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Phylogenomic analysis of colonizing and invasive Staphylococcus aureus in a neonatal intensive care unit reveals high levels of transmission of invasive strains Presenter: Qianxuan She , MS, University of Pennsylvania/Children's Hospital of Philadelphia Abstract Body: Background: Staphylococcus aureus is a leading cause of healthcare-associated infection.金黄色葡萄球菌的无症状定植代表了随后感染的重要风险。 最近的数据表明，金黄色葡萄球菌仍然是与新生儿重症监护病房（NICU）中感染有关的最常见病原体之一。 金黄色葡萄球菌在NICU中的殖民化和传播可能代表这种高危人群中感染的重要风险。 方法：这项研究利用了1,264个定居和浸润性金黄色葡萄球菌分离株的全基因组测序，该分离株是从NICU在费城儿童医院住院的婴儿中收集的两年筛查期。 进行了比较基因组分析和基因组流行病学方法，以研究NICU环境中金黄色葡萄球菌的传递动力学。 结果：比较基因组分析确定了73个单核苷酸多态性（SNP）阈值，以证明NICU S.金黄色葡萄球菌基因组之间紧密的克隆种群结构。 在此截止中，鉴定了460个独特的菌株，主要属于克隆综合体8和398。 59个传播簇被推断出，有16个侵入性簇涉及133名婴儿。 最大的侵入性簇涉及24名婴儿，持续了2年。 口头抽象演示＃2：代表了随后感染的重要风险。最近的数据表明，金黄色葡萄球菌仍然是与新生儿重症监护病房（NICU）中感染有关的最常见病原体之一。金黄色葡萄球菌在NICU中的殖民化和传播可能代表这种高危人群中感染的重要风险。方法：这项研究利用了1,264个定居和浸润性金黄色葡萄球菌分离株的全基因组测序，该分离株是从NICU在费城儿童医院住院的婴儿中收集的两年筛查期。进行了比较基因组分析和基因组流行病学方法，以研究NICU环境中金黄色葡萄球菌的传递动力学。结果：比较基因组分析确定了73个单核苷酸多态性（SNP）阈值，以证明NICU S.金黄色葡萄球菌基因组之间紧密的克隆种群结构。在此截止中，鉴定了460个独特的菌株，主要属于克隆综合体8和398。59个传播簇被推断出，有16个侵入性簇涉及133名婴儿。最大的侵入性簇涉及24名婴儿，持续了2年。口头抽象演示＃2：从定植到侵入性簇的进展，可能是由于无法消除定殖菌株的促进。在一些集群中发现了空间流行病学联系，这表明共享NICU房间的婴儿的传播，并且可能通过患者入院引入一些侵入性簇。与定居簇相比，侵入性簇表现出长时间的持久性和增强性，导致在特定时间范围内涉及的患者数量增加。结论：这些分析已经阐明了NICU S.金黄色葡萄球菌基因组之间的基因组相同性，并表征了已识别透射簇簇的流行病学联系。我们的发现表明，殖民，传播和侵入性感染的发展之间存在明显的关联，强调实施有效的预防和非殖民化策略以解决NICU环境中的金黄色葡萄球菌感染的重要性。
NGS 2024口头抽象演示内容和时间表
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