动物行为受环境刺激调节,并受神经网络活动影响,这强调了评估自由行为动物不同细胞群的形态功能特性的重要性。近年来,已经开发出许多光学工具来监测和调节蛋白质、细胞或网络水平的神经元和神经胶质活动,并为研究自由行为动物的大脑功能开辟了新途径。基因编码的传感器和执行器等工具现在通常用于研究大脑活动和功能,通过它们在不同神经元群中的表达来研究它们。与此同时,显微镜在过去几十年中也取得了重大进展。微型显微镜(微型显微镜也称为微型内窥镜)的出现已成为研究自由行为小鼠不同大脑区域细胞和网络水平大脑活动的首选方法。这种技术还允许在动物头戴显微镜执行行为任务时进行纵向研究。在这篇综述中,我们将讨论微型内窥镜成像以及这些设备为研究提供的优势。我们还将讨论微内窥镜成像的当前局限性和未来潜在的改进。