机构名称：
¥ 1.0
Thermincola Mag的组装使用了多个先前报道的数据集（6）。Illumina配对端（NCBI登录：SRR24043423）和Mate-pair（NCBI登录：SRR24043417）读数是从2013年从称为NRBC亚养殖Cartcons19获得的。配对末端的读数进行了测序，并使用Nextera Mate Pair库制剂制备套件对配偶对读数进行了测序。使用Trimmomaticv。0.32（7）处理所有原始读数，然后使用Abyssv。1.3.7（8），以创建与All-Paths-LGv。4.7.0（9）中生成的脚手架合并的Unitigs，使用gap填充Perl Script（10）基于Tang S1中的script in Dang et et eT eT eT eT eT eT eT eT script。（11）。由于该元基因组组装中的不确定核苷酸数量大量（JARXNP010000000），因此采取了进一步的步骤。在2018年，使用HISEQ PE群集Kit v4 cbot（Illumina）对NRBC亚培养（FES-DIASIS）进行了测序，没有其他质量控制措施（NCBI登录：SRR24043422）使用IDBAv。1.1.1.1（12）（12）和BINNENNNEND和VINNEND。在157个重叠群（NCBI登录：Javsmv000000000.1）中分配给Thermincola的垃圾箱如前所述（6）。将这157个重叠群纳入上述深渊/全paths-lg间隙填充工作流程中，生成了一个26 contig组件，该组件是通过使用BBMAPv。38.94（14）来策划映射来解决歧义的26 contig组件。读取映射可视化是使用Geneiousv。8.1.8进行的，并使用NCBI的原始基因组注释进行了基因组注释Finally, long reads from a 2020 NRBC subculture called 10L-NRBC, sequenced according to the manufac turer's instructions using PacBio RSII with the SMRTbell Express Template Prep Kit 2.0 ( SRR24043419 ) without shearing or size selection (Pacific Biosciences), were used to join adjacent contigs using the de novo assembly tool in Geneious v. 8.1.8（15），导致20碳组装。
厌氧硝酸盐还原的基因组草案，苯
主要关键词
相关文件推荐
