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在分类学多样性中，主要数据是税收 - 原子树，这些树被转化为物种之间成对距离。在功能多样性中，主要数据是物种特征，这些特征转移到物种之间的成对距离，然后转移到种类特征的树木中。使用树木的论点是，这样一个偏差物种将具有很小的影响，因为它仅评估一次，而不是评估其与所有其他物种的距离（Petchey and Gaston，2006年）。函数TREEDIVE实现功能分化定义为连接所有物种的性状树状图中的总分支长度，但不包括树的不必要的根部段（Petchey和Gaston，2002，2006）。该示例使用上一章的分类距离。这些首先转换为层次结构（实际上是它们的原始形式，然后在将它们转换为距离之前）
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