ调节循环雌激素的丧失导致胰腺β细胞和胰岛功能，GLUT4表达，胰岛素敏感性和葡萄糖耐受性，功能障碍性脂质稳态，氧化抑制作用，氧化性壳体和炎症性壳体的快速变化。非常明显，17β-雌激素（E2）可以完全逆转这些影响。本综述评估了当前对经典ER在临界途径和与胰岛素抵抗和2型糖尿病（T2DM）相关的分子机制中的保护作用的理解。它还研究了更年期激素治疗（MHT）在降低更年期妇女中T2DM的风险方面的有效性。临床试验表明，MHT对葡萄糖代谢的保护作用，这对于治疗中绝经妇女的T2DM可能很有用。但是，人们担心E2在绝经中肥胖和高脂血症的潜在副作用。有必要进行进一步的研究以获得理解并找到绝经后妇女治疗胰岛素抵抗和T2DM的其他雌激素替代方法。