。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可,根据 未经同行评审认证)是作者/资助者,他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者(此版本于 2020 年 5 月 29 日发布。;https://doi.org/10.1101/2020.05.26.117911 doi:bioRxiv 预印本
Setareh Aflaki,Setareh Aflaki,Cell。cel,2022,185(12),pp.2164-2�10.1016/j.cell。
Authors: Ehsan Ghorani 1 *, Matteo Quartagno 2 *, Fiona Blackhall 3 , Duncan C. Gilbert 2 , Mary O'Brien 5 , Christian Ottensmeier 6 , Elena Pizzo 7 , James Spicer 8 , [a patient representative], Alex Williams 9 , Philip Badman 9 , Mahesh K.B.Parmar 2 *和Michael J. Seckl 1 *代表精炼肺调查人员。
秀丽隐杆线虫是一种用于研究发育和衰老遗传学的多功能模型生物,通过给线虫喂养表达特定 dsRNA 的细菌可以抑制其基因表达。之前已证实通过常规转基因技术过表达缺氧诱导因子 1 ( hif-1 ) 或热休克因子 1 ( hsf-1 ) 可延长线虫寿命。然而,目前尚不清楚其他基因过表达方法是否可行,尤其是随着基于 CRISPR 的技术的出现。本文中,我们表明,给经过基因改造以稳定表达 Cas9 衍生的合成转录因子的秀丽隐杆线虫喂养表达启动子特异性单向导 RNA (sgRNA) 的细菌也可以激活基因表达。我们证明,通过摄取针对 hif-1 或 hsf-1 各自启动子区域的 sgRNA 激活 CRISPR 可增加基因表达并延长秀丽隐杆线虫的寿命。此外,作为旨在使用 CRISPR 激活秀丽隐杆线虫的未来研究的计算机资源,我们提供了预测的启动子特异性 sgRNA 靶序列,用于超过 13,000 个秀丽隐杆线虫基因,并具有实验定义的转录起始位点。我们预计本文描述的方法和组件将有助于促进全基因组基因过表达研究,例如,通过将表达 sgRNA 的细菌喂给线虫来诱导转录,以识别衰老或其他感兴趣的表型的调节因子。
覆盖度在外显子组测序中达到最高,从27.7X到33.6X不等。外显子组的中位覆盖度从14X到100X不等,而基因组测序则从27X到33X不等。从受试者的覆盖度来看,对于外显子组测序,超过58.8%的受试者对所有变异的覆盖度超过10X,对于许多变异,这个值达到了100%。对于15X和20X的覆盖度也是如此,拥有这种覆盖度的受试者比例最低分别为49.9%和35.7%,在很多情况下,这个值达到了100%。对于基因组测序,超过99.1%的受试者对所有变异的覆盖度超过10X,对于许多变异,这个值达到了100%。 15X 和 20X 以上的覆盖率也是如此,具有此类覆盖率的受试者的最低比例分别为 96.0% 和 82.9%,在许多情况下,该值达到 99.3% 和 95.1%。这些来自外显子组和基因组测序的覆盖率统计数据确保了变异调用的高可信度,并强调了我们
摘要摘要用于优化健康衰老和增加健康跨度的发现解决方案是我们社会面临的主要挑战之一。WHO将基于整合的新型医疗保健模型以及对维持最佳功能水平维持的研究和护理的转变被认为是优先事项。为了解决这个问题,缺少一种将纵向和实验人群与对生理功能的创新横向理解混合在一起的整合全球策略。虽然当前的衰老生物学方法主要集中在实质细胞上,但我们建议与年龄相关的功能丧失在很大程度上取决于构成支持不同特定实质的一般基础的三个元素:即基质,免疫系统和代谢。在Inspire项目中实施的这种策略可以强烈帮助找到一个能够通过阈值信号传递和护理依赖性来预测整个生命过程中容量变化的综合生物标志物。
(未经同行评审认证)是作者/资助者。保留所有权利。未经许可不得重复使用。此预印本的版权所有者此版本于 2023 年 5 月 30 日发布。;https://doi.org/10.1101/2023.05.30.542412 doi:bioRxiv preprint
Dhivya R. Sudhan,1 Angel Guerrero-Zotano,2 Helen Won,Paula Gonza´ Lez Ericsson,4 Alberto Servetto,1 Mariela Huerta-Rosario,1 Dan Ye,1 Kyung-Min Lee,1 Luigi formisano,1 Luigi formisano,2 Yan Guo,5 Qi liu kip liu koth tig n n n lies n.迈克尔·J·威克(Michael J.美国纽约州4乳腺癌计划,范德比尔特 - 伊格兰癌症中心,美国纳什维尔5综合癌症中心,新墨西哥大学,阿尔伯克基医学科学中心,美国纳什维尔,美国田纳西州纳什维尔7霍华德·休斯·休斯医学院,德克萨斯大学医学中心。
预印本(未通过同行评审认证)是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此版本的版权持有人于2025年1月28日发布。 https://doi.org/10.1101/2025.01.24.632989 doi:Biorxiv Preprint
* 香港中文大学法律学院教授,香港新界。非常感谢 Laurence Boisson de Chazournes、Benoit Mayer、Bryan Mercurio、Bryan Druzin、Qian Wang 和 Ryan Mitchell 对早期草案的评论。1 欧洲理事会结论(2022 年 3 月 24 日至 25 日),网址为 https://data.consilium.europa.eu/doc/docu- ment/ST-1-2022-INIT/en/pdf。2 关于对俄罗斯第六套制裁措施的问题和答案(2022 年 6 月 3 日),网址为 https://ec.europa. eu/commission/presscorner/detail/en/QANDA_22_2823。 3 委员会致欧洲议会、欧洲理事会、欧洲理事会、欧洲经济委员会和地区委员会的通报:REPowerEU 计划,第 20 页,COM/2022/230 final (2022 年 5 月 18 日),网址为 https://eur-lex.europa.eu/legal-content/EN/TXT/?uri¼COM:2022:230:FIN。4 例如,请参阅 David Sheppard、Tom Wilson、Guy Chazan 和 Roman Olearchyk 的《俄罗斯减少对德国和意大利的天然气出口以“政治”举措》,FIN.T IMES (2022 年 6 月 15 日),网址为 https://www.ft.com/content/1e972cf5-f42b-4ed8-b81b-6969dd91ccfd; Marek Strzelecki、Tsvetelia Tsolova 和 Pavel Polityuk,《俄罗斯暂停向波兰和保加利亚供应天然气》,《欧盟通讯社》(2022 年 4 月 28 日),网址:https://www.reuters.com/world/poland-bulgaria-