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在过去的十年中，全脑显微镜的发展现在可以对小动物（如小鼠）完整的大脑进行高分辨率成像。这些复杂的图像包含大量信息，但是许多神经科学实验室没有处理这些数据所需的所有计算知识和工具。我们回顾了将图像注册到地图酶的最新开源工具，以及大脑区域和标记结构（例如神经元）的分割，可视化和分析。由于该领域缺乏用于所有类型的全脑显微镜分析的完全集成的分析管道，因此我们为工具开发人员提供了一条途径，以应对这一挑战。©2021作者。由Elsevier Ltd.这是CC下的开放访问文章（http://creativecommons.org/licenses/4.0/）。
中尺度显微镜和图像分析工具，用于理解大脑
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