大蒜是一种无性繁殖的农作物,是洋葱后的第二个重要的鳞茎作物,被用作蔬菜和药用植物。在数千年的种植中已经形成了丰富而多样的大蒜资源。然而,基因组变异,种群结构和大蒜农艺性状的遗传结构仍未得到很好的阐明。在这里,使用从43个国家 /地区收集的606个大蒜加入中鉴定了100258个单核苷酸多态性(SNP)。种群结构,主要成分和系统发育分析表明,这些加入分为五个亚群。连续两年内实施了二十种农艺性状,包括地面生长性状,与灯泡相关和螺栓相关的特征。总共有542个SNP与这些农艺性状相关,其中188个SNP与两个以上的性状反复相关。一个SNP(CHR6:1896135972)反复与十个特征有关。这些相关的SNP位于或附近858个基因内,其中56个是转录因子。有趣的是,核糖体蛋白S5中的一个非同义词SNP(CHR4:166524085)与地上生长和与鳞茎相关的性状反复相关。此外,全基因组选择区域的基因本体富集分析在完全粘液和非螺栓固定加入之间的基因组选择区域表明,这些基因在“营养性的生殖相位过渡到生殖相位过渡”,“芽系统发展”,“芽系统发展”,“生殖过程”等中显着富集这些结果为可靠,有效地选择候选基因以实现大蒜遗传改善和优越品种提供了宝贵的信息。