XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System锌指
EMT 转录因子 ZEB1 抑制乳腺癌中的致突变 POL u 介导的末端连接途径
摘要 ◥ 癌症发展的一个特征是获得基因组不稳定性，这是由于 DNA 损伤修复不准确造成的。在致癌应激诱导的双链断裂修复机制中，高度诱变的 theta 介导末端连接 (TMEJ) 通路已被证明在多种人类癌症中过表达，该通路需要由 POLQ 基因编码的 DNA 聚合酶 theta (POL q )。然而，人们对 TMEJ 的调节机制及其失调的后果知之甚少。在本研究中，我们结合生物信息学方法，探索乳腺癌国际联盟分子分类学和 Cancer Genome Atlas 数据库，并使用 CRISPR/Cas9 介导的 claudin-low 肿瘤细胞中锌指 E-box 结合同源框 1 (ZEB1) 的消耗，或在基底样肿瘤细胞（两种三阴性乳腺癌 (TNBC) 亚型）中强制表达 ZEB1，以证明 ZEB1 抑制
金属复合物的DNA和RNA
诸如顺铂（顺铂）的设计需要详细了解铂和其他金属离子如何与核酸和核酸加工相互作用。此外，我们发现金属络合物在开发核酸的光谱和反应性探针方面具有独特的用处，因此在开发新的诊断剂中可能变得有价值。自然本身利用了金属/核酸化学，从天然产物的生物合成（例如博霉素）的生物合成，这些天然产物的生物合成将螯合氧化还原活性金属离子靶向和损害外源性DNA，到为真核调节性蛋白的基本结构基序的发展，这些基本结构基序（固定蛋白），锌指蛋白，锌字指蛋白，与DNA结合并调节转换。在所有这些努力中，我们首先需要对过渡金属离子和复合物如何与核酸相互作用以及如何最好地利用这种化学作用有所了解。
国内外基于基因剪刀技术的海洋与渔业领域研发及产业化现状
1. 基因组编辑技术在鱼类中的应用。海洋生命科学与技术。2021 2. 基因组编辑及其在水产养殖遗传改良中的应用，水产养殖评论。2021 3. 利用工程化锌指核酸酶对黄鲶鱼（Pelteobagrus fulvidraco）中的肌生长抑制素基因进行可遗传的靶向失活。2011. Plos One。 4. 基因组编辑及其在水产养殖遗传改良中的应用。2021. 水产养殖评论。재편집 5. 利用 CRISPR-Cas9 系统进行基因组编辑以产生尼罗罗非鱼（Oreochromis niloticus）的纯红色种系。CRISPR 杂志。2021，표지사진 6. 基因组编辑及其在水产养殖遗传改良中的应用。2021. 水产养殖评论。 재편집
推定的循环因子Znf143/ZFP143是必不可少的转录调节器，没有循环函数
远端基因座之间的相互作用，包括涉及增强子和启动子的相互作用，是哺乳动物基因调节的核心机制，但这些相互作用的蛋白质调节剂仍未确定。锌指转录因子Znf143/ZFP143被强烈牵涉到染色质相互作用的调节剂，在有或没有CTCF的情况下起作用。然而，Znf143/ZFP143在此过程中的作用及其功能，无论有或没有CTCF，都尚不清楚。在这里，我们使用双用途Degron/Imaging标签标记了CTCF和ZNF143/ZFP143，以组合其循环功能和彼此的效果。我们发现ZNF143/ZFP143在小鼠和人类细胞中没有一般循环功能，并且它在很大程度上独立于CTCF起作用。相反，ZNF143/ZFP143是具有极为稳定的染色质停留时间（> 20分钟）的必不可少且高度保守的转录因子，可调节线粒体和核糖体基因的重要子集。
在具有基础编辑的植物中精确且可预测的基因组编辑
自1996年第一个站点定向的核酸酶（SDN）和锌指核酸酶（ZFN）的发展以来，基因组编辑场发生了迅速变化（Kim等，1996）。自此以来，已经开发了许多工具，可以实现遗传序列的目标变化，最广泛使用的是CRISPR/CAS9（Jinek等，2012）。SDN允许研究人员轻松地靶向基因组中的序列，并在包括植物在内的各种生物体中以非常特定的方式引入变化（Feng等，2013）。SDNS的使用导致自引入以来的短时间内在植物中产生了各种各样的新表型。早期基因组编辑的重点主要是在基因敲除上，这很容易通过靶向核酸酶实现。SDNS形成双链断裂（DSB），由主机的本机维修机械修复。这通常会导致返回原始基因组序列，或插入或删除
分子开关控制细菌焦点粘连的组装
细胞运动普遍依赖于连接底物与细胞电机的局灶性粘附复合物（FAS）的空间调节。在细菌FAS中，冒险的滑行运动机制（AGL-GLT）在相互滑动运动蛋白（MGLA） - 瓜氨酰5'三磷酸（GTP）梯度沿细胞轴沿细胞轴沿铅杆组装。在这里，我们表明GLTJ是一种机械膜蛋白，包含胞质序列的结合MGLA-GTP和AGLZ，并募集MREB细胞骨架以启动向滞后细胞极运动。此外，MGLA-GTP结合触发相邻的GLTJ锌指域中的构象转移，从而促进了滞后极附近的MGLB募集。这提示了MGLA的GTP水解，从而导致复杂的拆卸。因此，GLTJ开关用作MGLA-GTP梯度的传感器，在空间上控制FA活性。
AMBP通过抑制
结果：RNA测序将AMBP识别为CAVD的关键调节剂。CAVD患者的AV和高胆固醇饮食（HCD）诱导的APOE - / - 小鼠的AV中增加了ABP。体内，AMBP过表达显着降低了HCD诱导的AV钙化和纤维化。在体外，AMBP敲低的成骨标记物，Runx2和Osterix升高，并促进了由成骨培养基（OM）诱导的瓣膜间质细胞中的钙沉积，而AMBP过表达反向这些影响。从机械上讲，AMBP通过竞争性结合FHL3的锌指域，抑制了OM诱导的ERK1/2（P-ERK1/2）和JNK（P-JNK）的磷酸化。这种相互作用破坏了FHL3在防止P-ERK1/2和P-JNK的泛素蛋白介导的降解中的保护作用。P-ERK1/2和P-JNK抑制剂和激动剂证实，AMBP对CAVD的保护作用是通过这些途径在体内和体外介导的。
如何引用：Mariano Junior CG，Oliveira VC，AmbrósioCE。小动物中的基因编辑用于转化医学：评论。动画复制。 2
与其他工程核酸酶（例如锌指核酸酶（ZFN）和类似转录激活剂样效应子核酸酶（Talens））相比，CRISPR/CAS9系统是一种更简单，更通用的方法，自从发现其CRISPR基因组编辑效率以来，基于CRISPR的基因组效率就可以使多种和不同类型的编辑效率提高。这些基因编辑的进步通过比以往任何时候都更加简单和有效性来启用精确的基因组编辑，从而彻底改变了生物技术。该工具已成功应用于各种动物物种，包括牛，猪，狗和其他小动物。工程核酸酶切断了特定靶位置的基因组，触发了细胞修复损伤的机制，并将突变引入特定的基因组位点。本评论讨论了基于基因组的新型CRISPR/CAS9编辑工具，为提高效率和特异性而开发的方法，在动物模型和转化医学上使用基因编辑的方法以及基于CRISPR的基因编辑方法的主要挑战和局限性。
病毒样粒子介导的CRIS/CAS9递送，以进行有效且安全的基因组编辑
摘要：设计师核酸酶的发现使基因组的编辑比以前更加有效。设计师核酸酶已被广泛用于机械研究，动物模型产生和基因治疗的发展。但是，潜在的靶标和宿主免疫反应是体内用途，尤其是临床应用仍需要解决问题。设计师核酸酶的短期表达对于降低两种风险是必要的。当前，正在开发各种递送方法，用于用于瞬时核酸酶的瞬时表达，包括锌指核酸酶（ZNF），转录激活剂样的效应核酸酶（TALEN）和定期间隔的短裂缝短底膜重复序列 / CRISPR与CRISPR相关（CRISPR / CAS）。最近，病毒样颗粒被用于基因编辑。在这篇综述中，我们将通过常用的基因组编辑核酸酶进行讨论，讨论基因编辑递送工具，并使用病毒样颗粒来回顾最新文献，以传递基因编辑效果。
通过计算机分析实现医用大麻基因组编辑的明智设计；基因家族和变异表征
我们访问并挖掘了大量的参考基因组数据集，以确定拷贝数变异和相关的 SNP 变异，以获得基因型独立编辑的最佳靶编辑位点。基因组中存在拷贝数变异和高度多态性的基因序列，使使用 CRISPR、锌指和 TALEN 进行基因组编辑在技术上变得困难。通过核苷酸和氨基酸比对并进行比较序列分析来确定等位基因或额外基因拷贝的评估。根据确定的基因拷贝数和 SNP 的存在，使用多种在线 CRISPR 设计工具设计针对每个基因、伴随等位基因和所有相关途径中的同源物的 sgRNA，以创建敲除以供进一步研究。使用 MultiTargeter 为高度同源序列设计通用 sgRNA，并使用 Sequencher 进行可视化，创建独特的 sgRNA，避免 SNP 和共享核苷酸位置，靶向最佳编辑位点。