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我们使用 All-in-one Cas9 构建体编辑了 HEK293 细胞中的 DNA (胞嘧啶-5-)-甲基转移酶 3 beta (DNMT3B) 基因,从编辑后的细胞中分离基因组 DNA,然后使用标准 (黄色曲线) 和 snapback 引物 (红色曲线,图 2A) 进行 CRISPY 测定以量化编辑成功率。我们还对从未编辑的细胞中分离的 DNA 进行了 CRISPY 测定,同样使用标准 (黄色曲线) 和 Snapback 引物 (红色曲线,图 2B)。正如预期的那样,标准引物在编辑和未编辑的 DNA 中均提供了强大的扩增,然而 snapback 引物仅在从编辑细胞中分离的 DNA 中提供了明显的扩增。标准和 snapback 引物之间的 ΔCt 可直接测量编辑成功率,而熔解曲线形状之间的差异表明编辑的 DNA 中存在缺失 (图 2C,方框区域)。

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