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将肽序列与串联质谱匹配是自下而上的蛋白质组学不可或缺的部分。据估计，嵌合光谱占 DDA 数据的 40% 以上 [2]，这违反了一个光谱代表一个肽的假设。一些搜索引擎允许对几个可能的前体进行多遍搜索或重复嵌合光谱，但很少有搜索引擎考虑到（同量异位素）碎片离子的测量强度可能是多个肽的总和。这会引入错误并使有价值的信息未被利用，导致肽鉴定数量远远少于数据中包含的数量。在这里，我们描述了 CHIMERYS，这是一种基于 AI 的新型搜索算法，它从头开始重新思考串联质谱的分析。与传统搜索算法相比，它通常将肽鉴定数量增加一倍，鉴定率达到 80% 以上。
CHIMERYS：AI 驱动的肽技术飞跃...
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