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摘要 分子对接是药物发现过程的重要步骤，旨在计算一个分子相对于另一个分子相互结合时的首选位置和形状。在这种分析过程中，根据分子的自由度对分子的 3D 表示进行操纵：沿可旋转键的刚性旋转平移和片段旋转。在我们的工作中，我们专注于分子对接过程的一个特定阶段，即分子展开 (MU)，它用于通过将分子展开为在目标腔内更易于操纵的展开形状来消除分子的初始偏差。MU 问题的目标是找到最大化分子面积的配置，或者等效地，最大化分子内部原子之间的内部距离。我们提出了一种量子退火方法来解决 MU，将其表述为高阶无约束二元优化，可以在最新的 D-wave 退火硬件（2000Q 和 advantage）上求解。将量子退火器获得的结果和性能与最先进的经典求解器进行了比较。
量子分子展开
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