基于结核病测序的药敏测试常见问题:全基因组测序和靶向下一代测序问:结核病药敏测试参考中心基于测序和表型方法的药敏测试算法是什么?答:结核病药敏测试 (DST) 参考中心 (TB DST RC) 依靠基于测序的 DST (sbDST),使用全基因组测序 (WGS) 和靶向下一代测序 (tNGS) 来全面预测 MTBC 中的药物敏感性/耐药性。表型 DST (pDST) 使用 Bactec MGIT 系统执行,并且仍然是一种重要的参考方法,尽管它的周转时间通常比 sbDST 方法更长。在 TB DST RC,sbDST 和 pDST 并行进行(PZA 除外)。 sbDST 和 pDST 的结果在可用时会单独报告,但为了解决差异,会同时考虑这两种方法。提交纯培养物时,WGS-DST 是主要方法,而 tNGS-DST 可直接在处理过的样本和混合/非活性培养物上进行。为 DST 目的生成的 WGS 数据也可用于结核病基因分型;结核病 DST RC 生成的 WGS 数据与 CDC 的国家结核病监测系统共享(除非提交者选择退出)。对于提交的沉淀物,结核病 DST RC 将尝试分离纯培养物,如果成功,将进行 WGS-DST,并报告结果(除了直接在沉淀物上进行的 tNGS)。以下是结核病 DST RC 测试工作流程的高级概述:
主要关键词