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要制定有效的 COVID-19 检测、治疗或预防策略，需要深入了解针对 SARS-CoV-2 的自然免疫反应，包括 T 细胞介导的细胞反应。我们使用了一种无偏倚的全基因组筛选技术（称为 T-Scan），以识别 25 名 COVID-19 康复患者的记忆 CD8+ T 细胞识别的 SARS-CoV-2 中的特定表位，重点关注六种最常见的 HLA 类型所呈现的表位：A*02:01、A*01:01、A*03:01、A*11:01、A*24:02 和 B*07:02。对于每种 HLA 类型，患者的 T 细胞识别 3-8 个在患者中广泛共享的免疫显性表位。值得注意的是，94% 的筛查患者的 T 细胞能够识别特定 HLA 的三个最主要表位中的至少一个，53% 的患者的 T 细胞能够识别所有三个表位。随后对另外 18 名 A*02:01 患者进行的验证研究证实了对前六个 A*02:01 表位有特异性的记忆性 CD8+ T 细胞的存在，单细胞测序表明患者通常具有针对每个表位的许多不同 T 细胞克隆，但相同的 T 细胞受体 V a 区域主要用于识别这些表位，即使在患者之间也是如此。总的来说，我们在所研究的六种 HLA 类型中确定了 29 个共享表位。针对大多数这些表位（29 个中的 27 个）的 T 细胞不会与导致普通感冒的地方性冠状病毒发生交叉反应，并且表位不会出现在突变变异较高的区域。值得注意的是，29 个表位中只有 3 个位于刺突蛋白中，这凸显了设计新类疫苗以重现对 SARS-CoV-2 的天然 CD8 + T 细胞反应的必要性。
手稿 - MacBeath
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