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在此过程中，1〜5 ml细菌培养物被打沉淀，然后重悬（FAPD1； RNase A包含），裂解（FAPD2）和中和（FAPD3）。修饰的碱性裂解方法和RNase A处理用于创建具有最小基因组DNA和RNA污染物的清除细胞裂解物。在存在混沌盐的情况下，裂解物中的质粒DNA与自旋柱中的玻璃纤维基质结合。杂质和其他不需要的颗粒在用WF缓冲液和洗涤缓冲液的洗涤步骤中去除。通过洗脱缓冲液或水洗脱纯化的质粒DNA。
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