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蘑菇科学及其最广泛应用的方面——食用和药用蘑菇的生产，传统上综合了发育生物学、遗传学、真菌代谢研究以及数百年来蘑菇生产实践中积累的大量经验知识。随着高通量组学的出现，该领域迅速采用了新技术，包括基因组和转录组测序或蛋白质组学。然而，在技术和知识方面，将基因和基因表达模式与表型联系起来的重要垫脚石一直缺失。最近发表的少数几项研究预测了这方面的变化，并描绘了蘑菇发育生物学的成熟。
蘑菇功能基因组学蓬勃发展 - 创新
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